MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_022118	ATT	2	6	991370	991375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422630
19502	NC_022118	CTG	2	6	991382	991387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422630
19503	NC_022118	GC	3	6	991460	991465	0 %	0 %	50 %	50 %	532422630
19504	NC_022118	ACAAA	2	10	991480	991489	80 %	0 %	0 %	20 %	532422630
19505	NC_022118	AGA	2	6	991528	991533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422630
19506	NC_022118	GAA	2	6	991558	991563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422630
19507	NC_022118	CTA	2	6	991566	991571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422630
19508	NC_022118	G	6	6	991586	991591	0 %	0 %	100 %	0 %	532422630
19509	NC_022118	TTC	2	6	991608	991613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422630
19510	NC_022118	CAGGGA	2	12	991626	991637	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532422630
19511	NC_022118	TCT	2	6	991683	991688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422630
19512	NC_022118	TGTT	2	8	991716	991723	0 %	75 %	25 %	0 %	532422630
19513	NC_022118	TGA	2	6	991795	991800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422630
19514	NC_022118	GTG	2	6	991824	991829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422630
19515	NC_022118	GGT	2	6	991841	991846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422630
19516	NC_022118	GA	4	8	991853	991860	50 %	0 %	50 %	0 %	532422630
19517	NC_022118	TAG	2	6	991881	991886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422630
19518	NC_022118	ATGG	2	8	991889	991896	25 %	25 %	50 %	0 %	532422630
19519	NC_022118	GCT	2	6	991928	991933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422630
19520	NC_022118	CCGG	2	8	991939	991946	0 %	0 %	50 %	50 %	532422630
19521	NC_022118	TTG	2	6	991964	991969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422630
19522	NC_022118	TCG	2	6	991987	991992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422630
19523	NC_022118	TGT	3	9	991993	992001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422630
19524	NC_022118	TCT	2	6	992133	992138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422630
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19529	NC_022118	GATG	2	8	992250	992257	25 %	25 %	50 %	0 %	532422630
19530	NC_022118	A	7	7	992266	992272	100 %	0 %	0 %	0 %	532422630
19531	NC_022118	ATT	2	6	992350	992355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422630
19532	NC_022118	A	7	7	992396	992402	100 %	0 %	0 %	0 %	532422630
19533	NC_022118	GAA	2	6	992418	992423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422630
19534	NC_022118	TGC	2	6	992463	992468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422630
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19537	NC_022118	A	7	7	992639	992645	100 %	0 %	0 %	0 %	532422630
19538	NC_022118	TGC	2	6	992700	992705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422630
19539	NC_022118	CAT	2	6	992724	992729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422630
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19542	NC_022118	AAG	2	6	992878	992883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422630
19543	NC_022118	CCG	2	6	992902	992907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422630
19544	NC_022118	CCT	2	6	992908	992913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422630
19545	NC_022118	GA	3	6	992985	992990	50 %	0 %	50 %	0 %	532422630
19546	NC_022118	TTA	2	6	992997	993002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422630
19547	NC_022118	CTT	2	6	993261	993266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422631
19548	NC_022118	CTT	2	6	993327	993332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422631
19549	NC_022118	GGA	2	6	993339	993344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422631
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19552	NC_022118	GAT	2	6	993804	993809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422631
19553	NC_022118	GAT	2	6	993835	993840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422631
19554	NC_022118	GGA	2	6	993949	993954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422631
19555	NC_022118	GAA	2	6	994020	994025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422631
19556	NC_022118	AGG	2	6	994114	994119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422631
19557	NC_022118	GAA	2	6	994120	994125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422631
19558	NC_022118	TAGA	2	8	994132	994139	50 %	25 %	25 %	0 %	532422631
19559	NC_022118	AGCG	2	8	994140	994147	25 %	0 %	50 %	25 %	532422631
19560	NC_022118	CTCCAT	2	12	994149	994160	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532422631
19561	NC_022118	TC	3	6	994224	994229	0 %	50 %	0 %	50 %	532422631
19562	NC_022118	GT	3	6	994252	994257	0 %	50 %	50 %	0 %	532422631
19563	NC_022118	GAA	2	6	994263	994268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422631
