MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022118	A	6	6	256418	256423	100 %	0 %	0 %	0 %	532422035
5002	NC_022118	ATG	2	6	256429	256434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422035
5003	NC_022118	ATCT	2	8	256478	256485	25 %	50 %	0 %	25 %	532422035
5004	NC_022118	T	7	7	256520	256526	0 %	100 %	0 %	0 %	532422035
5005	NC_022118	GCT	2	6	256530	256535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422035
5006	NC_022118	CTT	2	6	256540	256545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5007	NC_022118	T	6	6	256561	256566	0 %	100 %	0 %	0 %	532422035
5008	NC_022118	CT	4	8	256629	256636	0 %	50 %	0 %	50 %	532422035
5009	NC_022118	TTA	2	6	256694	256699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422035
5010	NC_022118	GCC	2	6	256828	256833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422035
5011	NC_022118	TTCG	2	8	256891	256898	0 %	50 %	25 %	25 %	532422035
5012	NC_022118	CTT	2	6	256927	256932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5013	NC_022118	CTA	2	6	256963	256968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422035
5014	NC_022118	TC	3	6	256982	256987	0 %	50 %	0 %	50 %	532422035
5015	NC_022118	TTC	2	6	257090	257095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5016	NC_022118	CTT	2	6	257098	257103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5017	NC_022118	TC	3	6	257120	257125	0 %	50 %	0 %	50 %	532422035
5018	NC_022118	TCT	2	6	257182	257187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5019	NC_022118	CAA	2	6	257243	257248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422035
5020	NC_022118	GTTTT	2	10	257255	257264	0 %	80 %	20 %	0 %	532422035
5021	NC_022118	TTA	2	6	257279	257284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422035
5022	NC_022118	CATT	2	8	257303	257310	25 %	50 %	0 %	25 %	532422035
5023	NC_022118	CAC	2	6	257313	257318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422035
5024	NC_022118	GCT	2	6	257398	257403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422035
5025	NC_022118	TCA	2	6	257446	257451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422035
5026	NC_022118	TCT	2	6	257481	257486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5027	NC_022118	TTC	2	6	257495	257500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5028	NC_022118	TGC	2	6	257554	257559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422035
5029	NC_022118	GTT	2	6	257560	257565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422035
5030	NC_022118	TAAT	2	8	257570	257577	50 %	50 %	0 %	0 %	532422035
5031	NC_022118	A	6	6	257578	257583	100 %	0 %	0 %	0 %	532422035
5032	NC_022118	AGA	2	6	257595	257600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422035
5033	NC_022118	TCA	2	6	257839	257844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422036
5034	NC_022118	ATTT	2	8	257853	257860	25 %	75 %	0 %	0 %	532422036
5035	NC_022118	GAT	2	6	257865	257870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422036
5036	NC_022118	GGC	2	6	257929	257934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422036
5037	NC_022118	TTC	2	6	257945	257950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422036
5038	NC_022118	ATT	2	6	257968	257973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422036
5039	NC_022118	CT	3	6	258001	258006	0 %	50 %	0 %	50 %	532422036
5040	NC_022118	AGG	2	6	258078	258083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422036
5041	NC_022118	TAC	2	6	258118	258123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422036
5042	NC_022118	CTT	2	6	258153	258158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422036
5043	NC_022118	TAA	2	6	258315	258320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422036
5044	NC_022118	CTT	3	9	258502	258510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422036
5045	NC_022118	AAAC	2	8	258532	258539	75 %	0 %	0 %	25 %	532422036
5046	NC_022118	AAT	2	6	258577	258582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422036
5047	NC_022118	TTTCT	2	10	258587	258596	0 %	80 %	0 %	20 %	532422036
5048	NC_022118	TTTA	2	8	258694	258701	25 %	75 %	0 %	0 %	532422036
5049	NC_022118	TC	3	6	258741	258746	0 %	50 %	0 %	50 %	532422036
5050	NC_022118	T	6	6	258751	258756	0 %	100 %	0 %	0 %	532422036
5051	NC_022118	TCT	3	9	258764	258772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422036
5052	NC_022118	GGC	2	6	258786	258791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422036
5053	NC_022118	GAT	2	6	258801	258806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422036
5054	NC_022118	TCT	2	6	258819	258824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422036
5055	NC_022118	A	6	6	258853	258858	100 %	0 %	0 %	0 %	532422036
5056	NC_022118	TCT	2	6	258871	258876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422036
