MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022118	ATT	2	6	629720	629725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422353
12502	NC_022118	GGT	2	6	629729	629734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422353
12503	NC_022118	AAGC	2	8	629796	629803	50 %	0 %	25 %	25 %	532422353
12504	NC_022118	AAT	2	6	629822	629827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422353
12505	NC_022118	GAA	2	6	629954	629959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422353
12506	NC_022118	TGA	2	6	630037	630042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422353
12507	NC_022118	TCA	2	6	630145	630150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422353
12508	NC_022118	GCA	2	6	630161	630166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422353
12509	NC_022118	CAG	2	6	630264	630269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422353
12510	NC_022118	CAA	3	9	630272	630280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422353
12511	NC_022118	A	6	6	630279	630284	100 %	0 %	0 %	0 %	532422353
12512	NC_022118	ACT	2	6	630380	630385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422353
12513	NC_022118	CAG	2	6	630386	630391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422353
12514	NC_022118	TCA	2	6	630425	630430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422353
12515	NC_022118	GTT	2	6	630538	630543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422353
12516	NC_022118	GCT	2	6	630545	630550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422353
12517	NC_022118	A	6	6	630578	630583	100 %	0 %	0 %	0 %	532422353
12518	NC_022118	A	6	6	630610	630615	100 %	0 %	0 %	0 %	532422353
12519	NC_022118	ATA	2	6	630686	630691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422354
12520	NC_022118	TTG	2	6	630753	630758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422354
12521	NC_022118	GAA	2	6	630862	630867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422354
12522	NC_022118	TCA	2	6	630917	630922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422354
12523	NC_022118	TGA	2	6	630936	630941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422354
12524	NC_022118	GGA	2	6	630952	630957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422354
12525	NC_022118	ATT	2	6	630976	630981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422354
12526	NC_022118	CA	3	6	630991	630996	50 %	0 %	0 %	50 %	532422354
12527	NC_022118	TGC	2	6	631050	631055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422354
12528	NC_022118	CTAT	2	8	631085	631092	25 %	50 %	0 %	25 %	532422354
12529	NC_022118	ACTC	2	8	631119	631126	25 %	25 %	0 %	50 %	532422354
12530	NC_022118	CTAC	2	8	631145	631152	25 %	25 %	0 %	50 %	532422354
12531	NC_022118	ATG	2	6	631165	631170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422354
12532	NC_022118	TGA	2	6	631202	631207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422354
12533	NC_022118	ATT	2	6	631373	631378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422354
12534	NC_022118	TTTA	2	8	631408	631415	25 %	75 %	0 %	0 %	532422354
12535	NC_022118	TTCG	2	8	631426	631433	0 %	50 %	25 %	25 %	532422354
12536	NC_022118	AACCTC	2	12	631482	631493	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532422354
12537	NC_022118	T	6	6	631652	631657	0 %	100 %	0 %	0 %	532422355
12538	NC_022118	TCT	2	6	631671	631676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422355
12539	NC_022118	AC	3	6	631706	631711	50 %	0 %	0 %	50 %	532422355
12540	NC_022118	AGC	2	6	631789	631794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422355
12541	NC_022118	AGG	2	6	631804	631809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422355
12542	NC_022118	AAC	2	6	631818	631823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422355
12543	NC_022118	GCA	2	6	631844	631849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422355
12544	NC_022118	CTT	2	6	631913	631918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422355
12545	NC_022118	A	6	6	631962	631967	100 %	0 %	0 %	0 %	532422355
12546	NC_022118	AAG	2	6	631977	631982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422355
12547	NC_022118	TCG	2	6	632028	632033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422355
12548	NC_022118	GAA	3	9	632063	632071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422355
12549	NC_022118	TA	3	6	632097	632102	50 %	50 %	0 %	0 %	532422355
12550	NC_022118	TAT	2	6	632137	632142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422355
12551	NC_022118	CTT	2	6	632223	632228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422355
12552	NC_022118	AC	5	10	632402	632411	50 %	0 %	0 %	50 %	532422355
12553	NC_022118	CT	3	6	632468	632473	0 %	50 %	0 %	50 %	532422355
12554	NC_022118	AGC	2	6	632512	632517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422355
12555	NC_022118	AAC	2	6	632547	632552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422355
12556	NC_022118	AAG	2	6	632577	632582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422355
12557	NC_022118	TGA	2	6	632637	632642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422356
12558	NC_022118	TGA	2	6	632656	632661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422356
12559	NC_022118	TCT	2	6	632686	632691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422356
12560	NC_022118	CAT	2	6	632705	632710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422356
12561	NC_022118	TCCT	2	8	632767	632774	0 %	50 %	0 %	50 %	532422356
