MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_022118	TAA	2	6	964927	964932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422610
19003	NC_022118	AGA	2	6	964936	964941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422610
19004	NC_022118	T	8	8	964947	964954	0 %	100 %	0 %	0 %	532422610
19005	NC_022118	AG	3	6	964958	964963	50 %	0 %	50 %	0 %	532422610
19006	NC_022118	GTTT	2	8	964968	964975	0 %	75 %	25 %	0 %	532422610
19007	NC_022118	TTGA	2	8	965006	965013	25 %	50 %	25 %	0 %	532422610
19008	NC_022118	AAT	2	6	965023	965028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422610
19009	NC_022118	C	6	6	965119	965124	0 %	0 %	0 %	100 %	532422611
19010	NC_022118	GGA	2	6	965215	965220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422611
19011	NC_022118	A	6	6	965226	965231	100 %	0 %	0 %	0 %	532422611
19012	NC_022118	GGT	2	6	965238	965243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422611
19013	NC_022118	TTA	2	6	965266	965271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422611
19014	NC_022118	GCA	2	6	965272	965277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422611
19015	NC_022118	CAG	2	6	965318	965323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422611
19016	NC_022118	TAA	2	6	965340	965345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422611
19017	NC_022118	TAG	2	6	965363	965368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422611
19018	NC_022118	TAT	2	6	965383	965388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422611
19019	NC_022118	AGG	2	6	965445	965450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422611
19020	NC_022118	AGC	2	6	965477	965482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422611
19021	NC_022118	GCT	2	6	965490	965495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422611
19022	NC_022118	CTT	2	6	965510	965515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422611
19023	NC_022118	TTA	2	6	965611	965616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422611
19024	NC_022118	CTT	2	6	965639	965644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422611
19025	NC_022118	TACT	2	8	965666	965673	25 %	50 %	0 %	25 %	532422611
19026	NC_022118	TGA	2	6	965715	965720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422611
19027	NC_022118	CTG	2	6	965906	965911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422611
19028	NC_022118	AGG	2	6	965928	965933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422611
19029	NC_022118	AAG	2	6	965957	965962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422611
19030	NC_022118	G	6	6	966019	966024	0 %	0 %	100 %	0 %	532422611
19031	NC_022118	GTC	2	6	966040	966045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422611
19032	NC_022118	AGAA	2	8	966077	966084	75 %	0 %	25 %	0 %	532422611
19033	NC_022118	AAAGG	2	10	966127	966136	60 %	0 %	40 %	0 %	532422611
19034	NC_022118	ATT	2	6	966142	966147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422611
19035	NC_022118	GA	3	6	966227	966232	50 %	0 %	50 %	0 %	532422611
19036	NC_022118	ATT	2	6	966245	966250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422611
19037	NC_022118	ATT	2	6	966267	966272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422612
19038	NC_022118	GGA	2	6	966345	966350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422612
19039	NC_022118	AAGC	2	8	966417	966424	50 %	0 %	25 %	25 %	532422612
19040	NC_022118	GAT	2	6	966443	966448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422612
19041	NC_022118	CAT	2	6	966644	966649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422612
19042	NC_022118	AAAG	2	8	966736	966743	75 %	0 %	25 %	0 %	532422612
19043	NC_022118	GT	4	8	966754	966761	0 %	50 %	50 %	0 %	532422612
19044	NC_022118	GA	3	6	966859	966864	50 %	0 %	50 %	0 %	532422612
19045	NC_022118	TGG	2	6	966866	966871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422612
19046	NC_022118	TAG	2	6	966911	966916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422612
19047	NC_022118	TAT	2	6	966986	966991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422612
19048	NC_022118	AAG	2	6	967024	967029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422612
19049	NC_022118	CAGG	2	8	967038	967045	25 %	0 %	50 %	25 %	532422612
19050	NC_022118	T	6	6	967113	967118	0 %	100 %	0 %	0 %	532422612
19051	NC_022118	ATC	2	6	967129	967134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422612
19052	NC_022118	AGT	2	6	967137	967142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422612
19053	NC_022118	AAAG	2	8	967324	967331	75 %	0 %	25 %	0 %	532422613
19054	NC_022118	AAG	2	6	967386	967391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422613
19055	NC_022118	AAG	2	6	967401	967406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422613
19056	NC_022118	GCT	2	6	967430	967435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422613
