MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022118	TTC	2	6	128904	128909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421928
2502	NC_022118	AGC	2	6	128958	128963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421928
2503	NC_022118	AG	3	6	129004	129009	50 %	0 %	50 %	0 %	532421928
2504	NC_022118	TCT	2	6	129026	129031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421928
2505	NC_022118	CTT	2	6	129032	129037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421928
2506	NC_022118	ACC	2	6	129174	129179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421928
2507	NC_022118	CGT	2	6	129200	129205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421928
2508	NC_022118	GAA	2	6	129227	129232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421928
2509	NC_022118	CATC	2	8	129307	129314	25 %	25 %	0 %	50 %	532421928
2510	NC_022118	CTT	2	6	129392	129397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421928
2511	NC_022118	AAT	2	6	129404	129409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421928
2512	NC_022118	CAT	2	6	129446	129451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421928
2513	NC_022118	GA	3	6	129466	129471	50 %	0 %	50 %	0 %	532421928
2514	NC_022118	GT	5	10	129513	129522	0 %	50 %	50 %	0 %	532421928
2515	NC_022118	TGC	2	6	129582	129587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421928
2516	NC_022118	GA	3	6	129663	129668	50 %	0 %	50 %	0 %	532421928
2517	NC_022118	AGA	2	6	129870	129875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421928
2518	NC_022118	T	6	6	129884	129889	0 %	100 %	0 %	0 %	532421928
2519	NC_022118	TG	4	8	129906	129913	0 %	50 %	50 %	0 %	532421928
2520	NC_022118	T	6	6	129930	129935	0 %	100 %	0 %	0 %	532421928
2521	NC_022118	GAGG	2	8	129995	130002	25 %	0 %	75 %	0 %	532421928
2522	NC_022118	ATG	2	6	130043	130048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421928
2523	NC_022118	AAG	2	6	130054	130059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421928
2524	NC_022118	CTT	2	6	130085	130090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421928
2525	NC_022118	TCA	2	6	130105	130110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421928
2526	NC_022118	AGC	2	6	130174	130179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421928
2527	NC_022118	GAAGA	2	10	130184	130193	60 %	0 %	40 %	0 %	532421928
2528	NC_022118	GTT	2	6	130196	130201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421928
2529	NC_022118	T	7	7	130260	130266	0 %	100 %	0 %	0 %	532421928
2530	NC_022118	CAG	2	6	130315	130320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421928
2531	NC_022118	AGT	2	6	130365	130370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421928
2532	NC_022118	TC	3	6	130386	130391	0 %	50 %	0 %	50 %	532421928
2533	NC_022118	ATC	2	6	130426	130431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422676
2534	NC_022118	AG	3	6	130463	130468	50 %	0 %	50 %	0 %	532422676
2535	NC_022118	AG	3	6	130488	130493	50 %	0 %	50 %	0 %	532422676
2536	NC_022118	TTTG	2	8	130815	130822	0 %	75 %	25 %	0 %	532421929
2537	NC_022118	CTG	2	6	130863	130868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421929
2538	NC_022118	GAC	2	6	130871	130876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421929
2539	NC_022118	CAG	2	6	130940	130945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421929
2540	NC_022118	TTG	2	6	130946	130951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421929
2541	NC_022118	AAG	2	6	130965	130970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421929
2542	NC_022118	CTT	2	6	131049	131054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421929
2543	NC_022118	AATT	2	8	131094	131101	50 %	50 %	0 %	0 %	532421929
2544	NC_022118	GAA	2	6	131144	131149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421929
2545	NC_022118	TTCT	2	8	131259	131266	0 %	75 %	0 %	25 %	532421929
2546	NC_022118	AAT	2	6	131279	131284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421929
2547	NC_022118	AG	3	6	131368	131373	50 %	0 %	50 %	0 %	532421929
2548	NC_022118	TGTA	2	8	131391	131398	25 %	50 %	25 %	0 %	532421929
2549	NC_022118	GAG	2	6	131436	131441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421929
2550	NC_022118	TGA	2	6	131512	131517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
2551	NC_022118	TAG	2	6	131529	131534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
2552	NC_022118	TGAA	2	8	131628	131635	50 %	25 %	25 %	0 %	532421929
2553	NC_022118	AT	3	6	131644	131649	50 %	50 %	0 %	0 %	532421929
2554	NC_022118	CTT	2	6	131703	131708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421929
2555	NC_022118	ATTC	2	8	131722	131729	25 %	50 %	0 %	25 %	532421929
2556	NC_022118	TTCT	2	8	131805	131812	0 %	75 %	0 %	25 %	532421929
2557	NC_022118	TTC	2	6	131835	131840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421929
2558	NC_022118	TGA	2	6	131863	131868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
2559	NC_022118	TGA	2	6	131917	131922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
2560	NC_022118	AAG	2	6	131958	131963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421929
2561	NC_022118	AGCA	2	8	131976	131983	50 %	0 %	25 %	25 %	532421929
2562	NC_022118	GAA	2	6	132071	132076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421929
