MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022118	GAA	2	6	653047	653052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422376
13002	NC_022118	CAAAT	2	10	653086	653095	60 %	20 %	0 %	20 %	532422376
13003	NC_022118	A	6	6	653099	653104	100 %	0 %	0 %	0 %	532422376
13004	NC_022118	CACAGG	2	12	653148	653159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422376
13005	NC_022118	CAG	2	6	653177	653182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422376
13006	NC_022118	ACA	2	6	653195	653200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422376
13007	NC_022118	AAG	2	6	653291	653296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422376
13008	NC_022118	GCT	2	6	653308	653313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422376
13009	NC_022118	CAG	2	6	653379	653384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422376
13010	NC_022118	CT	3	6	653445	653450	0 %	50 %	0 %	50 %	532422376
13011	NC_022118	ATAA	2	8	653496	653503	75 %	25 %	0 %	0 %	532422376
13012	NC_022118	ATA	2	6	653636	653641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422376
13013	NC_022118	ACT	2	6	653656	653661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422376
13014	NC_022118	AC	3	6	653801	653806	50 %	0 %	0 %	50 %	532422376
13015	NC_022118	AAC	2	6	653830	653835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422376
13016	NC_022118	CCA	2	6	653846	653851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422376
13017	NC_022118	T	6	6	654136	654141	0 %	100 %	0 %	0 %	532422377
13018	NC_022118	AAG	2	6	654179	654184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422377
13019	NC_022118	TTA	2	6	654263	654268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422377
13020	NC_022118	CCA	2	6	654290	654295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422377
13021	NC_022118	GAT	2	6	654334	654339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422377
13022	NC_022118	AC	3	6	654363	654368	50 %	0 %	0 %	50 %	532422377
13023	NC_022118	CTA	2	6	654453	654458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422377
13024	NC_022118	GAA	2	6	654484	654489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422377
13025	NC_022118	AGA	2	6	654528	654533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422377
13026	NC_022118	GCT	2	6	654574	654579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422377
13027	NC_022118	GAA	2	6	654634	654639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422377
13028	NC_022118	CCTT	2	8	654696	654703	0 %	50 %	0 %	50 %	532422377
13029	NC_022118	TCT	2	6	654742	654747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422377
13030	NC_022118	AT	3	6	654790	654795	50 %	50 %	0 %	0 %	532422377
13031	NC_022118	TCA	2	6	654837	654842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422377
13032	NC_022118	AGA	2	6	654846	654851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422377
13033	NC_022118	A	7	7	654855	654861	100 %	0 %	0 %	0 %	532422377
13034	NC_022118	TC	3	6	654899	654904	0 %	50 %	0 %	50 %	532422377
13035	NC_022118	CTG	2	6	654917	654922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422377
13036	NC_022118	T	6	6	654930	654935	0 %	100 %	0 %	0 %	532422377
13037	NC_022118	GTT	2	6	654952	654957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422377
13038	NC_022118	ACT	2	6	654974	654979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422377
13039	NC_022118	TCA	2	6	654990	654995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422377
13040	NC_022118	AG	3	6	655039	655044	50 %	0 %	50 %	0 %	532422377
13041	NC_022118	GAA	2	6	655108	655113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422377
13042	NC_022118	GAT	2	6	655429	655434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422377
13043	NC_022118	GA	3	6	655643	655648	50 %	0 %	50 %	0 %	532422377
13044	NC_022118	TAT	2	6	655659	655664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422377
13045	NC_022118	TTTG	2	8	655677	655684	0 %	75 %	25 %	0 %	532422377
13046	NC_022118	ATT	2	6	655768	655773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422377
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13048	NC_022118	TC	3	6	656009	656014	0 %	50 %	0 %	50 %	532422377
13049	NC_022118	TCCT	2	8	656052	656059	0 %	50 %	0 %	50 %	532422377
13050	NC_022118	GGC	2	6	656545	656550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422378
13051	NC_022118	GTT	2	6	656695	656700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422378
13052	NC_022118	A	7	7	656711	656717	100 %	0 %	0 %	0 %	532422378
13053	NC_022118	AGA	2	6	656721	656726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422378
13054	NC_022118	TTGG	2	8	656778	656785	0 %	50 %	50 %	0 %	532422378
13055	NC_022118	GCT	2	6	656812	656817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422378
13056	NC_022118	ATT	2	6	656845	656850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422378
13057	NC_022118	AC	3	6	656891	656896	50 %	0 %	0 %	50 %	532422378
13058	NC_022118	CTT	2	6	656900	656905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422378
13059	NC_022118	GCT	2	6	656935	656940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422378
13060	NC_022118	A	6	6	657113	657118	100 %	0 %	0 %	0 %	532422378
13061	NC_022118	CTT	2	6	657133	657138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422378
13062	NC_022118	GAA	2	6	657250	657255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422378
13063	NC_022118	CT	3	6	657416	657421	0 %	50 %	0 %	50 %	532422379
13064	NC_022118	AGA	2	6	657454	657459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422379
13065	NC_022118	CAA	2	6	657497	657502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422379
