MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20119	NC_022118	TTC	2	6	1022271	1022276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422654
20120	NC_022118	GAA	2	6	1022369	1022374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422654
20121	NC_022118	GATG	2	8	1022409	1022416	25 %	25 %	50 %	0 %	532422654
20122	NC_022118	ATT	2	6	1022430	1022435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422654
20123	NC_022118	ATG	2	6	1022532	1022537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422654
20124	NC_022118	GTT	2	6	1022540	1022545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422654
20125	NC_022118	TAT	2	6	1022613	1022618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422654
20126	NC_022118	GAAA	2	8	1022643	1022650	75 %	0 %	25 %	0 %	532422654
20127	NC_022118	G	6	6	1022662	1022667	0 %	0 %	100 %	0 %	532422654
20128	NC_022118	GA	3	6	1022683	1022688	50 %	0 %	50 %	0 %	532422654
20129	NC_022118	ATT	2	6	1022719	1022724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422654
20130	NC_022118	ATC	2	6	1022736	1022741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422654
20131	NC_022118	CTC	2	6	1022821	1022826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422654
20132	NC_022118	GTT	2	6	1022864	1022869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422654
20133	NC_022118	GCTTT	2	10	1022906	1022915	0 %	60 %	20 %	20 %	532422654
20134	NC_022118	CAT	2	6	1022921	1022926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422654
20135	NC_022118	TTAC	2	8	1022950	1022957	25 %	50 %	0 %	25 %	532422654
20136	NC_022118	TGA	2	6	1022991	1022996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422654
20137	NC_022118	AG	5	10	1023076	1023085	50 %	0 %	50 %	0 %	532422654
20138	NC_022118	GAT	2	6	1023107	1023112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422654
20139	NC_022118	CTG	2	6	1023127	1023132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422654
20140	NC_022118	CCT	2	6	1023152	1023157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422654
20141	NC_022118	TC	3	6	1023288	1023293	0 %	50 %	0 %	50 %	532422655
20142	NC_022118	TTC	2	6	1023447	1023452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422655
20143	NC_022118	CTT	2	6	1023473	1023478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422655
20144	NC_022118	GATA	2	8	1023482	1023489	50 %	25 %	25 %	0 %	532422655
20145	NC_022118	GGC	2	6	1023501	1023506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422655
20146	NC_022118	TGT	2	6	1023532	1023537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422655
20147	NC_022118	TA	3	6	1023546	1023551	50 %	50 %	0 %	0 %	532422655
20148	NC_022118	GAA	2	6	1023567	1023572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422655
20149	NC_022118	CTT	2	6	1023671	1023676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422655
20150	NC_022118	CAG	2	6	1023683	1023688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422655
20151	NC_022118	GTC	2	6	1023737	1023742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422655
20152	NC_022118	GGA	2	6	1023766	1023771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422655
20153	NC_022118	AT	3	6	1023838	1023843	50 %	50 %	0 %	0 %	532422655
20154	NC_022118	TGTT	2	8	1023901	1023908	0 %	75 %	25 %	0 %	532422655
20155	NC_022118	AGG	2	6	1023960	1023965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422655
20156	NC_022118	GTT	2	6	1023986	1023991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422655
20157	NC_022118	TTGC	2	8	1024004	1024011	0 %	50 %	25 %	25 %	532422655
20158	NC_022118	ATG	2	6	1024111	1024116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422655
20159	NC_022118	AAG	2	6	1024139	1024144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422655
20160	NC_022118	GGA	2	6	1024201	1024206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422655
20161	NC_022118	ATA	2	6	1024222	1024227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422655
20162	NC_022118	TTA	2	6	1024238	1024243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422655
20163	NC_022118	AAT	2	6	1024252	1024257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422655
20164	NC_022118	TC	3	6	1024573	1024578	0 %	50 %	0 %	50 %	532422656
20165	NC_022118	CCT	2	6	1024643	1024648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422656
20166	NC_022118	TGC	2	6	1024650	1024655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422656
20167	NC_022118	GTT	2	6	1024706	1024711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422656
20168	NC_022118	TCT	2	6	1024741	1024746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422656
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20172	NC_022118	GTT	2	6	1024930	1024935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422656
20173	NC_022118	GGC	2	6	1024946	1024951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422656
20174	NC_022118	CAG	2	6	1024969	1024974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422656
20175	NC_022118	AG	3	6	1024981	1024986	50 %	0 %	50 %	0 %	532422656
20176	NC_022118	T	6	6	1025016	1025021	0 %	100 %	0 %	0 %	532422656
20177	NC_022118	TCT	2	6	1025023	1025028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422656
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20180	NC_022118	AAT	2	6	1025136	1025141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422656
20181	NC_022118	GAT	2	6	1025172	1025177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422656
20182	NC_022118	TCG	2	6	1025181	1025186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422656
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20184	NC_022118	TCT	2	6	1025242	1025247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422656
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20187	NC_022118	G	8	8	1025371	1025378	0 %	0 %	100 %	0 %	532422656
20188	NC_022118	AGG	2	6	1025403	1025408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422656
