MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022118	CAC	2	6	554301	554306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422277
11002	NC_022118	CTC	2	6	554387	554392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422277
11003	NC_022118	AGT	2	6	554395	554400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422277
11004	NC_022118	AAG	2	6	554420	554425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422277
11005	NC_022118	TCT	2	6	554515	554520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422277
11006	NC_022118	GCA	2	6	554563	554568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422277
11007	NC_022118	AAG	2	6	554636	554641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422277
11008	NC_022118	TTTA	2	8	554715	554722	25 %	75 %	0 %	0 %	532422277
11009	NC_022118	AAT	2	6	554736	554741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422277
11010	NC_022118	CAA	2	6	554753	554758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422277
11011	NC_022118	AAAAT	2	10	554771	554780	80 %	20 %	0 %	0 %	532422277
11012	NC_022118	GAT	2	6	554801	554806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422277
11013	NC_022118	ATA	2	6	554855	554860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422277
11014	NC_022118	TCC	2	6	555023	555028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422277
11015	NC_022118	TTCA	2	8	555114	555121	25 %	50 %	0 %	25 %	532422277
11016	NC_022118	TCC	2	6	555178	555183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422277
11017	NC_022118	CAA	2	6	555197	555202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422277
11018	NC_022118	CCT	2	6	555217	555222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422277
11019	NC_022118	GAAT	2	8	555224	555231	50 %	25 %	25 %	0 %	532422277
11020	NC_022118	CTG	2	6	555236	555241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422277
11021	NC_022118	GAA	2	6	555268	555273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422277
11022	NC_022118	AGC	2	6	555289	555294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422277
11023	NC_022118	CTT	2	6	555363	555368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422277
11024	NC_022118	AAT	2	6	555384	555389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422277
11025	NC_022118	A	8	8	555441	555448	100 %	0 %	0 %	0 %	532422277
11026	NC_022118	CT	3	6	555471	555476	0 %	50 %	0 %	50 %	532422277
11027	NC_022118	TACG	2	8	555505	555512	25 %	25 %	25 %	25 %	532422277
11028	NC_022118	AGC	2	6	555579	555584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422277
11029	NC_022118	GAT	2	6	555609	555614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422277
11030	NC_022118	CTC	2	6	555674	555679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422277
11031	NC_022118	T	6	6	555765	555770	0 %	100 %	0 %	0 %	532422278
11032	NC_022118	TTA	2	6	555873	555878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422278
11033	NC_022118	GAT	2	6	555905	555910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422278
11034	NC_022118	TCT	2	6	555996	556001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422278
11035	NC_022118	AAT	2	6	556066	556071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422278
11036	NC_022118	TCGT	2	8	556144	556151	0 %	50 %	25 %	25 %	532422278
11037	NC_022118	TAG	2	6	556170	556175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422278
11038	NC_022118	CGGAAA	2	12	556182	556193	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532422278
11039	NC_022118	TGT	2	6	556315	556320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422278
11040	NC_022118	ATG	2	6	556321	556326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422278
11041	NC_022118	AG	3	6	556333	556338	50 %	0 %	50 %	0 %	532422278
11042	NC_022118	AAT	2	6	556385	556390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422278
11043	NC_022118	CGAT	2	8	556398	556405	25 %	25 %	25 %	25 %	532422278
11044	NC_022118	AAAGA	2	10	556442	556451	80 %	0 %	20 %	0 %	532422278
11045	NC_022118	TGA	2	6	556490	556495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422278
11046	NC_022118	T	7	7	556497	556503	0 %	100 %	0 %	0 %	532422278
11047	NC_022118	CCTCT	2	10	556513	556522	0 %	40 %	0 %	60 %	532422278
11048	NC_022118	AGC	2	6	556523	556528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422278
11049	NC_022118	AGG	2	6	556583	556588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422278
11050	NC_022118	AG	3	6	556630	556635	50 %	0 %	50 %	0 %	532422278
11051	NC_022118	ATATAG	2	12	556653	556664	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532422278
11052	NC_022118	TCA	2	6	556728	556733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422278
11053	NC_022118	GAA	2	6	556791	556796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422278
