MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022119	T	6	6	328826	328831	0 %	100 %	0 %	0 %	532424219
6502	NC_022119	TA	3	6	328836	328841	50 %	50 %	0 %	0 %	532424219
6503	NC_022119	TGT	2	6	328908	328913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424219
6504	NC_022119	ACT	2	6	328927	328932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424219
6505	NC_022119	AAGC	2	8	328993	329000	50 %	0 %	25 %	25 %	532424219
6506	NC_022119	CTT	2	6	329030	329035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424219
6507	NC_022119	ACC	2	6	329047	329052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424219
6508	NC_022119	ATC	2	6	329091	329096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424219
6509	NC_022119	CTG	2	6	329112	329117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424219
6510	NC_022119	GAA	2	6	329156	329161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424219
6511	NC_022119	GCC	2	6	329306	329311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424219
6512	NC_022119	TCT	2	6	329317	329322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424219
6513	NC_022119	AT	3	6	329389	329394	50 %	50 %	0 %	0 %	532424219
6514	NC_022119	GAT	2	6	329396	329401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424219
6515	NC_022119	CT	3	6	329407	329412	0 %	50 %	0 %	50 %	532424219
6516	NC_022119	CAG	2	6	329414	329419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424219
6517	NC_022119	TCC	2	6	329481	329486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424219
6518	NC_022119	AGG	2	6	329520	329525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424219
6519	NC_022119	AAAT	2	8	329613	329620	75 %	25 %	0 %	0 %	532424219
6520	NC_022119	AAT	2	6	329678	329683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424219
6521	NC_022119	TCT	2	6	329714	329719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424219
6522	NC_022119	CT	3	6	329859	329864	0 %	50 %	0 %	50 %	532424219
6523	NC_022119	ACA	2	6	329917	329922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424219
6524	NC_022119	TTAG	2	8	330151	330158	25 %	50 %	25 %	0 %	532424220
6525	NC_022119	GAG	2	6	330170	330175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424220
6526	NC_022119	C	6	6	330204	330209	0 %	0 %	0 %	100 %	532424220
6527	NC_022119	AGAAA	2	10	330238	330247	80 %	0 %	20 %	0 %	532424220
6528	NC_022119	AGC	2	6	330281	330286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424220
6529	NC_022119	TCT	2	6	330317	330322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424220
6530	NC_022119	CAG	2	6	330378	330383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424220
6531	NC_022119	CT	3	6	330402	330407	0 %	50 %	0 %	50 %	532424220
6532	NC_022119	ATC	2	6	330413	330418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424220
6533	NC_022119	TC	4	8	330447	330454	0 %	50 %	0 %	50 %	532424220
6534	NC_022119	CCT	2	6	330489	330494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424220
6535	NC_022119	GCA	2	6	330729	330734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424221
6536	NC_022119	CA	3	6	330733	330738	50 %	0 %	0 %	50 %	532424221
6537	NC_022119	TAAAT	2	10	330762	330771	60 %	40 %	0 %	0 %	532424221
6538	NC_022119	CTT	2	6	330793	330798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424221
6539	NC_022119	CTT	2	6	330818	330823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424221
6540	NC_022119	CTG	2	6	330842	330847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424221
6541	NC_022119	AAG	2	6	330848	330853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424221
6542	NC_022119	TAG	2	6	330896	330901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424221
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6544	NC_022119	CAA	2	6	330953	330958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424221
6545	NC_022119	AGC	2	6	330963	330968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424221
6546	NC_022119	AC	3	6	330998	331003	50 %	0 %	0 %	50 %	532424221
6547	NC_022119	A	6	6	331046	331051	100 %	0 %	0 %	0 %	532424221
6548	NC_022119	GGC	2	6	331126	331131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424221
6549	NC_022119	TTC	2	6	331184	331189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424221
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6551	NC_022119	CA	3	6	331230	331235	50 %	0 %	0 %	50 %	532424221
6552	NC_022119	A	7	7	331359	331365	100 %	0 %	0 %	0 %	532424221
6553	NC_022119	TGC	2	6	331380	331385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424221
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6555	NC_022119	CA	3	6	331450	331455	50 %	0 %	0 %	50 %	532424222
