MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022118	AAC	2	6	380384	380389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422137
7502	NC_022118	ATT	2	6	380457	380462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422137
7503	NC_022118	TCT	2	6	380490	380495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422137
7504	NC_022118	TTG	2	6	380630	380635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422137
7505	NC_022118	GGA	2	6	380703	380708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422137
7506	NC_022118	AAG	2	6	380731	380736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422137
7507	NC_022118	TTA	2	6	380766	380771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422137
7508	NC_022118	TCTT	2	8	380805	380812	0 %	75 %	0 %	25 %	532422137
7509	NC_022118	A	8	8	380813	380820	100 %	0 %	0 %	0 %	532422137
7510	NC_022118	AC	3	6	380834	380839	50 %	0 %	0 %	50 %	532422137
7511	NC_022118	CT	3	6	380888	380893	0 %	50 %	0 %	50 %	532422137
7512	NC_022118	A	6	6	380905	380910	100 %	0 %	0 %	0 %	532422137
7513	NC_022118	TTCC	2	8	380937	380944	0 %	50 %	0 %	50 %	532422137
7514	NC_022118	CT	3	6	380987	380992	0 %	50 %	0 %	50 %	532422137
7515	NC_022118	CAA	3	9	381000	381008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422137
7516	NC_022118	AGT	2	6	381056	381061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422137
7517	NC_022118	ACC	2	6	381073	381078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422137
7518	NC_022118	TC	3	6	381085	381090	0 %	50 %	0 %	50 %	532422137
7519	NC_022118	ATCT	2	8	381163	381170	25 %	50 %	0 %	25 %	532422137
7520	NC_022118	TAAA	2	8	381190	381197	75 %	25 %	0 %	0 %	532422137
7521	NC_022118	AAG	2	6	381420	381425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422138
7522	NC_022118	GCA	2	6	381508	381513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422138
7523	NC_022118	AAC	2	6	381552	381557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422138
7524	NC_022118	TC	3	6	381647	381652	0 %	50 %	0 %	50 %	532422138
7525	NC_022118	TAT	2	6	381771	381776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422138
7526	NC_022118	TGA	2	6	381777	381782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422138
7527	NC_022118	CTAA	2	8	381793	381800	50 %	25 %	0 %	25 %	532422138
7528	NC_022118	CTA	2	6	381817	381822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
7529	NC_022118	CCT	2	6	381838	381843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422138
7530	NC_022118	CAT	2	6	381948	381953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
7531	NC_022118	AAG	2	6	381980	381985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422138
7532	NC_022118	GCT	2	6	382027	382032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422138
7533	NC_022118	GTA	2	6	382072	382077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422138
7534	NC_022118	ACAGC	2	10	382106	382115	40 %	0 %	20 %	40 %	532422138
7535	NC_022118	TAC	2	6	382170	382175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
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7537	NC_022118	CTC	2	6	382326	382331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422138
7538	NC_022118	A	6	6	382400	382405	100 %	0 %	0 %	0 %	532422138
7539	NC_022118	ATT	2	6	382423	382428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422138
7540	NC_022118	TCT	2	6	382431	382436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422138
7541	NC_022118	TC	3	6	382460	382465	0 %	50 %	0 %	50 %	532422138
7542	NC_022118	CAC	2	6	382544	382549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422138
7543	NC_022118	AAATC	2	10	382550	382559	60 %	20 %	0 %	20 %	532422138
7544	NC_022118	ATC	3	9	382581	382589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
7545	NC_022118	CAAC	2	8	382591	382598	50 %	0 %	0 %	50 %	532422138
7546	NC_022118	TCA	2	6	382642	382647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
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7548	NC_022118	ACC	2	6	382680	382685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422138
7549	NC_022118	C	6	6	382684	382689	0 %	0 %	0 %	100 %	532422138
7550	NC_022118	TC	3	6	382690	382695	0 %	50 %	0 %	50 %	532422138
7551	NC_022118	TGT	2	6	382749	382754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422138
7552	NC_022118	A	6	6	382814	382819	100 %	0 %	0 %	0 %	532422138
7553	NC_022118	CT	3	6	382861	382866	0 %	50 %	0 %	50 %	532422139
7554	NC_022118	AGT	2	6	382987	382992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422139
7555	NC_022118	GCA	2	6	383009	383014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422139
7556	NC_022118	AGC	2	6	383020	383025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422139
7557	NC_022118	AGC	2	6	383029	383034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422139
7558	NC_022118	T	6	6	383081	383086	0 %	100 %	0 %	0 %	532422139
7559	NC_022118	TGA	2	6	383106	383111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422140
7560	NC_022118	TAA	2	6	383180	383185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422140
7561	NC_022118	AGA	2	6	383259	383264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422140
7562	NC_022118	TC	3	6	383281	383286	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
7563	NC_022118	TTC	2	6	383307	383312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
7564	NC_022118	ACA	2	6	383328	383333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422140
7565	NC_022118	TGA	2	6	383334	383339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422140
