MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022119	GAT	2	6	404127	404132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424276
8002	NC_022119	CTAAAG	2	12	404169	404180	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532424276
8003	NC_022119	CTG	2	6	404185	404190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424276
8004	NC_022119	CCTCT	2	10	404238	404247	0 %	40 %	0 %	60 %	532424276
8005	NC_022119	GGAT	2	8	404256	404263	25 %	25 %	50 %	0 %	532424276
8006	NC_022119	TCT	2	6	404360	404365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424276
8007	NC_022119	AGC	2	6	404419	404424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424276
8008	NC_022119	TAA	2	6	404849	404854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424277
8009	NC_022119	A	7	7	404880	404886	100 %	0 %	0 %	0 %	532424277
8010	NC_022119	TCT	2	6	404902	404907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424277
8011	NC_022119	ACA	2	6	405078	405083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424277
8012	NC_022119	CTTGG	2	10	405096	405105	0 %	40 %	40 %	20 %	532424277
8013	NC_022119	A	6	6	405275	405280	100 %	0 %	0 %	0 %	532424277
8014	NC_022119	TAA	2	6	405287	405292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424277
8015	NC_022119	CTA	2	6	405322	405327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424277
8016	NC_022119	CCTTTC	2	12	405333	405344	0 %	50 %	0 %	50 %	532424277
8017	NC_022119	CTG	2	6	405544	405549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424277
8018	NC_022119	A	6	6	405585	405590	100 %	0 %	0 %	0 %	532424277
8019	NC_022119	CTT	2	6	405605	405610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424277
8020	NC_022119	AAG	2	6	405637	405642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424277
8021	NC_022119	ATA	2	6	405688	405693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424278
8022	NC_022119	TCT	2	6	405714	405719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424278
8023	NC_022119	AAG	2	6	405722	405727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424278
8024	NC_022119	CTT	2	6	405790	405795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424278
8025	NC_022119	CCG	2	6	405796	405801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424278
8026	NC_022119	CAT	2	6	405809	405814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424278
8027	NC_022119	TCT	2	6	405951	405956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424278
8028	NC_022119	GAA	2	6	405998	406003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424278
8029	NC_022119	TTC	2	6	406004	406009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424278
8030	NC_022119	C	6	6	406025	406030	0 %	0 %	0 %	100 %	532424278
8031	NC_022119	AAG	2	6	406069	406074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424278
8032	NC_022119	TG	3	6	406114	406119	0 %	50 %	50 %	0 %	532424278
8033	NC_022119	TG	3	6	406167	406172	0 %	50 %	50 %	0 %	532424278
8034	NC_022119	ATA	2	6	406202	406207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424278
8035	NC_022119	CAT	2	6	406256	406261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424278
8036	NC_022119	CTA	2	6	406279	406284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424278
8037	NC_022119	A	6	6	406328	406333	100 %	0 %	0 %	0 %	532424278
8038	NC_022119	TCT	2	6	406408	406413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424278
8039	NC_022119	AAT	2	6	406483	406488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424278
8040	NC_022119	A	6	6	406537	406542	100 %	0 %	0 %	0 %	532424278
8041	NC_022119	ATGG	2	8	406616	406623	25 %	25 %	50 %	0 %	532424278
8042	NC_022119	A	6	6	406693	406698	100 %	0 %	0 %	0 %	532424278
8043	NC_022119	ACT	2	6	406737	406742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424278
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8045	NC_022119	TTG	2	6	407135	407140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424279
8046	NC_022119	AATC	2	8	407160	407167	50 %	25 %	0 %	25 %	532424279
8047	NC_022119	TC	3	6	407171	407176	0 %	50 %	0 %	50 %	532424279
8048	NC_022119	CCAA	2	8	407219	407226	50 %	0 %	0 %	50 %	532424279
8049	NC_022119	GAA	2	6	407243	407248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424279
8050	NC_022119	TGT	2	6	407320	407325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424279
8051	NC_022119	GCAA	2	8	407347	407354	50 %	0 %	25 %	25 %	532424279
8052	NC_022119	AG	3	6	407362	407367	50 %	0 %	50 %	0 %	532424279
8053	NC_022119	TCT	2	6	407413	407418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424279
8054	NC_022119	GTC	2	6	407435	407440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424279
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8056	NC_022119	GCAAA	2	10	407475	407484	60 %	0 %	20 %	20 %	532424279
8057	NC_022119	CTTT	2	8	407522	407529	0 %	75 %	0 %	25 %	532424279
8058	NC_022119	CAA	2	6	407532	407537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424279
