MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022118	T	6	6	703595	703600	0 %	100 %	0 %	0 %	532422415
14002	NC_022118	CT	3	6	703635	703640	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
14003	NC_022118	CTTC	2	8	703645	703652	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
14004	NC_022118	GATT	2	8	703695	703702	25 %	50 %	25 %	0 %	532422415
14005	NC_022118	CTAC	2	8	703799	703806	25 %	25 %	0 %	50 %	532422415
14006	NC_022118	ACA	2	6	703830	703835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422415
14007	NC_022118	ACA	2	6	703911	703916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422415
14008	NC_022118	ATG	2	6	704123	704128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
14009	NC_022118	GGA	2	6	704185	704190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422415
14010	NC_022118	AGA	2	6	704223	704228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422415
14011	NC_022118	CTTC	2	8	704245	704252	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
14012	NC_022118	ATC	2	6	704257	704262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422415
14013	NC_022118	GGA	2	6	704266	704271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422415
14014	NC_022118	CAAG	2	8	704284	704291	50 %	0 %	25 %	25 %	532422415
14015	NC_022118	CAA	2	6	704305	704310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422415
14016	NC_022118	AAATGC	2	12	704345	704356	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532422415
14017	NC_022118	GCA	2	6	704370	704375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422415
14018	NC_022118	GTA	2	6	704386	704391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
14019	NC_022118	ATCT	2	8	704419	704426	25 %	50 %	0 %	25 %	532422415
14020	NC_022118	CTAG	2	8	704443	704450	25 %	25 %	25 %	25 %	532422415
14021	NC_022118	AGC	2	6	704463	704468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422415
14022	NC_022118	AAAT	2	8	704546	704553	75 %	25 %	0 %	0 %	532422416
14023	NC_022118	ACC	2	6	704582	704587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422416
14024	NC_022118	CTG	2	6	704662	704667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422416
14025	NC_022118	ATG	2	6	704871	704876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422416
14026	NC_022118	TCA	2	6	704963	704968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422416
14027	NC_022118	TTG	2	6	704983	704988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422416
14028	NC_022118	GCT	2	6	705008	705013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422416
14029	NC_022118	TTTCT	2	10	705043	705052	0 %	80 %	0 %	20 %	532422416
14030	NC_022118	ACA	2	6	705116	705121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422416
14031	NC_022118	TACA	2	8	705169	705176	50 %	25 %	0 %	25 %	532422416
14032	NC_022118	AGACG	2	10	705233	705242	40 %	0 %	40 %	20 %	532422416
14033	NC_022118	TCAA	2	8	705284	705291	50 %	25 %	0 %	25 %	532422416
14034	NC_022118	TTC	2	6	705434	705439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
14035	NC_022118	GAAT	2	8	705456	705463	50 %	25 %	25 %	0 %	532422416
14036	NC_022118	TCA	2	6	705557	705562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422416
14037	NC_022118	TTA	2	6	705686	705691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422416
14038	NC_022118	TCT	2	6	705722	705727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
14039	NC_022118	AAC	3	9	705766	705774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422416
14040	NC_022118	CTG	2	6	705811	705816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422416
14041	NC_022118	TTG	2	6	705817	705822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422416
14042	NC_022118	GAT	2	6	705827	705832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422416
14043	NC_022118	GCA	2	6	705836	705841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422416
14044	NC_022118	TGC	3	9	705851	705859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422416
14045	NC_022118	GCAC	2	8	705893	705900	25 %	0 %	25 %	50 %	532422416
14046	NC_022118	CAT	2	6	705919	705924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422416
14047	NC_022118	TAG	2	6	705957	705962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422416
14048	NC_022118	AG	3	6	705980	705985	50 %	0 %	50 %	0 %	532422416
14049	NC_022118	GCT	2	6	706100	706105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422416
14050	NC_022118	TGAGA	2	10	706212	706221	40 %	20 %	40 %	0 %	532422416
14051	NC_022118	TTC	2	6	706249	706254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
14052	NC_022118	CTT	2	6	706260	706265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
14053	NC_022118	CTT	2	6	706281	706286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
14054	NC_022118	CAT	2	6	706455	706460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422416
14055	NC_022118	GAAAGA	2	12	706463	706474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422416
14056	NC_022118	CTTG	2	8	706506	706513	0 %	50 %	25 %	25 %	532422416
14057	NC_022118	TTC	3	9	706561	706569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
14058	NC_022118	CAA	2	6	706701	706706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422416
14059	NC_022118	CT	3	6	706757	706762	0 %	50 %	0 %	50 %	532422416
14060	NC_022118	TCTA	2	8	706780	706787	25 %	50 %	0 %	25 %	532422416
14061	NC_022118	AAG	2	6	706855	706860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422416
14062	NC_022118	CTT	2	6	706872	706877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
14063	NC_022118	TTG	2	6	706920	706925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422416
14064	NC_022118	TCT	2	6	706944	706949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
14065	NC_022118	TAT	2	6	706971	706976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422416
14066	NC_022118	CT	3	6	707023	707028	0 %	50 %	0 %	50 %	532422416
14067	NC_022118	TGAA	2	8	707292	707299	50 %	25 %	25 %	0 %	532422417
