MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_022119	GAAA	2	8	477536	477543	75 %	0 %	25 %	0 %	532424332
9503	NC_022119	TAA	2	6	477550	477555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
9504	NC_022119	AAT	2	6	477596	477601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
9505	NC_022119	TCAA	2	8	477609	477616	50 %	25 %	0 %	25 %	532424332
9506	NC_022119	ATG	2	6	477630	477635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
9507	NC_022119	AAATAC	2	12	477745	477756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532424332
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9509	NC_022119	CTT	2	6	477837	477842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
9510	NC_022119	CAA	2	6	477862	477867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
9511	NC_022119	GTA	2	6	477912	477917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
9512	NC_022119	CT	4	8	477935	477942	0 %	50 %	0 %	50 %	532424332
9513	NC_022119	TG	3	6	477980	477985	0 %	50 %	50 %	0 %	532424332
9514	NC_022119	A	7	7	477998	478004	100 %	0 %	0 %	0 %	532424332
9515	NC_022119	TAA	2	6	478042	478047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
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9517	NC_022119	TCT	2	6	478088	478093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
9518	NC_022119	AGAA	2	8	478197	478204	75 %	0 %	25 %	0 %	532424332
9519	NC_022119	ATTA	2	8	478213	478220	50 %	50 %	0 %	0 %	532424332
9520	NC_022119	CTC	2	6	478311	478316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
9521	NC_022119	TCT	2	6	478329	478334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
9522	NC_022119	CTC	2	6	478335	478340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
9523	NC_022119	GGA	2	6	478379	478384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
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9526	NC_022119	GCA	2	6	478430	478435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
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9529	NC_022119	TTG	2	6	478800	478805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424332
9530	NC_022119	CAA	2	6	478822	478827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
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9532	NC_022119	GAT	2	6	478850	478855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
9533	NC_022119	CAA	2	6	478904	478909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
9534	NC_022119	CTC	2	6	478914	478919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
9535	NC_022119	GAA	2	6	478925	478930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424332
9536	NC_022119	TAC	2	6	478937	478942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424332
9537	NC_022119	A	7	7	479039	479045	100 %	0 %	0 %	0 %	532424332
9538	NC_022119	TTCCT	2	10	479148	479157	0 %	60 %	0 %	40 %	532424332
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9541	NC_022119	TTC	2	6	479308	479313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
9542	NC_022119	GAT	2	6	479402	479407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
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9544	NC_022119	TCTA	2	8	479513	479520	25 %	50 %	0 %	25 %	532424332
9545	NC_022119	CTGT	2	8	479532	479539	0 %	50 %	25 %	25 %	532424332
9546	NC_022119	CT	3	6	479652	479657	0 %	50 %	0 %	50 %	532424332
9547	NC_022119	ACTAT	2	10	479664	479673	40 %	40 %	0 %	20 %	532424332
9548	NC_022119	TCT	2	6	479727	479732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
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9554	NC_022119	TAG	4	12	480144	480155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424333
9555	NC_022119	TCTTCA	2	12	480184	480195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532424333
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9559	NC_022119	ACTA	2	8	480306	480313	50 %	25 %	0 %	25 %	532424333
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9561	NC_022119	TTC	2	6	480373	480378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424333
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9587	NC_022119	A	6	6	481549	481554	100 %	0 %	0 %	0 %	532424333
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9605	NC_022119	ATCT	2	8	482193	482200	25 %	50 %	0 %	25 %	532424333
9606	NC_022119	TGC	2	6	482229	482234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424333
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9622	NC_022119	TAA	2	6	482736	482741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424333
9623	NC_022119	GGA	2	6	482773	482778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424333
9624	NC_022119	CTG	2	6	482795	482800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424333
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9990	NC_022119	CTTCT	2	10	502917	502926	0 %	60 %	0 %	40 %	532424827
9991	NC_022119	A	8	8	502931	502938	100 %	0 %	0 %	0 %	532424827
9992	NC_022119	ATCC	2	8	503005	503012	25 %	25 %	0 %	50 %	532424352
9993	NC_022119	CTG	2	6	503029	503034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424352
9994	NC_022119	TAT	2	6	503045	503050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424352
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9996	NC_022119	CTT	2	6	503233	503238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424352
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9998	NC_022119	CTTC	2	8	503325	503332	0 %	50 %	0 %	50 %	532424352
9999	NC_022119	CTC	2	6	503336	503341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424352
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