13066	NC_022118	TCA	3	9	657535	657543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422379
13067	NC_022118	A	6	6	657572	657577	100 %	0 %	0 %	0 %	532422379
13068	NC_022118	ATT	2	6	657586	657591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422379
13069	NC_022118	TTA	2	6	657673	657678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422379
13070	NC_022118	A	6	6	657779	657784	100 %	0 %	0 %	0 %	532422379
13071	NC_022118	ATC	2	6	657880	657885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422379
13072	NC_022118	CAA	2	6	657893	657898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422379
13073	NC_022118	CTTTT	2	10	657901	657910	0 %	80 %	0 %	20 %	532422379
13074	NC_022118	T	7	7	657907	657913	0 %	100 %	0 %	0 %	532422379
13075	NC_022118	ATT	2	6	657928	657933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422379
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13083	NC_022118	GTT	2	6	658235	658240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422380
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13085	NC_022118	TCA	2	6	658342	658347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422380
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13087	NC_022118	A	7	7	658501	658507	100 %	0 %	0 %	0 %	532422380
13088	NC_022118	A	7	7	658519	658525	100 %	0 %	0 %	0 %	532422380
13089	NC_022118	AAG	2	6	658540	658545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422380
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13091	NC_022118	ATC	2	6	658614	658619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422380
13092	NC_022118	GTC	2	6	658872	658877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422381
13093	NC_022118	TTC	2	6	658910	658915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422381
13094	NC_022118	ACT	2	6	658940	658945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422381
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13097	NC_022118	GAA	2	6	659168	659173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422381
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13099	NC_022118	TTTA	2	8	659527	659534	25 %	75 %	0 %	0 %	532422381
13100	NC_022118	GAA	2	6	659564	659569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422381
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13102	NC_022118	AGA	2	6	659638	659643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422381
13103	NC_022118	AATC	2	8	659644	659651	50 %	25 %	0 %	25 %	532422381
13104	NC_022118	CAA	2	6	659723	659728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422381
13105	NC_022118	A	6	6	659736	659741	100 %	0 %	0 %	0 %	532422381
13106	NC_022118	TAAA	2	8	659827	659834	75 %	25 %	0 %	0 %	532422381
13107	NC_022118	A	6	6	659832	659837	100 %	0 %	0 %	0 %	532422381
13108	NC_022118	AAC	2	6	659842	659847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422381
13109	NC_022118	TG	3	6	659855	659860	0 %	50 %	50 %	0 %	532422381
13110	NC_022118	TCC	2	6	659904	659909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422382
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13112	NC_022118	CTT	2	6	660109	660114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422382
13113	NC_022118	CTA	2	6	660145	660150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422382
13114	NC_022118	TAC	2	6	660155	660160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422382
13115	NC_022118	A	6	6	660201	660206	100 %	0 %	0 %	0 %	532422382
13116	NC_022118	CTT	2	6	660209	660214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422382
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13119	NC_022118	CT	3	6	660386	660391	0 %	50 %	0 %	50 %	532422382
13120	NC_022118	CCT	2	6	660420	660425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422382
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13122	NC_022118	ACC	2	6	660578	660583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422382
13123	NC_022118	CT	3	6	660594	660599	0 %	50 %	0 %	50 %	532422382
13124	NC_022118	GAA	2	6	660662	660667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422382
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13126	NC_022118	GAA	2	6	660692	660697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422382
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13227	NC_022118	TCC	2	6	665109	665114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422384
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13229	NC_022118	GA	3	6	665201	665206	50 %	0 %	50 %	0 %	532422384
13230	NC_022118	GAA	2	6	665215	665220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422384
13231	NC_022118	GAA	2	6	665263	665268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422384
13232	NC_022118	TTA	2	6	665373	665378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422384
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13234	NC_022118	CTC	2	6	665559	665564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422385
13235	NC_022118	CTTT	3	12	665585	665596	0 %	75 %	0 %	25 %	532422385
13236	NC_022118	ATT	2	6	665621	665626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422385
13237	NC_022118	GAAAA	2	10	665669	665678	80 %	0 %	20 %	0 %	532422385
13238	NC_022118	T	6	6	665752	665757	0 %	100 %	0 %	0 %	532422385
13239	NC_022118	GAT	2	6	665776	665781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422385
13240	NC_022118	TTC	2	6	665818	665823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422385
13241	NC_022118	TA	3	6	665873	665878	50 %	50 %	0 %	0 %	532422385
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13243	NC_022118	TCT	2	6	666097	666102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422385
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