MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022118	A	6	6	305567	305572	100 %	0 %	0 %	0 %	532422078
6002	NC_022118	CTC	2	6	305579	305584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422078
6003	NC_022118	ACA	2	6	305603	305608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422078
6004	NC_022118	AGA	2	6	305633	305638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422078
6005	NC_022118	GAA	2	6	305805	305810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422079
6006	NC_022118	T	8	8	305875	305882	0 %	100 %	0 %	0 %	532422079
6007	NC_022118	AGG	2	6	305933	305938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422079
6008	NC_022118	AGA	2	6	306065	306070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422079
6009	NC_022118	CGT	2	6	306097	306102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422079
6010	NC_022118	TAC	2	6	306139	306144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422079
6011	NC_022118	C	6	6	306159	306164	0 %	0 %	0 %	100 %	532422079
6012	NC_022118	GCA	2	6	306444	306449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422080
6013	NC_022118	GCT	2	6	306483	306488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422080
6014	NC_022118	AGA	2	6	306532	306537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422080
6015	NC_022118	A	6	6	306546	306551	100 %	0 %	0 %	0 %	532422080
6016	NC_022118	A	6	6	306605	306610	100 %	0 %	0 %	0 %	532422080
6017	NC_022118	GTT	2	6	306665	306670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422080
6018	NC_022118	AGCTTA	2	12	306756	306767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532422080
6019	NC_022118	TCCA	2	8	306802	306809	25 %	25 %	0 %	50 %	532422080
6020	NC_022118	TGC	2	6	306841	306846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422080
6021	NC_022118	TATT	2	8	306873	306880	25 %	75 %	0 %	0 %	532422080
6022	NC_022118	TGG	2	6	306883	306888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422080
6023	NC_022118	CAT	2	6	306944	306949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422080
6024	NC_022118	TTA	2	6	306987	306992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422080
6025	NC_022118	TCA	2	6	307003	307008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422080
6026	NC_022118	ATCG	2	8	307047	307054	25 %	25 %	25 %	25 %	532422080
6027	NC_022118	TCG	2	6	307068	307073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422080
6028	NC_022118	TTG	2	6	307161	307166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422080
6029	NC_022118	TTG	2	6	307236	307241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422080
6030	NC_022118	TA	3	6	307337	307342	50 %	50 %	0 %	0 %	532422080
6031	NC_022118	TAA	2	6	307387	307392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422080
6032	NC_022118	TAA	2	6	307417	307422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422080
6033	NC_022118	AAC	2	6	307435	307440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422080
6034	NC_022118	TTG	2	6	307635	307640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422080
6035	NC_022118	TGC	2	6	307648	307653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422080
6036	NC_022118	ACTC	2	8	307664	307671	25 %	25 %	0 %	50 %	532422080
6037	NC_022118	A	6	6	307729	307734	100 %	0 %	0 %	0 %	532422080
6038	NC_022118	AAT	2	6	307754	307759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422080
6039	NC_022118	CAC	2	6	307773	307778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422080
6040	NC_022118	ATT	2	6	307808	307813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422080
6041	NC_022118	A	6	6	307861	307866	100 %	0 %	0 %	0 %	532422081
6042	NC_022118	TGA	2	6	307873	307878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422081
6043	NC_022118	GTG	2	6	307902	307907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422081
6044	NC_022118	TA	3	6	307927	307932	50 %	50 %	0 %	0 %	532422081
6045	NC_022118	AGAAC	2	10	307940	307949	60 %	0 %	20 %	20 %	532422081
6046	NC_022118	AAG	2	6	308013	308018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422081
6047	NC_022118	CAA	2	6	308039	308044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422081
6048	NC_022118	GAA	2	6	308045	308050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422081
6049	NC_022118	GAA	2	6	308078	308083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422081
6050	NC_022118	ACT	2	6	308090	308095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422081
6051	NC_022118	GA	3	6	308135	308140	50 %	0 %	50 %	0 %	532422081
6052	NC_022118	ATT	2	6	308192	308197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422081
6053	NC_022118	GAA	2	6	308237	308242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422081
6054	NC_022118	TG	3	6	308345	308350	0 %	50 %	50 %	0 %	532422081
6055	NC_022118	TG	3	6	308367	308372	0 %	50 %	50 %	0 %	532422081
6056	NC_022118	TTC	2	6	308460	308465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422082
