MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022118	GGA	2	6	803087	803092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422494
16002	NC_022118	TGT	2	6	803098	803103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422494
16003	NC_022118	TAT	2	6	803106	803111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422494
16004	NC_022118	T	8	8	803240	803247	0 %	100 %	0 %	0 %	532422494
16005	NC_022118	GCTT	2	8	803316	803323	0 %	50 %	25 %	25 %	532422495
16006	NC_022118	A	6	6	803463	803468	100 %	0 %	0 %	0 %	532422495
16007	NC_022118	AT	3	6	803498	803503	50 %	50 %	0 %	0 %	532422495
16008	NC_022118	TTC	2	6	803509	803514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422495
16009	NC_022118	GAA	2	6	803532	803537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422495
16010	NC_022118	GAAATT	2	12	803564	803575	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532422495
16011	NC_022118	T	6	6	803588	803593	0 %	100 %	0 %	0 %	532422495
16012	NC_022118	TCT	2	6	803657	803662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422495
16013	NC_022118	GCGA	2	8	803680	803687	25 %	0 %	50 %	25 %	532422495
16014	NC_022118	TCGC	2	8	803692	803699	0 %	25 %	25 %	50 %	532422495
16015	NC_022118	TGC	2	6	803735	803740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422495
16016	NC_022118	AAG	2	6	803782	803787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422495
16017	NC_022118	TTA	2	6	803791	803796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422495
16018	NC_022118	AG	3	6	803955	803960	50 %	0 %	50 %	0 %	532422495
16019	NC_022118	CTG	2	6	804045	804050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422495
16020	NC_022118	TGA	2	6	804091	804096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422495
16021	NC_022118	GCG	3	9	804114	804122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422495
16022	NC_022118	CTG	2	6	804152	804157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422495
16023	NC_022118	TGA	2	6	804188	804193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422495
16024	NC_022118	GCTGAG	2	12	804246	804257	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532422495
16025	NC_022118	TGGCT	2	10	804316	804325	0 %	40 %	40 %	20 %	532422495
16026	NC_022118	CGA	2	6	804343	804348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422495
16027	NC_022118	AGCG	2	8	804382	804389	25 %	0 %	50 %	25 %	532422495
16028	NC_022118	CGAG	2	8	804491	804498	25 %	0 %	50 %	25 %	532422495
16029	NC_022118	ACG	2	6	804501	804506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422495
16030	NC_022118	GAA	2	6	804539	804544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422495
16031	NC_022118	TAG	2	6	804580	804585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422495
16032	NC_022118	TC	3	6	804618	804623	0 %	50 %	0 %	50 %	532422495
16033	NC_022118	GTAA	2	8	804626	804633	50 %	25 %	25 %	0 %	532422495
16034	NC_022118	TCC	2	6	804900	804905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422496
16035	NC_022118	AG	3	6	804908	804913	50 %	0 %	50 %	0 %	532422496
16036	NC_022118	GTTG	2	8	804935	804942	0 %	50 %	50 %	0 %	532422496
16037	NC_022118	GAC	2	6	804984	804989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16038	NC_022118	CTT	2	6	805053	805058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422496
16039	NC_022118	GTT	2	6	805074	805079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422496
16040	NC_022118	ATC	2	6	805129	805134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422496
16041	NC_022118	GGAA	2	8	805220	805227	50 %	0 %	50 %	0 %	532422496
16042	NC_022118	ATT	2	6	805303	805308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422496
16043	NC_022118	GAC	2	6	805361	805366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16044	NC_022118	CCA	2	6	805389	805394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422496
16045	NC_022118	AAGAA	2	10	805487	805496	80 %	0 %	20 %	0 %	532422496
16046	NC_022118	TAT	2	6	805526	805531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422496
16047	NC_022118	TTGA	2	8	805551	805558	25 %	50 %	25 %	0 %	532422496
16048	NC_022118	T	6	6	805709	805714	0 %	100 %	0 %	0 %	532422496
16049	NC_022118	GTTA	2	8	805784	805791	25 %	50 %	25 %	0 %	532422496
16050	NC_022118	CGT	2	6	805821	805826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16051	NC_022118	CT	3	6	805917	805922	0 %	50 %	0 %	50 %	532422496
16052	NC_022118	TA	3	6	805927	805932	50 %	50 %	0 %	0 %	532422496
16053	NC_022118	AAT	2	6	805950	805955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422496
16054	NC_022118	GGT	2	6	806004	806009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422496
16055	NC_022118	AGA	2	6	806015	806020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422496
16056	NC_022118	TGA	2	6	806026	806031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422496
16057	NC_022118	GAA	2	6	806061	806066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422496
16058	NC_022118	CAG	2	6	806083	806088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16059	NC_022118	GAT	2	6	806214	806219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422496
16060	NC_022118	ATC	2	6	806229	806234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422496