8059	NC_022119	AGA	2	6	407538	407543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424279
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8061	NC_022119	ACCA	2	8	407626	407633	50 %	0 %	0 %	50 %	532424279
8062	NC_022119	GCA	2	6	407683	407688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424279
8063	NC_022119	TC	3	6	407787	407792	0 %	50 %	0 %	50 %	532424279
8064	NC_022119	CCA	2	6	407795	407800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424279
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8067	NC_022119	TCCCT	2	10	407906	407915	0 %	40 %	0 %	60 %	532424279
8068	NC_022119	TCT	2	6	407951	407956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424279
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8070	NC_022119	TCCG	2	8	408032	408039	0 %	25 %	25 %	50 %	532424279
8071	NC_022119	TCC	2	6	408048	408053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424279
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8074	NC_022119	AG	3	6	408102	408107	50 %	0 %	50 %	0 %	532424279
8075	NC_022119	TTAA	2	8	408216	408223	50 %	50 %	0 %	0 %	532424279
8076	NC_022119	AT	3	6	408270	408275	50 %	50 %	0 %	0 %	532424279
8077	NC_022119	CAT	2	6	408299	408304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424279
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8079	NC_022119	ATC	2	6	408353	408358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424279
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8081	NC_022119	A	7	7	408438	408444	100 %	0 %	0 %	0 %	532424279
8082	NC_022119	TTC	3	9	408587	408595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424279
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8084	NC_022119	CT	3	6	408674	408679	0 %	50 %	0 %	50 %	532424279
8085	NC_022119	AAAG	2	8	408776	408783	75 %	0 %	25 %	0 %	532424279
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8090	NC_022119	A	7	7	409020	409026	100 %	0 %	0 %	0 %	532424279
8091	NC_022119	AGA	2	6	409104	409109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424279
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8094	NC_022119	A	6	6	409169	409174	100 %	0 %	0 %	0 %	532424279
8095	NC_022119	A	8	8	409176	409183	100 %	0 %	0 %	0 %	532424279
8096	NC_022119	TTTTAA	2	12	409196	409207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424279
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8109	NC_022119	TAG	2	6	409820	409825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424821
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8118	NC_022119	TAT	2	6	410150	410155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424280
8119	NC_022119	TCTCT	2	10	410239	410248	0 %	60 %	0 %	40 %	532424280
8120	NC_022119	AGA	2	6	410348	410353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424280
8121	NC_022119	AGA	2	6	410402	410407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424280
8122	NC_022119	TC	3	6	410425	410430	0 %	50 %	0 %	50 %	532424280
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8124	NC_022119	TC	3	6	410437	410442	0 %	50 %	0 %	50 %	532424280
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8151	NC_022119	A	6	6	411738	411743	100 %	0 %	0 %	0 %	532424282
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8167	NC_022119	TAC	2	6	412938	412943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424283
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8237	NC_022119	CTC	2	6	416520	416525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424287
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8239	NC_022119	TCTT	2	8	416635	416642	0 %	75 %	0 %	25 %	532424287
8240	NC_022119	AACT	2	8	416707	416714	50 %	25 %	0 %	25 %	532424287
8241	NC_022119	CTT	2	6	416734	416739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424287
8242	NC_022119	AAGC	2	8	416743	416750	50 %	0 %	25 %	25 %	532424287
8243	NC_022119	TAT	2	6	416775	416780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424287
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8245	NC_022119	CTTCT	2	10	416814	416823	0 %	60 %	0 %	40 %	532424287
8246	NC_022119	TGA	2	6	416858	416863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424287
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8494	NC_022119	TCA	2	6	427119	427124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424295
8495	NC_022119	GTA	2	6	427265	427270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424295
8496	NC_022119	GCT	2	6	427283	427288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424295
8497	NC_022119	TC	3	6	427291	427296	0 %	50 %	0 %	50 %	532424295
8498	NC_022119	AT	3	6	427343	427348	50 %	50 %	0 %	0 %	532424295
8499	NC_022119	CTG	2	6	427419	427424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424295
8500	NC_022119	CTT	2	6	427602	427607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424295

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