MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022119	A	6	6	304798	304803	100 %	0 %	0 %	0 %	532424196
6002	NC_022119	ACC	2	6	304815	304820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424196
6003	NC_022119	TCACA	2	10	304832	304841	40 %	20 %	0 %	40 %	532424196
6004	NC_022119	ACT	2	6	304846	304851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424196
6005	NC_022119	AAT	2	6	304867	304872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424196
6006	NC_022119	CT	3	6	304879	304884	0 %	50 %	0 %	50 %	532424196
6007	NC_022119	CAAA	2	8	305377	305384	75 %	0 %	0 %	25 %	532424197
6008	NC_022119	A	7	7	305386	305392	100 %	0 %	0 %	0 %	532424197
6009	NC_022119	TCC	2	6	305412	305417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424197
6010	NC_022119	AAC	2	6	305432	305437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424197
6011	NC_022119	CTTA	2	8	305450	305457	25 %	50 %	0 %	25 %	532424197
6012	NC_022119	TC	3	6	305464	305469	0 %	50 %	0 %	50 %	532424197
6013	NC_022119	CAAGAC	2	12	305485	305496	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532424197
6014	NC_022119	A	6	6	305501	305506	100 %	0 %	0 %	0 %	532424197
6015	NC_022119	A	6	6	305577	305582	100 %	0 %	0 %	0 %	532424197
6016	NC_022119	CTC	2	6	305589	305594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424197
6017	NC_022119	ACA	2	6	305613	305618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424197
6018	NC_022119	AGA	2	6	305643	305648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424197
6019	NC_022119	GAA	2	6	305815	305820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424198
6020	NC_022119	T	8	8	305885	305892	0 %	100 %	0 %	0 %	532424198
6021	NC_022119	AGG	2	6	305943	305948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424198
6022	NC_022119	AGA	2	6	306075	306080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424198
6023	NC_022119	CGT	2	6	306107	306112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424198
6024	NC_022119	TAC	2	6	306149	306154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424198
6025	NC_022119	C	6	6	306169	306174	0 %	0 %	0 %	100 %	532424198
6026	NC_022119	GCA	2	6	306454	306459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424199
6027	NC_022119	GCT	2	6	306493	306498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424199
6028	NC_022119	AGA	2	6	306542	306547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424199
6029	NC_022119	A	6	6	306556	306561	100 %	0 %	0 %	0 %	532424199
6030	NC_022119	A	6	6	306615	306620	100 %	0 %	0 %	0 %	532424199
6031	NC_022119	GTT	2	6	306675	306680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424199
6032	NC_022119	AGCTTA	2	12	306766	306777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532424199
6033	NC_022119	TCCA	2	8	306812	306819	25 %	25 %	0 %	50 %	532424199
6034	NC_022119	TGC	2	6	306851	306856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424199
6035	NC_022119	TATT	2	8	306883	306890	25 %	75 %	0 %	0 %	532424199
6036	NC_022119	TGG	2	6	306893	306898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424199
6037	NC_022119	CAT	2	6	306954	306959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424199
6038	NC_022119	TTA	2	6	306997	307002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424199
6039	NC_022119	TCA	2	6	307013	307018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424199
6040	NC_022119	ATCG	2	8	307057	307064	25 %	25 %	25 %	25 %	532424199
6041	NC_022119	TCG	2	6	307078	307083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424199
6042	NC_022119	TTG	2	6	307171	307176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424199
6043	NC_022119	TTG	2	6	307246	307251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424199
6044	NC_022119	TA	3	6	307347	307352	50 %	50 %	0 %	0 %	532424199
6045	NC_022119	TAA	2	6	307397	307402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424199
6046	NC_022119	TAA	2	6	307427	307432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424199
6047	NC_022119	AAC	2	6	307445	307450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424199
6048	NC_022119	TTG	2	6	307645	307650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424199
6049	NC_022119	TGC	2	6	307658	307663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424199
6050	NC_022119	ACTC	2	8	307674	307681	25 %	25 %	0 %	50 %	532424199
6051	NC_022119	A	6	6	307739	307744	100 %	0 %	0 %	0 %	532424199
6052	NC_022119	AAT	2	6	307764	307769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424199
