MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022118	ATTC	2	8	889297	889304	25 %	50 %	0 %	25 %	532422550
17502	NC_022118	TTA	2	6	889316	889321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422550
17503	NC_022118	TGCC	2	8	889346	889353	0 %	25 %	25 %	50 %	532422550
17504	NC_022118	TAT	2	6	889386	889391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422550
17505	NC_022118	AGTC	2	8	889447	889454	25 %	25 %	25 %	25 %	532422550
17506	NC_022118	TGCC	2	8	889463	889470	0 %	25 %	25 %	50 %	532422550
17507	NC_022118	ATG	2	6	889514	889519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422550
17508	NC_022118	GCT	2	6	889549	889554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422550
17509	NC_022118	CTGTTC	2	12	889562	889573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532422550
17510	NC_022118	CAT	2	6	889683	889688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422550
17511	NC_022118	T	6	6	889690	889695	0 %	100 %	0 %	0 %	532422550
17512	NC_022118	GA	3	6	889700	889705	50 %	0 %	50 %	0 %	532422550
17513	NC_022118	TGT	2	6	889815	889820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422550
17514	NC_022118	GTT	2	6	889821	889826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422550
17515	NC_022118	TTA	2	6	889858	889863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422550
17516	NC_022118	TAGAA	2	10	889907	889916	60 %	20 %	20 %	0 %	532422550
17517	NC_022118	T	6	6	890075	890080	0 %	100 %	0 %	0 %	532422551
17518	NC_022118	T	7	7	890085	890091	0 %	100 %	0 %	0 %	532422551
17519	NC_022118	A	7	7	890116	890122	100 %	0 %	0 %	0 %	532422551
17520	NC_022118	AGA	2	6	890167	890172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422551
17521	NC_022118	AT	3	6	890191	890196	50 %	50 %	0 %	0 %	532422551
17522	NC_022118	GTTTTT	2	12	890216	890227	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	532422551
17523	NC_022118	CTATT	2	10	890295	890304	20 %	60 %	0 %	20 %	532422551
17524	NC_022118	GAT	2	6	890327	890332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422551
17525	NC_022118	GGC	2	6	890404	890409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422551
17526	NC_022118	TTC	2	6	890418	890423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422551
17527	NC_022118	TAT	2	6	890425	890430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422551
17528	NC_022118	AAAG	2	8	890441	890448	75 %	0 %	25 %	0 %	532422551
17529	NC_022118	CAT	2	6	890495	890500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422551
17530	NC_022118	TGG	2	6	890501	890506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422551
17531	NC_022118	TTG	2	6	890544	890549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422551
17532	NC_022118	TGGAT	2	10	890578	890587	20 %	40 %	40 %	0 %	532422551
17533	NC_022118	TGT	2	6	890672	890677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422551
17534	NC_022118	TTC	2	6	890679	890684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422551
17535	NC_022118	ACA	2	6	890724	890729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422551
17536	NC_022118	TG	3	6	890793	890798	0 %	50 %	50 %	0 %	532422551
17537	NC_022118	TAT	2	6	890802	890807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422551
17538	NC_022118	TCT	2	6	890821	890826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422551
17539	NC_022118	GGGA	2	8	890836	890843	25 %	0 %	75 %	0 %	532422551
17540	NC_022118	AAGA	2	8	890896	890903	75 %	0 %	25 %	0 %	532422551
17541	NC_022118	TCTT	2	8	890910	890917	0 %	75 %	0 %	25 %	532422551
17542	NC_022118	CAT	2	6	890933	890938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422551
17543	NC_022118	GTA	2	6	891005	891010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422551
17544	NC_022118	GTGTAT	2	12	891128	891139	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532422552
17545	NC_022118	TGT	2	6	891234	891239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422552
17546	NC_022118	AG	3	6	891352	891357	50 %	0 %	50 %	0 %	532422552
17547	NC_022118	ATT	2	6	891399	891404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422552
17548	NC_022118	TTG	2	6	891503	891508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422552
17549	NC_022118	ATCCT	2	10	891543	891552	20 %	40 %	0 %	40 %	532422552
17550	NC_022118	GGA	2	6	891562	891567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422552
17551	NC_022118	CAAGC	2	10	891628	891637	40 %	0 %	20 %	40 %	532422552
17552	NC_022118	TATG	2	8	891650	891657	25 %	50 %	25 %	0 %	532422552
