MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022118	TG	3	6	679910	679915	0 %	50 %	50 %	0 %	532422393
13502	NC_022118	AAAG	2	8	679967	679974	75 %	0 %	25 %	0 %	532422393
13503	NC_022118	CTT	2	6	679977	679982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422393
13504	NC_022118	ACC	2	6	679998	680003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422393
13505	NC_022118	CTG	2	6	680045	680050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422393
13506	NC_022118	A	7	7	680063	680069	100 %	0 %	0 %	0 %	532422393
13507	NC_022118	GA	3	6	680094	680099	50 %	0 %	50 %	0 %	532422393
13508	NC_022118	TAT	2	6	680183	680188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422394
13509	NC_022118	CTT	2	6	680194	680199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422394
13510	NC_022118	TTC	2	6	680205	680210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422394
13511	NC_022118	GAA	2	6	680305	680310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422394
13512	NC_022118	CAA	2	6	680314	680319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422394
13513	NC_022118	TTG	2	6	680324	680329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422394
13514	NC_022118	AGA	2	6	680346	680351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422394
13515	NC_022118	TA	4	8	680495	680502	50 %	50 %	0 %	0 %	532422394
13516	NC_022118	TCG	2	6	680556	680561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422394
13517	NC_022118	TCA	2	6	680585	680590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422394
13518	NC_022118	CAA	2	6	680677	680682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422394
13519	NC_022118	TCG	2	6	680685	680690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422394
13520	NC_022118	TAA	2	6	680730	680735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422394
13521	NC_022118	CCT	2	6	680817	680822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422395
13522	NC_022118	TCA	2	6	680836	680841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422395
13523	NC_022118	ACCT	2	8	680922	680929	25 %	25 %	0 %	50 %	532422395
13524	NC_022118	TCT	2	6	681014	681019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422395
13525	NC_022118	AAAT	2	8	681025	681032	75 %	25 %	0 %	0 %	532422395
13526	NC_022118	CAA	2	6	681044	681049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422395
13527	NC_022118	A	8	8	681054	681061	100 %	0 %	0 %	0 %	532422395
13528	NC_022118	TGT	2	6	681172	681177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422395
13529	NC_022118	GA	3	6	681186	681191	50 %	0 %	50 %	0 %	532422395
13530	NC_022118	CGT	2	6	681226	681231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422395
13531	NC_022118	A	7	7	681238	681244	100 %	0 %	0 %	0 %	532422395
13532	NC_022118	TAA	2	6	681247	681252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422395
13533	NC_022118	ATA	2	6	681325	681330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422395
13534	NC_022118	AAC	2	6	681468	681473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422396
13535	NC_022118	TAT	2	6	681524	681529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422396
13536	NC_022118	GAA	2	6	681564	681569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422396
13537	NC_022118	CTT	2	6	681572	681577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422396
13538	NC_022118	CTT	2	6	681590	681595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422396
13539	NC_022118	ACTA	2	8	681626	681633	50 %	25 %	0 %	25 %	532422396
13540	NC_022118	ATC	2	6	681636	681641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422396
13541	NC_022118	ATT	2	6	681675	681680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422396
13542	NC_022118	CT	3	6	681694	681699	0 %	50 %	0 %	50 %	532422396
13543	NC_022118	CTT	2	6	681717	681722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422396
13544	NC_022118	AGA	2	6	681874	681879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422397
13545	NC_022118	AAC	2	6	681953	681958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422397
13546	NC_022118	AGCG	2	8	681992	681999	25 %	0 %	50 %	25 %	532422397
13547	NC_022118	AAG	2	6	682042	682047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422397
13548	NC_022118	TCC	2	6	682082	682087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422397
13549	NC_022118	GTC	2	6	682130	682135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422397
13550	NC_022118	ATCT	2	8	682183	682190	25 %	50 %	0 %	25 %	532422397
13551	NC_022118	AC	3	6	682214	682219	50 %	0 %	0 %	50 %	532422397
13552	NC_022118	AGA	2	6	682243	682248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422397
13553	NC_022118	AG	3	6	682278	682283	50 %	0 %	50 %	0 %	532422397
13554	NC_022118	TTTC	2	8	682285	682292	0 %	75 %	0 %	25 %	532422397
13555	NC_022118	TCT	2	6	682293	682298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422397
13556	NC_022118	AAC	2	6	682304	682309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422397
13557	NC_022118	ATA	2	6	682356	682361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422397
13558	NC_022118	CTC	2	6	682362	682367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422397
13559	NC_022118	AGAA	2	8	682370	682377	75 %	0 %	25 %	0 %	532422397
13560	NC_022118	AAC	2	6	682630	682635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422398
13561	NC_022118	GTC	2	6	682642	682647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422398
13562	NC_022118	GA	3	6	682763	682768	50 %	0 %	50 %	0 %	532422398