2563	NC_022118	AAAAG	2	10	132097	132106	80 %	0 %	20 %	0 %	532421929
2564	NC_022118	CTT	2	6	132201	132206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421929
2565	NC_022118	GGA	2	6	132208	132213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421929
2566	NC_022118	TGA	2	6	132277	132282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
2567	NC_022118	GTT	2	6	132299	132304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421929
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2569	NC_022118	GGAG	2	8	132340	132347	25 %	0 %	75 %	0 %	532421929
2570	NC_022118	GGA	2	6	132370	132375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421929
2571	NC_022118	AGA	2	6	132382	132387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421929
2572	NC_022118	CAGT	2	8	132420	132427	25 %	25 %	25 %	25 %	532421929
2573	NC_022118	GATTC	2	10	132428	132437	20 %	40 %	20 %	20 %	532421929
2574	NC_022118	GCT	2	6	132440	132445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421929
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2577	NC_022118	GAT	2	6	132568	132573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
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2579	NC_022118	TCC	2	6	132631	132636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421929
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2582	NC_022118	TC	3	6	132667	132672	0 %	50 %	0 %	50 %	532421929
2583	NC_022118	AAG	2	6	132682	132687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421929
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2587	NC_022118	TGA	2	6	132766	132771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
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2590	NC_022118	AAG	2	6	132897	132902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421929
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2593	NC_022118	GAAA	2	8	133058	133065	75 %	0 %	25 %	0 %	532421929
2594	NC_022118	GAT	2	6	133082	133087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
2595	NC_022118	AGT	2	6	133168	133173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421929
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2599	NC_022118	ACCG	2	8	133346	133353	25 %	0 %	25 %	50 %	532421930
2600	NC_022118	GCGA	2	8	133358	133365	25 %	0 %	50 %	25 %	532421930
2601	NC_022118	CAA	2	6	133407	133412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421930
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2605	NC_022118	AG	3	6	133764	133769	50 %	0 %	50 %	0 %	532421930
2606	NC_022118	TGC	2	6	133781	133786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421930
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2609	NC_022118	CCT	2	6	134010	134015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421930
2610	NC_022118	TTAC	2	8	134024	134031	25 %	50 %	0 %	25 %	532421930
2611	NC_022118	GGA	2	6	134067	134072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421930
2612	NC_022118	CTTT	2	8	134176	134183	0 %	75 %	0 %	25 %	532421930
2613	NC_022118	TTC	2	6	134200	134205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421930
2614	NC_022118	GGC	2	6	134300	134305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421930
2615	NC_022118	ATCT	2	8	134354	134361	25 %	50 %	0 %	25 %	532421930
2616	NC_022118	AT	3	6	134378	134383	50 %	50 %	0 %	0 %	532421930
2617	NC_022118	GTT	2	6	134405	134410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421930
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2619	NC_022118	AAG	2	6	134475	134480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421930
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2621	NC_022118	ACA	2	6	134517	134522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421930
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2623	NC_022118	AGA	2	6	134564	134569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421930
2624	NC_022118	CT	3	6	134595	134600	0 %	50 %	0 %	50 %	532421930
2625	NC_022118	GTT	2	6	134699	134704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421930
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2627	NC_022118	CT	3	6	134725	134730	0 %	50 %	0 %	50 %	532421930
2628	NC_022118	TTG	2	6	134758	134763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421930
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2631	NC_022118	TGG	2	6	135113	135118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421931
2632	NC_022118	GTT	2	6	135157	135162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421931
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2742	NC_022118	GCT	2	6	140165	140170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421939
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2994	NC_022118	GCA	2	6	152908	152913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421950
2995	NC_022118	GTT	2	6	153130	153135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421950
2996	NC_022118	AG	3	6	153214	153219	50 %	0 %	50 %	0 %	532421950
2997	NC_022118	CTTT	2	8	153243	153250	0 %	75 %	0 %	25 %	532421950
2998	NC_022118	AT	3	6	153368	153373	50 %	50 %	0 %	0 %	532421951
2999	NC_022118	T	7	7	153383	153389	0 %	100 %	0 %	0 %	532421951
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