MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 20549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022119	TTC	2	6	279986	279991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424174
5502	NC_022119	GAA	2	6	280017	280022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424174
5503	NC_022119	GA	3	6	280042	280047	50 %	0 %	50 %	0 %	532424174
5504	NC_022119	AAAG	2	8	280074	280081	75 %	0 %	25 %	0 %	532424174
5505	NC_022119	ATA	2	6	280172	280177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424174
5506	NC_022119	CAT	2	6	280240	280245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424174
5507	NC_022119	TAA	2	6	280247	280252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424174
5508	NC_022119	GTT	2	6	280320	280325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424174
5509	NC_022119	GAT	2	6	280353	280358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424174
5510	NC_022119	TTC	2	6	280417	280422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424174
5511	NC_022119	A	6	6	280428	280433	100 %	0 %	0 %	0 %	532424174
5512	NC_022119	TAAT	2	8	280495	280502	50 %	50 %	0 %	0 %	532424174
5513	NC_022119	TTC	2	6	280505	280510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424174
5514	NC_022119	AGA	2	6	280541	280546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424174
5515	NC_022119	GAA	2	6	280592	280597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424174
5516	NC_022119	CTT	2	6	280600	280605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424174
5517	NC_022119	TCC	2	6	280775	280780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424174
5518	NC_022119	CAG	2	6	280783	280788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424174
5519	NC_022119	GAA	2	6	280888	280893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424174
5520	NC_022119	CACGCG	2	12	281042	281053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532424174
5521	NC_022119	ATT	3	9	281066	281074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424174
5522	NC_022119	TTTCTT	2	12	281221	281232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532424174
5523	NC_022119	TCT	2	6	281345	281350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424175
5524	NC_022119	TGC	2	6	281368	281373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5525	NC_022119	TGTT	2	8	281396	281403	0 %	75 %	25 %	0 %	532424175
5526	NC_022119	TTG	2	6	281409	281414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424175
5527	NC_022119	AGA	2	6	281433	281438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424175
5528	NC_022119	AAC	2	6	281491	281496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424175
5529	NC_022119	CAT	2	6	281499	281504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424175
5530	NC_022119	CTT	2	6	281516	281521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424175
5531	NC_022119	GTT	2	6	281528	281533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424175
5532	NC_022119	CAG	2	6	281561	281566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5533	NC_022119	CTG	2	6	281574	281579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5534	NC_022119	GAA	2	6	281609	281614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424175
5535	NC_022119	TATC	2	8	281684	281691	25 %	50 %	0 %	25 %	532424175
5536	NC_022119	AGCT	2	8	281705	281712	25 %	25 %	25 %	25 %	532424175
5537	NC_022119	CTG	2	6	281871	281876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5538	NC_022119	ACG	2	6	281910	281915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5539	NC_022119	TAA	2	6	281973	281978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424175
5540	NC_022119	ATA	2	6	281980	281985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424175
5541	NC_022119	ATA	2	6	282035	282040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424175
5542	NC_022119	TGC	2	6	282042	282047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5543	NC_022119	GGA	2	6	282271	282276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424175
5544	NC_022119	AGA	2	6	282318	282323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424175
5545	NC_022119	GAG	2	6	282398	282403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424175
5546	NC_022119	GTT	2	6	282408	282413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424175
5547	NC_022119	TTC	2	6	282475	282480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424175
5548	NC_022119	TCT	2	6	282559	282564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424175
5549	NC_022119	AGT	2	6	282573	282578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424175
5550	NC_022119	GCT	2	6	282605	282610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5551	NC_022119	CCA	2	6	282637	282642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424175
5552	NC_022119	CT	3	6	282649	282654	0 %	50 %	0 %	50 %	532424175
5553	NC_022119	TAT	2	6	282668	282673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424175
5554	NC_022119	ACA	2	6	282682	282687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424175
5555	NC_022119	CT	3	6	282761	282766	0 %	50 %	0 %	50 %	532424175
5556	NC_022119	ATA	2	6	282804	282809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424175
5557	NC_022119	CT	3	6	282900	282905	0 %	50 %	0 %	50 %	532424175
5558	NC_022119	TCT	2	6	282940	282945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424175
5559	NC_022119	GTA	2	6	283032	283037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424175
5560	NC_022119	AC	3	6	283111	283116	50 %	0 %	0 %	50 %	532424175
5561	NC_022119	TCT	2	6	283117	283122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424175
5562	NC_022119	ATTC	2	8	283151	283158	25 %	50 %	0 %	25 %	532424175
5563	NC_022119	ATG	2	6	283178	283183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424175
5564	NC_022119	CTA	2	6	283274	283279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424175
5565	NC_022119	CTT	2	6	283337	283342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424175
5566	NC_022119	AAG	2	6	283409	283414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424175
5567	NC_022119	CAG	2	6	283455	283460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5568	NC_022119	CTC	2	6	283509	283514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424175