5057	NC_022118	TGC	2	6	258885	258890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422036
5058	NC_022118	T	6	6	258928	258933	0 %	100 %	0 %	0 %	532422036
5059	NC_022118	TATT	2	8	258987	258994	25 %	75 %	0 %	0 %	532422036
5060	NC_022118	ACTT	2	8	259069	259076	25 %	50 %	0 %	25 %	532422036
5061	NC_022118	TGG	2	6	259168	259173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422036
5062	NC_022118	TCTT	2	8	259238	259245	0 %	75 %	0 %	25 %	532422036
5063	NC_022118	AAC	2	6	259279	259284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422036
5064	NC_022118	A	6	6	259473	259478	100 %	0 %	0 %	0 %	532422037
5065	NC_022118	GCA	2	6	259521	259526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422037
5066	NC_022118	TCT	2	6	259568	259573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422037
5067	NC_022118	TGC	2	6	259574	259579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422037
5068	NC_022118	TTA	2	6	259644	259649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422037
5069	NC_022118	CTT	2	6	259650	259655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422037
5070	NC_022118	CAA	2	6	259720	259725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422037
5071	NC_022118	GTC	2	6	259740	259745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422037
5072	NC_022118	CAG	2	6	259749	259754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422037
5073	NC_022118	CA	3	6	259841	259846	50 %	0 %	0 %	50 %	532422038
5074	NC_022118	CTT	2	6	259971	259976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422038
5075	NC_022118	CAA	2	6	259996	260001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422038
5076	NC_022118	TGCAA	2	10	260007	260016	40 %	20 %	20 %	20 %	532422038
5077	NC_022118	AAC	2	6	260017	260022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422038
5078	NC_022118	A	6	6	260059	260064	100 %	0 %	0 %	0 %	532422038
5079	NC_022118	TGC	2	6	260133	260138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422038
5080	NC_022118	TTC	2	6	260192	260197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422038
5081	NC_022118	TTGT	2	8	260207	260214	0 %	75 %	25 %	0 %	532422038
5082	NC_022118	CTGG	2	8	260215	260222	0 %	25 %	50 %	25 %	532422038
5083	NC_022118	TTG	2	6	260274	260279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422038
5084	NC_022118	TCT	2	6	260297	260302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422038
5085	NC_022118	T	6	6	260454	260459	0 %	100 %	0 %	0 %	532422039
5086	NC_022118	TAT	2	6	260495	260500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422039
5087	NC_022118	TTC	2	6	260501	260506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422039
5088	NC_022118	AGA	2	6	260571	260576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422039
5089	NC_022118	CTT	2	6	260619	260624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422039
5090	NC_022118	CT	3	6	260659	260664	0 %	50 %	0 %	50 %	532422039
5091	NC_022118	TC	3	6	260675	260680	0 %	50 %	0 %	50 %	532422039
5092	NC_022118	CT	3	6	260687	260692	0 %	50 %	0 %	50 %	532422039
5093	NC_022118	ACCTTT	2	12	260726	260737	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532422039
5094	NC_022118	T	6	6	260735	260740	0 %	100 %	0 %	0 %	532422039
5095	NC_022118	T	6	6	260854	260859	0 %	100 %	0 %	0 %	532422039
5096	NC_022118	T	6	6	260919	260924	0 %	100 %	0 %	0 %	532422039
5097	NC_022118	TTC	2	6	260972	260977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422039
5098	NC_022118	AGA	2	6	261051	261056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422039
5099	NC_022118	CAAA	2	8	261096	261103	75 %	0 %	0 %	25 %	532422039
5100	NC_022118	CTT	2	6	261169	261174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422039
5101	NC_022118	ATT	2	6	261194	261199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422039
5102	NC_022118	CTC	2	6	261267	261272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422039
5103	NC_022118	CAT	2	6	261348	261353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422039
5104	NC_022118	CTT	2	6	261372	261377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422039
5105	NC_022118	TGT	2	6	261388	261393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422039
5106	NC_022118	CAA	2	6	261422	261427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422039
5107	NC_022118	GCTT	2	8	261450	261457	0 %	50 %	25 %	25 %	532422039
5108	NC_022118	GAT	2	6	261466	261471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422039
5109	NC_022118	AAT	2	6	261472	261477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422039
5110	NC_022118	TTA	2	6	261484	261489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422039
5111	NC_022118	TAA	2	6	261504	261509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422039
