MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022118	CAATTA	2	12	778204	778215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532422475
15502	NC_022118	GA	3	6	778226	778231	50 %	0 %	50 %	0 %	532422475
15503	NC_022118	GTT	2	6	778256	778261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422475
15504	NC_022118	TAA	2	6	778286	778291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422475
15505	NC_022118	T	6	6	778301	778306	0 %	100 %	0 %	0 %	532422475
15506	NC_022118	CAATT	2	10	778337	778346	40 %	40 %	0 %	20 %	532422475
15507	NC_022118	TC	3	6	778409	778414	0 %	50 %	0 %	50 %	532422475
15508	NC_022118	AGC	2	6	778442	778447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422475
15509	NC_022118	T	7	7	778472	778478	0 %	100 %	0 %	0 %	532422475
15510	NC_022118	CAA	2	6	778483	778488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422475
15511	NC_022118	TC	3	6	778499	778504	0 %	50 %	0 %	50 %	532422475
15512	NC_022118	T	6	6	778516	778521	0 %	100 %	0 %	0 %	532422475
15513	NC_022118	GAT	2	6	778571	778576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422475
15514	NC_022118	T	7	7	778587	778593	0 %	100 %	0 %	0 %	532422475
15515	NC_022118	TTG	2	6	778926	778931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422726
15516	NC_022118	AG	3	6	778935	778940	50 %	0 %	50 %	0 %	532422726
15517	NC_022118	AGG	2	6	778943	778948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422726
15518	NC_022118	A	9	9	778979	778987	100 %	0 %	0 %	0 %	532422726
15519	NC_022118	TTA	2	6	779028	779033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422726
15520	NC_022118	AATT	2	8	779071	779078	50 %	50 %	0 %	0 %	532422726
15521	NC_022118	AGC	2	6	779104	779109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422476
15522	NC_022118	TC	3	6	779110	779115	0 %	50 %	0 %	50 %	532422476
15523	NC_022118	GTT	2	6	779168	779173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422476
15524	NC_022118	ACA	2	6	779321	779326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422476
15525	NC_022118	AAGA	2	8	779427	779434	75 %	0 %	25 %	0 %	532422476
15526	NC_022118	CTTG	2	8	779441	779448	0 %	50 %	25 %	25 %	532422476
15527	NC_022118	CTG	2	6	779502	779507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422476
15528	NC_022118	TTA	2	6	779549	779554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422476
15529	NC_022118	CTG	2	6	779565	779570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422476
15530	NC_022118	TTC	2	6	779590	779595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422476
15531	NC_022118	AAG	2	6	779625	779630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422476
15532	NC_022118	AGT	2	6	779692	779697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422476
15533	NC_022118	CCA	2	6	779712	779717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422476
15534	NC_022118	GCA	2	6	779753	779758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422476
15535	NC_022118	TGG	2	6	779835	779840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422476
15536	NC_022118	GTTC	3	12	779944	779955	0 %	50 %	25 %	25 %	532422476
15537	NC_022118	GTG	2	6	780107	780112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422476
15538	NC_022118	CCG	2	6	780131	780136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422476
15539	NC_022118	CAG	2	6	780177	780182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422476
15540	NC_022118	AGG	2	6	780207	780212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422476
15541	NC_022118	T	6	6	780256	780261	0 %	100 %	0 %	0 %	532422476
15542	NC_022118	CT	3	6	780290	780295	0 %	50 %	0 %	50 %	532422476
15543	NC_022118	ACT	2	6	780901	780906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422477
15544	NC_022118	TAT	2	6	780916	780921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422477
15545	NC_022118	ATC	2	6	780932	780937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422477
15546	NC_022118	TGT	2	6	780961	780966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422477
15547	NC_022118	GCA	2	6	780967	780972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422477
15548	NC_022118	GAAG	2	8	780982	780989	50 %	0 %	50 %	0 %	532422477
15549	NC_022118	A	6	6	781196	781201	100 %	0 %	0 %	0 %	532422477
15550	NC_022118	T	6	6	781210	781215	0 %	100 %	0 %	0 %	532422477
15551	NC_022118	T	6	6	781327	781332	0 %	100 %	0 %	0 %	532422477
15552	NC_022118	GC	3	6	781408	781413	0 %	0 %	50 %	50 %	532422477
15553	NC_022118	TTG	2	6	781424	781429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422477
15554	NC_022118	AGA	2	6	781453	781458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422477
15555	NC_022118	ATGC	2	8	781592	781599	25 %	25 %	25 %	25 %	532422477
15556	NC_022118	TTC	2	6	781729	781734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422477
15557	NC_022118	GAGGT	2	10	781821	781830	20 %	20 %	60 %	0 %	532422477
15558	NC_022118	CAA	2	6	781859	781864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422477
15559	NC_022118	GCC	2	6	781870	781875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422477
15560	NC_022118	T	6	6	781876	781881	0 %	100 %	0 %	0 %	532422477
15561	NC_022118	TTG	2	6	781905	781910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422477
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15563	NC_022118	AAT	2	6	781967	781972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422477
15564	NC_022118	AGG	2	6	782004	782009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422477
15565	NC_022118	TTC	2	6	782017	782022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422477
15566	NC_022118	AG	3	6	782090	782095	50 %	0 %	50 %	0 %	532422477
15567	NC_022118	TGA	2	6	782125	782130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422477
15568	NC_022118	CT	3	6	782135	782140	0 %	50 %	0 %	50 %	532422477
15569	NC_022118	T	6	6	782155	782160	0 %	100 %	0 %	0 %	532422477