20189	NC_022118	TAG	2	6	1025450	1025455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422656
20190	NC_022118	GCA	2	6	1025469	1025474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422656
20191	NC_022118	AATC	2	8	1025517	1025524	50 %	25 %	0 %	25 %	532422656
20192	NC_022118	AAC	3	9	1025532	1025540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422656
20193	NC_022118	AAG	2	6	1025541	1025546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422656
20194	NC_022118	TTC	2	6	1025595	1025600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422656
20195	NC_022118	CGA	2	6	1025619	1025624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422656
20196	NC_022118	GAG	2	6	1025630	1025635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422656
20197	NC_022118	CTT	2	6	1025646	1025651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422656
20198	NC_022118	AGTTG	2	10	1025655	1025664	20 %	40 %	40 %	0 %	532422656
20199	NC_022118	ACA	2	6	1025672	1025677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422656
20200	NC_022118	TTAA	2	8	1025691	1025698	50 %	50 %	0 %	0 %	532422656
20201	NC_022118	AAAG	2	8	1025705	1025712	75 %	0 %	25 %	0 %	532422656
20202	NC_022118	AT	3	6	1025714	1025719	50 %	50 %	0 %	0 %	532422656
20203	NC_022118	AATA	2	8	1026236	1026243	75 %	25 %	0 %	0 %	532422657
20204	NC_022118	A	6	6	1026309	1026314	100 %	0 %	0 %	0 %	532422657
20205	NC_022118	CTT	2	6	1026443	1026448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422657
20206	NC_022118	AGA	2	6	1026489	1026494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422657
20207	NC_022118	GTT	2	6	1026498	1026503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422657
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20209	NC_022118	CTGA	2	8	1026537	1026544	25 %	25 %	25 %	25 %	532422657
20210	NC_022118	GT	4	8	1026559	1026566	0 %	50 %	50 %	0 %	532422657
20211	NC_022118	ATC	2	6	1026577	1026582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422657
20212	NC_022118	GAT	2	6	1026620	1026625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422657
20213	NC_022118	CAT	2	6	1026648	1026653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422657
20214	NC_022118	TCC	3	9	1026660	1026668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422657
20215	NC_022118	T	6	6	1026715	1026720	0 %	100 %	0 %	0 %	532422657
20216	NC_022118	AGC	2	6	1026736	1026741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422657
20217	NC_022118	TAG	2	6	1026819	1026824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422657
20218	NC_022118	TTG	2	6	1026866	1026871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422657
20219	NC_022118	CCAT	2	8	1026930	1026937	25 %	25 %	0 %	50 %	532422657
20220	NC_022118	ATAG	2	8	1027006	1027013	50 %	25 %	25 %	0 %	532422657
20221	NC_022118	TGA	2	6	1027023	1027028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422657
20222	NC_022118	TCA	2	6	1027075	1027080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422657
20223	NC_022118	TGAG	2	8	1027082	1027089	25 %	25 %	50 %	0 %	532422657
20224	NC_022118	CTG	2	6	1027127	1027132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422657
20225	NC_022118	CAC	2	6	1027184	1027189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422657
20226	NC_022118	GAA	2	6	1027201	1027206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422657
20227	NC_022118	ACA	2	6	1027306	1027311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422657
20228	NC_022118	TG	3	6	1027321	1027326	0 %	50 %	50 %	0 %	532422657
20229	NC_022118	TTTG	2	8	1027402	1027409	0 %	75 %	25 %	0 %	532422657
20230	NC_022118	TGA	2	6	1027420	1027425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422657
20231	NC_022118	TAC	2	6	1027458	1027463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422657
20232	NC_022118	A	6	6	1027535	1027540	100 %	0 %	0 %	0 %	532422657
20233	NC_022118	TCT	2	6	1027608	1027613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422657
20234	NC_022118	AGG	2	6	1027614	1027619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422657
20235	NC_022118	ATA	2	6	1027681	1027686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422657
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20355	NC_022118	CGA	2	6	1032479	1032484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422659
20356	NC_022118	TATT	2	8	1032510	1032517	25 %	75 %	0 %	0 %	532422659
20357	NC_022118	AAT	2	6	1032541	1032546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422659
20358	NC_022118	AGT	2	6	1032684	1032689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422659
20359	NC_022118	TGC	2	6	1032768	1032773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422659
20360	NC_022118	GCA	2	6	1032786	1032791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422659
20361	NC_022118	TCA	2	6	1032799	1032804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422659
20362	NC_022118	AGA	2	6	1032816	1032821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422659
20363	NC_022118	AGT	2	6	1032825	1032830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422659
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20366	NC_022118	CAA	2	6	1032945	1032950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422659
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20368	NC_022118	CAAC	2	8	1032982	1032989	50 %	0 %	0 %	50 %	532422659
20369	NC_022118	GGA	2	6	1033030	1033035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422659
20370	NC_022118	TCT	2	6	1033040	1033045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422659
20371	NC_022118	AGC	2	6	1033062	1033067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422659
20372	NC_022118	AGT	2	6	1033110	1033115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422659
20373	NC_022118	TAG	2	6	1033122	1033127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422659
20374	NC_022118	GCT	2	6	1033135	1033140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422659
20375	NC_022118	ATG	2	6	1033220	1033225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422659