19057	NC_022118	TA	4	8	967455	967462	50 %	50 %	0 %	0 %	532422613
19058	NC_022118	ATT	2	6	967539	967544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422613
19059	NC_022118	T	6	6	967556	967561	0 %	100 %	0 %	0 %	532422613
19060	NC_022118	T	6	6	967568	967573	0 %	100 %	0 %	0 %	532422613
19061	NC_022118	AG	3	6	967589	967594	50 %	0 %	50 %	0 %	532422613
19062	NC_022118	CAG	2	6	967595	967600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422613
19063	NC_022118	GCA	2	6	967606	967611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422613
19064	NC_022118	TGT	2	6	967660	967665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422613
19065	NC_022118	CAT	2	6	967673	967678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422613
19066	NC_022118	ACG	2	6	967716	967721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422613
19067	NC_022118	GCTATT	2	12	967850	967861	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532422613
19068	NC_022118	GCAA	2	8	967879	967886	50 %	0 %	25 %	25 %	532422613
19069	NC_022118	GAA	2	6	967917	967922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422613
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19072	NC_022118	TGT	2	6	968236	968241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422613
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19077	NC_022118	TGCGT	2	10	968326	968335	0 %	40 %	40 %	20 %	532422613
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19085	NC_022118	AGT	2	6	968739	968744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422613
19086	NC_022118	CTAGT	2	10	968767	968776	20 %	40 %	20 %	20 %	532422613
19087	NC_022118	ATG	2	6	969054	969059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422614
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19089	NC_022118	AGTGG	2	10	969123	969132	20 %	20 %	60 %	0 %	532422614
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19093	NC_022118	GTT	2	6	969335	969340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422614
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19096	NC_022118	TC	3	6	969398	969403	0 %	50 %	0 %	50 %	532422614
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19099	NC_022118	GAG	2	6	969520	969525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422614
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19101	NC_022118	TCT	2	6	969833	969838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422614
19102	NC_022118	TA	3	6	969967	969972	50 %	50 %	0 %	0 %	532422614
19103	NC_022118	TTGT	2	8	969973	969980	0 %	75 %	25 %	0 %	532422614
19104	NC_022118	AAGG	2	8	970106	970113	50 %	0 %	50 %	0 %	532422614
19105	NC_022118	TATTC	2	10	970125	970134	20 %	60 %	0 %	20 %	532422614
19106	NC_022118	CTA	2	6	970167	970172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422614
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19108	NC_022118	TTTG	2	8	970217	970224	0 %	75 %	25 %	0 %	532422614
19109	NC_022118	GA	3	6	970234	970239	50 %	0 %	50 %	0 %	532422614
19110	NC_022118	AGA	2	6	970355	970360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422614
19111	NC_022118	AC	3	6	970373	970378	50 %	0 %	0 %	50 %	532422614
19112	NC_022118	CAAATG	2	12	970383	970394	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532422614
19113	NC_022118	GAA	2	6	970401	970406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422614
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19115	NC_022118	AAG	3	9	970456	970464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422614
19116	NC_022118	TTCC	2	8	970504	970511	0 %	50 %	0 %	50 %	532422614
19117	NC_022118	AGAA	2	8	970534	970541	75 %	0 %	25 %	0 %	532422614
19118	NC_022118	TTC	2	6	970561	970566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422614
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19121	NC_022118	TGG	2	6	970736	970741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422614
19122	NC_022118	TTCTC	2	10	970761	970770	0 %	60 %	0 %	40 %	532422614
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19231	NC_022118	GA	3	6	976450	976455	50 %	0 %	50 %	0 %	532422617
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19239	NC_022118	CAA	2	6	976780	976785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422617
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19355	NC_022118	AGCAC	2	10	982625	982634	40 %	0 %	20 %	40 %	532422622
19356	NC_022118	TTAAGC	2	12	982654	982665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532422622
19357	NC_022118	GAT	2	6	982674	982679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422622
19358	NC_022118	AAAGC	2	10	982695	982704	60 %	0 %	20 %	20 %	532422622
19359	NC_022118	TAAAG	2	10	982733	982742	60 %	20 %	20 %	0 %	532422622
19360	NC_022118	TTG	2	6	982837	982842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422622
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