MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022118	GAA	2	6	578954	578959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422297
11502	NC_022118	GAA	2	6	579025	579030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422298
11503	NC_022118	TCTG	2	8	579059	579066	0 %	50 %	25 %	25 %	532422298
11504	NC_022118	AGA	2	6	579147	579152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422298
11505	NC_022118	TAT	2	6	579162	579167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422298
11506	NC_022118	GCG	2	6	579179	579184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422298
11507	NC_022118	T	7	7	579194	579200	0 %	100 %	0 %	0 %	532422298
11508	NC_022118	CTCCAT	2	12	579245	579256	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532422298
11509	NC_022118	T	6	6	579342	579347	0 %	100 %	0 %	0 %	532422298
11510	NC_022118	A	7	7	579352	579358	100 %	0 %	0 %	0 %	532422298
11511	NC_022118	TCA	2	6	579399	579404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422298
11512	NC_022118	CA	3	6	579403	579408	50 %	0 %	0 %	50 %	532422298
11513	NC_022118	CTT	2	6	579473	579478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422298
11514	NC_022118	ATG	2	6	579497	579502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422298
11515	NC_022118	AGA	2	6	579540	579545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422298
11516	NC_022118	GCA	2	6	579571	579576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422298
11517	NC_022118	ACTC	2	8	579612	579619	25 %	25 %	0 %	50 %	532422298
11518	NC_022118	A	9	9	579662	579670	100 %	0 %	0 %	0 %	532422298
11519	NC_022118	C	6	6	579673	579678	0 %	0 %	0 %	100 %	532422298
11520	NC_022118	TCGAA	2	10	579840	579849	40 %	20 %	20 %	20 %	532422299
11521	NC_022118	CTT	2	6	579860	579865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422299
11522	NC_022118	CT	3	6	579888	579893	0 %	50 %	0 %	50 %	532422299
11523	NC_022118	TAC	2	6	579930	579935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422299
11524	NC_022118	A	6	6	579973	579978	100 %	0 %	0 %	0 %	532422299
11525	NC_022118	TC	3	6	579981	579986	0 %	50 %	0 %	50 %	532422299
11526	NC_022118	AAC	2	6	579993	579998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422299
11527	NC_022118	GA	3	6	580024	580029	50 %	0 %	50 %	0 %	532422299
11528	NC_022118	GCA	2	6	580045	580050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422299
11529	NC_022118	AAT	2	6	580080	580085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422299
11530	NC_022118	CT	3	6	580162	580167	0 %	50 %	0 %	50 %	532422299
11531	NC_022118	GCAC	2	8	580183	580190	25 %	0 %	25 %	50 %	532422299
11532	NC_022118	CTT	2	6	580349	580354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422300
11533	NC_022118	TCA	2	6	580379	580384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422300
11534	NC_022118	CTG	2	6	580391	580396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422300
11535	NC_022118	GA	3	6	580403	580408	50 %	0 %	50 %	0 %	532422300
11536	NC_022118	CTT	2	6	580436	580441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422300
11537	NC_022118	AGA	2	6	580446	580451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422300
11538	NC_022118	AGGA	2	8	580463	580470	50 %	0 %	50 %	0 %	532422300
11539	NC_022118	CCA	2	6	580526	580531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422300
11540	NC_022118	CTG	2	6	580541	580546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422300
11541	NC_022118	T	7	7	580547	580553	0 %	100 %	0 %	0 %	532422300
11542	NC_022118	GC	3	6	580596	580601	0 %	0 %	50 %	50 %	532422300
11543	NC_022118	ATAG	2	8	580639	580646	50 %	25 %	25 %	0 %	532422300
11544	NC_022118	TAA	2	6	580680	580685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422300
11545	NC_022118	GC	3	6	580789	580794	0 %	0 %	50 %	50 %	532422300
11546	NC_022118	CTA	2	6	580799	580804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422300
11547	NC_022118	A	6	6	580804	580809	100 %	0 %	0 %	0 %	532422300
11548	NC_022118	ATA	2	6	580822	580827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422300
11549	NC_022118	TCA	2	6	580867	580872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422300
11550	NC_022118	TCT	2	6	581015	581020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422301
11551	NC_022118	AAT	2	6	581042	581047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422301
11552	NC_022118	CTT	2	6	581071	581076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422301
11553	NC_022118	CAG	2	6	581097	581102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422301
11554	NC_022118	T	6	6	581104	581109	0 %	100 %	0 %	0 %	532422301
11555	NC_022118	TAA	3	9	581161	581169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422301
11556	NC_022118	ACA	2	6	581237	581242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422301
11557	NC_022118	TTG	2	6	581257	581262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422301
11558	NC_022118	AAC	2	6	581285	581290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422301
11559	NC_022118	GA	3	6	581322	581327	50 %	0 %	50 %	0 %	532422301
11560	NC_022118	CTG	2	6	581643	581648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422302
11561	NC_022118	CAT	2	6	581687	581692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422302
11562	NC_022118	TGA	2	6	581695	581700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422302
11563	NC_022118	TTG	2	6	581706	581711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422302
11564	NC_022118	TGT	2	6	581824	581829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422302
11565	NC_022118	CTT	2	6	581880	581885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422302
11566	NC_022118	AACA	2	8	581915	581922	75 %	0 %	0 %	25 %	532422302
11567	NC_022118	ACA	2	6	581927	581932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422302
11568	NC_022118	TTC	2	6	582009	582014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422302
11569	NC_022118	ACA	2	6	582065	582070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422302