16061	NC_022118	CGT	2	6	806265	806270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16062	NC_022118	TGC	2	6	806452	806457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16063	NC_022118	CTTG	2	8	806476	806483	0 %	50 %	25 %	25 %	532422496
16064	NC_022118	ATG	2	6	806497	806502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422496
16065	NC_022118	TTG	2	6	806539	806544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422496
16066	NC_022118	AAG	2	6	806683	806688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422496
16067	NC_022118	GACA	2	8	806755	806762	50 %	0 %	25 %	25 %	532422496
16068	NC_022118	GCT	2	6	806786	806791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16069	NC_022118	GACA	2	8	806839	806846	50 %	0 %	25 %	25 %	532422496
16070	NC_022118	TGC	2	6	806883	806888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16071	NC_022118	TTC	2	6	806893	806898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422496
16072	NC_022118	CTTT	2	8	806899	806906	0 %	75 %	0 %	25 %	532422496
16073	NC_022118	AGAT	2	8	806910	806917	50 %	25 %	25 %	0 %	532422496
16074	NC_022118	TGA	2	6	806918	806923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422496
16075	NC_022118	TCC	2	6	806970	806975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422496
16076	NC_022118	GATT	2	8	807011	807018	25 %	50 %	25 %	0 %	532422496
16077	NC_022118	ATG	2	6	807080	807085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422496
16078	NC_022118	AAC	2	6	807098	807103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422496
16079	NC_022118	ATG	2	6	807128	807133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422496
16080	NC_022118	TTGT	2	8	807151	807158	0 %	75 %	25 %	0 %	532422496
16081	NC_022118	TAGCCT	2	12	807191	807202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532422496
16082	NC_022118	AGA	2	6	807252	807257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422496
16083	NC_022118	GAT	2	6	807289	807294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422496
16084	NC_022118	TTA	2	6	807349	807354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422496
16085	NC_022118	TGCT	2	8	807386	807393	0 %	50 %	25 %	25 %	532422496
16086	NC_022118	ATT	2	6	807406	807411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422496
16087	NC_022118	CAG	2	6	807416	807421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422496
16088	NC_022118	ATT	2	6	807463	807468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422496
16089	NC_022118	TTA	2	6	807514	807519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422496
16090	NC_022118	GAAT	2	8	807576	807583	50 %	25 %	25 %	0 %	532422496
16091	NC_022118	GAA	2	6	807763	807768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422496
16092	NC_022118	GAT	2	6	807933	807938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422497
16093	NC_022118	ATG	2	6	807992	807997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422497
16094	NC_022118	GTG	2	6	808064	808069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422497
16095	NC_022118	GAA	2	6	808086	808091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422497
16096	NC_022118	AGG	2	6	808129	808134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422497
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16098	NC_022118	CAA	2	6	808154	808159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422497
16099	NC_022118	ATC	2	6	808273	808278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422497
16100	NC_022118	TTC	2	6	808279	808284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422497
16101	NC_022118	TA	3	6	808285	808290	50 %	50 %	0 %	0 %	532422497
16102	NC_022118	AGATG	2	10	808341	808350	40 %	20 %	40 %	0 %	532422497
16103	NC_022118	TCA	2	6	808376	808381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422497
16104	NC_022118	TA	3	6	808528	808533	50 %	50 %	0 %	0 %	532422498
16105	NC_022118	GCT	2	6	808542	808547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422498
16106	NC_022118	T	6	6	808557	808562	0 %	100 %	0 %	0 %	532422498
16107	NC_022118	CAG	2	6	808586	808591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422498
16108	NC_022118	GTC	3	9	808629	808637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422498
16109	NC_022118	TAG	2	6	808650	808655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422498
16110	NC_022118	ATC	2	6	808766	808771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422498
16111	NC_022118	GCG	2	6	808799	808804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422498
16112	NC_022118	GC	3	6	808829	808834	0 %	0 %	50 %	50 %	532422498
16113	NC_022118	TA	3	6	808841	808846	50 %	50 %	0 %	0 %	532422498
16114	NC_022118	ATTT	2	8	808909	808916	25 %	75 %	0 %	0 %	532422498
16115	NC_022118	T	6	6	808934	808939	0 %	100 %	0 %	0 %	532422498
16116	NC_022118	ATAG	2	8	808953	808960	50 %	25 %	25 %	0 %	532422498
16117	NC_022118	GCT	2	6	808984	808989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422498
16118	NC_022118	GAA	2	6	809049	809054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422498
16119	NC_022118	TGT	2	6	809155	809160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422498
16120	NC_022118	CTC	2	6	809198	809203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422498
16121	NC_022118	AAG	2	6	809207	809212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422498
16122	NC_022118	GGA	2	6	809225	809230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422498
