MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_022118	CAT	2	6	355582	355587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422118
7003	NC_022118	CT	3	6	355625	355630	0 %	50 %	0 %	50 %	532422118
7004	NC_022118	CTT	2	6	355669	355674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7005	NC_022118	ACG	2	6	355694	355699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7006	NC_022118	TC	3	6	355750	355755	0 %	50 %	0 %	50 %	532422118
7007	NC_022118	TTCT	2	8	355793	355800	0 %	75 %	0 %	25 %	532422118
7008	NC_022118	CTT	2	6	355822	355827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7009	NC_022118	TCA	2	6	355836	355841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422118
7010	NC_022118	CTG	2	6	355866	355871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7011	NC_022118	AGG	2	6	355907	355912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422118
7012	NC_022118	AG	3	6	355920	355925	50 %	0 %	50 %	0 %	532422118
7013	NC_022118	CCG	2	6	355939	355944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422118
7014	NC_022118	TC	3	6	355948	355953	0 %	50 %	0 %	50 %	532422118
7015	NC_022118	CAA	2	6	355967	355972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422118
7016	NC_022118	CAA	2	6	356020	356025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422118
7017	NC_022118	TCT	2	6	356127	356132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7018	NC_022118	TTC	2	6	356168	356173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7019	NC_022118	GAT	2	6	356219	356224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422118
7020	NC_022118	T	6	6	356408	356413	0 %	100 %	0 %	0 %	532422118
7021	NC_022118	ATT	2	6	356441	356446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422118
7022	NC_022118	CTT	2	6	356447	356452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7023	NC_022118	AAT	2	6	356510	356515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422118
7024	NC_022118	GCA	2	6	356532	356537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7025	NC_022118	CAA	2	6	356557	356562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422118
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7027	NC_022118	AAT	2	6	356580	356585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422118
7028	NC_022118	TCG	2	6	356634	356639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7029	NC_022118	AC	3	6	356814	356819	50 %	0 %	0 %	50 %	532422118
7030	NC_022118	TCT	2	6	356820	356825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7031	NC_022118	CTG	2	6	356833	356838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7032	NC_022118	CACGA	2	10	356876	356885	40 %	0 %	20 %	40 %	532422118
7033	NC_022118	GAC	2	6	357070	357075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7034	NC_022118	GAA	2	6	357140	357145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422118
7035	NC_022118	AAT	2	6	357179	357184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422118
7036	NC_022118	AGA	2	6	357206	357211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422118
7037	NC_022118	ATTC	2	8	357224	357231	25 %	50 %	0 %	25 %	532422118
7038	NC_022118	TCG	2	6	357308	357313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7039	NC_022118	ATC	2	6	357332	357337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422118
7040	NC_022118	TCT	2	6	357346	357351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7041	NC_022118	TCT	2	6	357399	357404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7042	NC_022118	TCG	2	6	357432	357437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7043	NC_022118	T	6	6	357455	357460	0 %	100 %	0 %	0 %	532422118
7044	NC_022118	ATTTA	2	10	357461	357470	40 %	60 %	0 %	0 %	532422118
7045	NC_022118	GAA	2	6	357509	357514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422118
7046	NC_022118	AGC	2	6	357593	357598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422118
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7048	NC_022118	TC	3	6	357727	357732	0 %	50 %	0 %	50 %	532422118
7049	NC_022118	GAA	2	6	357753	357758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422118
7050	NC_022118	CTC	2	6	357833	357838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422118
7051	NC_022118	AAT	2	6	357857	357862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422118
7052	NC_022118	T	6	6	357926	357931	0 %	100 %	0 %	0 %	532422118
7053	NC_022118	AAT	2	6	358001	358006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422118
7054	NC_022118	ACA	2	6	358086	358091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422118
7055	NC_022118	CT	4	8	358093	358100	0 %	50 %	0 %	50 %	532422118
7056	NC_022118	TAA	3	9	358108	358116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422118
7057	NC_022118	ATG	2	6	358134	358139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422118
7058	NC_022118	CTT	4	12	358159	358170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7059	NC_022118	TCA	2	6	358182	358187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422118
7060	NC_022118	CGA	2	6	358233	358238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422118
