MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_022118	TCT	2	6	478077	478082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
9502	NC_022118	AGAA	2	8	478186	478193	75 %	0 %	25 %	0 %	532422213
9503	NC_022118	ATTA	2	8	478202	478209	50 %	50 %	0 %	0 %	532422213
9504	NC_022118	CTC	2	6	478300	478305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422213
9505	NC_022118	TCT	2	6	478318	478323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
9506	NC_022118	CTC	2	6	478324	478329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422213
9507	NC_022118	GGA	2	6	478368	478373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422213
9508	NC_022118	CAG	2	6	478382	478387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
9509	NC_022118	CAA	2	6	478396	478401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
9510	NC_022118	GCA	2	6	478419	478424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
9511	NC_022118	ACT	2	6	478446	478451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422213
9512	NC_022118	TCG	2	6	478715	478720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422213
9513	NC_022118	TTG	2	6	478789	478794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422213
9514	NC_022118	CAA	2	6	478811	478816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
9515	NC_022118	AAT	2	6	478824	478829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422213
9516	NC_022118	GAT	2	6	478839	478844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422213
9517	NC_022118	CAA	2	6	478893	478898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
9518	NC_022118	CTC	2	6	478903	478908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422213
9519	NC_022118	GAA	2	6	478914	478919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422213
9520	NC_022118	TAC	2	6	478926	478931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422213
9521	NC_022118	A	7	7	479028	479034	100 %	0 %	0 %	0 %	532422213
9522	NC_022118	TTCCT	2	10	479137	479146	0 %	60 %	0 %	40 %	532422213
9523	NC_022118	ACA	3	9	479187	479195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
9524	NC_022118	GAAA	2	8	479214	479221	75 %	0 %	25 %	0 %	532422213
9525	NC_022118	TTC	2	6	479297	479302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
9526	NC_022118	GAT	2	6	479391	479396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422213
9527	NC_022118	TAA	2	6	479474	479479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422213
9528	NC_022118	TCTA	2	8	479502	479509	25 %	50 %	0 %	25 %	532422213
9529	NC_022118	CTGT	2	8	479521	479528	0 %	50 %	25 %	25 %	532422213
9530	NC_022118	CT	3	6	479641	479646	0 %	50 %	0 %	50 %	532422213
9531	NC_022118	ACTAT	2	10	479653	479662	40 %	40 %	0 %	20 %	532422213
9532	NC_022118	TCT	2	6	479716	479721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
9533	NC_022118	CTG	2	6	479919	479924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
9534	NC_022118	TGC	2	6	479929	479934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
9535	NC_022118	CTC	2	6	479941	479946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422214
9536	NC_022118	ATG	2	6	480041	480046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422214
9537	NC_022118	GCT	2	6	480071	480076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
9538	NC_022118	TAG	4	12	480133	480144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422214
9539	NC_022118	TCTTCA	2	12	480173	480184	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532422214
9540	NC_022118	TGA	2	6	480238	480243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422214
9541	NC_022118	AGA	3	9	480250	480258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9542	NC_022118	AG	3	6	480287	480292	50 %	0 %	50 %	0 %	532422214
9543	NC_022118	ACTA	2	8	480295	480302	50 %	25 %	0 %	25 %	532422214
9544	NC_022118	CT	5	10	480319	480328	0 %	50 %	0 %	50 %	532422214
9545	NC_022118	TTC	2	6	480362	480367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422214
9546	NC_022118	GGA	2	6	480413	480418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
9547	NC_022118	GA	3	6	480429	480434	50 %	0 %	50 %	0 %	532422214
9548	NC_022118	CTA	2	6	480464	480469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
9549	NC_022118	TCC	2	6	480557	480562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422214
9550	NC_022118	TGG	2	6	480565	480570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422214
9551	NC_022118	GGT	3	9	480578	480586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422214
9552	NC_022118	CAA	2	6	480625	480630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422214
9553	NC_022118	TGC	2	6	480649	480654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
9554	NC_022118	CAG	2	6	480663	480668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422214
9555	NC_022118	GAA	2	6	480686	480691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9556	NC_022118	AGA	2	6	480805	480810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9557	NC_022118	CGA	2	6	480850	480855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422214
9558	NC_022118	GGT	3	9	480869	480877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422214
9559	NC_022118	GGA	3	9	481040	481048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
9560	NC_022118	ACT	2	6	481100	481105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
9561	NC_022118	GGT	3	9	481157	481165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422214
9562	NC_022118	CTTT	2	8	481181	481188	0 %	75 %	0 %	25 %	532422214
9563	NC_022118	GGA	2	6	481238	481243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