5112	NC_022118	TTG	2	6	261545	261550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422039
5113	NC_022118	ACT	2	6	261576	261581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422039
5114	NC_022118	TTTA	2	8	261585	261592	25 %	75 %	0 %	0 %	532422039
5115	NC_022118	TAT	2	6	261615	261620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422039
5116	NC_022118	CCG	2	6	261626	261631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422039
5117	NC_022118	CACT	2	8	261660	261667	25 %	25 %	0 %	50 %	532422039
5118	NC_022118	TC	4	8	261690	261697	0 %	50 %	0 %	50 %	532422039
5119	NC_022118	ATGA	2	8	261745	261752	50 %	25 %	25 %	0 %	532422039
5120	NC_022118	A	6	6	261795	261800	100 %	0 %	0 %	0 %	532422039
5121	NC_022118	TTG	2	6	261838	261843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422039
5122	NC_022118	A	6	6	261849	261854	100 %	0 %	0 %	0 %	532422039
5123	NC_022118	A	6	6	261933	261938	100 %	0 %	0 %	0 %	532422039
5124	NC_022118	AGC	2	6	261988	261993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422039
5125	NC_022118	AGC	3	9	262014	262022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422039
5126	NC_022118	GAT	2	6	262075	262080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422039
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5128	NC_022118	TAA	2	6	262211	262216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422039
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5132	NC_022118	AC	3	6	262400	262405	50 %	0 %	0 %	50 %	532422039
5133	NC_022118	GTTC	2	8	262467	262474	0 %	50 %	25 %	25 %	532422039
5134	NC_022118	CT	3	6	262530	262535	0 %	50 %	0 %	50 %	532422039
5135	NC_022118	GCA	2	6	262609	262614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422039
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5137	NC_022118	GCT	2	6	262681	262686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422039
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5154	NC_022118	A	7	7	263634	263640	100 %	0 %	0 %	0 %	532422040
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5157	NC_022118	TCT	2	6	263838	263843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422041
5158	NC_022118	AGA	2	6	263849	263854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422041
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5162	NC_022118	CTT	2	6	264522	264527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422042
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5167	NC_022118	TA	3	6	264683	264688	50 %	50 %	0 %	0 %	532422042
5168	NC_022118	TTC	3	9	264721	264729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422042
5169	NC_022118	AAG	2	6	264742	264747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422042
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5227	NC_022118	TTC	2	6	267883	267888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422690
5228	NC_022118	A	7	7	268097	268103	100 %	0 %	0 %	0 %	532422046
5229	NC_022118	TTCT	2	8	268150	268157	0 %	75 %	0 %	25 %	532422046
5230	NC_022118	GA	3	6	268212	268217	50 %	0 %	50 %	0 %	532422046
5231	NC_022118	TAAAA	2	10	268243	268252	80 %	20 %	0 %	0 %	532422046
5232	NC_022118	GTT	2	6	268267	268272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422046
5233	NC_022118	TGA	2	6	268288	268293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422046
5234	NC_022118	TC	3	6	268368	268373	0 %	50 %	0 %	50 %	532422046
5235	NC_022118	AG	3	6	268400	268405	50 %	0 %	50 %	0 %	532422046
5236	NC_022118	ATT	2	6	268492	268497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422046
5237	NC_022118	TAC	2	6	268544	268549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422046
5238	NC_022118	TCATAA	2	12	268570	268581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532422046
5239	NC_022118	AAG	2	6	268620	268625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422046
5240	NC_022118	A	7	7	268642	268648	100 %	0 %	0 %	0 %	532422046
5241	NC_022118	CAA	2	6	268722	268727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422046
5242	NC_022118	ATC	2	6	268755	268760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422046
5243	NC_022118	TTGG	2	8	268973	268980	0 %	50 %	50 %	0 %	532422046
5244	NC_022118	GAGT	2	8	269127	269134	25 %	25 %	50 %	0 %	532422046
5245	NC_022118	TTAA	2	8	269159	269166	50 %	50 %	0 %	0 %	532422046
5246	NC_022118	ATG	2	6	269193	269198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422046
5247	NC_022118	AAGTGT	2	12	269296	269307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422046
5248	NC_022118	GTTC	2	8	269315	269322	0 %	50 %	25 %	25 %	532422046
5249	NC_022118	ATTT	2	8	269433	269440	25 %	75 %	0 %	0 %	532422046
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5361	NC_022118	TCTT	2	8	274217	274224	0 %	75 %	0 %	25 %	532422050