11570	NC_022118	TCT	2	6	582425	582430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422303
11571	NC_022118	GCT	2	6	582444	582449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422303
11572	NC_022118	TTC	2	6	582457	582462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422303
11573	NC_022118	AAC	2	6	582490	582495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422303
11574	NC_022118	TTC	2	6	582607	582612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422303
11575	NC_022118	AATC	2	8	582625	582632	50 %	25 %	0 %	25 %	532422303
11576	NC_022118	AGG	3	9	582637	582645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422303
11577	NC_022118	AGA	2	6	582685	582690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422303
11578	NC_022118	ATC	2	6	582725	582730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422303
11579	NC_022118	CGA	2	6	582773	582778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422303
11580	NC_022118	T	6	6	582787	582792	0 %	100 %	0 %	0 %	532422303
11581	NC_022118	TC	3	6	582829	582834	0 %	50 %	0 %	50 %	532422303
11582	NC_022118	CTT	2	6	582900	582905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422303
11583	NC_022118	TAT	2	6	582918	582923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422303
11584	NC_022118	CAA	2	6	582984	582989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422303
11585	NC_022118	A	6	6	583106	583111	100 %	0 %	0 %	0 %	532422303
11586	NC_022118	CCT	2	6	583118	583123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422303
11587	NC_022118	TAA	2	6	583215	583220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422303
11588	NC_022118	ACGA	2	8	583253	583260	50 %	0 %	25 %	25 %	532422303
11589	NC_022118	TTTA	2	8	583264	583271	25 %	75 %	0 %	0 %	532422303
11590	NC_022118	GTAC	2	8	583282	583289	25 %	25 %	25 %	25 %	532422304
11591	NC_022118	TAA	2	6	583292	583297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422304
11592	NC_022118	ATCG	2	8	583357	583364	25 %	25 %	25 %	25 %	532422304
11593	NC_022118	AGA	2	6	583424	583429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422304
11594	NC_022118	CTT	2	6	583438	583443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422304
11595	NC_022118	GTA	2	6	583448	583453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422304
11596	NC_022118	ATA	2	6	583455	583460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422304
11597	NC_022118	TTC	2	6	583461	583466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422304
11598	NC_022118	TGC	2	6	583478	583483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422304
11599	NC_022118	CGT	2	6	583514	583519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422304
11600	NC_022118	CTA	2	6	583546	583551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422304
11601	NC_022118	AGC	2	6	583634	583639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422304
11602	NC_022118	CTC	2	6	583672	583677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422304
11603	NC_022118	TGT	2	6	583745	583750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422304
11604	NC_022118	CTT	2	6	583759	583764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422304
11605	NC_022118	GTA	2	6	583815	583820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422304
11606	NC_022118	ATG	2	6	583836	583841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422304
11607	NC_022118	CTG	2	6	583859	583864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422304
11608	NC_022118	CT	3	6	583924	583929	0 %	50 %	0 %	50 %	532422304
11609	NC_022118	GCA	2	6	583953	583958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422304
11610	NC_022118	ACAA	2	8	583971	583978	75 %	0 %	0 %	25 %	532422304
11611	NC_022118	CGA	3	9	583990	583998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422304
11612	NC_022118	TCTT	2	8	584059	584066	0 %	75 %	0 %	25 %	532422304
11613	NC_022118	CATC	2	8	584082	584089	25 %	25 %	0 %	50 %	532422304
11614	NC_022118	GAG	2	6	584104	584109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422304
11615	NC_022118	GT	3	6	584120	584125	0 %	50 %	50 %	0 %	532422304
11616	NC_022118	TAAA	2	8	584137	584144	75 %	25 %	0 %	0 %	532422304
11617	NC_022118	GAA	2	6	584401	584406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422305
11618	NC_022118	TAT	2	6	584513	584518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422305
11619	NC_022118	TCT	2	6	584547	584552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422305
11620	NC_022118	ATC	2	6	584584	584589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422305
11621	NC_022118	CT	3	6	584610	584615	0 %	50 %	0 %	50 %	532422305
11622	NC_022118	T	7	7	584718	584724	0 %	100 %	0 %	0 %	532422305
11623	NC_022118	T	6	6	584776	584781	0 %	100 %	0 %	0 %	532422306
11624	NC_022118	T	6	6	584797	584802	0 %	100 %	0 %	0 %	532422306
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11654	NC_022118	CAG	2	6	586176	586181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422307
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11725	NC_022118	TCTT	2	8	590969	590976	0 %	75 %	0 %	25 %	532422314
11726	NC_022118	TA	3	6	590987	590992	50 %	50 %	0 %	0 %	532422314
11727	NC_022118	T	7	7	590994	591000	0 %	100 %	0 %	0 %	532422314
11728	NC_022118	TC	4	8	591022	591029	0 %	50 %	0 %	50 %	532422314
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11735	NC_022118	ATC	2	6	591463	591468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422316
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11739	NC_022118	ATCAC	2	10	591614	591623	40 %	20 %	0 %	40 %	532422316
11740	NC_022118	CGA	2	6	591641	591646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422316
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11865	NC_022118	AGGT	2	8	597417	597424	25 %	25 %	50 %	0 %	532422325
11866	NC_022118	TCC	2	6	597428	597433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422325
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11973	NC_022118	CATT	2	8	603806	603813	25 %	50 %	0 %	25 %	532422332
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