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20377	NC_022118	CTG	2	6	1033268	1033273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422659
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20381	NC_022118	CCAG	2	8	1033464	1033471	25 %	0 %	25 %	50 %	532422659
20382	NC_022118	AAGG	2	8	1033577	1033584	50 %	0 %	50 %	0 %	532422659
20383	NC_022118	TTC	2	6	1033589	1033594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422659
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20387	NC_022118	TCTT	2	8	1033749	1033756	0 %	75 %	0 %	25 %	532422659
20388	NC_022118	TCC	2	6	1033785	1033790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422659
20389	NC_022118	TCC	2	6	1033797	1033802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422659
20390	NC_022118	CTG	2	6	1033841	1033846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422659
20391	NC_022118	T	6	6	1033873	1033878	0 %	100 %	0 %	0 %	532422659
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20406	NC_022118	TAA	2	6	1034808	1034813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422659
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20423	NC_022118	GTAATA	2	12	1035737	1035748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532422660
20424	NC_022118	ACA	2	6	1035781	1035786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422660
20425	NC_022118	TTTC	2	8	1035821	1035828	0 %	75 %	0 %	25 %	532422660
20426	NC_022118	CCT	2	6	1035842	1035847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422660
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20431	NC_022118	TGC	2	6	1035948	1035953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422660
20432	NC_022118	AGG	2	6	1035981	1035986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422660
20433	NC_022118	GGA	2	6	1035991	1035996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422660
20434	NC_022118	GAT	2	6	1036012	1036017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422660
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20441	NC_022118	AGG	2	6	1036242	1036247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422660
20442	NC_022118	GTGA	2	8	1036258	1036265	25 %	25 %	50 %	0 %	532422660
20443	NC_022118	T	6	6	1036322	1036327	0 %	100 %	0 %	0 %	532422660
20444	NC_022118	AGCGC	2	10	1036358	1036367	20 %	0 %	40 %	40 %	532422660
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20450	NC_022118	AGG	2	6	1036632	1036637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422660
20451	NC_022118	GTTG	2	8	1036641	1036648	0 %	50 %	50 %	0 %	532422660
20452	NC_022118	ACT	2	6	1036669	1036674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422660
20453	NC_022118	TGC	2	6	1036743	1036748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422660
20454	NC_022118	ATA	2	6	1036751	1036756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422660
20455	NC_022118	GATT	2	8	1036785	1036792	25 %	50 %	25 %	0 %	532422660
20456	NC_022118	TCT	2	6	1036957	1036962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422660
20457	NC_022118	AGT	2	6	1036963	1036968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422660
20458	NC_022118	A	6	6	1036986	1036991	100 %	0 %	0 %	0 %	532422660
20459	NC_022118	ATG	2	6	1037006	1037011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422660
20460	NC_022118	CCT	2	6	1037098	1037103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422660
20461	NC_022118	CT	3	6	1037199	1037204	0 %	50 %	0 %	50 %	532422660
20462	NC_022118	GAT	2	6	1037329	1037334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422660
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20464	NC_022118	GAA	2	6	1037501	1037506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422660
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20467	NC_022118	GGA	2	6	1037758	1037763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422660
20468	NC_022118	TCGC	2	8	1037807	1037814	0 %	25 %	25 %	50 %	532422660
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20470	NC_022118	TCC	2	6	1037883	1037888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422660
20471	NC_022118	ATT	2	6	1037959	1037964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422660
20472	NC_022118	CTT	3	9	1038015	1038023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422660
20473	NC_022118	TCA	2	6	1038048	1038053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422660
20474	NC_022118	TCG	3	9	1038090	1038098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422660
20475	NC_022118	TTA	2	6	1038518	1038523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422752
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20477	NC_022118	TCA	2	6	1038730	1038735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422753
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20479	NC_022118	TGT	2	6	1038776	1038781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422753
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20482	NC_022118	GA	3	6	1038919	1038924	50 %	0 %	50 %	0 %	532422753
20483	NC_022118	AG	3	6	1038942	1038947	50 %	0 %	50 %	0 %	532422753
20484	NC_022118	TAG	2	6	1039465	1039470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422661
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20486	NC_022118	T	8	8	1039488	1039495	0 %	100 %	0 %	0 %	532422661
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20490	NC_022118	AG	3	6	1039795	1039800	50 %	0 %	50 %	0 %	532422661
20491	NC_022118	TA	3	6	1039827	1039832	50 %	50 %	0 %	0 %	532422661
20492	NC_022118	TAA	2	6	1039853	1039858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422661
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20494	NC_022118	ATG	2	6	1039959	1039964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422661
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20499	NC_022118	ATC	2	6	1040071	1040076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422661
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