MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_022119	CTA	2	6	427649	427654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424295
8502	NC_022119	TCT	2	6	427664	427669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424295
8503	NC_022119	TTC	2	6	427710	427715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424295
8504	NC_022119	TAAG	2	8	427758	427765	50 %	25 %	25 %	0 %	532424295
8505	NC_022119	GAT	2	6	427804	427809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424295
8506	NC_022119	CT	3	6	427834	427839	0 %	50 %	0 %	50 %	532424295
8507	NC_022119	GGA	2	6	427856	427861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424295
8508	NC_022119	A	6	6	427944	427949	100 %	0 %	0 %	0 %	532424295
8509	NC_022119	TAA	2	6	428029	428034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424295
8510	NC_022119	AG	4	8	428046	428053	50 %	0 %	50 %	0 %	532424295
8511	NC_022119	TCT	2	6	428272	428277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424296
8512	NC_022119	TCT	2	6	428351	428356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424296
8513	NC_022119	CTT	2	6	428360	428365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424296
8514	NC_022119	A	6	6	428381	428386	100 %	0 %	0 %	0 %	532424296
8515	NC_022119	CAC	2	6	428419	428424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424296
8516	NC_022119	TC	3	6	428432	428437	0 %	50 %	0 %	50 %	532424296
8517	NC_022119	TCC	2	6	428490	428495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424296
8518	NC_022119	GTG	2	6	428566	428571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424296
8519	NC_022119	TGATAA	2	12	428659	428670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532424296
8520	NC_022119	AT	3	6	428671	428676	50 %	50 %	0 %	0 %	532424296
8521	NC_022119	ATT	2	6	428771	428776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424296
8522	NC_022119	CCA	2	6	428885	428890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424296
8523	NC_022119	AT	3	6	428911	428916	50 %	50 %	0 %	0 %	532424296
8524	NC_022119	ACA	2	6	428927	428932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424296
8525	NC_022119	CAAC	2	8	428968	428975	50 %	0 %	0 %	50 %	532424296
8526	NC_022119	ATT	2	6	429069	429074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424296
8527	NC_022119	AGG	2	6	429148	429153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424296
8528	NC_022119	TCT	2	6	429169	429174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424296
8529	NC_022119	AT	3	6	429232	429237	50 %	50 %	0 %	0 %	532424296
8530	NC_022119	AGC	2	6	429268	429273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424296
8531	NC_022119	CT	3	6	429285	429290	0 %	50 %	0 %	50 %	532424296
8532	NC_022119	GAA	2	6	429345	429350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424297
8533	NC_022119	TCA	2	6	429353	429358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424297
8534	NC_022119	AC	3	6	429496	429501	50 %	0 %	0 %	50 %	532424297
8535	NC_022119	GAA	2	6	429506	429511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424297
8536	NC_022119	CTT	2	6	429522	429527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424297
8537	NC_022119	AT	3	6	429535	429540	50 %	50 %	0 %	0 %	532424297
8538	NC_022119	AGC	2	6	429547	429552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424297
8539	NC_022119	TGC	2	6	429568	429573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424297
8540	NC_022119	ATA	2	6	429641	429646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424297
8541	NC_022119	TTCT	2	8	429845	429852	0 %	75 %	0 %	25 %	532424297
8542	NC_022119	AAT	2	6	429854	429859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424297
8543	NC_022119	CAA	3	9	429909	429917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424297
8544	NC_022119	TGT	2	6	429940	429945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424297
8545	NC_022119	AGA	2	6	429992	429997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424297
8546	NC_022119	TCTCT	2	10	429998	430007	0 %	60 %	0 %	40 %	532424297
8547	NC_022119	CAT	2	6	430068	430073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424297
8548	NC_022119	ATG	2	6	430077	430082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424297
8549	NC_022119	TAA	2	6	430102	430107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424297
8550	NC_022119	CAT	2	6	430119	430124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424297
8551	NC_022119	TCC	2	6	430261	430266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424297
8552	NC_022119	ATG	2	6	430815	430820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424298
8553	NC_022119	CTT	2	6	430861	430866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424298
8554	NC_022119	GAG	2	6	430948	430953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424298
8555	NC_022119	GAA	2	6	430977	430982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424298
8556	NC_022119	AGCTAA	2	12	431033	431044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532424298
8557	NC_022119	CAA	2	6	431053	431058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424298
8558	NC_022119	GAT	2	6	431079	431084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424298
8559	NC_022119	ATA	2	6	431095	431100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424298
8560	NC_022119	TGA	2	6	431166	431171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424298
8561	NC_022119	A	6	6	431181	431186	100 %	0 %	0 %	0 %	532424298
8562	NC_022119	AAT	2	6	431219	431224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424298
8563	NC_022119	CCTTC	2	10	431248	431257	0 %	40 %	0 %	60 %	532424298
8564	NC_022119	TC	3	6	431256	431261	0 %	50 %	0 %	50 %	532424298
8565	NC_022119	ATTCC	2	10	431281	431290	20 %	40 %	0 %	40 %	532424298
8566	NC_022119	TGT	2	6	431295	431300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424298
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8570	NC_022119	AGC	2	6	431450	431455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424298
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8573	NC_022119	TGC	2	6	431687	431692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424298
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8580	NC_022119	TCC	2	6	431946	431951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424298
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8589	NC_022119	A	6	6	432303	432308	100 %	0 %	0 %	0 %	532424298
8590	NC_022119	CAT	2	6	432317	432322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424298
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8593	NC_022119	CTC	2	6	432603	432608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424299
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8601	NC_022119	ACG	2	6	433125	433130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424299
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8603	NC_022119	TTC	2	6	433196	433201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424299
8604	NC_022119	TC	3	6	433220	433225	0 %	50 %	0 %	50 %	532424299
8605	NC_022119	CCA	2	6	433246	433251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424299
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8609	NC_022119	AATT	2	8	433383	433390	50 %	50 %	0 %	0 %	532424299
8610	NC_022119	ACA	3	9	433405	433413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424299
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8612	NC_022119	TCA	2	6	433459	433464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424299
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8621	NC_022119	TCTT	2	8	433768	433775	0 %	75 %	0 %	25 %	532424299
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8994	NC_022119	CT	3	6	452929	452934	0 %	50 %	0 %	50 %	532424315
8995	NC_022119	AG	3	6	452976	452981	50 %	0 %	50 %	0 %	532424315
8996	NC_022119	AGA	2	6	453002	453007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424315
8997	NC_022119	TCT	2	6	453014	453019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424315
8998	NC_022119	CAGC	2	8	453037	453044	25 %	0 %	25 %	50 %	532424315
8999	NC_022119	TCG	2	6	453053	453058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424315
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