11054	NC_022118	TCT	2	6	556845	556850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422278
11055	NC_022118	TCT	2	6	556858	556863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422278
11056	NC_022118	T	6	6	556943	556948	0 %	100 %	0 %	0 %	532422278
11057	NC_022118	AACG	2	8	556990	556997	50 %	0 %	25 %	25 %	532422278
11058	NC_022118	CCGAA	2	10	557021	557030	40 %	0 %	20 %	40 %	532422278
11059	NC_022118	CAT	2	6	557116	557121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422278
11060	NC_022118	AAG	2	6	557145	557150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422278
11061	NC_022118	AAAT	2	8	557220	557227	75 %	25 %	0 %	0 %	532422278
11062	NC_022118	CTC	2	6	557300	557305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422278
11063	NC_022118	CCTT	2	8	557445	557452	0 %	50 %	0 %	50 %	532422278
11064	NC_022118	AAC	2	6	557454	557459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422278
11065	NC_022118	ATA	2	6	557494	557499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422278
11066	NC_022118	T	7	7	557580	557586	0 %	100 %	0 %	0 %	532422278
11067	NC_022118	ACA	2	6	557689	557694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422278
11068	NC_022118	TATC	2	8	557731	557738	25 %	50 %	0 %	25 %	532422278
11069	NC_022118	CTT	2	6	558026	558031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422712
11070	NC_022118	AAC	2	6	558051	558056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422712
11071	NC_022118	AGA	2	6	558060	558065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422712
11072	NC_022118	CTT	2	6	558068	558073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422712
11073	NC_022118	TCT	2	6	558076	558081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422712
11074	NC_022118	TCA	2	6	558088	558093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422712
11075	NC_022118	CAG	2	6	558107	558112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422712
11076	NC_022118	GCA	2	6	558115	558120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422712
11077	NC_022118	T	6	6	558147	558152	0 %	100 %	0 %	0 %	532422712
11078	NC_022118	TG	3	6	558457	558462	0 %	50 %	50 %	0 %	532422279
11079	NC_022118	TAC	2	6	558534	558539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422279
11080	NC_022118	GAAA	2	8	558557	558564	75 %	0 %	25 %	0 %	532422279
11081	NC_022118	ATA	2	6	558611	558616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422279
11082	NC_022118	TG	3	6	558624	558629	0 %	50 %	50 %	0 %	532422279
11083	NC_022118	AGG	2	6	558636	558641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422279
11084	NC_022118	GAA	2	6	558673	558678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422279
11085	NC_022118	CT	3	6	558717	558722	0 %	50 %	0 %	50 %	532422279
11086	NC_022118	TGA	2	6	558739	558744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422279
11087	NC_022118	A	6	6	558772	558777	100 %	0 %	0 %	0 %	532422279
11088	NC_022118	GAA	2	6	558878	558883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422279
11089	NC_022118	TG	3	6	558895	558900	0 %	50 %	50 %	0 %	532422279
11090	NC_022118	AG	3	6	558994	558999	50 %	0 %	50 %	0 %	532422279
11091	NC_022118	TCT	2	6	559107	559112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422713
11092	NC_022118	ATA	2	6	559137	559142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422713
11093	NC_022118	TTC	2	6	559160	559165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422713
11094	NC_022118	CTG	2	6	559177	559182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422713
11095	NC_022118	GAG	2	6	559212	559217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422713
11096	NC_022118	CTG	2	6	559260	559265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422280
11097	NC_022118	AAG	2	6	559451	559456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422280
11098	NC_022118	GAG	2	6	559534	559539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422280
11099	NC_022118	AAT	2	6	559582	559587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422280
11100	NC_022118	CTC	2	6	559591	559596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422280
11101	NC_022118	ACC	2	6	559661	559666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422280
11102	NC_022118	GCATAG	2	12	559687	559698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532422280
11103	NC_022118	AGC	2	6	559730	559735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422280
11104	NC_022118	AAC	2	6	559799	559804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422280
11105	NC_022118	GAAA	2	8	559815	559822	75 %	0 %	25 %	0 %	532422280
11106	NC_022118	ACA	2	6	559833	559838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422280
