MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022118	AAC	2	6	604974	604979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422334
12002	NC_022118	ATAG	2	8	605000	605007	50 %	25 %	25 %	0 %	532422334
12003	NC_022118	ATC	2	6	605060	605065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422334
12004	NC_022118	A	6	6	605073	605078	100 %	0 %	0 %	0 %	532422334
12005	NC_022118	CT	3	6	605105	605110	0 %	50 %	0 %	50 %	532422334
12006	NC_022118	AAG	2	6	605122	605127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422334
12007	NC_022118	AGA	2	6	605243	605248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422334
12008	NC_022118	TC	3	6	605265	605270	0 %	50 %	0 %	50 %	532422334
12009	NC_022118	TCT	2	6	605275	605280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422334
12010	NC_022118	TCT	2	6	605307	605312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422334
12011	NC_022118	AAC	2	6	605345	605350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422334
12012	NC_022118	TAAA	2	8	605375	605382	75 %	25 %	0 %	0 %	532422334
12013	NC_022118	TTTG	2	8	605440	605447	0 %	75 %	25 %	0 %	532422334
12014	NC_022118	T	7	7	606254	606260	0 %	100 %	0 %	0 %	532422335
12015	NC_022118	GCA	2	6	606312	606317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422335
12016	NC_022118	TTC	2	6	606356	606361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422335
12017	NC_022118	CAAAGA	2	12	606452	606463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532422335
12018	NC_022118	CT	3	6	606501	606506	0 %	50 %	0 %	50 %	532422335
12019	NC_022118	CATA	2	8	606582	606589	50 %	25 %	0 %	25 %	532422336
12020	NC_022118	CT	4	8	606736	606743	0 %	50 %	0 %	50 %	532422336
12021	NC_022118	ATA	2	6	606748	606753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422336
12022	NC_022118	A	6	6	606777	606782	100 %	0 %	0 %	0 %	532422336
12023	NC_022118	CTT	2	6	606810	606815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422336
12024	NC_022118	CCA	2	6	606825	606830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422336
12025	NC_022118	AAAG	2	8	606836	606843	75 %	0 %	25 %	0 %	532422336
12026	NC_022118	AAT	2	6	606852	606857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422336
12027	NC_022118	CT	3	6	606867	606872	0 %	50 %	0 %	50 %	532422336
12028	NC_022118	CA	3	6	606937	606942	50 %	0 %	0 %	50 %	532422336
12029	NC_022118	GAA	2	6	606987	606992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422336
12030	NC_022118	A	6	6	607003	607008	100 %	0 %	0 %	0 %	532422336
12031	NC_022118	TCG	2	6	607040	607045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422337
12032	NC_022118	ACTTC	2	10	607059	607068	20 %	40 %	0 %	40 %	532422337
12033	NC_022118	AG	3	6	607079	607084	50 %	0 %	50 %	0 %	532422337
12034	NC_022118	ATGT	2	8	607126	607133	25 %	50 %	25 %	0 %	532422337
12035	NC_022118	CTT	2	6	607152	607157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422337
12036	NC_022118	TTC	2	6	607226	607231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422337
12037	NC_022118	GAA	2	6	607235	607240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422337
12038	NC_022118	AGAA	2	8	607300	607307	75 %	0 %	25 %	0 %	532422337
12039	NC_022118	TTA	2	6	607346	607351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422337
12040	NC_022118	CAA	2	6	607539	607544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422337
12041	NC_022118	TCT	2	6	607637	607642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422337
12042	NC_022118	AT	3	6	607737	607742	50 %	50 %	0 %	0 %	532422337
12043	NC_022118	TTC	2	6	607754	607759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422337
12044	NC_022118	CAT	2	6	607932	607937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422338
12045	NC_022118	CAT	2	6	608007	608012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422338
12046	NC_022118	GGA	2	6	608047	608052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422338
12047	NC_022118	A	6	6	608076	608081	100 %	0 %	0 %	0 %	532422338
12048	NC_022118	TAA	2	6	608118	608123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422338
