MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_022118	AG	3	6	1040250	1040255	50 %	0 %	50 %	0 %	532422661
20502	NC_022118	AG	4	8	1040292	1040299	50 %	0 %	50 %	0 %	532422661
20503	NC_022118	AG	3	6	1040373	1040378	50 %	0 %	50 %	0 %	532422661
20504	NC_022118	T	6	6	1040423	1040428	0 %	100 %	0 %	0 %	532422661
20505	NC_022118	AAG	2	6	1040492	1040497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422661
20506	NC_022118	GAG	2	6	1040514	1040519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422661
20507	NC_022118	GA	5	10	1040534	1040543	50 %	0 %	50 %	0 %	532422661
20508	NC_022118	GCT	2	6	1040603	1040608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422661
20509	NC_022118	T	6	6	1040636	1040641	0 %	100 %	0 %	0 %	532422661
20510	NC_022118	CTT	2	6	1040642	1040647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422661
20511	NC_022118	AGG	2	6	1040753	1040758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422661
20512	NC_022118	TGC	2	6	1040774	1040779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422661
20513	NC_022118	AAAGA	2	10	1040802	1040811	80 %	0 %	20 %	0 %	532422661
20514	NC_022118	GAA	2	6	1040836	1040841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422661
20515	NC_022118	GAACA	2	10	1040916	1040925	60 %	0 %	20 %	20 %	532422661
20516	NC_022118	AG	3	6	1040946	1040951	50 %	0 %	50 %	0 %	532422661
20517	NC_022118	CTCC	2	8	1040953	1040960	0 %	25 %	0 %	75 %	532422661
20518	NC_022118	TGT	2	6	1040996	1041001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422661
20519	NC_022118	TTGC	2	8	1041079	1041086	0 %	50 %	25 %	25 %	532422661
20520	NC_022118	CAAG	2	8	1041106	1041113	50 %	0 %	25 %	25 %	532422661
20521	NC_022118	AG	6	12	1041112	1041123	50 %	0 %	50 %	0 %	532422661
20522	NC_022118	ACA	2	6	1041153	1041158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422661
20523	NC_022118	AG	3	6	1041197	1041202	50 %	0 %	50 %	0 %	532422661
20524	NC_022118	TAC	2	6	1041230	1041235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422661
20525	NC_022118	GCC	2	6	1041246	1041251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422661
20526	NC_022118	GAAA	2	8	1041276	1041283	75 %	0 %	25 %	0 %	532422661
20527	NC_022118	AGA	2	6	1041345	1041350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422661
20528	NC_022118	CTC	2	6	1041413	1041418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422661
20529	NC_022118	ATT	2	6	1041459	1041464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422661
20530	NC_022118	TGA	2	6	1041490	1041495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422661
20531	NC_022118	ATA	2	6	1041496	1041501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422661
20532	NC_022118	AAGGA	2	10	1041535	1041544	60 %	0 %	40 %	0 %	532422661
20533	NC_022118	TACA	2	8	1041648	1041655	50 %	25 %	0 %	25 %	532422661
20534	NC_022118	ATC	2	6	1041660	1041665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422661
20535	NC_022118	A	6	6	1041720	1041725	100 %	0 %	0 %	0 %	532422661
20536	NC_022118	GAC	2	6	1041732	1041737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422661
20537	NC_022118	GAG	2	6	1041756	1041761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422661
20538	NC_022118	AGC	2	6	1041816	1041821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422661
20539	NC_022118	ACA	2	6	1041828	1041833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422661
20540	NC_022118	AGA	2	6	1041881	1041886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422661

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.