6556	NC_022119	GAA	2	6	331511	331516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424222
6557	NC_022119	CTAAA	2	10	331527	331536	60 %	20 %	0 %	20 %	532424222
6558	NC_022119	TCT	2	6	331541	331546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424222
6559	NC_022119	CTC	2	6	331549	331554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424222
6560	NC_022119	GAA	2	6	331598	331603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424222
6561	NC_022119	AGG	3	9	331645	331653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424222
6562	NC_022119	GAG	2	6	331683	331688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424222
6563	NC_022119	TAC	2	6	331713	331718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424222
6564	NC_022119	GAA	2	6	331775	331780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424222
6565	NC_022119	CAA	2	6	331828	331833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424222
6566	NC_022119	ACA	2	6	331873	331878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424222
6567	NC_022119	T	6	6	331929	331934	0 %	100 %	0 %	0 %	532424222
6568	NC_022119	GA	3	6	331975	331980	50 %	0 %	50 %	0 %	532424222
6569	NC_022119	CAAAA	2	10	332007	332016	80 %	0 %	0 %	20 %	532424222
6570	NC_022119	TAT	2	6	332032	332037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424222
6571	NC_022119	TAG	2	6	332091	332096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424222
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6574	NC_022119	CAT	2	6	332281	332286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424222
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6576	NC_022119	TTC	2	6	332338	332343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424222
6577	NC_022119	A	6	6	332421	332426	100 %	0 %	0 %	0 %	532424222
6578	NC_022119	TA	3	6	332442	332447	50 %	50 %	0 %	0 %	532424222
6579	NC_022119	CA	3	6	332488	332493	50 %	0 %	0 %	50 %	532424222
6580	NC_022119	GGT	2	6	332524	332529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424222
6581	NC_022119	TA	3	6	332538	332543	50 %	50 %	0 %	0 %	532424222
6582	NC_022119	GA	3	6	332577	332582	50 %	0 %	50 %	0 %	532424222
6583	NC_022119	AGG	2	6	332590	332595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424222
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6585	NC_022119	ATT	2	6	332642	332647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424222
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6592	NC_022119	T	7	7	332972	332978	0 %	100 %	0 %	0 %	532424223
6593	NC_022119	GAT	2	6	332982	332987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424223
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6601	NC_022119	ATC	2	6	333358	333363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424223
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6612	NC_022119	GAA	3	9	334348	334356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424224
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6616	NC_022119	AT	3	6	334417	334422	50 %	50 %	0 %	0 %	532424224
6617	NC_022119	CA	3	6	334430	334435	50 %	0 %	0 %	50 %	532424224
6618	NC_022119	GCTC	2	8	334605	334612	0 %	25 %	25 %	50 %	532424224
6619	NC_022119	TAT	2	6	334640	334645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424224
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6621	NC_022119	CTGG	2	8	334677	334684	0 %	25 %	50 %	25 %	532424224
6622	NC_022119	ATAG	2	8	334688	334695	50 %	25 %	25 %	0 %	532424224
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6624	NC_022119	CTT	2	6	334802	334807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424224
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6872	NC_022119	CT	3	6	348321	348326	0 %	50 %	0 %	50 %	532424233
6873	NC_022119	GCT	2	6	348388	348393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424233
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6993	NC_022119	TTC	2	6	353990	353995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424236
6994	NC_022119	CCAT	2	8	354000	354007	25 %	25 %	0 %	50 %	532424236
6995	NC_022119	GAA	2	6	354020	354025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424236
6996	NC_022119	CTC	2	6	354165	354170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424236
6997	NC_022119	CAA	2	6	354207	354212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424236
6998	NC_022119	CAT	2	6	354228	354233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424236
6999	NC_022119	AAG	2	6	354235	354240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424236
7000	NC_022119	TCT	2	6	354246	354251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424236

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