5569	NC_022119	TAC	2	6	283533	283538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424175
5570	NC_022119	GCT	2	6	283583	283588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424175
5571	NC_022119	GAA	2	6	283629	283634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424175
5572	NC_022119	ATA	2	6	283676	283681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424175
5573	NC_022119	CGTT	2	8	283683	283690	0 %	50 %	25 %	25 %	532424175
5574	NC_022119	ATTC	2	8	283692	283699	25 %	50 %	0 %	25 %	532424175
5575	NC_022119	T	9	9	284016	284024	0 %	100 %	0 %	0 %	532424176
5576	NC_022119	TTC	2	6	284100	284105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424176
5577	NC_022119	GT	3	6	284124	284129	0 %	50 %	50 %	0 %	532424176
5578	NC_022119	CTG	2	6	284180	284185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424176
5579	NC_022119	CCA	2	6	284305	284310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424176
5580	NC_022119	A	6	6	284315	284320	100 %	0 %	0 %	0 %	532424176
5581	NC_022119	CAC	2	6	284496	284501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424176
5582	NC_022119	CCT	2	6	284530	284535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424176
5583	NC_022119	CTCC	2	8	284578	284585	0 %	25 %	0 %	75 %	532424176
5584	NC_022119	AAGC	2	8	284600	284607	50 %	0 %	25 %	25 %	532424176
5585	NC_022119	ATG	2	6	284617	284622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424176
5586	NC_022119	T	6	6	284673	284678	0 %	100 %	0 %	0 %	532424176
5587	NC_022119	CTC	2	6	284679	284684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424176
5588	NC_022119	GAT	2	6	284728	284733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424176
5589	NC_022119	A	7	7	284734	284740	100 %	0 %	0 %	0 %	532424176
5590	NC_022119	AG	3	6	284801	284806	50 %	0 %	50 %	0 %	532424176
5591	NC_022119	CTT	2	6	285104	285109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424177
5592	NC_022119	ACT	2	6	285133	285138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424177
5593	NC_022119	GCTGT	2	10	285146	285155	0 %	40 %	40 %	20 %	532424177
5594	NC_022119	GTC	2	6	285214	285219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424177
5595	NC_022119	T	6	6	285233	285238	0 %	100 %	0 %	0 %	532424177
5596	NC_022119	ACT	2	6	285261	285266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424177
5597	NC_022119	ACT	2	6	285330	285335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424177
5598	NC_022119	TGC	2	6	285366	285371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424177
5599	NC_022119	T	7	7	285376	285382	0 %	100 %	0 %	0 %	532424177
5600	NC_022119	CTCCTA	2	12	285383	285394	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532424177
5601	NC_022119	AAC	2	6	285468	285473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424177
5602	NC_022119	TC	3	6	285583	285588	0 %	50 %	0 %	50 %	532424177
5603	NC_022119	ATC	2	6	285608	285613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424177
5604	NC_022119	TGGC	2	8	285618	285625	0 %	25 %	50 %	25 %	532424177
5605	NC_022119	TTCGA	2	10	285637	285646	20 %	40 %	20 %	20 %	532424177
5606	NC_022119	ATT	2	6	285672	285677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424177
5607	NC_022119	AG	3	6	285679	285684	50 %	0 %	50 %	0 %	532424177
5608	NC_022119	TTG	2	6	285686	285691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424177
5609	NC_022119	ACT	2	6	285719	285724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424177
5610	NC_022119	AT	3	6	285729	285734	50 %	50 %	0 %	0 %	532424177
5611	NC_022119	TTG	2	6	285761	285766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424178
5612	NC_022119	T	6	6	285793	285798	0 %	100 %	0 %	0 %	532424178
5613	NC_022119	CTTTT	2	10	285950	285959	0 %	80 %	0 %	20 %	532424178
5614	NC_022119	T	7	7	285956	285962	0 %	100 %	0 %	0 %	532424178
5615	NC_022119	GAA	2	6	286010	286015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424178
5616	NC_022119	TTA	2	6	286070	286075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424178
5617	NC_022119	ATT	2	6	286104	286109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424178
5618	NC_022119	AAC	2	6	286139	286144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424178
5619	NC_022119	GAA	2	6	286168	286173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424178
5620	NC_022119	GAA	2	6	286246	286251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424178
5621	NC_022119	T	6	6	286255	286260	0 %	100 %	0 %	0 %	532424178
5622	NC_022119	TTC	2	6	286279	286284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424178
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5624	NC_022119	CTT	2	6	286355	286360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424178
5625	NC_022119	TTTG	2	8	286386	286393	0 %	75 %	25 %	0 %	532424178
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5740	NC_022119	AGAT	2	8	292475	292482	50 %	25 %	25 %	0 %	532424185
5741	NC_022119	AGCT	2	8	292499	292506	25 %	25 %	25 %	25 %	532424185
5742	NC_022119	CGAG	2	8	292523	292530	25 %	0 %	50 %	25 %	532424185
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5990	NC_022119	GCA	2	6	304429	304434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424196
5991	NC_022119	CTC	2	6	304435	304440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424196
5992	NC_022119	TCT	2	6	304483	304488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424196
5993	NC_022119	CACTT	2	10	304506	304515	20 %	40 %	0 %	40 %	532424196
5994	NC_022119	GAT	2	6	304556	304561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424196
5995	NC_022119	GTT	2	6	304593	304598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424196
5996	NC_022119	AGCA	2	8	304626	304633	50 %	0 %	25 %	25 %	532424196
5997	NC_022119	CAT	2	6	304637	304642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424196
5998	NC_022119	CTT	2	6	304670	304675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424196
5999	NC_022119	AAG	2	6	304679	304684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424196
6000	NC_022119	CAGA	2	8	304745	304752	50 %	0 %	25 %	25 %	532424196

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