MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022119	TCC	2	6	453126	453131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424315
9002	NC_022119	CTC	2	6	453134	453139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424315
9003	NC_022119	TGC	2	6	453210	453215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424315
9004	NC_022119	A	6	6	453230	453235	100 %	0 %	0 %	0 %	532424315
9005	NC_022119	AAGC	2	8	453245	453252	50 %	0 %	25 %	25 %	532424315
9006	NC_022119	AGA	2	6	453264	453269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424315
9007	NC_022119	CAA	2	6	453277	453282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424315
9008	NC_022119	ACAA	2	8	453317	453324	75 %	0 %	0 %	25 %	532424315
9009	NC_022119	AAG	2	6	453329	453334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424315
9010	NC_022119	AGA	2	6	453471	453476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424315
9011	NC_022119	AGC	2	6	453498	453503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424315
9012	NC_022119	TGA	2	6	453507	453512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424315
9013	NC_022119	A	6	6	453530	453535	100 %	0 %	0 %	0 %	532424315
9014	NC_022119	ATCCGC	2	12	453558	453569	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532424315
9015	NC_022119	AGC	2	6	453570	453575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424315
9016	NC_022119	TCT	2	6	453577	453582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424315
9017	NC_022119	AGG	2	6	453597	453602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424315
9018	NC_022119	A	6	6	453628	453633	100 %	0 %	0 %	0 %	532424315
9019	NC_022119	CAG	2	6	453656	453661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424315
9020	NC_022119	ACA	2	6	453683	453688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424315
9021	NC_022119	TTG	2	6	453710	453715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424315
9022	NC_022119	A	6	6	454054	454059	100 %	0 %	0 %	0 %	532424316
9023	NC_022119	TGGA	2	8	454191	454198	25 %	25 %	50 %	0 %	532424316
9024	NC_022119	GGA	2	6	454235	454240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424316
9025	NC_022119	A	6	6	454242	454247	100 %	0 %	0 %	0 %	532424316
9026	NC_022119	TCAT	2	8	454257	454264	25 %	50 %	0 %	25 %	532424316
9027	NC_022119	TTCT	2	8	454269	454276	0 %	75 %	0 %	25 %	532424316
9028	NC_022119	TAG	2	6	454293	454298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424316
9029	NC_022119	TC	3	6	454308	454313	0 %	50 %	0 %	50 %	532424316
9030	NC_022119	TG	3	6	454340	454345	0 %	50 %	50 %	0 %	532424316
9031	NC_022119	GTT	2	6	454417	454422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424316
9032	NC_022119	TG	3	6	454435	454440	0 %	50 %	50 %	0 %	532424316
9033	NC_022119	ACC	2	6	454465	454470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424316
9034	NC_022119	TTA	2	6	454530	454535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424316
9035	NC_022119	AGA	2	6	454555	454560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424316
9036	NC_022119	GAC	2	6	454691	454696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424316
9037	NC_022119	GCT	2	6	454799	454804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424316
9038	NC_022119	TGC	2	6	454848	454853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424316
9039	NC_022119	CTGTAT	2	12	454908	454919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532424316
9040	NC_022119	GTA	2	6	454980	454985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424316
9041	NC_022119	ATG	2	6	455001	455006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424316
9042	NC_022119	A	6	6	455027	455032	100 %	0 %	0 %	0 %	532424316
9043	NC_022119	T	6	6	455085	455090	0 %	100 %	0 %	0 %	532424316
9044	NC_022119	AAC	2	6	455103	455108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424316
9045	NC_022119	TTC	2	6	455127	455132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424316
9046	NC_022119	ACAA	2	8	455187	455194	75 %	0 %	0 %	25 %	532424316
9047	NC_022119	GCT	2	6	455198	455203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424316
9048	NC_022119	CA	3	6	455290	455295	50 %	0 %	0 %	50 %	532424316
9049	NC_022119	CCT	2	6	455300	455305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424316
9050	NC_022119	GAA	2	6	455309	455314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424316
9051	NC_022119	ACT	2	6	455520	455525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424316
9052	NC_022119	AC	4	8	455526	455533	50 %	0 %	0 %	50 %	532424316
9053	NC_022119	CCG	2	6	455548	455553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424316
9054	NC_022119	CT	4	8	455592	455599	0 %	50 %	0 %	50 %	532424316
9055	NC_022119	AGA	3	9	455602	455610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424316
9056	NC_022119	AAG	2	6	455690	455695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424316
9057	NC_022119	CTT	2	6	455701	455706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424316
9058	NC_022119	A	6	6	455708	455713	100 %	0 %	0 %	0 %	532424316
9059	NC_022119	AGA	2	6	455719	455724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424316
9060	NC_022119	ATT	2	6	455753	455758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424316
9061	NC_022119	TCC	2	6	455787	455792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424316
9062	NC_022119	CAAA	2	8	455852	455859	75 %	0 %	0 %	25 %	532424316
9063	NC_022119	AGA	2	6	455869	455874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424316
9064	NC_022119	CA	3	6	455938	455943	50 %	0 %	0 %	50 %	532424316