12049	NC_022118	ATTTT	2	10	608131	608140	20 %	80 %	0 %	0 %	532422338
12050	NC_022118	GAAC	2	8	608215	608222	50 %	0 %	25 %	25 %	532422338
12051	NC_022118	GAT	2	6	608279	608284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422338
12052	NC_022118	GCT	2	6	608434	608439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422338
12053	NC_022118	T	6	6	608547	608552	0 %	100 %	0 %	0 %	532422338
12054	NC_022118	CAA	2	6	608719	608724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422338
12055	NC_022118	CTT	2	6	608783	608788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422338
12056	NC_022118	CCA	2	6	608887	608892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422338
12057	NC_022118	CGCA	2	8	608937	608944	25 %	0 %	25 %	50 %	532422338
12058	NC_022118	TCA	2	6	608950	608955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422338
12059	NC_022118	AAC	2	6	609016	609021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422338
12060	NC_022118	GATA	2	8	609056	609063	50 %	25 %	25 %	0 %	532422338
12061	NC_022118	AGT	2	6	609077	609082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422338
12062	NC_022118	TTC	2	6	609249	609254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422338
12063	NC_022118	TCA	2	6	609271	609276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422338
12064	NC_022118	ACA	2	6	609308	609313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422338
12065	NC_022118	GAA	2	6	609322	609327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422338
12066	NC_022118	CA	3	6	609402	609407	50 %	0 %	0 %	50 %	532422338
12067	NC_022118	TGA	2	6	609442	609447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422338
12068	NC_022118	AC	3	6	609471	609476	50 %	0 %	0 %	50 %	532422338
12069	NC_022118	CACC	2	8	609546	609553	25 %	0 %	0 %	75 %	532422338
12070	NC_022118	AACC	2	8	609625	609632	50 %	0 %	0 %	50 %	532422338
12071	NC_022118	TTG	2	6	609646	609651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422338
12072	NC_022118	ACAA	2	8	609730	609737	75 %	0 %	0 %	25 %	532422339
12073	NC_022118	TTG	2	6	609745	609750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422339
12074	NC_022118	GCA	2	6	609755	609760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422339
12075	NC_022118	CTT	2	6	609781	609786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422339
12076	NC_022118	CTGC	2	8	609858	609865	0 %	25 %	25 %	50 %	532422339
12077	NC_022118	CCAAAA	2	12	609959	609970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422339
12078	NC_022118	TCA	2	6	610007	610012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422339
12079	NC_022118	CGCC	2	8	610016	610023	0 %	0 %	25 %	75 %	532422339
12080	NC_022118	TAA	2	6	610085	610090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422339
12081	NC_022118	GATT	2	8	610113	610120	25 %	50 %	25 %	0 %	532422339
12082	NC_022118	ATC	2	6	610183	610188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422339
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12084	NC_022118	TCTT	2	8	610279	610286	0 %	75 %	0 %	25 %	532422339
12085	NC_022118	GAA	2	6	610321	610326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422339
12086	NC_022118	A	6	6	610373	610378	100 %	0 %	0 %	0 %	532422339
12087	NC_022118	AG	4	8	610433	610440	50 %	0 %	50 %	0 %	532422339
12088	NC_022118	TGA	2	6	610493	610498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422339
12089	NC_022118	TTG	2	6	610519	610524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422339
12090	NC_022118	ATA	2	6	610552	610557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422339
12091	NC_022118	TTA	2	6	610562	610567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422339
12092	NC_022118	CAG	2	6	610581	610586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422339
12093	NC_022118	CAA	2	6	610594	610599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422339
12094	NC_022118	AAC	2	6	610606	610611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422339