17553	NC_022118	AGA	2	6	891714	891719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422552
17554	NC_022118	TTA	2	6	891739	891744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422552
17555	NC_022118	AAAG	2	8	891748	891755	75 %	0 %	25 %	0 %	532422552
17556	NC_022118	ACT	2	6	891791	891796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422552
17557	NC_022118	TGCT	2	8	891809	891816	0 %	50 %	25 %	25 %	532422552
17558	NC_022118	CCT	2	6	891877	891882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422552
17559	NC_022118	GGA	2	6	892006	892011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422552
17560	NC_022118	CTT	2	6	892039	892044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422552
17561	NC_022118	AGA	2	6	892116	892121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422552
17562	NC_022118	AGCA	2	8	892175	892182	50 %	0 %	25 %	25 %	532422552
17563	NC_022118	TGT	2	6	892202	892207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422552
17564	NC_022118	TTGG	2	8	892273	892280	0 %	50 %	50 %	0 %	532422552
17565	NC_022118	GAT	2	6	892316	892321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422552
17566	NC_022118	CTG	2	6	892330	892335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422552
17567	NC_022118	CG	3	6	892370	892375	0 %	0 %	50 %	50 %	532422553
17568	NC_022118	GTT	2	6	892443	892448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422553
17569	NC_022118	TGC	2	6	892535	892540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422553
17570	NC_022118	CGA	2	6	892621	892626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422553
17571	NC_022118	GTA	2	6	892665	892670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422553
17572	NC_022118	AAGG	2	8	892899	892906	50 %	0 %	50 %	0 %	532422553
17573	NC_022118	CATTG	2	10	892922	892931	20 %	40 %	20 %	20 %	532422553
17574	NC_022118	GTT	2	6	892955	892960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422553
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17577	NC_022118	TCA	2	6	893115	893120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422554
17578	NC_022118	GTA	2	6	893149	893154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422554
17579	NC_022118	CA	3	6	893155	893160	50 %	0 %	0 %	50 %	532422554
17580	NC_022118	AAC	2	6	893420	893425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422554
17581	NC_022118	GTA	2	6	893440	893445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422554
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17590	NC_022118	ATT	2	6	893967	893972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422554
17591	NC_022118	TTA	2	6	893986	893991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422554
17592	NC_022118	GTT	2	6	894000	894005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422554
17593	NC_022118	T	6	6	894042	894047	0 %	100 %	0 %	0 %	532422554
17594	NC_022118	TG	3	6	894079	894084	0 %	50 %	50 %	0 %	532422554
17595	NC_022118	TGA	2	6	894110	894115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422554
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17597	NC_022118	GTGG	2	8	894142	894149	0 %	25 %	75 %	0 %	532422554
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17600	NC_022118	AG	3	6	894184	894189	50 %	0 %	50 %	0 %	532422554
17601	NC_022118	T	6	6	894243	894248	0 %	100 %	0 %	0 %	532422735
17602	NC_022118	GAT	2	6	894253	894258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422735
17603	NC_022118	TA	3	6	894341	894346	50 %	50 %	0 %	0 %	532422735
17604	NC_022118	TGCT	2	8	894434	894441	0 %	50 %	25 %	25 %	532422735
17605	NC_022118	AAG	2	6	894447	894452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422735
17606	NC_022118	GCA	3	9	894547	894555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422735
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17608	NC_022118	TG	3	6	894649	894654	0 %	50 %	50 %	0 %	532422735
17609	NC_022118	AGG	2	6	894657	894662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422735
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17611	NC_022118	TCA	2	6	894744	894749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422735
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17613	NC_022118	TAC	2	6	894851	894856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422735
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17615	NC_022118	TGCC	2	8	894923	894930	0 %	25 %	25 %	50 %	532422735
17616	NC_022118	AAG	2	6	894965	894970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422735
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