6057	NC_022118	AGAA	2	8	308493	308500	75 %	0 %	25 %	0 %	532422082
6058	NC_022118	CTG	2	6	308513	308518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422082
6059	NC_022118	CTTTT	2	10	308528	308537	0 %	80 %	0 %	20 %	532422082
6060	NC_022118	TC	3	6	308601	308606	0 %	50 %	0 %	50 %	532422082
6061	NC_022118	GAA	2	6	308617	308622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422082
6062	NC_022118	AGC	2	6	308670	308675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422082
6063	NC_022118	AG	3	6	308766	308771	50 %	0 %	50 %	0 %	532422082
6064	NC_022118	TAC	2	6	308870	308875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422082
6065	NC_022118	CGC	2	6	308878	308883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422082
6066	NC_022118	CAA	2	6	308884	308889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422082
6067	NC_022118	TC	3	6	308900	308905	0 %	50 %	0 %	50 %	532422082
6068	NC_022118	GCA	2	6	308925	308930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422082
6069	NC_022118	AAC	2	6	308976	308981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422082
6070	NC_022118	T	6	6	308986	308991	0 %	100 %	0 %	0 %	532422082
6071	NC_022118	TAA	2	6	309006	309011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422082
6072	NC_022118	TC	3	6	309048	309053	0 %	50 %	0 %	50 %	532422082
6073	NC_022118	AC	3	6	309168	309173	50 %	0 %	0 %	50 %	532422083
6074	NC_022118	TCT	2	6	309178	309183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422083
6075	NC_022118	CGTT	2	8	309188	309195	0 %	50 %	25 %	25 %	532422083
6076	NC_022118	GAT	2	6	309222	309227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422083
6077	NC_022118	GTTG	2	8	309228	309235	0 %	50 %	50 %	0 %	532422083
6078	NC_022118	CTC	2	6	309430	309435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422083
6079	NC_022118	AGG	2	6	309453	309458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422083
6080	NC_022118	TAT	2	6	309480	309485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422083
6081	NC_022118	TCCT	2	8	309542	309549	0 %	50 %	0 %	50 %	532422083
6082	NC_022118	CTA	2	6	309551	309556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422083
6083	NC_022118	AGT	2	6	309594	309599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422083
6084	NC_022118	GGC	2	6	309619	309624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422083
6085	NC_022118	GAAT	2	8	309629	309636	50 %	25 %	25 %	0 %	532422083
6086	NC_022118	AAAG	2	8	309736	309743	75 %	0 %	25 %	0 %	532422083
6087	NC_022118	AGA	2	6	309770	309775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422083
6088	NC_022118	CTC	2	6	309827	309832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422083
6089	NC_022118	AAC	2	6	309977	309982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422083
6090	NC_022118	ACT	2	6	309997	310002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422083
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6092	NC_022118	CTT	2	6	310027	310032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422083
6093	NC_022118	GA	3	6	310136	310141	50 %	0 %	50 %	0 %	532422083
6094	NC_022118	CTT	2	6	310174	310179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422083
6095	NC_022118	CTT	2	6	310196	310201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422083
6096	NC_022118	T	6	6	310233	310238	0 %	100 %	0 %	0 %	532422083
6097	NC_022118	AAC	2	6	310272	310277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422083
6098	NC_022118	TTC	2	6	310386	310391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422083
6099	NC_022118	AATC	2	8	310461	310468	50 %	25 %	0 %	25 %	532422083
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6102	NC_022118	TAT	2	6	310675	310680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422084
6103	NC_022118	CAA	2	6	310726	310731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422084
6104	NC_022118	TTC	2	6	310755	310760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422084
6105	NC_022118	TA	3	6	310808	310813	50 %	50 %	0 %	0 %	532422084
6106	NC_022118	CTC	2	6	310847	310852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422084
6107	NC_022118	TCTT	2	8	310929	310936	0 %	75 %	0 %	25 %	532422084
6108	NC_022118	AGA	2	6	310962	310967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422084
6109	NC_022118	CAAC	2	8	310978	310985	50 %	0 %	0 %	50 %	532422084
6110	NC_022118	TTC	2	6	311105	311110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422084
6111	NC_022118	CTAT	2	8	311138	311145	25 %	50 %	0 %	25 %	532422084
6112	NC_022118	CTT	2	6	311189	311194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422084
6113	NC_022118	A	7	7	311252	311258	100 %	0 %	0 %	0 %	532422084
6114	NC_022118	A	6	6	311269	311274	100 %	0 %	0 %	0 %	532422084
6115	NC_022118	GCA	2	6	311356	311361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422084
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6117	NC_022118	TC	3	6	311444	311449	0 %	50 %	0 %	50 %	532422084
