MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022118	GGAAT	2	10	179349	179358	40 %	20 %	40 %	0 %	532422679
3502	NC_022118	CTG	2	6	179506	179511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421969
3503	NC_022118	CTG	2	6	179514	179519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421969
3504	NC_022118	AGA	3	9	179548	179556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421969
3505	NC_022118	T	7	7	179581	179587	0 %	100 %	0 %	0 %	532421969
3506	NC_022118	TCA	2	6	179619	179624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421969
3507	NC_022118	TGTT	2	8	179631	179638	0 %	75 %	25 %	0 %	532421969
3508	NC_022118	CCT	2	6	179729	179734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421969
3509	NC_022118	CAG	2	6	179780	179785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421969
3510	NC_022118	TAG	2	6	179891	179896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421969
3511	NC_022118	TTG	2	6	179902	179907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421969
3512	NC_022118	CTC	2	6	179925	179930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421969
3513	NC_022118	AG	3	6	180002	180007	50 %	0 %	50 %	0 %	532421969
3514	NC_022118	ATT	2	6	180043	180048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421969
3515	NC_022118	AAG	2	6	180055	180060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421969
3516	NC_022118	TGA	2	6	180299	180304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421969
3517	NC_022118	AGAGT	2	10	180307	180316	40 %	20 %	40 %	0 %	532421969
3518	NC_022118	GAA	2	6	180362	180367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421969
3519	NC_022118	AGG	2	6	180384	180389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421969
3520	NC_022118	AAG	3	9	180390	180398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421969
3521	NC_022118	T	6	6	180814	180819	0 %	100 %	0 %	0 %	532421970
3522	NC_022118	TTGAA	2	10	180840	180849	40 %	40 %	20 %	0 %	532421970
3523	NC_022118	TTTG	2	8	180854	180861	0 %	75 %	25 %	0 %	532421970
3524	NC_022118	TGCA	2	8	180972	180979	25 %	25 %	25 %	25 %	532421970
3525	NC_022118	TGT	2	6	180990	180995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421970
3526	NC_022118	AGT	2	6	181009	181014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421970
3527	NC_022118	CT	3	6	181054	181059	0 %	50 %	0 %	50 %	532421970
3528	NC_022118	T	6	6	181059	181064	0 %	100 %	0 %	0 %	532421970
3529	NC_022118	CTC	2	6	181088	181093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421970
3530	NC_022118	GA	3	6	181133	181138	50 %	0 %	50 %	0 %	532421970
3531	NC_022118	GAT	2	6	181188	181193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421970
3532	NC_022118	AAAG	2	8	181341	181348	75 %	0 %	25 %	0 %	532421970
3533	NC_022118	CA	3	6	181446	181451	50 %	0 %	0 %	50 %	532421970
3534	NC_022118	ACA	2	6	181504	181509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421970
3535	NC_022118	CGA	2	6	181522	181527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421970
3536	NC_022118	AAT	2	6	181548	181553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421970
3537	NC_022118	ATT	2	6	181588	181593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421970
3538	NC_022118	GTTT	2	8	181644	181651	0 %	75 %	25 %	0 %	532421970
3539	NC_022118	CTT	2	6	181732	181737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421970
3540	NC_022118	AGA	2	6	181812	181817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421970
3541	NC_022118	TG	3	6	181845	181850	0 %	50 %	50 %	0 %	532421970
3542	NC_022118	G	7	7	181852	181858	0 %	0 %	100 %	0 %	532421970
3543	NC_022118	GA	3	6	181889	181894	50 %	0 %	50 %	0 %	532421970
3544	NC_022118	AGA	2	6	181917	181922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421970
3545	NC_022118	GAA	2	6	181930	181935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421970
3546	NC_022118	AGA	3	9	181974	181982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421970
3547	NC_022118	GATG	2	8	182249	182256	25 %	25 %	50 %	0 %	532422680
3548	NC_022118	TCT	2	6	182266	182271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422680
3549	NC_022118	AGG	2	6	182320	182325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422680
3550	NC_022118	GGA	2	6	182354	182359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422680
3551	NC_022118	TTGAG	2	10	182400	182409	20 %	40 %	40 %	0 %	532422680
3552	NC_022118	GAATG	2	10	182425	182434	40 %	20 %	40 %	0 %	532422680
3553	NC_022118	CT	3	6	182475	182480	0 %	50 %	0 %	50 %	532422680
3554	NC_022118	TGA	2	6	182489	182494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422680
3555	NC_022118	GA	4	8	182517	182524	50 %	0 %	50 %	0 %	532422680
3556	NC_022118	AAC	2	6	182572	182577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422680
3557	NC_022118	TGA	2	6	182591	182596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422680
3558	NC_022118	TGC	2	6	182627	182632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422680
3559	NC_022118	CCAG	2	8	182647	182654	25 %	0 %	25 %	50 %	532422680
3560	NC_022118	TTG	2	6	182656	182661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422680
3561	NC_022118	GAC	2	6	182665	182670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422680
3562	NC_022118	GAT	2	6	182695	182700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422680