12562	NC_022118	TCCC	2	8	632799	632806	0 %	25 %	0 %	75 %	532422356
12563	NC_022118	ATT	2	6	632821	632826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422356
12564	NC_022118	ACT	2	6	632857	632862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422356
12565	NC_022118	GCT	2	6	632901	632906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422356
12566	NC_022118	CTAC	2	8	632923	632930	25 %	25 %	0 %	50 %	532422356
12567	NC_022118	TCC	2	6	632956	632961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422356
12568	NC_022118	AGA	2	6	632971	632976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422356
12569	NC_022118	ATGCT	2	10	633003	633012	20 %	40 %	20 %	20 %	532422356
12570	NC_022118	ACGGA	2	10	633137	633146	40 %	0 %	40 %	20 %	532422356
12571	NC_022118	ATT	2	6	633156	633161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422356
12572	NC_022118	GGA	2	6	633214	633219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422356
12573	NC_022118	CTT	2	6	633262	633267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422356
12574	NC_022118	AGA	2	6	633286	633291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422356
12575	NC_022118	GATA	2	8	633370	633377	50 %	25 %	25 %	0 %	532422356
12576	NC_022118	TCT	2	6	633450	633455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422356
12577	NC_022118	A	6	6	633583	633588	100 %	0 %	0 %	0 %	532422718
12578	NC_022118	CCTG	2	8	633674	633681	0 %	25 %	25 %	50 %	532422718
12579	NC_022118	GTC	2	6	633754	633759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422357
12580	NC_022118	TAA	2	6	633762	633767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422357
12581	NC_022118	A	6	6	633766	633771	100 %	0 %	0 %	0 %	532422357
12582	NC_022118	TC	3	6	633774	633779	0 %	50 %	0 %	50 %	532422357
12583	NC_022118	AAG	2	6	633833	633838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422357
12584	NC_022118	GAA	2	6	633868	633873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422357
12585	NC_022118	AGGA	2	8	633914	633921	50 %	0 %	50 %	0 %	532422357
12586	NC_022118	TTA	2	6	633953	633958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422357
12587	NC_022118	CCTC	2	8	633992	633999	0 %	25 %	0 %	75 %	532422357
12588	NC_022118	ATC	2	6	634030	634035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422357
12589	NC_022118	AAC	2	6	634157	634162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422357
12590	NC_022118	A	7	7	634176	634182	100 %	0 %	0 %	0 %	532422357
12591	NC_022118	CT	3	6	634210	634215	0 %	50 %	0 %	50 %	532422357
12592	NC_022118	A	6	6	634336	634341	100 %	0 %	0 %	0 %	532422357
12593	NC_022118	ACA	2	6	634357	634362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422357
12594	NC_022118	AAGA	2	8	634378	634385	75 %	0 %	25 %	0 %	532422357
12595	NC_022118	TCT	2	6	634424	634429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422358
12596	NC_022118	GCA	2	6	634477	634482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422358
12597	NC_022118	CTT	2	6	634493	634498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422358
12598	NC_022118	CTC	2	6	634517	634522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422358
12599	NC_022118	A	6	6	634547	634552	100 %	0 %	0 %	0 %	532422358
12600	NC_022118	CCT	2	6	634612	634617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422358
12601	NC_022118	AAG	2	6	634619	634624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422358
12602	NC_022118	TCC	2	6	634630	634635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422358
12603	NC_022118	CCT	2	6	634727	634732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422358
12604	NC_022118	ATT	2	6	634744	634749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422358
12605	NC_022118	ACA	2	6	634782	634787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422358
12606	NC_022118	CCT	2	6	634792	634797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422358
12607	NC_022118	A	6	6	634879	634884	100 %	0 %	0 %	0 %	532422358
12608	NC_022118	TCGAG	2	10	634889	634898	20 %	20 %	40 %	20 %	532422358
12609	NC_022118	T	6	6	634916	634921	0 %	100 %	0 %	0 %	532422358
12610	NC_022118	TTG	2	6	634946	634951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422358
12611	NC_022118	TTA	2	6	634988	634993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422358
12612	NC_022118	CAA	2	6	635065	635070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422358
12613	NC_022118	ATC	2	6	635092	635097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422358
12614	NC_022118	TCA	2	6	635108	635113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422358
12615	NC_022118	CTTT	2	8	635162	635169	0 %	75 %	0 %	25 %	532422358
12616	NC_022118	ATG	3	9	635212	635220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422358
12617	NC_022118	TC	4	8	635237	635244	0 %	50 %	0 %	50 %	532422358
12618	NC_022118	CTA	2	6	635290	635295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422358
12619	NC_022118	TGA	2	6	635303	635308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422358
12620	NC_022118	CAA	2	6	635347	635352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422358
12621	NC_022118	TTTG	2	8	635366	635373	0 %	75 %	25 %	0 %	532422359
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12738	NC_022118	TTTC	2	8	640057	640064	0 %	75 %	0 %	25 %	532422366
12739	NC_022118	AGAA	2	8	640086	640093	75 %	0 %	25 %	0 %	532422366
12740	NC_022118	CAC	2	6	640094	640099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422366
12741	NC_022118	TGC	2	6	640142	640147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422366