16123	NC_022118	CTT	3	9	809329	809337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422498
16124	NC_022118	TCA	2	6	809367	809372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422498
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16127	NC_022118	TTC	2	6	809438	809443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422498
16128	NC_022118	CTG	2	6	809579	809584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422498
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16130	NC_022118	CTA	2	6	809683	809688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422498
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16132	NC_022118	CTG	3	9	809713	809721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422498
16133	NC_022118	TGA	2	6	809733	809738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422498
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16135	NC_022118	ATA	2	6	809799	809804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422498
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16140	NC_022118	AGT	2	6	810154	810159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422499
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16142	NC_022118	TGC	2	6	810249	810254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422499
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16144	NC_022118	AGC	2	6	810337	810342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422499
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16147	NC_022118	TTTG	2	8	810392	810399	0 %	75 %	25 %	0 %	532422499
16148	NC_022118	TTG	2	6	810451	810456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422499
16149	NC_022118	GA	3	6	810470	810475	50 %	0 %	50 %	0 %	532422499
16150	NC_022118	CAA	2	6	810522	810527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422499
16151	NC_022118	T	6	6	810557	810562	0 %	100 %	0 %	0 %	532422499
16152	NC_022118	ATAGG	2	10	810620	810629	40 %	20 %	40 %	0 %	532422499
16153	NC_022118	GTAA	2	8	810646	810653	50 %	25 %	25 %	0 %	532422499
16154	NC_022118	T	7	7	810686	810692	0 %	100 %	0 %	0 %	532422499
16155	NC_022118	GA	3	6	810716	810721	50 %	0 %	50 %	0 %	532422499
16156	NC_022118	AAGG	2	8	810733	810740	50 %	0 %	50 %	0 %	532422499
16157	NC_022118	AAAGC	2	10	810778	810787	60 %	0 %	20 %	20 %	532422499
16158	NC_022118	GCA	2	6	810796	810801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422499
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16160	NC_022118	CTA	2	6	810902	810907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422499
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16221	NC_022118	ATTT	2	8	814079	814086	25 %	75 %	0 %	0 %	532422502
16222	NC_022118	TCA	2	6	814114	814119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422502
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16224	NC_022118	T	6	6	814213	814218	0 %	100 %	0 %	0 %	532422502
16225	NC_022118	TCT	2	6	814234	814239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
16226	NC_022118	GAAA	2	8	814326	814333	75 %	0 %	25 %	0 %	532422502
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16228	NC_022118	CA	3	6	814409	814414	50 %	0 %	0 %	50 %	532422502
16229	NC_022118	CAA	2	6	814493	814498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422502
16230	NC_022118	TAT	2	6	814499	814504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422502
16231	NC_022118	ACA	2	6	814537	814542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422502
16232	NC_022118	T	8	8	814543	814550	0 %	100 %	0 %	0 %	532422502
16233	NC_022118	CTT	2	6	814565	814570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
16234	NC_022118	TG	3	6	814582	814587	0 %	50 %	50 %	0 %	532422502
16235	NC_022118	ACACA	2	10	814616	814625	60 %	0 %	0 %	40 %	532422502
16236	NC_022118	TCT	2	6	814636	814641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
16237	NC_022118	A	8	8	814855	814862	100 %	0 %	0 %	0 %	532422729
16238	NC_022118	T	6	6	814876	814881	0 %	100 %	0 %	0 %	532422729
16239	NC_022118	GGT	2	6	814895	814900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422729
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16483	NC_022118	GAAA	2	8	827093	827100	75 %	0 %	25 %	0 %	532422509
16484	NC_022118	GAG	2	6	827122	827127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422509
16485	NC_022118	CTG	2	6	827128	827133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422509
16486	NC_022118	ATT	2	6	827204	827209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422509
16487	NC_022118	AAG	2	6	827213	827218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422509
16488	NC_022118	TAGG	2	8	827252	827259	25 %	25 %	50 %	0 %	532422509
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16491	NC_022118	TAA	2	6	827345	827350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422510
16492	NC_022118	TTTC	2	8	827390	827397	0 %	75 %	0 %	25 %	532422510
16493	NC_022118	CAG	2	6	827403	827408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422510
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16496	NC_022118	T	7	7	827579	827585	0 %	100 %	0 %	0 %	532422510
16497	NC_022118	AAGAGG	2	12	827632	827643	50 %	0 %	50 %	0 %	532422510
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16499	NC_022118	TAG	2	6	827748	827753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422510
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