MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022118	ACC	2	6	751666	751671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422450
15002	NC_022118	ATA	2	6	751694	751699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422450
15003	NC_022118	CA	3	6	751710	751715	50 %	0 %	0 %	50 %	532422450
15004	NC_022118	AGC	2	6	751835	751840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422451
15005	NC_022118	AAT	2	6	751881	751886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422451
15006	NC_022118	CCA	2	6	751944	751949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422451
15007	NC_022118	ACA	2	6	752001	752006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422451
15008	NC_022118	CGA	2	6	752019	752024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422451
15009	NC_022118	TTG	2	6	752058	752063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422451
15010	NC_022118	AAC	2	6	752074	752079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422451
15011	NC_022118	GAT	2	6	752093	752098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422451
15012	NC_022118	T	6	6	752168	752173	0 %	100 %	0 %	0 %	532422451
15013	NC_022118	AGA	2	6	752211	752216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422451
15014	NC_022118	GAC	2	6	752224	752229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422451
15015	NC_022118	A	6	6	752232	752237	100 %	0 %	0 %	0 %	532422451
15016	NC_022118	AAT	2	6	752249	752254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422451
15017	NC_022118	AGC	2	6	752267	752272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422451
15018	NC_022118	CTT	2	6	752326	752331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422451
15019	NC_022118	AGA	2	6	752438	752443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422451
15020	NC_022118	CAA	2	6	752455	752460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422451
15021	NC_022118	TCG	2	6	752471	752476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422451
15022	NC_022118	T	6	6	752564	752569	0 %	100 %	0 %	0 %	532422451
15023	NC_022118	AAG	2	6	753077	753082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422452
15024	NC_022118	AGA	2	6	753108	753113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422452
15025	NC_022118	GTTC	2	8	753151	753158	0 %	50 %	25 %	25 %	532422452
15026	NC_022118	CTT	2	6	753344	753349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422452
15027	NC_022118	GAA	2	6	753366	753371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422453
15028	NC_022118	TAA	2	6	753389	753394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422453
15029	NC_022118	GAA	2	6	753398	753403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422453
15030	NC_022118	CTT	2	6	753404	753409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422453
15031	NC_022118	ACAA	2	8	753445	753452	75 %	0 %	0 %	25 %	532422453
15032	NC_022118	TATT	2	8	753455	753462	25 %	75 %	0 %	0 %	532422453
15033	NC_022118	CAG	2	6	753543	753548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422453
15034	NC_022118	GGT	2	6	753602	753607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422453
15035	NC_022118	TCT	2	6	753608	753613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422453
15036	NC_022118	T	6	6	753759	753764	0 %	100 %	0 %	0 %	532422454
15037	NC_022118	TGA	2	6	753775	753780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422454
15038	NC_022118	CAA	2	6	753851	753856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422454
15039	NC_022118	AGA	2	6	753949	753954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422454
15040	NC_022118	GAA	2	6	753956	753961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422454
15041	NC_022118	CTT	2	6	753966	753971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422454
15042	NC_022118	ATG	2	6	754016	754021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422454
15043	NC_022118	TAA	2	6	754030	754035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422454
15044	NC_022118	GGT	2	6	754084	754089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422454
15045	NC_022118	TGC	2	6	754098	754103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422454
15046	NC_022118	GAG	2	6	754139	754144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422454
15047	NC_022118	TTG	2	6	754193	754198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422454
15048	NC_022118	CT	3	6	754227	754232	0 %	50 %	0 %	50 %	532422454
15049	NC_022118	A	6	6	754261	754266	100 %	0 %	0 %	0 %	532422454
15050	NC_022118	AGGA	2	8	754343	754350	50 %	0 %	50 %	0 %	532422454
15051	NC_022118	CCA	2	6	754468	754473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422454
15052	NC_022118	ACAA	2	8	754563	754570	75 %	0 %	0 %	25 %	532422454
15053	NC_022118	GTTTT	2	10	754735	754744	0 %	80 %	20 %	0 %	532422454
15054	NC_022118	T	6	6	754741	754746	0 %	100 %	0 %	0 %	532422454
15055	NC_022118	AAG	2	6	754751	754756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422454
15056	NC_022118	A	6	6	754860	754865	100 %	0 %	0 %	0 %	532422455
15057	NC_022118	TTG	2	6	754868	754873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422455
15058	NC_022118	AAG	2	6	754973	754978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422455
15059	NC_022118	CT	3	6	755268	755273	0 %	50 %	0 %	50 %	532422456
15060	NC_022118	GGTA	2	8	755275	755282	25 %	25 %	50 %	0 %	532422456
15061	NC_022118	TCA	2	6	755285	755290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422456
15062	NC_022118	AGC	2	6	755339	755344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422456
15063	NC_022118	T	6	6	755368	755373	0 %	100 %	0 %	0 %	532422456
15064	NC_022118	TTTCT	2	10	755407	755416	0 %	80 %	0 %	20 %	532422456
15065	NC_022118	TCA	2	6	755447	755452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422456
15066	NC_022118	T	7	7	755463	755469	0 %	100 %	0 %	0 %	532422456
15067	NC_022118	GCT	2	6	755480	755485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422456
15068	NC_022118	TTGC	2	8	755496	755503	0 %	50 %	25 %	25 %	532422456
15069	NC_022118	TGA	2	6	755572	755577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422456
15070	NC_022118	TCTT	2	8	755586	755593	0 %	75 %	0 %	25 %	532422456
15071	NC_022118	AG	3	6	755596	755601	50 %	0 %	50 %	0 %	532422456
15072	NC_022118	TCT	2	6	755684	755689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422456
15073	NC_022118	T	7	7	755704	755710	0 %	100 %	0 %	0 %	532422456
15074	NC_022118	GTT	2	6	755759	755764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422456