19564	NC_022118	TGG	2	6	994302	994307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422631
19565	NC_022118	CAA	2	6	994393	994398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422631
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19568	NC_022118	TAA	2	6	994518	994523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422631
19569	NC_022118	TCT	2	6	994547	994552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422631
19570	NC_022118	TTTG	2	8	994581	994588	0 %	75 %	25 %	0 %	532422631
19571	NC_022118	TA	3	6	994633	994638	50 %	50 %	0 %	0 %	532422631
19572	NC_022118	TCC	2	6	994792	994797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422631
19573	NC_022118	CGT	2	6	994905	994910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422631
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19582	NC_022118	CTGGC	2	10	995183	995192	0 %	20 %	40 %	40 %	532422631
19583	NC_022118	TCAGTA	2	12	995337	995348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532422632
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19585	NC_022118	CTA	2	6	995383	995388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422632
19586	NC_022118	TCAG	2	8	995463	995470	25 %	25 %	25 %	25 %	532422632
19587	NC_022118	T	6	6	995522	995527	0 %	100 %	0 %	0 %	532422632
19588	NC_022118	TCT	2	6	995535	995540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422632
19589	NC_022118	A	6	6	995583	995588	100 %	0 %	0 %	0 %	532422632
19590	NC_022118	GAA	2	6	995818	995823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422633
19591	NC_022118	GTTG	2	8	995870	995877	0 %	50 %	50 %	0 %	532422633
19592	NC_022118	ATC	2	6	995879	995884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422633
19593	NC_022118	ATC	2	6	995900	995905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422633
19594	NC_022118	ATA	2	6	995916	995921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422633
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19597	NC_022118	G	6	6	996093	996098	0 %	0 %	100 %	0 %	532422633
19598	NC_022118	GGAG	2	8	996122	996129	25 %	0 %	75 %	0 %	532422633
19599	NC_022118	T	7	7	996141	996147	0 %	100 %	0 %	0 %	532422633
19600	NC_022118	GTT	2	6	996177	996182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422633
19601	NC_022118	T	8	8	996224	996231	0 %	100 %	0 %	0 %	532422633
19602	NC_022118	AGAGA	2	10	996232	996241	60 %	0 %	40 %	0 %	532422633
19603	NC_022118	GAAG	2	8	996254	996261	50 %	0 %	50 %	0 %	532422633
19604	NC_022118	TA	3	6	996286	996291	50 %	50 %	0 %	0 %	532422633
19605	NC_022118	GAC	2	6	996323	996328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422634
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19607	NC_022118	GAG	2	6	996387	996392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422634
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19609	NC_022118	GAA	2	6	996411	996416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422634
19610	NC_022118	GA	3	6	996436	996441	50 %	0 %	50 %	0 %	532422634
19611	NC_022118	T	8	8	996461	996468	0 %	100 %	0 %	0 %	532422634
19612	NC_022118	AGA	2	6	996476	996481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422634
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19615	NC_022118	GGA	2	6	996636	996641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422635
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19617	NC_022118	GAA	2	6	996760	996765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422635
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19622	NC_022118	A	7	7	997075	997081	100 %	0 %	0 %	0 %	532422635
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19975	NC_022118	CAAGC	2	10	1014670	1014679	40 %	0 %	20 %	40 %	532422750
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19977	NC_022118	ATG	2	6	1014959	1014964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422750
19978	NC_022118	GAT	2	6	1014994	1014999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422750
19979	NC_022118	CGA	2	6	1015005	1015010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422750
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19981	NC_022118	AGA	2	6	1015194	1015199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422750
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19983	NC_022118	ATG	2	6	1015217	1015222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422750
19984	NC_022118	AAC	2	6	1015228	1015233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422750
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19990	NC_022118	CTAT	2	8	1015454	1015461	25 %	50 %	0 %	25 %	532422750
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19994	NC_022118	GAA	2	6	1015565	1015570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422750
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20000	NC_022118	TCTG	2	8	1015883	1015890	0 %	50 %	25 %	25 %	532422750

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