9065	NC_022119	GTTG	2	8	455959	455966	0 %	50 %	50 %	0 %	532424316
9066	NC_022119	CTAAAG	2	12	455976	455987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532424316
9067	NC_022119	A	7	7	456008	456014	100 %	0 %	0 %	0 %	532424316
9068	NC_022119	AAAGA	2	10	456032	456041	80 %	0 %	20 %	0 %	532424316
9069	NC_022119	A	6	6	456062	456067	100 %	0 %	0 %	0 %	532424316
9070	NC_022119	GAA	2	6	456082	456087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424316
9071	NC_022119	A	6	6	456434	456439	100 %	0 %	0 %	0 %	532424317
9072	NC_022119	GAA	2	6	456500	456505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424317
9073	NC_022119	AGATC	2	10	456532	456541	40 %	20 %	20 %	20 %	532424317
9074	NC_022119	GATCA	2	10	456575	456584	40 %	20 %	20 %	20 %	532424317
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9076	NC_022119	A	8	8	456613	456620	100 %	0 %	0 %	0 %	532424317
9077	NC_022119	TAA	2	6	456661	456666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424317
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9079	NC_022119	TCT	2	6	456730	456735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424317
9080	NC_022119	TC	3	6	456738	456743	0 %	50 %	0 %	50 %	532424317
9081	NC_022119	GAAA	2	8	456745	456752	75 %	0 %	25 %	0 %	532424317
9082	NC_022119	TC	3	6	456754	456759	0 %	50 %	0 %	50 %	532424317
9083	NC_022119	TAG	2	6	456772	456777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424317
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9085	NC_022119	GA	3	6	456801	456806	50 %	0 %	50 %	0 %	532424317
9086	NC_022119	GAA	2	6	456824	456829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424317
9087	NC_022119	GAAA	2	8	456862	456869	75 %	0 %	25 %	0 %	532424317
9088	NC_022119	ATT	2	6	456883	456888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424317
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9090	NC_022119	GTT	2	6	456929	456934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424317
9091	NC_022119	ATC	2	6	457014	457019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424317
9092	NC_022119	CAG	2	6	457077	457082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424317
9093	NC_022119	CGT	5	15	457100	457114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424317
9094	NC_022119	TAA	2	6	457552	457557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424318
9095	NC_022119	GCAT	2	8	457574	457581	25 %	25 %	25 %	25 %	532424318
9096	NC_022119	GTA	2	6	457584	457589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424318
9097	NC_022119	CAA	2	6	457593	457598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424318
9098	NC_022119	GTT	3	9	457605	457613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424318
9099	NC_022119	CAT	2	6	457657	457662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424318
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9101	NC_022119	TCC	2	6	457750	457755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424318
9102	NC_022119	TAA	2	6	457801	457806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424318
9103	NC_022119	TAC	2	6	457822	457827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424318
9104	NC_022119	AC	3	6	457832	457837	50 %	0 %	0 %	50 %	532424318
9105	NC_022119	GAA	2	6	457850	457855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424318
9106	NC_022119	AGT	2	6	457879	457884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424318
9107	NC_022119	AAT	2	6	457923	457928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424318
9108	NC_022119	AGA	2	6	458030	458035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424318
9109	NC_022119	A	6	6	458040	458045	100 %	0 %	0 %	0 %	532424318
9110	NC_022119	ACA	3	9	458114	458122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424318
9111	NC_022119	GCA	2	6	458156	458161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424318
9112	NC_022119	CAA	2	6	458169	458174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424318
9113	NC_022119	TTC	2	6	458189	458194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424318
9114	NC_022119	TC	3	6	458217	458222	0 %	50 %	0 %	50 %	532424318
9115	NC_022119	CAC	2	6	458229	458234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424318
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9117	NC_022119	TCG	2	6	458337	458342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424318
9118	NC_022119	A	7	7	458385	458391	100 %	0 %	0 %	0 %	532424318
9119	NC_022119	TGA	2	6	458402	458407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424318
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9121	NC_022119	TGA	2	6	458429	458434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424318
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9123	NC_022119	TCCA	2	8	458630	458637	25 %	25 %	0 %	50 %	532424319
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9493	NC_022119	ATC	2	6	477085	477090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424332
9494	NC_022119	AGG	2	6	477103	477108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
9495	NC_022119	CCT	2	6	477159	477164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
9496	NC_022119	ACA	2	6	477206	477211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
9497	NC_022119	GAG	2	6	477225	477230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
9498	NC_022119	CTT	2	6	477309	477314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
9499	NC_022119	GGA	2	6	477356	477361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
9500	NC_022119	TC	3	6	477396	477401	0 %	50 %	0 %	50 %	532424332

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