6053	NC_022119	CAC	2	6	307783	307788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424199
6054	NC_022119	A	6	6	307871	307876	100 %	0 %	0 %	0 %	532424200
6055	NC_022119	TGA	2	6	307883	307888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424200
6056	NC_022119	GTG	2	6	307912	307917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424200
6057	NC_022119	TA	3	6	307937	307942	50 %	50 %	0 %	0 %	532424200
6058	NC_022119	AGAAC	2	10	307950	307959	60 %	0 %	20 %	20 %	532424200
6059	NC_022119	AAG	2	6	308023	308028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424200
6060	NC_022119	CAA	2	6	308049	308054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424200
6061	NC_022119	GAA	2	6	308055	308060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424200
6062	NC_022119	GAA	2	6	308088	308093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424200
6063	NC_022119	ACT	2	6	308100	308105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424200
6064	NC_022119	GA	3	6	308145	308150	50 %	0 %	50 %	0 %	532424200
6065	NC_022119	ATT	2	6	308202	308207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424200
6066	NC_022119	GAA	2	6	308247	308252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424200
6067	NC_022119	TG	3	6	308355	308360	0 %	50 %	50 %	0 %	532424200
6068	NC_022119	TG	3	6	308377	308382	0 %	50 %	50 %	0 %	532424200
6069	NC_022119	TTC	2	6	308470	308475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424201
6070	NC_022119	AGAA	2	8	308503	308510	75 %	0 %	25 %	0 %	532424201
6071	NC_022119	CTG	2	6	308523	308528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424201
6072	NC_022119	CTTTT	2	10	308538	308547	0 %	80 %	0 %	20 %	532424201
6073	NC_022119	TC	3	6	308611	308616	0 %	50 %	0 %	50 %	532424201
6074	NC_022119	GAA	2	6	308627	308632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424201
6075	NC_022119	AGC	2	6	308680	308685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424201
6076	NC_022119	AG	3	6	308776	308781	50 %	0 %	50 %	0 %	532424201
6077	NC_022119	TAC	2	6	308880	308885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424201
6078	NC_022119	CGC	2	6	308888	308893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424201
6079	NC_022119	CAA	2	6	308894	308899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424201
6080	NC_022119	TC	3	6	308910	308915	0 %	50 %	0 %	50 %	532424201
6081	NC_022119	GCA	2	6	308935	308940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424201
6082	NC_022119	AAC	2	6	308986	308991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424201
6083	NC_022119	T	6	6	308996	309001	0 %	100 %	0 %	0 %	532424201
6084	NC_022119	TAA	2	6	309016	309021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424201
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6086	NC_022119	AC	3	6	309178	309183	50 %	0 %	0 %	50 %	532424202
6087	NC_022119	TCT	2	6	309188	309193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424202
6088	NC_022119	CGTT	2	8	309198	309205	0 %	50 %	25 %	25 %	532424202
6089	NC_022119	GAT	2	6	309232	309237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424202
6090	NC_022119	GTTG	2	8	309238	309245	0 %	50 %	50 %	0 %	532424202
6091	NC_022119	CTC	2	6	309440	309445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424202
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6093	NC_022119	TAT	2	6	309490	309495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424202
6094	NC_022119	TCCT	2	8	309552	309559	0 %	50 %	0 %	50 %	532424202
6095	NC_022119	CTA	2	6	309561	309566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424202
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6098	NC_022119	GAAT	2	8	309639	309646	50 %	25 %	25 %	0 %	532424202
6099	NC_022119	AAAG	2	8	309746	309753	75 %	0 %	25 %	0 %	532424202
6100	NC_022119	AGA	2	6	309780	309785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424202
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6102	NC_022119	AAC	2	6	309987	309992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424202
6103	NC_022119	ACT	2	6	310007	310012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424202
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6105	NC_022119	CTT	2	6	310037	310042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424202
6106	NC_022119	GA	3	6	310146	310151	50 %	0 %	50 %	0 %	532424202
6107	NC_022119	CTT	2	6	310184	310189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424202