12095	NC_022118	TGC	2	6	610612	610617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422339
12096	NC_022118	T	7	7	610650	610656	0 %	100 %	0 %	0 %	532422339
12097	NC_022118	AAG	2	6	610661	610666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422339
12098	NC_022118	T	6	6	610679	610684	0 %	100 %	0 %	0 %	532422339
12099	NC_022118	A	6	6	610712	610717	100 %	0 %	0 %	0 %	532422339
12100	NC_022118	TCA	2	6	610751	610756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422339
12101	NC_022118	AGA	2	6	610810	610815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422339
12102	NC_022118	T	6	6	610829	610834	0 %	100 %	0 %	0 %	532422339
12103	NC_022118	T	8	8	610950	610957	0 %	100 %	0 %	0 %	532422717
12104	NC_022118	ACC	2	6	610972	610977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422717
12105	NC_022118	ACT	2	6	611003	611008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422717
12106	NC_022118	TC	3	6	611026	611031	0 %	50 %	0 %	50 %	532422717
12107	NC_022118	ATT	2	6	611033	611038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422717
12108	NC_022118	AC	3	6	611050	611055	50 %	0 %	0 %	50 %	532422717
12109	NC_022118	ATCC	2	8	611070	611077	25 %	25 %	0 %	50 %	532422717
12110	NC_022118	CGC	2	6	611083	611088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422717
12111	NC_022118	CT	3	6	611106	611111	0 %	50 %	0 %	50 %	532422717
12112	NC_022118	TCT	2	6	611131	611136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422717
12113	NC_022118	CCT	2	6	611353	611358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422340
12114	NC_022118	TCT	2	6	611426	611431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422340
12115	NC_022118	TTC	2	6	611455	611460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422340
12116	NC_022118	TGCCA	2	10	611487	611496	20 %	20 %	20 %	40 %	532422340
12117	NC_022118	GTA	2	6	611546	611551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422340
12118	NC_022118	CT	3	6	611552	611557	0 %	50 %	0 %	50 %	532422340
12119	NC_022118	GATT	2	8	611636	611643	25 %	50 %	25 %	0 %	532422340
12120	NC_022118	TCT	2	6	611663	611668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422340
12121	NC_022118	TC	3	6	611673	611678	0 %	50 %	0 %	50 %	532422340
12122	NC_022118	GGTT	2	8	611719	611726	0 %	50 %	50 %	0 %	532422340
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12229	NC_022118	TTAT	2	8	616229	616236	25 %	75 %	0 %	0 %	532422341
12230	NC_022118	CT	4	8	616277	616284	0 %	50 %	0 %	50 %	532422341
12231	NC_022118	TC	3	6	616320	616325	0 %	50 %	0 %	50 %	532422341
12232	NC_022118	T	6	6	616336	616341	0 %	100 %	0 %	0 %	532422341
12233	NC_022118	GAT	2	6	616349	616354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422341
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12239	NC_022118	GCT	2	6	616935	616940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422342
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12242	NC_022118	TCC	2	6	617068	617073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422342
12243	NC_022118	TC	3	6	617181	617186	0 %	50 %	0 %	50 %	532422342
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12354	NC_022118	GAAA	2	8	622258	622265	75 %	0 %	25 %	0 %	532422349
12355	NC_022118	AAC	2	6	622384	622389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422349
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12359	NC_022118	CTT	2	6	622533	622538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422349
12360	NC_022118	AC	4	8	622570	622577	50 %	0 %	0 %	50 %	532422349
12361	NC_022118	ATC	2	6	622625	622630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422349
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12363	NC_022118	A	6	6	622826	622831	100 %	0 %	0 %	0 %	532422349
12364	NC_022118	TC	3	6	622839	622844	0 %	50 %	0 %	50 %	532422349
12365	NC_022118	CCG	2	6	622885	622890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422349
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12493	NC_022118	CT	3	6	628956	628961	0 %	50 %	0 %	50 %	532422352
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