7061	NC_022118	TCT	2	6	358245	358250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7062	NC_022118	AG	3	6	358280	358285	50 %	0 %	50 %	0 %	532422118
7063	NC_022118	CTT	2	6	358342	358347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
7064	NC_022118	GAA	2	6	358390	358395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422118
7065	NC_022118	TCT	2	6	358449	358454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422118
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7068	NC_022118	TCT	2	6	358908	358913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422119
7069	NC_022118	T	6	6	358930	358935	0 %	100 %	0 %	0 %	532422119
7070	NC_022118	CTT	2	6	358975	358980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422119
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7074	NC_022118	GCA	2	6	359136	359141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422119
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7077	NC_022118	CTA	2	6	359215	359220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422119
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7080	NC_022118	AGAA	2	8	359325	359332	75 %	0 %	25 %	0 %	532422120
7081	NC_022118	AGC	2	6	359367	359372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422120
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7087	NC_022118	A	6	6	359622	359627	100 %	0 %	0 %	0 %	532422120
7088	NC_022118	CAG	2	6	359654	359659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422120
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7094	NC_022118	TCT	2	6	359785	359790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422120
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7097	NC_022118	TGT	2	6	360075	360080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422121
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7099	NC_022118	CAT	2	6	360153	360158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422121
7100	NC_022118	T	6	6	360206	360211	0 %	100 %	0 %	0 %	532422121
7101	NC_022118	CTA	2	6	360212	360217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422121
7102	NC_022118	GTC	2	6	360219	360224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422121
7103	NC_022118	CAA	2	6	360230	360235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422121
7104	NC_022118	CAG	2	6	360275	360280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422121
7105	NC_022118	GATC	2	8	360362	360369	25 %	25 %	25 %	25 %	532422121
7106	NC_022118	TC	3	6	360583	360588	0 %	50 %	0 %	50 %	532422122
7107	NC_022118	T	6	6	360718	360723	0 %	100 %	0 %	0 %	532422122
7108	NC_022118	GAA	2	6	360731	360736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422122
7109	NC_022118	ACA	2	6	360791	360796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422122
7110	NC_022118	GCA	2	6	360869	360874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422122
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7112	NC_022118	T	7	7	360948	360954	0 %	100 %	0 %	0 %	532422122
7113	NC_022118	ATC	2	6	361120	361125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422123
7114	NC_022118	TC	3	6	361134	361139	0 %	50 %	0 %	50 %	532422123
7115	NC_022118	GCC	2	6	361167	361172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422123
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7117	NC_022118	AACA	2	8	361213	361220	75 %	0 %	0 %	25 %	532422123
7118	NC_022118	AAC	2	6	361270	361275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422123
7119	NC_022118	T	6	6	361282	361287	0 %	100 %	0 %	0 %	532422123
7120	NC_022118	T	6	6	361310	361315	0 %	100 %	0 %	0 %	532422123
7121	NC_022118	CTT	3	9	361317	361325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422123
7122	NC_022118	CAGA	2	8	361326	361333	50 %	0 %	25 %	25 %	532422123
7123	NC_022118	TCT	2	6	361377	361382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422123
7124	NC_022118	TTC	2	6	361472	361477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422123
7125	NC_022118	GAT	2	6	361504	361509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422123
7126	NC_022118	CTG	2	6	361510	361515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422123
7127	NC_022118	CTT	2	6	361539	361544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422123
7128	NC_022118	TCT	2	6	361550	361555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422123
7129	NC_022118	CTTT	2	8	361569	361576	0 %	75 %	0 %	25 %	532422123
7130	NC_022118	CA	3	6	361684	361689	50 %	0 %	0 %	50 %	532422124
7131	NC_022118	TCA	2	6	361719	361724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422124
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7133	NC_022118	TCT	2	6	361773	361778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422124
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7135	NC_022118	GCT	2	6	361808	361813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422124
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7137	NC_022118	TTC	2	6	361848	361853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422124
7138	NC_022118	TTC	2	6	361877	361882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422124
