MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022118	AGA	2	6	280532	280537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422055
5502	NC_022118	GAA	2	6	280583	280588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422055
5503	NC_022118	CTT	2	6	280591	280596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422055
5504	NC_022118	TCC	2	6	280766	280771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422055
5505	NC_022118	CAG	2	6	280774	280779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422055
5506	NC_022118	GAA	2	6	280879	280884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422055
5507	NC_022118	CACGCG	2	12	281033	281044	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532422055
5508	NC_022118	ATT	3	9	281057	281065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422055
5509	NC_022118	TTTCTT	2	12	281212	281223	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532422055
5510	NC_022118	TGC	2	6	281359	281364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5511	NC_022118	TGTT	2	8	281387	281394	0 %	75 %	25 %	0 %	532422056
5512	NC_022118	TTG	2	6	281400	281405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422056
5513	NC_022118	AGA	2	6	281424	281429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422056
5514	NC_022118	AAC	2	6	281482	281487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422056
5515	NC_022118	CAT	2	6	281490	281495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422056
5516	NC_022118	CTT	2	6	281507	281512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422056
5517	NC_022118	GTT	2	6	281519	281524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422056
5518	NC_022118	CAG	2	6	281552	281557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5519	NC_022118	CTG	2	6	281565	281570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5520	NC_022118	GAA	2	6	281600	281605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422056
5521	NC_022118	TATC	2	8	281675	281682	25 %	50 %	0 %	25 %	532422056
5522	NC_022118	AGCT	2	8	281696	281703	25 %	25 %	25 %	25 %	532422056
5523	NC_022118	CTG	2	6	281862	281867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5524	NC_022118	ACG	2	6	281901	281906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5525	NC_022118	TAA	2	6	281964	281969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422056
5526	NC_022118	ATA	2	6	281971	281976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422056
5527	NC_022118	ATA	2	6	282026	282031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422056
5528	NC_022118	TGC	2	6	282033	282038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5529	NC_022118	GGA	2	6	282262	282267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422056
5530	NC_022118	AGA	2	6	282309	282314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422056
5531	NC_022118	GAG	2	6	282389	282394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422056
5532	NC_022118	GTT	2	6	282399	282404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422056
5533	NC_022118	TTC	2	6	282466	282471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422056
5534	NC_022118	TCT	2	6	282550	282555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422056
5535	NC_022118	AGT	2	6	282564	282569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422056
5536	NC_022118	GCT	2	6	282596	282601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5537	NC_022118	CCA	2	6	282628	282633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422056
5538	NC_022118	CT	3	6	282640	282645	0 %	50 %	0 %	50 %	532422056
5539	NC_022118	TAT	2	6	282659	282664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422056
5540	NC_022118	ACA	2	6	282673	282678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422056
5541	NC_022118	CT	3	6	282752	282757	0 %	50 %	0 %	50 %	532422056
5542	NC_022118	ATA	2	6	282795	282800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422056
5543	NC_022118	CT	3	6	282891	282896	0 %	50 %	0 %	50 %	532422056
5544	NC_022118	TCT	2	6	282931	282936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422056
5545	NC_022118	GTA	2	6	283023	283028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422056
5546	NC_022118	AC	3	6	283102	283107	50 %	0 %	0 %	50 %	532422056
5547	NC_022118	TCT	2	6	283108	283113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422056
5548	NC_022118	ATTC	2	8	283142	283149	25 %	50 %	0 %	25 %	532422056
5549	NC_022118	ATG	2	6	283169	283174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422056
5550	NC_022118	CTA	2	6	283265	283270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422056
5551	NC_022118	CTT	2	6	283328	283333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422056
5552	NC_022118	AAG	2	6	283400	283405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422056
5553	NC_022118	CAG	2	6	283446	283451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5554	NC_022118	CTC	2	6	283500	283505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422056
5555	NC_022118	TAC	2	6	283524	283529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422056
5556	NC_022118	GCT	2	6	283574	283579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422056
5557	NC_022118	GAA	2	6	283620	283625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422056
5558	NC_022118	ATA	2	6	283667	283672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422056
5559	NC_022118	CGTT	2	8	283674	283681	0 %	50 %	25 %	25 %	532422056
5560	NC_022118	ATTC	2	8	283683	283690	25 %	50 %	0 %	25 %	532422056
5561	NC_022118	TTC	2	6	284091	284096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422057
5562	NC_022118	GT	3	6	284115	284120	0 %	50 %	50 %	0 %	532422057
5563	NC_022118	CTG	2	6	284171	284176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422057