6118	NC_022118	TTG	2	6	311473	311478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422084
6119	NC_022118	TTC	2	6	311482	311487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422084
6120	NC_022118	TAA	2	6	311524	311529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422084
6121	NC_022118	CAA	2	6	311566	311571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422085
6122	NC_022118	GCT	2	6	311673	311678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422085
6123	NC_022118	TGT	2	6	311686	311691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422085
6124	NC_022118	GAT	2	6	311728	311733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422085
6125	NC_022118	T	6	6	311791	311796	0 %	100 %	0 %	0 %	532422085
6126	NC_022118	TTG	2	6	311826	311831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422085
6127	NC_022118	TGGG	2	8	311938	311945	0 %	25 %	75 %	0 %	532422085
6128	NC_022118	AG	3	6	311969	311974	50 %	0 %	50 %	0 %	532422085
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6134	NC_022118	ATT	2	6	312362	312367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422086
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6136	NC_022118	TTG	2	6	312452	312457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422086
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6163	NC_022118	A	6	6	313560	313565	100 %	0 %	0 %	0 %	532422088
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6230	NC_022118	ACT	2	6	316818	316823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422089
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6232	NC_022118	ACA	2	6	316936	316941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422089
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6234	NC_022118	A	6	6	316969	316974	100 %	0 %	0 %	0 %	532422089
6235	NC_022118	TTA	2	6	316988	316993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422089
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6237	NC_022118	CTT	2	6	317047	317052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422090
6238	NC_022118	A	6	6	317088	317093	100 %	0 %	0 %	0 %	532422090
6239	NC_022118	CTC	2	6	317230	317235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422090
6240	NC_022118	CGT	2	6	317260	317265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422090
6241	NC_022118	CA	3	6	317282	317287	50 %	0 %	0 %	50 %	532422090
6242	NC_022118	AGA	2	6	317294	317299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422090
6243	NC_022118	TCCAA	2	10	317343	317352	40 %	20 %	0 %	40 %	532422090
6244	NC_022118	ATTG	2	8	317360	317367	25 %	50 %	25 %	0 %	532422090
6245	NC_022118	TAT	2	6	317467	317472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422090
6246	NC_022118	ACC	3	9	317483	317491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422090
6247	NC_022118	GAC	2	6	317497	317502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422090
6248	NC_022118	TC	3	6	317546	317551	0 %	50 %	0 %	50 %	532422090
6249	NC_022118	TAA	2	6	317557	317562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422090
6250	NC_022118	GAA	2	6	317608	317613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422090
6251	NC_022118	TTC	2	6	317677	317682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422090
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6255	NC_022118	GAA	2	6	318229	318234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422091
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6259	NC_022118	ATTTA	2	10	318409	318418	40 %	60 %	0 %	0 %	532422091
6260	NC_022118	C	7	7	318424	318430	0 %	0 %	0 %	100 %	532422091
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6263	NC_022118	TCT	3	9	318479	318487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422091
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6269	NC_022118	A	6	6	318758	318763	100 %	0 %	0 %	0 %	532422091
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6351	NC_022118	A	8	8	322266	322273	100 %	0 %	0 %	0 %	532422093
6352	NC_022118	AAG	2	6	322281	322286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422093
6353	NC_022118	CT	4	8	322355	322362	0 %	50 %	0 %	50 %	532422093
6354	NC_022118	GAG	2	6	322389	322394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422093
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6356	NC_022118	GGT	2	6	322493	322498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422093
6357	NC_022118	T	6	6	322500	322505	0 %	100 %	0 %	0 %	532422093
6358	NC_022118	TA	3	6	322545	322550	50 %	50 %	0 %	0 %	532422093
6359	NC_022118	GCT	2	6	322595	322600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422093
6360	NC_022118	ATC	2	6	322604	322609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422093
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6362	NC_022118	GCCT	2	8	322623	322630	0 %	25 %	25 %	50 %	532422093
6363	NC_022118	A	6	6	322755	322760	100 %	0 %	0 %	0 %	532422093