12742	NC_022118	TAA	2	6	640189	640194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422366
12743	NC_022118	CT	3	6	640227	640232	0 %	50 %	0 %	50 %	532422366
12744	NC_022118	AAG	2	6	640330	640335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422366
12745	NC_022118	CAGC	2	8	640345	640352	25 %	0 %	25 %	50 %	532422366
12746	NC_022118	TAA	3	9	640415	640423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422366
12747	NC_022118	TC	4	8	640475	640482	0 %	50 %	0 %	50 %	532422366
12748	NC_022118	AGC	2	6	640517	640522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422366
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12750	NC_022118	CT	3	6	640529	640534	0 %	50 %	0 %	50 %	532422366
12751	NC_022118	CGT	2	6	640569	640574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422366
12752	NC_022118	T	6	6	640574	640579	0 %	100 %	0 %	0 %	532422366
12753	NC_022118	CCT	2	6	640623	640628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422366
12754	NC_022118	CGGAA	2	10	640839	640848	40 %	0 %	40 %	20 %	532422367
12755	NC_022118	TAA	2	6	640909	640914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422367
12756	NC_022118	CA	3	6	640936	640941	50 %	0 %	0 %	50 %	532422367
12757	NC_022118	TTG	2	6	641001	641006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422367
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12759	NC_022118	CAT	2	6	641064	641069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422367
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12762	NC_022118	TA	3	6	641325	641330	50 %	50 %	0 %	0 %	532422367
12763	NC_022118	GTC	2	6	641336	641341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422367
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12765	NC_022118	AGG	2	6	641422	641427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422367
12766	NC_022118	ATGA	2	8	641497	641504	50 %	25 %	25 %	0 %	532422367
12767	NC_022118	TCC	2	6	641539	641544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422367
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12769	NC_022118	GCTC	2	8	641735	641742	0 %	25 %	25 %	50 %	532422367
12770	NC_022118	AAG	2	6	641809	641814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422367
12771	NC_022118	TA	3	6	641898	641903	50 %	50 %	0 %	0 %	532422367
12772	NC_022118	AAT	2	6	641920	641925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422367
12773	NC_022118	CTT	2	6	641931	641936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422367
12774	NC_022118	T	7	7	642003	642009	0 %	100 %	0 %	0 %	532422367
12775	NC_022118	GCA	2	6	642054	642059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422367
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12777	NC_022118	A	6	6	642074	642079	100 %	0 %	0 %	0 %	532422367
12778	NC_022118	CAT	2	6	642130	642135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422367
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12781	NC_022118	TTTC	2	8	642189	642196	0 %	75 %	0 %	25 %	532422368
12782	NC_022118	AGC	2	6	642209	642214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422368
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12847	NC_022118	TTA	2	6	645435	645440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422369
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12850	NC_022118	CTG	2	6	645541	645546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422369
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12852	NC_022118	A	7	7	645607	645613	100 %	0 %	0 %	0 %	532422369
12853	NC_022118	ACA	2	6	645633	645638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422369
12854	NC_022118	A	6	6	645646	645651	100 %	0 %	0 %	0 %	532422369
12855	NC_022118	TTAAAT	2	12	645796	645807	50 %	50 %	0 %	0 %	532422370
12856	NC_022118	TTCA	2	8	645809	645816	25 %	50 %	0 %	25 %	532422370
12857	NC_022118	CT	3	6	645950	645955	0 %	50 %	0 %	50 %	532422370
12858	NC_022118	ATGA	2	8	645977	645984	50 %	25 %	25 %	0 %	532422370
12859	NC_022118	TCCAT	2	10	645993	646002	20 %	40 %	0 %	40 %	532422370
12860	NC_022118	ATCC	2	8	646105	646112	25 %	25 %	0 %	50 %	532422370
12861	NC_022118	GCT	2	6	646117	646122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422370
12862	NC_022118	AAT	2	6	646274	646279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422370
12863	NC_022118	GGA	2	6	646281	646286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422370
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12871	NC_022118	GC	3	6	646779	646784	0 %	0 %	50 %	50 %	532422370
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12886	NC_022118	CAA	2	6	647580	647585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422371
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12969	NC_022118	ATG	2	6	651283	651288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422374
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12972	NC_022118	CAG	2	6	651364	651369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422374
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12975	NC_022118	GT	3	6	651465	651470	0 %	50 %	50 %	0 %	532422374
12976	NC_022118	AGCTC	2	10	651519	651528	20 %	20 %	20 %	40 %	532422375
12977	NC_022118	A	6	6	651567	651572	100 %	0 %	0 %	0 %	532422375
12978	NC_022118	CTTC	2	8	651826	651833	0 %	50 %	0 %	50 %	532422375
12979	NC_022118	GTT	2	6	651859	651864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422375
12980	NC_022118	GCAA	2	8	651921	651928	50 %	0 %	25 %	25 %	532422375
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