6108	NC_022119	CTT	2	6	310206	310211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424202
6109	NC_022119	T	6	6	310243	310248	0 %	100 %	0 %	0 %	532424202
6110	NC_022119	AAC	2	6	310282	310287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424202
6111	NC_022119	TTC	2	6	310396	310401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424202
6112	NC_022119	AATC	2	8	310471	310478	50 %	25 %	0 %	25 %	532424202
6113	NC_022119	ATT	2	6	310534	310539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424202
6114	NC_022119	TCT	2	6	310676	310681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424203
6115	NC_022119	TAT	2	6	310685	310690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424203
6116	NC_022119	CAA	2	6	310736	310741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424203
6117	NC_022119	TTC	2	6	310765	310770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424203
6118	NC_022119	TA	3	6	310818	310823	50 %	50 %	0 %	0 %	532424203
6119	NC_022119	CTC	2	6	310857	310862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424203
6120	NC_022119	TCTT	2	8	310939	310946	0 %	75 %	0 %	25 %	532424203
6121	NC_022119	AGA	2	6	310972	310977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424203
6122	NC_022119	CAAC	2	8	310988	310995	50 %	0 %	0 %	50 %	532424203
6123	NC_022119	TTC	2	6	311115	311120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424203
6124	NC_022119	CTAT	2	8	311148	311155	25 %	50 %	0 %	25 %	532424203
6125	NC_022119	CTT	2	6	311199	311204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424203
6126	NC_022119	A	7	7	311262	311268	100 %	0 %	0 %	0 %	532424203
6127	NC_022119	A	6	6	311279	311284	100 %	0 %	0 %	0 %	532424203
6128	NC_022119	GCA	2	6	311366	311371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424203
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6132	NC_022119	TTC	2	6	311492	311497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424203
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6235	NC_022119	ATC	2	6	316687	316692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424208
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6237	NC_022119	GCT	2	6	316749	316754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424208
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6239	NC_022119	TC	3	6	316782	316787	0 %	50 %	0 %	50 %	532424208
6240	NC_022119	ACT	2	6	316828	316833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424208
6241	NC_022119	T	6	6	316894	316899	0 %	100 %	0 %	0 %	532424208
6242	NC_022119	ACA	2	6	316946	316951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424208
6243	NC_022119	TACAAA	2	12	316957	316968	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532424208
6244	NC_022119	A	6	6	316979	316984	100 %	0 %	0 %	0 %	532424208
6245	NC_022119	TTA	2	6	316998	317003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424208
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6247	NC_022119	CTT	2	6	317057	317062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424209
6248	NC_022119	A	6	6	317098	317103	100 %	0 %	0 %	0 %	532424209
6249	NC_022119	CTC	2	6	317240	317245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424209
6250	NC_022119	CGT	2	6	317270	317275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424209
6251	NC_022119	CA	3	6	317292	317297	50 %	0 %	0 %	50 %	532424209
6252	NC_022119	AGA	2	6	317304	317309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424209
6253	NC_022119	TCCAA	2	10	317353	317362	40 %	20 %	0 %	40 %	532424209
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6264	NC_022119	GAA	2	6	318239	318244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
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6269	NC_022119	C	7	7	318434	318440	0 %	0 %	0 %	100 %	532424210
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6272	NC_022119	TCT	3	9	318489	318497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424210
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6277	NC_022119	A	6	6	318662	318667	100 %	0 %	0 %	0 %	532424210
6278	NC_022119	A	6	6	318768	318773	100 %	0 %	0 %	0 %	532424210
6279	NC_022119	GAA	2	6	318834	318839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
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6281	NC_022119	TTAT	2	8	318888	318895	25 %	75 %	0 %	0 %	532424210
6282	NC_022119	TGA	2	6	318896	318901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