14068	NC_022118	CAA	2	6	707356	707361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422417
14069	NC_022118	CT	3	6	707363	707368	0 %	50 %	0 %	50 %	532422417
14070	NC_022118	GCA	2	6	707379	707384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422417
14071	NC_022118	CAG	2	6	707416	707421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422417
14072	NC_022118	TCT	2	6	707475	707480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422417
14073	NC_022118	TTGC	2	8	707485	707492	0 %	50 %	25 %	25 %	532422417
14074	NC_022118	TA	3	6	707542	707547	50 %	50 %	0 %	0 %	532422417
14075	NC_022118	CTG	2	6	707584	707589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422417
14076	NC_022118	CGC	2	6	707692	707697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422417
14077	NC_022118	TGC	3	9	707756	707764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422417
14078	NC_022118	GAA	2	6	707775	707780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422417
14079	NC_022118	GAA	2	6	707784	707789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422417
14080	NC_022118	CCT	2	6	707850	707855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422417
14081	NC_022118	CTG	2	6	707908	707913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422417
14082	NC_022118	GTT	2	6	707917	707922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422417
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14084	NC_022118	CAT	2	6	708124	708129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422417
14085	NC_022118	CAA	2	6	708134	708139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422417
14086	NC_022118	TTC	2	6	708145	708150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422417
14087	NC_022118	AGC	2	6	708197	708202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422417
14088	NC_022118	CTC	2	6	708284	708289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422417
14089	NC_022118	T	6	6	708293	708298	0 %	100 %	0 %	0 %	532422417
14090	NC_022118	CAG	2	6	708358	708363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422417
14091	NC_022118	AATT	2	8	708368	708375	50 %	50 %	0 %	0 %	532422417
14092	NC_022118	TAT	2	6	708403	708408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422417
14093	NC_022118	GAA	2	6	708421	708426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422417
14094	NC_022118	AGA	2	6	708497	708502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422417
14095	NC_022118	TTG	2	6	708594	708599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422417
14096	NC_022118	ATCTG	2	10	708627	708636	20 %	40 %	20 %	20 %	532422417
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14099	NC_022118	CTT	2	6	708757	708762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422417
14100	NC_022118	TTTCG	2	10	708836	708845	0 %	60 %	20 %	20 %	532422417
14101	NC_022118	TCA	2	6	708909	708914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422417
14102	NC_022118	GA	5	10	708970	708979	50 %	0 %	50 %	0 %	532422417
14103	NC_022118	AG	3	6	709020	709025	50 %	0 %	50 %	0 %	532422417
14104	NC_022118	A	6	6	709050	709055	100 %	0 %	0 %	0 %	532422417
14105	NC_022118	GCT	2	6	709061	709066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422417
14106	NC_022118	TAA	2	6	709147	709152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422417
14107	NC_022118	AGA	2	6	709175	709180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422417
14108	NC_022118	A	8	8	709212	709219	100 %	0 %	0 %	0 %	532422417
14109	NC_022118	A	7	7	709221	709227	100 %	0 %	0 %	0 %	532422417
14110	NC_022118	CTTA	2	8	709229	709236	25 %	50 %	0 %	25 %	532422417
14111	NC_022118	AGC	2	6	709393	709398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422418
14112	NC_022118	GAAA	2	8	709408	709415	75 %	0 %	25 %	0 %	532422418
14113	NC_022118	TAGT	2	8	709460	709467	25 %	50 %	25 %	0 %	532422418
14114	NC_022118	TCG	2	6	709624	709629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422418
14115	NC_022118	AG	3	6	709640	709645	50 %	0 %	50 %	0 %	532422418
14116	NC_022118	GTT	2	6	709700	709705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422418
14117	NC_022118	T	6	6	709772	709777	0 %	100 %	0 %	0 %	532422418
14118	NC_022118	CAAC	2	8	709815	709822	50 %	0 %	0 %	50 %	532422418
14119	NC_022118	AAT	2	6	709836	709841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422418
14120	NC_022118	CTG	2	6	709884	709889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422418
14121	NC_022118	CAA	2	6	709923	709928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422418
14122	NC_022118	ACC	2	6	710023	710028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422418
14123	NC_022118	AAG	2	6	710207	710212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422418
14124	NC_022118	CTG	2	6	710232	710237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422418
14125	NC_022118	AGA	2	6	710239	710244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422418
14126	NC_022118	AGC	2	6	710296	710301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422418
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14129	NC_022118	GC	3	6	710574	710579	0 %	0 %	50 %	50 %	532422418
14130	NC_022118	T	6	6	710602	710607	0 %	100 %	0 %	0 %	532422418
14131	NC_022118	T	7	7	710710	710716	0 %	100 %	0 %	0 %	532422720
14132	NC_022118	CTTA	2	8	710736	710743	25 %	50 %	0 %	25 %	532422720
14133	NC_022118	AGGA	2	8	710782	710789	50 %	0 %	50 %	0 %	532422720
14134	NC_022118	T	6	6	710790	710795	0 %	100 %	0 %	0 %	532422720
14135	NC_022118	GAA	2	6	710819	710824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422720
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14140	NC_022118	TTG	2	6	711017	711022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422419
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14142	NC_022118	TAA	2	6	711085	711090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422419