6364	NC_022118	GAGC	2	8	322861	322868	25 %	0 %	50 %	25 %	532422093
6365	NC_022118	CTT	2	6	322870	322875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422093
6366	NC_022118	AT	3	6	322929	322934	50 %	50 %	0 %	0 %	532422093
6367	NC_022118	TAA	2	6	322948	322953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422093
6368	NC_022118	ACA	2	6	322960	322965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422093
6369	NC_022118	CTTA	2	8	323001	323008	25 %	50 %	0 %	25 %	532422093
6370	NC_022118	TAA	2	6	323020	323025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422093
6371	NC_022118	CGA	2	6	323026	323031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422093
6372	NC_022118	TAAA	2	8	323103	323110	75 %	25 %	0 %	0 %	532422093
6373	NC_022118	ACG	2	6	323131	323136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422093
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6375	NC_022118	CAA	2	6	323264	323269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422093
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6377	NC_022118	AGA	2	6	323281	323286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422093
6378	NC_022118	GGC	2	6	323350	323355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422093
6379	NC_022118	ATG	2	6	323420	323425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422093
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6381	NC_022118	CT	3	6	323471	323476	0 %	50 %	0 %	50 %	532422093
6382	NC_022118	ACA	2	6	323482	323487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422093
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6388	NC_022118	AAG	2	6	323763	323768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422094
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6390	NC_022118	TGA	2	6	323807	323812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422094
6391	NC_022118	TAT	2	6	323838	323843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422094
6392	NC_022118	TTGG	2	8	323894	323901	0 %	50 %	50 %	0 %	532422094
6393	NC_022118	TCA	2	6	323930	323935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422094
6394	NC_022118	CAT	2	6	324069	324074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422094
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6396	NC_022118	TCT	2	6	324197	324202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422094
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6399	NC_022118	TTC	2	6	324253	324258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422094
6400	NC_022118	CTTT	2	8	324301	324308	0 %	75 %	0 %	25 %	532422094
6401	NC_022118	ATC	2	6	324310	324315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422094
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6403	NC_022118	T	6	6	324373	324378	0 %	100 %	0 %	0 %	532422094
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6410	NC_022118	T	6	6	324556	324561	0 %	100 %	0 %	0 %	532422094
6411	NC_022118	TAG	2	6	324624	324629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422094
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6432	NC_022118	ATA	2	6	325792	325797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422096
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6443	NC_022118	GAAC	2	8	326237	326244	50 %	0 %	25 %	25 %	532422097
6444	NC_022118	CT	3	6	326298	326303	0 %	50 %	0 %	50 %	532422097
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6447	NC_022118	A	6	6	326555	326560	100 %	0 %	0 %	0 %	532422098
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6450	NC_022118	TAC	2	6	326602	326607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422098
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6484	NC_022118	ATA	2	6	328616	328621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422100
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6489	NC_022118	AAAT	2	8	328780	328787	75 %	25 %	0 %	0 %	532422100
6490	NC_022118	T	6	6	328816	328821	0 %	100 %	0 %	0 %	532422100
6491	NC_022118	TA	3	6	328826	328831	50 %	50 %	0 %	0 %	532422100
6492	NC_022118	TGT	2	6	328898	328903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422100
6493	NC_022118	ACT	2	6	328917	328922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422100
6494	NC_022118	AAGC	2	8	328983	328990	50 %	0 %	25 %	25 %	532422100
6495	NC_022118	CTT	2	6	329020	329025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422100
6496	NC_022118	ACC	2	6	329037	329042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422100
6497	NC_022118	ATC	2	6	329081	329086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422100
6498	NC_022118	CTG	2	6	329102	329107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422100
6499	NC_022118	GAA	2	6	329146	329151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422100
6500	NC_022118	GCC	2	6	329296	329301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422100

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