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6284	NC_022119	GCT	2	6	318927	318932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424210
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6289	NC_022119	A	6	6	319128	319133	100 %	0 %	0 %	0 %	532424210
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6352	NC_022119	A	7	7	321755	321761	100 %	0 %	0 %	0 %	532424812
6353	NC_022119	TCA	2	6	321854	321859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424212
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6359	NC_022119	AAAACA	2	12	322121	322132	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532424212
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6361	NC_022119	A	8	8	322276	322283	100 %	0 %	0 %	0 %	532424212
6362	NC_022119	AAG	2	6	322291	322296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424212
6363	NC_022119	CT	4	8	322365	322372	0 %	50 %	0 %	50 %	532424212
6364	NC_022119	GAG	2	6	322399	322404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424212
6365	NC_022119	CTC	2	6	322432	322437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424212
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6367	NC_022119	T	6	6	322510	322515	0 %	100 %	0 %	0 %	532424212
6368	NC_022119	TA	3	6	322555	322560	50 %	50 %	0 %	0 %	532424212
6369	NC_022119	GCT	2	6	322605	322610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424212
6370	NC_022119	ATC	2	6	322614	322619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424212
6371	NC_022119	TTC	2	6	322621	322626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424212
6372	NC_022119	GCCT	2	8	322633	322640	0 %	25 %	25 %	50 %	532424212
6373	NC_022119	A	6	6	322765	322770	100 %	0 %	0 %	0 %	532424212
6374	NC_022119	GAGC	2	8	322871	322878	25 %	0 %	50 %	25 %	532424212
6375	NC_022119	CTT	2	6	322880	322885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424212
6376	NC_022119	AT	3	6	322939	322944	50 %	50 %	0 %	0 %	532424212
6377	NC_022119	TAA	2	6	322958	322963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424212
6378	NC_022119	ACA	2	6	322970	322975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424212
6379	NC_022119	CTTA	2	8	323011	323018	25 %	50 %	0 %	25 %	532424212
6380	NC_022119	TAA	2	6	323030	323035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424212
6381	NC_022119	CGA	2	6	323036	323041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424212
6382	NC_022119	TAAA	2	8	323113	323120	75 %	25 %	0 %	0 %	532424212
6383	NC_022119	ACG	2	6	323141	323146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424212
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6391	NC_022119	CT	3	6	323481	323486	0 %	50 %	0 %	50 %	532424212
6392	NC_022119	ACA	2	6	323492	323497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424212
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6398	NC_022119	AAG	2	6	323773	323778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424213
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6402	NC_022119	TTGG	2	8	323904	323911	0 %	50 %	50 %	0 %	532424213
6403	NC_022119	TCA	2	6	323940	323945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424213
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6420	NC_022119	T	6	6	324566	324571	0 %	100 %	0 %	0 %	532424213
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6443	NC_022119	GAAA	2	8	325830	325837	75 %	0 %	25 %	0 %	532424215
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6452	NC_022119	GAAC	2	8	326247	326254	50 %	0 %	25 %	25 %	532424216
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6485	NC_022119	GATT	2	8	327891	327898	25 %	50 %	25 %	0 %	532424218
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6491	NC_022119	A	6	6	328226	328231	100 %	0 %	0 %	0 %	532424219
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6493	NC_022119	ATA	2	6	328407	328412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424219
6494	NC_022119	AATT	2	8	328506	328513	50 %	50 %	0 %	0 %	532424219
6495	NC_022119	ATA	2	6	328626	328631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424219
6496	NC_022119	T	6	6	328685	328690	0 %	100 %	0 %	0 %	532424219
6497	NC_022119	GCA	2	6	328720	328725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424219
6498	NC_022119	TCT	2	6	328741	328746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424219
6499	NC_022119	CTC	2	6	328776	328781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424219
6500	NC_022119	AAAT	2	8	328790	328797	75 %	25 %	0 %	0 %	532424219

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