7566	NC_022118	TAA	2	6	383347	383352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422140
7567	NC_022118	CT	3	6	383396	383401	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
7568	NC_022118	CT	3	6	383457	383462	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
7569	NC_022118	ATC	2	6	383478	383483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422140
7570	NC_022118	TCT	2	6	383556	383561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
7571	NC_022118	GTC	2	6	383626	383631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422140
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7574	NC_022118	CAAA	2	8	383755	383762	75 %	0 %	0 %	25 %	532422140
7575	NC_022118	ACTGAA	2	12	383785	383796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532422140
7576	NC_022118	TTC	2	6	383822	383827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
7577	NC_022118	TTC	2	6	383921	383926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
7578	NC_022118	TACT	2	8	383929	383936	25 %	50 %	0 %	25 %	532422140
7579	NC_022118	GA	5	10	383946	383955	50 %	0 %	50 %	0 %	532422140
7580	NC_022118	CTGCAC	2	12	383978	383989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532422140
7581	NC_022118	GCTT	2	8	384012	384019	0 %	50 %	25 %	25 %	532422140
7582	NC_022118	ATA	2	6	384023	384028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422140
7583	NC_022118	TC	3	6	384064	384069	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
7584	NC_022118	GTA	2	6	384132	384137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422140
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7587	NC_022118	TC	3	6	384427	384432	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
7588	NC_022118	AGA	2	6	384440	384445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422140
7589	NC_022118	A	6	6	384445	384450	100 %	0 %	0 %	0 %	532422140
7590	NC_022118	ACC	2	6	384489	384494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422140
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7593	NC_022118	GTA	2	6	384629	384634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422140
7594	NC_022118	CTT	3	9	384655	384663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
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7601	NC_022118	AGA	2	6	385036	385041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422141
7602	NC_022118	CTG	2	6	385059	385064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422141
7603	NC_022118	GAA	2	6	385107	385112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422141
7604	NC_022118	C	6	6	385123	385128	0 %	0 %	0 %	100 %	532422141
7605	NC_022118	TTC	2	6	385139	385144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422141
7606	NC_022118	ATG	2	6	385165	385170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422141
7607	NC_022118	ATA	2	6	385199	385204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422141
7608	NC_022118	CCAG	2	8	385301	385308	25 %	0 %	25 %	50 %	532422142
7609	NC_022118	GAT	2	6	385434	385439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422142
7610	NC_022118	AAC	2	6	385442	385447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422142
7611	NC_022118	TAA	2	6	385533	385538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422142
7612	NC_022118	TCT	2	6	385540	385545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422142
7613	NC_022118	AAG	2	6	385548	385553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422142
7614	NC_022118	A	8	8	385628	385635	100 %	0 %	0 %	0 %	532422142
7615	NC_022118	AAC	2	6	385668	385673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422142
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7617	NC_022118	CAT	2	6	385739	385744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422142
7618	NC_022118	A	7	7	385799	385805	100 %	0 %	0 %	0 %	532422142
7619	NC_022118	CTT	2	6	385945	385950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422698
7620	NC_022118	GA	3	6	385979	385984	50 %	0 %	50 %	0 %	532422698
7621	NC_022118	GTT	2	6	385999	386004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422698
7622	NC_022118	ACA	2	6	386115	386120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422143
7623	NC_022118	GGCA	2	8	386151	386158	25 %	0 %	50 %	25 %	532422143
7624	NC_022118	TGCT	2	8	386159	386166	0 %	50 %	25 %	25 %	532422143
7625	NC_022118	CTG	2	6	386181	386186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422143
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7636	NC_022118	TCA	2	6	386652	386657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422143
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7734	NC_022118	CG	3	6	392535	392540	0 %	0 %	50 %	50 %	532422148
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7743	NC_022118	A	6	6	392960	392965	100 %	0 %	0 %	0 %	532422148
7744	NC_022118	AGAA	2	8	392990	392997	75 %	0 %	25 %	0 %	532422148
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7994	NC_022118	TAA	2	6	405275	405280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422158
7995	NC_022118	CTA	2	6	405310	405315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422158
7996	NC_022118	CCTTTC	2	12	405321	405332	0 %	50 %	0 %	50 %	532422158
7997	NC_022118	CTG	2	6	405532	405537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422158
7998	NC_022118	A	6	6	405573	405578	100 %	0 %	0 %	0 %	532422158
7999	NC_022118	CTT	2	6	405593	405598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422158
8000	NC_022118	AAG	2	6	405625	405630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422158

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