14143	NC_022118	GCT	2	6	711093	711098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422419
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14145	NC_022118	ACG	2	6	711211	711216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422419
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14154	NC_022118	ACC	2	6	711510	711515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422419
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14220	NC_022118	ACTCT	2	10	715162	715171	20 %	40 %	0 %	40 %	532422422
14221	NC_022118	CTT	2	6	715175	715180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422422
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14223	NC_022118	TGGA	2	8	715212	715219	25 %	25 %	50 %	0 %	532422422
14224	NC_022118	CT	3	6	715345	715350	0 %	50 %	0 %	50 %	532422422
14225	NC_022118	CTA	2	6	715372	715377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422422
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14229	NC_022118	CTC	2	6	715473	715478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422422
14230	NC_022118	AG	4	8	715498	715505	50 %	0 %	50 %	0 %	532422422
14231	NC_022118	AAAC	2	8	715507	715514	75 %	0 %	0 %	25 %	532422422
14232	NC_022118	CAA	2	6	715539	715544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422422
14233	NC_022118	ACCA	2	8	715578	715585	50 %	0 %	0 %	50 %	532422422
14234	NC_022118	A	7	7	715590	715596	100 %	0 %	0 %	0 %	532422422
14235	NC_022118	TGC	2	6	715789	715794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422423
14236	NC_022118	AAT	2	6	715805	715810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422423
14237	NC_022118	ATC	2	6	715840	715845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422423
14238	NC_022118	ATC	2	6	715864	715869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422423
14239	NC_022118	CTA	2	6	715911	715916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422423
14240	NC_022118	TCC	3	9	715936	715944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422423
14241	NC_022118	AAC	2	6	715946	715951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422423
14242	NC_022118	GCAA	2	8	715963	715970	50 %	0 %	25 %	25 %	532422423
14243	NC_022118	TAA	2	6	715998	716003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422423
14244	NC_022118	A	6	6	716035	716040	100 %	0 %	0 %	0 %	532422423
14245	NC_022118	CCT	2	6	716057	716062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422423
14246	NC_022118	TCC	2	6	716068	716073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422423
14247	NC_022118	AGC	2	6	716188	716193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422423
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14251	NC_022118	CAA	2	6	716391	716396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422423
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14253	NC_022118	T	7	7	716498	716504	0 %	100 %	0 %	0 %	532422423
14254	NC_022118	TCGA	2	8	716511	716518	25 %	25 %	25 %	25 %	532422423
14255	NC_022118	AAT	2	6	716529	716534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422423
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14257	NC_022118	TCA	2	6	716563	716568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422423
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14259	NC_022118	ATG	2	6	716738	716743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422424
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14261	NC_022118	ATCTA	2	10	716762	716771	40 %	40 %	0 %	20 %	532422424
14262	NC_022118	AGC	2	6	716846	716851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422424
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14265	NC_022118	ATA	2	6	716973	716978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422424
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14268	NC_022118	CTT	2	6	717061	717066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422424
14269	NC_022118	TCT	2	6	717111	717116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422424
14270	NC_022118	CAAA	2	8	717135	717142	75 %	0 %	0 %	25 %	532422424
14271	NC_022118	AGG	2	6	717193	717198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422424
14272	NC_022118	T	6	6	717294	717299	0 %	100 %	0 %	0 %	532422425
14273	NC_022118	CAT	2	6	717305	717310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422425
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14275	NC_022118	AAG	2	6	717444	717449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422425
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14278	NC_022118	TCA	2	6	717718	717723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422425
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14281	NC_022118	TC	3	6	717779	717784	0 %	50 %	0 %	50 %	532422425
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14350	NC_022118	TTA	2	6	721353	721358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422428
14351	NC_022118	AG	3	6	721366	721371	50 %	0 %	50 %	0 %	532422428
14352	NC_022118	GCTA	2	8	721421	721428	25 %	25 %	25 %	25 %	532422428
14353	NC_022118	GA	3	6	721446	721451	50 %	0 %	50 %	0 %	532422428
14354	NC_022118	GAA	2	6	721462	721467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422428
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14357	NC_022118	TCT	2	6	721595	721600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422429
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14359	NC_022118	TAA	3	9	721662	721670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422429
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14361	NC_022118	CATG	2	8	721740	721747	25 %	25 %	25 %	25 %	532422429
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14363	NC_022118	A	6	6	721784	721789	100 %	0 %	0 %	0 %	532422429
14364	NC_022118	AGAT	2	8	721792	721799	50 %	25 %	25 %	0 %	532422429
14365	NC_022118	GAA	2	6	721872	721877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422429
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