13563	NC_022118	CCT	3	9	682784	682792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422398
13564	NC_022118	GCG	2	6	682837	682842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422398
13565	NC_022118	GAAT	2	8	682916	682923	50 %	25 %	25 %	0 %	532422398
13566	NC_022118	CACC	2	8	682927	682934	25 %	0 %	0 %	75 %	532422398
13567	NC_022118	AGA	2	6	682980	682985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422398
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13569	NC_022118	GCA	2	6	683023	683028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422398
13570	NC_022118	AC	3	6	683037	683042	50 %	0 %	0 %	50 %	532422398
13571	NC_022118	GAA	2	6	683050	683055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422398
13572	NC_022118	CTT	2	6	683093	683098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422398
13573	NC_022118	A	6	6	683125	683130	100 %	0 %	0 %	0 %	532422398
13574	NC_022118	CT	3	6	683147	683152	0 %	50 %	0 %	50 %	532422398
13575	NC_022118	AGA	2	6	683190	683195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422398
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13577	NC_022118	CACAG	2	10	683340	683349	40 %	0 %	20 %	40 %	532422398
13578	NC_022118	CT	3	6	683362	683367	0 %	50 %	0 %	50 %	532422398
13579	NC_022118	TAA	2	6	683391	683396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422398
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13587	NC_022118	TTC	2	6	683628	683633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422398
13588	NC_022118	TTC	2	6	683637	683642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422398
13589	NC_022118	TTC	2	6	683659	683664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422398
13590	NC_022118	CG	3	6	683719	683724	0 %	0 %	50 %	50 %	532422398
13591	NC_022118	ATAC	2	8	683732	683739	50 %	25 %	0 %	25 %	532422398
13592	NC_022118	A	6	6	683780	683785	100 %	0 %	0 %	0 %	532422398
13593	NC_022118	TTTTC	2	10	683795	683804	0 %	80 %	0 %	20 %	532422398
13594	NC_022118	AAG	2	6	683808	683813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422398
13595	NC_022118	TAA	2	6	683874	683879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422398
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13597	NC_022118	CA	3	6	684309	684314	50 %	0 %	0 %	50 %	532422399
13598	NC_022118	TAA	2	6	684379	684384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422399
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13601	NC_022118	A	6	6	684568	684573	100 %	0 %	0 %	0 %	532422399
13602	NC_022118	CATA	2	8	684579	684586	50 %	25 %	0 %	25 %	532422399
13603	NC_022118	GAA	2	6	684591	684596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422399
13604	NC_022118	TTTA	2	8	684619	684626	25 %	75 %	0 %	0 %	532422399
13605	NC_022118	CATC	2	8	684648	684655	25 %	25 %	0 %	50 %	532422399
13606	NC_022118	TGT	2	6	684733	684738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422399
13607	NC_022118	AATC	2	8	684793	684800	50 %	25 %	0 %	25 %	532422399
13608	NC_022118	TCCC	2	8	684975	684982	0 %	25 %	0 %	75 %	532422399
13609	NC_022118	AATT	2	8	685006	685013	50 %	50 %	0 %	0 %	532422399
13610	NC_022118	TGC	2	6	685020	685025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422399
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13612	NC_022118	ATGA	2	8	685061	685068	50 %	25 %	25 %	0 %	532422399
13613	NC_022118	CAT	2	6	685095	685100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422399
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13620	NC_022118	ATC	2	6	685605	685610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422400
13621	NC_022118	CT	3	6	685620	685625	0 %	50 %	0 %	50 %	532422400
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13623	NC_022118	A	7	7	685732	685738	100 %	0 %	0 %	0 %	532422400
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13733	NC_022118	ATC	2	6	691091	691096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422405
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13739	NC_022118	TTCTT	2	10	691292	691301	0 %	80 %	0 %	20 %	532422405
13740	NC_022118	A	6	6	691322	691327	100 %	0 %	0 %	0 %	532422406
13741	NC_022118	ACAA	2	8	691462	691469	75 %	0 %	0 %	25 %	532422406
13742	NC_022118	GAC	2	6	691521	691526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422406
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13987	NC_022118	TCA	2	6	702947	702952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422415
13988	NC_022118	ACT	2	6	702985	702990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422415
13989	NC_022118	AACG	2	8	702999	703006	50 %	0 %	25 %	25 %	532422415
13990	NC_022118	GC	3	6	703035	703040	0 %	0 %	50 %	50 %	532422415
13991	NC_022118	AACT	2	8	703061	703068	50 %	25 %	0 %	25 %	532422415
13992	NC_022118	TGA	2	6	703110	703115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
13993	NC_022118	AGG	2	6	703122	703127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422415
13994	NC_022118	GAC	2	6	703194	703199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422415
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13996	NC_022118	AG	3	6	703335	703340	50 %	0 %	50 %	0 %	532422415
13997	NC_022118	CTT	2	6	703408	703413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422415
13998	NC_022118	T	6	6	703489	703494	0 %	100 %	0 %	0 %	532422415
13999	NC_022118	CTT	2	6	703560	703565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422415
14000	NC_022118	AGA	2	6	703568	703573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422415

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