15570	NC_022118	ATTTT	2	10	782163	782172	20 %	80 %	0 %	0 %	532422477
15571	NC_022118	AGC	2	6	782253	782258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422477
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15573	NC_022118	AG	3	6	782399	782404	50 %	0 %	50 %	0 %	532422477
15574	NC_022118	ATCT	2	8	782451	782458	25 %	50 %	0 %	25 %	532422477
15575	NC_022118	TTA	2	6	782531	782536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422477
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15577	NC_022118	CA	3	6	782674	782679	50 %	0 %	0 %	50 %	532422477
15578	NC_022118	TTA	2	6	782682	782687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422477
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15582	NC_022118	TAG	2	6	782751	782756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422477
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15585	NC_022118	CCT	2	6	782837	782842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422477
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15587	NC_022118	TTG	2	6	782872	782877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422477
15588	NC_022118	T	6	6	782935	782940	0 %	100 %	0 %	0 %	532422477
15589	NC_022118	CTT	2	6	783087	783092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422477
15590	NC_022118	ATCT	2	8	783117	783124	25 %	50 %	0 %	25 %	532422477
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15593	NC_022118	AAG	2	6	783213	783218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422477
15594	NC_022118	T	6	6	783290	783295	0 %	100 %	0 %	0 %	532422477
15595	NC_022118	CTT	2	6	783315	783320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422477
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15600	NC_022118	ACAT	2	8	783586	783593	50 %	25 %	0 %	25 %	532422477
15601	NC_022118	GTG	2	6	783596	783601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422477
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15603	NC_022118	GTTA	2	8	783634	783641	25 %	50 %	25 %	0 %	532422477
15604	NC_022118	AAG	2	6	783716	783721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422477
15605	NC_022118	TCG	2	6	783750	783755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422477
15606	NC_022118	AG	3	6	783765	783770	50 %	0 %	50 %	0 %	532422477
15607	NC_022118	TAT	2	6	783850	783855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422477
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15609	NC_022118	ATGAAG	2	12	783954	783965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532422477
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15612	NC_022118	A	6	6	784076	784081	100 %	0 %	0 %	0 %	532422477
15613	NC_022118	ATTT	2	8	784209	784216	25 %	75 %	0 %	0 %	532422478
15614	NC_022118	GTG	2	6	784221	784226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422478
15615	NC_022118	AGCA	2	8	784233	784240	50 %	0 %	25 %	25 %	532422478
15616	NC_022118	AG	3	6	784243	784248	50 %	0 %	50 %	0 %	532422478
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15619	NC_022118	AGA	2	6	784435	784440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422478
15620	NC_022118	TTTA	2	8	784495	784502	25 %	75 %	0 %	0 %	532422478
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15622	NC_022118	GAA	2	6	784538	784543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422478
15623	NC_022118	GGA	2	6	784630	784635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422478
15624	NC_022118	TTA	2	6	784655	784660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422478
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15637	NC_022118	CT	4	8	785194	785201	0 %	50 %	0 %	50 %	532422478
15638	NC_022118	T	6	6	785215	785220	0 %	100 %	0 %	0 %	532422727
15639	NC_022118	T	6	6	785223	785228	0 %	100 %	0 %	0 %	532422727
15640	NC_022118	TTTG	2	8	785230	785237	0 %	75 %	25 %	0 %	532422727
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15661	NC_022118	A	7	7	785929	785935	100 %	0 %	0 %	0 %	532422479
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15732	NC_022118	A	6	6	789604	789609	100 %	0 %	0 %	0 %	532422482
15733	NC_022118	TCC	2	6	789627	789632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422482
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15741	NC_022118	CAGC	2	8	789988	789995	25 %	0 %	25 %	50 %	532422482
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15980	NC_022118	ACAG	2	8	801870	801877	50 %	0 %	25 %	25 %	532422493
15981	NC_022118	A	6	6	801938	801943	100 %	0 %	0 %	0 %	532422493
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15985	NC_022118	GGA	2	6	802009	802014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422493
15986	NC_022118	AGC	2	6	802054	802059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422493
15987	NC_022118	TAAA	2	8	802068	802075	75 %	25 %	0 %	0 %	532422493
15988	NC_022118	ATC	2	6	802376	802381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422494
15989	NC_022118	TTC	2	6	802384	802389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422494
15990	NC_022118	T	6	6	802400	802405	0 %	100 %	0 %	0 %	532422494
15991	NC_022118	TTA	2	6	802509	802514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422494
15992	NC_022118	AGA	2	6	802546	802551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422494
15993	NC_022118	T	7	7	802591	802597	0 %	100 %	0 %	0 %	532422494
15994	NC_022118	TG	3	6	802649	802654	0 %	50 %	50 %	0 %	532422494
15995	NC_022118	CTG	2	6	802659	802664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422494
15996	NC_022118	T	6	6	802744	802749	0 %	100 %	0 %	0 %	532422494
15997	NC_022118	T	6	6	802884	802889	0 %	100 %	0 %	0 %	532422494
15998	NC_022118	CCA	2	6	803023	803028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422494
15999	NC_022118	A	6	6	803054	803059	100 %	0 %	0 %	0 %	532422494
16000	NC_022118	T	7	7	803074	803080	0 %	100 %	0 %	0 %	532422494

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