9564	NC_022118	CAA	2	6	481272	481277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422214
9565	NC_022118	TCT	2	6	481292	481297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422214
9566	NC_022118	TCC	2	6	481307	481312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422214
9567	NC_022118	AGT	2	6	481333	481338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422214
9568	NC_022118	AAAT	2	8	481350	481357	75 %	25 %	0 %	0 %	532422214
9569	NC_022118	ATCA	2	8	481493	481500	50 %	25 %	0 %	25 %	532422214
9570	NC_022118	A	6	6	481514	481519	100 %	0 %	0 %	0 %	532422214
9571	NC_022118	A	6	6	481538	481543	100 %	0 %	0 %	0 %	532422214
9572	NC_022118	AGG	3	9	481600	481608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
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9574	NC_022118	AAG	2	6	481680	481685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9575	NC_022118	ATTC	2	8	481694	481701	25 %	50 %	0 %	25 %	532422214
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9578	NC_022118	TCC	2	6	481801	481806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422214
9579	NC_022118	AGA	2	6	481834	481839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9580	NC_022118	GAAG	2	8	481856	481863	50 %	0 %	50 %	0 %	532422214
9581	NC_022118	CTG	2	6	481902	481907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
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9583	NC_022118	GAA	2	6	482006	482011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9584	NC_022118	ATC	2	6	482062	482067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
9585	NC_022118	ATC	2	6	482125	482130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
9586	NC_022118	CTC	2	6	482133	482138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422214
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9588	NC_022118	CTT	2	6	482154	482159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422214
9589	NC_022118	ATCT	2	8	482182	482189	25 %	50 %	0 %	25 %	532422214
9590	NC_022118	TGC	2	6	482218	482223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
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9592	NC_022118	AGA	2	6	482263	482268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9593	NC_022118	CTT	3	9	482277	482285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422214
9594	NC_022118	TCT	2	6	482306	482311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422214
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9596	NC_022118	CTGA	2	8	482363	482370	25 %	25 %	25 %	25 %	532422214
9597	NC_022118	ACA	2	6	482387	482392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422214
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9599	NC_022118	CTAT	2	8	482421	482428	25 %	50 %	0 %	25 %	532422214
9600	NC_022118	CTC	2	6	482509	482514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422214
9601	NC_022118	TCT	2	6	482618	482623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422214
9602	NC_022118	ACA	2	6	482630	482635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422214
9603	NC_022118	GGA	2	6	482648	482653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
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9605	NC_022118	CAA	2	6	482712	482717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422214
9606	NC_022118	TAA	2	6	482725	482730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422214
9607	NC_022118	GGA	2	6	482762	482767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
9608	NC_022118	CTG	2	6	482784	482789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
9609	NC_022118	AGG	2	6	482800	482805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
9610	NC_022118	CA	3	6	482863	482868	50 %	0 %	0 %	50 %	532422214
9611	NC_022118	CTA	2	6	482902	482907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
9612	NC_022118	A	7	7	482913	482919	100 %	0 %	0 %	0 %	532422214
9613	NC_022118	CTA	2	6	482937	482942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
9614	NC_022118	AGA	2	6	483004	483009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9615	NC_022118	TTTAC	2	10	483021	483030	20 %	60 %	0 %	20 %	532422214
9616	NC_022118	AAG	2	6	483033	483038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
9617	NC_022118	TGC	2	6	483154	483159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
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9619	NC_022118	CTT	2	6	483270	483275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422214
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9621	NC_022118	CTA	2	6	483381	483386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
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9990	NC_022118	TCGT	2	8	503496	503503	0 %	50 %	25 %	25 %	532422233
9991	NC_022118	GA	3	6	503556	503561	50 %	0 %	50 %	0 %	532422233
9992	NC_022118	GCA	2	6	503567	503572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422233
9993	NC_022118	CTC	2	6	503595	503600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422233
9994	NC_022118	T	6	6	503613	503618	0 %	100 %	0 %	0 %	532422233
9995	NC_022118	TATT	2	8	503657	503664	25 %	75 %	0 %	0 %	532422233
9996	NC_022118	TTC	2	6	503772	503777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422234
9997	NC_022118	AT	3	6	503792	503797	50 %	50 %	0 %	0 %	532422234
9998	NC_022118	ATT	2	6	503870	503875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422234
9999	NC_022118	TGT	2	6	503917	503922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422234
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