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7143	NC_022118	GAA	2	6	362225	362230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422125
7144	NC_022118	GTC	2	6	362239	362244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422125
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7149	NC_022118	GACC	2	8	362455	362462	25 %	0 %	25 %	50 %	532422125
7150	NC_022118	TAC	2	6	362513	362518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422125
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7153	NC_022118	TGA	2	6	362683	362688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422125
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7227	NC_022118	GCAT	2	8	366708	366715	25 %	25 %	25 %	25 %	532422696
7228	NC_022118	TGAG	2	8	366741	366748	25 %	25 %	50 %	0 %	532422696
7229	NC_022118	AC	3	6	366769	366774	50 %	0 %	0 %	50 %	532422696
7230	NC_022118	A	6	6	366870	366875	100 %	0 %	0 %	0 %	532422696
7231	NC_022118	CAA	2	6	366890	366895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422696
7232	NC_022118	CT	4	8	366941	366948	0 %	50 %	0 %	50 %	532422696
7233	NC_022118	CAA	2	6	367029	367034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422696
7234	NC_022118	TGA	2	6	367051	367056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422696
7235	NC_022118	CCA	2	6	367117	367122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422696
7236	NC_022118	TGA	2	6	367147	367152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422696
7237	NC_022118	CT	3	6	367174	367179	0 %	50 %	0 %	50 %	532422696
7238	NC_022118	CA	3	6	367183	367188	50 %	0 %	0 %	50 %	532422696
7239	NC_022118	CAA	2	6	367229	367234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422696
7240	NC_022118	GTC	3	9	367248	367256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422696
7241	NC_022118	ATC	3	9	367257	367265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422696
7242	NC_022118	GCA	2	6	367303	367308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422696
7243	NC_022118	C	9	9	367352	367360	0 %	0 %	0 %	100 %	532422697
7244	NC_022118	TCT	2	6	367431	367436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422697
7245	NC_022118	GAA	2	6	367440	367445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422697
7246	NC_022118	TCG	2	6	367476	367481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422697
7247	NC_022118	TATG	2	8	367483	367490	25 %	50 %	25 %	0 %	532422697
7248	NC_022118	GT	3	6	367501	367506	0 %	50 %	50 %	0 %	532422697
7249	NC_022118	TAT	2	6	367513	367518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422697
7250	NC_022118	TCT	2	6	367539	367544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422697
7251	NC_022118	CAT	2	6	367783	367788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422129
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7312	NC_022118	CT	3	6	371419	371424	0 %	50 %	0 %	50 %	532422132
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7322	NC_022118	A	6	6	371671	371676	100 %	0 %	0 %	0 %	532422132
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7327	NC_022118	CAAC	2	8	371910	371917	50 %	0 %	0 %	50 %	532422133
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7340	NC_022118	CTTT	2	8	372686	372693	0 %	75 %	0 %	25 %	532422135
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7350	NC_022118	CAGCCT	2	12	373121	373132	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532422135
7351	NC_022118	TG	3	6	373144	373149	0 %	50 %	50 %	0 %	532422135
7352	NC_022118	AGCTGA	2	12	373171	373182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532422135
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7354	NC_022118	A	8	8	373237	373244	100 %	0 %	0 %	0 %	532422135
7355	NC_022118	GAA	2	6	373318	373323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422135
7356	NC_022118	TGC	2	6	373481	373486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422135
7357	NC_022118	TCTA	2	8	373487	373494	25 %	50 %	0 %	25 %	532422135
7358	NC_022118	T	6	6	373501	373506	0 %	100 %	0 %	0 %	532422135
7359	NC_022118	ATG	2	6	373533	373538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422135
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7362	NC_022118	TTCTT	2	10	373700	373709	0 %	80 %	0 %	20 %	532422135
7363	NC_022118	TAT	2	6	373713	373718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422135
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7365	NC_022118	TTC	2	6	373800	373805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422135
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7494	NC_022118	TTA	2	6	380089	380094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422137
7495	NC_022118	A	6	6	380094	380099	100 %	0 %	0 %	0 %	532422137
7496	NC_022118	ACCA	2	8	380106	380113	50 %	0 %	0 %	50 %	532422137
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7498	NC_022118	AC	3	6	380257	380262	50 %	0 %	0 %	50 %	532422137
7499	NC_022118	A	6	6	380272	380277	100 %	0 %	0 %	0 %	532422137
7500	NC_022118	CAC	2	6	380278	380283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422137

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