MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_022118	AGAAA	2	10	853353	853362	80 %	0 %	20 %	0 %	532422533
17003	NC_022118	TA	3	6	853408	853413	50 %	50 %	0 %	0 %	532422533
17004	NC_022118	AAG	2	6	853416	853421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422533
17005	NC_022118	TG	3	6	853458	853463	0 %	50 %	50 %	0 %	532422533
17006	NC_022118	GGCTAG	2	12	853511	853522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532422533
17007	NC_022118	GAGAAA	2	12	853558	853569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422533
17008	NC_022118	GCTT	2	8	853571	853578	0 %	50 %	25 %	25 %	532422533
17009	NC_022118	CT	4	8	853603	853610	0 %	50 %	0 %	50 %	532422533
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17011	NC_022118	A	8	8	854009	854016	100 %	0 %	0 %	0 %	532422732
17012	NC_022118	A	7	7	854018	854024	100 %	0 %	0 %	0 %	532422732
17013	NC_022118	GT	3	6	854063	854068	0 %	50 %	50 %	0 %	532422732
17014	NC_022118	T	6	6	854101	854106	0 %	100 %	0 %	0 %	532422732
17015	NC_022118	A	6	6	854118	854123	100 %	0 %	0 %	0 %	532422732
17016	NC_022118	A	6	6	854133	854138	100 %	0 %	0 %	0 %	532422732
17017	NC_022118	CTTT	2	8	854161	854168	0 %	75 %	0 %	25 %	532422732
17018	NC_022118	CGAA	2	8	854169	854176	50 %	0 %	25 %	25 %	532422732
17019	NC_022118	GAAG	2	8	854181	854188	50 %	0 %	50 %	0 %	532422732
17020	NC_022118	AGA	2	6	859870	859875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422534
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17022	NC_022118	TCT	2	6	859955	859960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422534
17023	NC_022118	GA	4	8	860070	860077	50 %	0 %	50 %	0 %	532422534
17024	NC_022118	TTCT	2	8	860104	860111	0 %	75 %	0 %	25 %	532422534
17025	NC_022118	CTT	2	6	860127	860132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422534
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17029	NC_022118	AG	3	6	860336	860341	50 %	0 %	50 %	0 %	532422534
17030	NC_022118	AT	3	6	860343	860348	50 %	50 %	0 %	0 %	532422534
17031	NC_022118	GGTCG	2	10	860374	860383	0 %	20 %	60 %	20 %	532422534
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17038	NC_022118	ACA	2	6	860708	860713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422534
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17055	NC_022118	TTA	2	6	861637	861642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422535
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17057	NC_022118	GAG	2	6	861939	861944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422536
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17059	NC_022118	AAT	2	6	862093	862098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422536
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17061	NC_022118	AG	3	6	862158	862163	50 %	0 %	50 %	0 %	532422536
17062	NC_022118	TCT	2	6	862166	862171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422536
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17094	NC_022118	T	6	6	863311	863316	0 %	100 %	0 %	0 %	532422537
17095	NC_022118	TGC	2	6	863390	863395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422537
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17109	NC_022118	ATA	2	6	864336	864341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422538
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17228	NC_022118	TTTG	2	8	870071	870078	0 %	75 %	25 %	0 %	532422542
17229	NC_022118	CTG	2	6	870093	870098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422542
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17231	NC_022118	CTT	2	6	870227	870232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422542
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17233	NC_022118	T	6	6	870272	870277	0 %	100 %	0 %	0 %	532422542
17234	NC_022118	TA	3	6	870309	870314	50 %	50 %	0 %	0 %	532422542
17235	NC_022118	GC	3	6	870327	870332	0 %	0 %	50 %	50 %	532422542
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17239	NC_022118	T	6	6	870764	870769	0 %	100 %	0 %	0 %	532422542
17240	NC_022118	GCAT	2	8	870808	870815	25 %	25 %	25 %	25 %	532422542
17241	NC_022118	TGC	2	6	870945	870950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422542
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17245	NC_022118	AG	3	6	871050	871055	50 %	0 %	50 %	0 %	532422542
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17491	NC_022118	CA	3	6	889086	889091	50 %	0 %	0 %	50 %	532422550
17492	NC_022118	GCA	2	6	889101	889106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422550
17493	NC_022118	TCG	2	6	889142	889147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422550
17494	NC_022118	A	6	6	889151	889156	100 %	0 %	0 %	0 %	532422550
17495	NC_022118	CTT	2	6	889202	889207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422550
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17497	NC_022118	A	6	6	889224	889229	100 %	0 %	0 %	0 %	532422550
17498	NC_022118	GCA	2	6	889237	889242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422550
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