11107	NC_022118	AAC	2	6	559850	559855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422280
11108	NC_022118	AAG	2	6	559861	559866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422280
11109	NC_022118	T	6	6	559872	559877	0 %	100 %	0 %	0 %	532422280
11110	NC_022118	ACC	2	6	560155	560160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422714
11111	NC_022118	CGAA	2	8	560178	560185	50 %	0 %	25 %	25 %	532422714
11112	NC_022118	CTTT	2	8	560215	560222	0 %	75 %	0 %	25 %	532422714
11113	NC_022118	T	8	8	560234	560241	0 %	100 %	0 %	0 %	532422714
11114	NC_022118	TCT	2	6	560254	560259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422714
11115	NC_022118	AG	3	6	560268	560273	50 %	0 %	50 %	0 %	532422714
11116	NC_022118	AGG	2	6	560419	560424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422281
11117	NC_022118	CT	3	6	560445	560450	0 %	50 %	0 %	50 %	532422281
11118	NC_022118	TTG	2	6	560492	560497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422281
11119	NC_022118	T	6	6	560618	560623	0 %	100 %	0 %	0 %	532422281
11120	NC_022118	CTC	2	6	560644	560649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422281
11121	NC_022118	AGG	2	6	560652	560657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422281
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11229	NC_022118	TCA	2	6	565456	565461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422287
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11236	NC_022118	ATCA	2	8	565797	565804	50 %	25 %	0 %	25 %	532422287
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11239	NC_022118	AGA	2	6	565993	565998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422287
11240	NC_022118	AGGTA	2	10	566135	566144	40 %	20 %	40 %	0 %	532422287
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11242	NC_022118	CTC	2	6	566282	566287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422287
11243	NC_022118	CTT	2	6	566351	566356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422287
11244	NC_022118	CGTC	2	8	566358	566365	0 %	25 %	25 %	50 %	532422287
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11247	NC_022118	CCT	2	6	566624	566629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422288
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11255	NC_022118	TCC	2	6	567152	567157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422289
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11263	NC_022118	ACG	2	6	567812	567817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422289
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11274	NC_022118	ATT	2	6	568285	568290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422290
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11332	NC_022118	TTG	2	6	571462	571467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422292
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11350	NC_022118	ATCA	2	8	572227	572234	50 %	25 %	0 %	25 %	532422292
11351	NC_022118	AAT	2	6	572239	572244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422292
11352	NC_022118	AAC	2	6	572269	572274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422292
11353	NC_022118	ACAA	2	8	572297	572304	75 %	0 %	0 %	25 %	532422292
11354	NC_022118	GCAG	2	8	572386	572393	25 %	0 %	50 %	25 %	532422292
11355	NC_022118	A	6	6	572396	572401	100 %	0 %	0 %	0 %	532422292
11356	NC_022118	TAA	2	6	572407	572412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422292
11357	NC_022118	A	7	7	572419	572425	100 %	0 %	0 %	0 %	532422292
11358	NC_022118	TTC	2	6	572426	572431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422292
11359	NC_022118	TAA	2	6	572442	572447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422292
11360	NC_022118	CTA	2	6	572611	572616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422293
11361	NC_022118	AAG	3	9	572617	572625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422293
11362	NC_022118	TCT	2	6	572649	572654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422293
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11488	NC_022118	TTA	2	6	578451	578456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422297
11489	NC_022118	CT	3	6	578484	578489	0 %	50 %	0 %	50 %	532422297
11490	NC_022118	ACT	2	6	578510	578515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422297
11491	NC_022118	AGCG	2	8	578520	578527	25 %	0 %	50 %	25 %	532422297
11492	NC_022118	CTATG	2	10	578528	578537	20 %	40 %	20 %	20 %	532422297
11493	NC_022118	GTC	2	6	578638	578643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422297
11494	NC_022118	CTT	2	6	578664	578669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422297
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11500	NC_022118	GCTTA	2	10	578840	578849	20 %	40 %	20 %	20 %	532422297

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