15075	NC_022118	TA	3	6	755832	755837	50 %	50 %	0 %	0 %	532422456
15076	NC_022118	GAGG	2	8	755892	755899	25 %	0 %	75 %	0 %	532422456
15077	NC_022118	GAATC	2	10	755916	755925	40 %	20 %	20 %	20 %	532422456
15078	NC_022118	TGC	2	6	755947	755952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422456
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15080	NC_022118	TTG	2	6	756039	756044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422456
15081	NC_022118	CATC	2	8	756087	756094	25 %	25 %	0 %	50 %	532422456
15082	NC_022118	CCT	2	6	756098	756103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422456
15083	NC_022118	AG	3	6	756120	756125	50 %	0 %	50 %	0 %	532422456
15084	NC_022118	TAG	2	6	756163	756168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422456
15085	NC_022118	AGT	2	6	756236	756241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422456
15086	NC_022118	CT	3	6	756277	756282	0 %	50 %	0 %	50 %	532422456
15087	NC_022118	CCT	2	6	756330	756335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422456
15088	NC_022118	TA	3	6	756361	756366	50 %	50 %	0 %	0 %	532422456
15089	NC_022118	CAT	2	6	756537	756542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422456
15090	NC_022118	CTT	2	6	756569	756574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422456
15091	NC_022118	TG	3	6	756641	756646	0 %	50 %	50 %	0 %	532422456
15092	NC_022118	AAT	2	6	756720	756725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422457
15093	NC_022118	GT	3	6	756773	756778	0 %	50 %	50 %	0 %	532422457
15094	NC_022118	T	6	6	756903	756908	0 %	100 %	0 %	0 %	532422457
15095	NC_022118	TCT	3	9	756937	756945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422457
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15100	NC_022118	AG	3	6	757135	757140	50 %	0 %	50 %	0 %	532422457
15101	NC_022118	A	6	6	757172	757177	100 %	0 %	0 %	0 %	532422457
15102	NC_022118	TCT	2	6	757201	757206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422457
15103	NC_022118	GGA	2	6	757209	757214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422457
15104	NC_022118	TG	3	6	757255	757260	0 %	50 %	50 %	0 %	532422457
15105	NC_022118	T	8	8	757398	757405	0 %	100 %	0 %	0 %	532422457
15106	NC_022118	CTTG	2	8	757421	757428	0 %	50 %	25 %	25 %	532422457
15107	NC_022118	TTC	2	6	757441	757446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422457
15108	NC_022118	T	6	6	757451	757456	0 %	100 %	0 %	0 %	532422457
15109	NC_022118	AGA	2	6	757512	757517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422457
15110	NC_022118	CTT	2	6	757526	757531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422457
15111	NC_022118	TTTGG	2	10	757581	757590	0 %	60 %	40 %	0 %	532422457
15112	NC_022118	CAGC	2	8	757627	757634	25 %	0 %	25 %	50 %	532422457
15113	NC_022118	T	6	6	757666	757671	0 %	100 %	0 %	0 %	532422457
15114	NC_022118	A	6	6	757674	757679	100 %	0 %	0 %	0 %	532422457
15115	NC_022118	GTT	2	6	757738	757743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422457
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15117	NC_022118	CTT	3	9	757859	757867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422457
15118	NC_022118	AAG	2	6	757878	757883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422457
15119	NC_022118	AAT	2	6	757917	757922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422457
15120	NC_022118	T	6	6	757963	757968	0 %	100 %	0 %	0 %	532422457
15121	NC_022118	GAAA	2	8	757983	757990	75 %	0 %	25 %	0 %	532422457
15122	NC_022118	GA	3	6	758015	758020	50 %	0 %	50 %	0 %	532422457
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15156	NC_022118	GA	3	6	759822	759827	50 %	0 %	50 %	0 %	532422458
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15243	NC_022118	TCAC	2	8	764360	764367	25 %	25 %	0 %	50 %	532422463
15244	NC_022118	ATG	2	6	764372	764377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422463
15245	NC_022118	TTC	2	6	764382	764387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422463
15246	NC_022118	AG	4	8	764414	764421	50 %	0 %	50 %	0 %	532422463
15247	NC_022118	GCT	2	6	764430	764435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422463
15248	NC_022118	ATG	2	6	764514	764519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422463
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15250	NC_022118	TGC	2	6	764624	764629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422464
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15253	NC_022118	GATC	2	8	764783	764790	25 %	25 %	25 %	25 %	532422464
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15256	NC_022118	TTG	2	6	764935	764940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422464
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15273	NC_022118	TTCT	2	8	766264	766271	0 %	75 %	0 %	25 %	532422465
15274	NC_022118	AAC	2	6	766357	766362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422465
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15281	NC_022118	GCT	2	6	766542	766547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422465
15282	NC_022118	TAG	2	6	766585	766590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422465
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15350	NC_022118	AGA	2	6	768834	768839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422468
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15360	NC_022118	AT	3	6	769733	769738	50 %	50 %	0 %	0 %	532422469
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15483	NC_022118	AAG	2	6	777555	777560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422474
15484	NC_022118	TGT	2	6	777599	777604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422474
15485	NC_022118	CAA	2	6	777608	777613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422474
15486	NC_022118	CAA	2	6	777635	777640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422474
15487	NC_022118	CAC	2	6	777647	777652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422474
15488	NC_022118	TCA	2	6	777655	777660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422474
15489	NC_022118	GCA	2	6	777667	777672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422474
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15492	NC_022118	TAAA	2	8	777735	777742	75 %	25 %	0 %	0 %	532422474
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15500	NC_022118	ATC	2	6	778082	778087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422475

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