3563	NC_022118	GA	3	6	182721	182726	50 %	0 %	50 %	0 %	532422680
3564	NC_022118	GCG	2	6	182729	182734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422680
3565	NC_022118	TAG	2	6	182811	182816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422681
3566	NC_022118	GCA	2	6	182866	182871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422681
3567	NC_022118	TCGC	2	8	182909	182916	0 %	25 %	25 %	50 %	532422681
3568	NC_022118	AGA	2	6	182920	182925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422681
3569	NC_022118	GCA	2	6	182929	182934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422681
3570	NC_022118	GAA	2	6	182957	182962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422681
3571	NC_022118	AGA	2	6	182996	183001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422681
3572	NC_022118	GA	3	6	183035	183040	50 %	0 %	50 %	0 %	532422681
3573	NC_022118	GTT	2	6	183052	183057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422681
3574	NC_022118	GTT	2	6	183087	183092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422681
3575	NC_022118	CTT	2	6	183095	183100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422681
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3577	NC_022118	GTT	2	6	183149	183154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422681
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3583	NC_022118	TGA	2	6	183358	183363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422681
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3585	NC_022118	GTA	2	6	183474	183479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422681
3586	NC_022118	GTTG	2	8	183514	183521	0 %	50 %	50 %	0 %	532422681
3587	NC_022118	GGA	3	9	183529	183537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422681
3588	NC_022118	TC	3	6	183545	183550	0 %	50 %	0 %	50 %	532422681
3589	NC_022118	ATT	2	6	183564	183569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422681
3590	NC_022118	A	7	7	183594	183600	100 %	0 %	0 %	0 %	532422681
3591	NC_022118	T	8	8	183606	183613	0 %	100 %	0 %	0 %	532422681
3592	NC_022118	ATA	2	6	183656	183661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422681
3593	NC_022118	A	6	6	183661	183666	100 %	0 %	0 %	0 %	532422681
3594	NC_022118	TGT	2	6	183878	183883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421971
3595	NC_022118	TCT	3	9	183947	183955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421971
3596	NC_022118	TTTC	2	8	184020	184027	0 %	75 %	0 %	25 %	532421971
3597	NC_022118	CTG	2	6	184068	184073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421971
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3599	NC_022118	TAG	2	6	184120	184125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421971
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3601	NC_022118	ATCG	2	8	184277	184284	25 %	25 %	25 %	25 %	532421971
3602	NC_022118	TCA	2	6	184360	184365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421972
3603	NC_022118	GGA	2	6	184375	184380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421972
3604	NC_022118	AGAGA	2	10	184468	184477	60 %	0 %	40 %	0 %	532421972
3605	NC_022118	GCA	2	6	184564	184569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421972
3606	NC_022118	TTA	2	6	184861	184866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421972
3607	NC_022118	GAA	2	6	184930	184935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421972
3608	NC_022118	ATA	2	6	184990	184995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421972
3609	NC_022118	TCTA	2	8	185031	185038	25 %	50 %	0 %	25 %	532421972
3610	NC_022118	TGC	2	6	185232	185237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421973
3611	NC_022118	CA	3	6	185253	185258	50 %	0 %	0 %	50 %	532421973
3612	NC_022118	AGA	2	6	185368	185373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421973
3613	NC_022118	T	7	7	185724	185730	0 %	100 %	0 %	0 %	532421974
3614	NC_022118	TCT	2	6	185748	185753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
3615	NC_022118	TG	3	6	185758	185763	0 %	50 %	50 %	0 %	532421974
3616	NC_022118	GTC	2	6	185849	185854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421974
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3618	NC_022118	TCT	2	6	185938	185943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
3619	NC_022118	CTT	2	6	185954	185959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421974
3620	NC_022118	AAGC	2	8	185992	185999	50 %	0 %	25 %	25 %	532421974
3621	NC_022118	GAA	2	6	186022	186027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421974
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3623	NC_022118	TA	3	6	186176	186181	50 %	50 %	0 %	0 %	532421974
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3994	NC_022118	A	6	6	206114	206119	100 %	0 %	0 %	0 %	532421988
3995	NC_022118	CT	3	6	206191	206196	0 %	50 %	0 %	50 %	532421988
3996	NC_022118	TAT	2	6	206224	206229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421988
3997	NC_022118	AGT	2	6	206251	206256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421988
3998	NC_022118	TTC	2	6	206446	206451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421988
3999	NC_022118	TCC	2	6	206670	206675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421989
4000	NC_022118	AGGA	2	8	206753	206760	50 %	0 %	50 %	0 %	532421989

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