5564	NC_022118	CCA	2	6	284296	284301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422057
5565	NC_022118	A	6	6	284306	284311	100 %	0 %	0 %	0 %	532422057
5566	NC_022118	CAC	2	6	284487	284492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422057
5567	NC_022118	CCT	2	6	284521	284526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422057
5568	NC_022118	CTCC	2	8	284569	284576	0 %	25 %	0 %	75 %	532422057
5569	NC_022118	AAGC	2	8	284591	284598	50 %	0 %	25 %	25 %	532422057
5570	NC_022118	ATG	2	6	284608	284613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422057
5571	NC_022118	T	6	6	284664	284669	0 %	100 %	0 %	0 %	532422057
5572	NC_022118	CTC	2	6	284670	284675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422057
5573	NC_022118	GAT	2	6	284719	284724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422057
5574	NC_022118	A	7	7	284725	284731	100 %	0 %	0 %	0 %	532422057
5575	NC_022118	AG	3	6	284792	284797	50 %	0 %	50 %	0 %	532422057
5576	NC_022118	CT	3	6	284834	284839	0 %	50 %	0 %	50 %	532422057
5577	NC_022118	CTT	2	6	285095	285100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422058
5578	NC_022118	ACT	2	6	285124	285129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422058
5579	NC_022118	GCTGT	2	10	285137	285146	0 %	40 %	40 %	20 %	532422058
5580	NC_022118	GTC	2	6	285205	285210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422058
5581	NC_022118	T	6	6	285224	285229	0 %	100 %	0 %	0 %	532422058
5582	NC_022118	ACT	2	6	285252	285257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422058
5583	NC_022118	ACT	2	6	285321	285326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422058
5584	NC_022118	TGC	2	6	285357	285362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422058
5585	NC_022118	T	7	7	285367	285373	0 %	100 %	0 %	0 %	532422058
5586	NC_022118	CTCCTA	2	12	285374	285385	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532422058
5587	NC_022118	AAC	2	6	285459	285464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422058
5588	NC_022118	TC	3	6	285574	285579	0 %	50 %	0 %	50 %	532422058
5589	NC_022118	ATC	2	6	285599	285604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422058
5590	NC_022118	TGGC	2	8	285609	285616	0 %	25 %	50 %	25 %	532422058
5591	NC_022118	TTCGA	2	10	285628	285637	20 %	40 %	20 %	20 %	532422058
5592	NC_022118	ATT	2	6	285663	285668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422058
5593	NC_022118	AG	3	6	285670	285675	50 %	0 %	50 %	0 %	532422058
5594	NC_022118	TTG	2	6	285677	285682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422058
5595	NC_022118	ACT	2	6	285710	285715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422058
5596	NC_022118	AT	3	6	285720	285725	50 %	50 %	0 %	0 %	532422058
5597	NC_022118	TTG	2	6	285752	285757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422059
5598	NC_022118	T	6	6	285784	285789	0 %	100 %	0 %	0 %	532422059
5599	NC_022118	CTTTT	2	10	285941	285950	0 %	80 %	0 %	20 %	532422059
5600	NC_022118	T	7	7	285947	285953	0 %	100 %	0 %	0 %	532422059
5601	NC_022118	GAA	2	6	286001	286006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422059
5602	NC_022118	TTA	2	6	286061	286066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422059
5603	NC_022118	ATT	2	6	286095	286100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422059
5604	NC_022118	TGCC	2	8	286107	286114	0 %	25 %	25 %	50 %	532422059
5605	NC_022118	AAC	2	6	286129	286134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422059
5606	NC_022118	GAA	2	6	286158	286163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422059
5607	NC_022118	GAA	2	6	286236	286241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422059
5608	NC_022118	T	6	6	286245	286250	0 %	100 %	0 %	0 %	532422059
5609	NC_022118	TTC	2	6	286269	286274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422059
5610	NC_022118	TGT	2	6	286301	286306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422059
5611	NC_022118	CTT	2	6	286345	286350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422059
5612	NC_022118	TTTG	2	8	286376	286383	0 %	75 %	25 %	0 %	532422059
5613	NC_022118	TCTTT	2	10	286384	286393	0 %	80 %	0 %	20 %	532422059
5614	NC_022118	TTTA	2	8	286404	286411	25 %	75 %	0 %	0 %	532422059
5615	NC_022118	A	8	8	286492	286499	100 %	0 %	0 %	0 %	532422059
5616	NC_022118	TTC	2	6	286740	286745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422060
5617	NC_022118	GAG	2	6	286787	286792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422060
5618	NC_022118	CGA	2	6	286795	286800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422060
5619	NC_022118	CTT	2	6	286829	286834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422060
5620	NC_022118	AAG	2	6	286864	286869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422060
5621	NC_022118	AGTA	2	8	286887	286894	50 %	25 %	25 %	0 %	532422060
5622	NC_022118	TA	3	6	286974	286979	50 %	50 %	0 %	0 %	532422060
5623	NC_022118	TTC	2	6	287076	287081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422060
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5993	NC_022118	CAAA	2	8	305367	305374	75 %	0 %	0 %	25 %	532422078
5994	NC_022118	A	7	7	305376	305382	100 %	0 %	0 %	0 %	532422078
5995	NC_022118	TCC	2	6	305402	305407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422078
5996	NC_022118	AAC	2	6	305422	305427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422078
5997	NC_022118	CTTA	2	8	305440	305447	25 %	50 %	0 %	25 %	532422078
5998	NC_022118	TC	3	6	305454	305459	0 %	50 %	0 %	50 %	532422078
5999	NC_022118	CAAGAC	2	12	305475	305486	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532422078
6000	NC_022118	A	6	6	305491	305496	100 %	0 %	0 %	0 %	532422078

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