5362	NC_022118	ATTT	2	8	274246	274253	25 %	75 %	0 %	0 %	532422050
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5367	NC_022118	ATCCT	2	10	274411	274420	20 %	40 %	0 %	40 %	532422050
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5370	NC_022118	TGA	2	6	274623	274628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422051
5371	NC_022118	AGGAG	2	10	274662	274671	40 %	0 %	60 %	0 %	532422051
5372	NC_022118	GCT	2	6	274762	274767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422051
5373	NC_022118	TGGAAT	2	12	274773	274784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422051
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5377	NC_022118	TGC	2	6	274848	274853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422051
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5385	NC_022118	GCT	2	6	275236	275241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422051
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5399	NC_022118	A	6	6	275633	275638	100 %	0 %	0 %	0 %	532422052
5400	NC_022118	TGGT	2	8	275722	275729	0 %	50 %	50 %	0 %	532422052
5401	NC_022118	AAG	2	6	275748	275753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422052
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5404	NC_022118	ATG	2	6	275933	275938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422052
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5406	NC_022118	ACC	2	6	275953	275958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422052
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5409	NC_022118	CT	3	6	276050	276055	0 %	50 %	0 %	50 %	532422052
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5432	NC_022118	CTC	2	6	276818	276823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422052
5433	NC_022118	AAG	2	6	276853	276858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422052
5434	NC_022118	C	6	6	276958	276963	0 %	0 %	0 %	100 %	532422053
5435	NC_022118	CTT	2	6	276979	276984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422053
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5437	NC_022118	TCT	2	6	277121	277126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422053
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5439	NC_022118	TTG	2	6	277170	277175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422053
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5444	NC_022118	GCT	2	6	277496	277501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422053
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5457	NC_022118	GAA	2	6	278187	278192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422053
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5459	NC_022118	TC	3	6	278218	278223	0 %	50 %	0 %	50 %	532422053
5460	NC_022118	GAA	2	6	278235	278240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422053
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5462	NC_022118	CAT	2	6	278326	278331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422053
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5465	NC_022118	GGAACA	2	12	278660	278671	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532422053
5466	NC_022118	ATGCT	2	10	278738	278747	20 %	40 %	20 %	20 %	532422053
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5473	NC_022118	ACC	2	6	279165	279170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422053
5474	NC_022118	CCAT	2	8	279177	279184	25 %	25 %	0 %	50 %	532422053
5475	NC_022118	GAG	2	6	279237	279242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422053
5476	NC_022118	GCTT	2	8	279278	279285	0 %	50 %	25 %	25 %	532422053
5477	NC_022118	GCA	2	6	279554	279559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422054
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5479	NC_022118	TCT	2	6	279582	279587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422054
5480	NC_022118	GCA	2	6	279612	279617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422054
5481	NC_022118	TTA	2	6	279727	279732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422054
5482	NC_022118	AGC	2	6	279743	279748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422054
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5484	NC_022118	GTA	2	6	279827	279832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422054
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5486	NC_022118	CT	3	6	279965	279970	0 %	50 %	0 %	50 %	532422055
5487	NC_022118	ATC	2	6	279971	279976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422055
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5489	NC_022118	GAA	2	6	280008	280013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422055
5490	NC_022118	GA	3	6	280033	280038	50 %	0 %	50 %	0 %	532422055
5491	NC_022118	AAAG	2	8	280065	280072	75 %	0 %	25 %	0 %	532422055
5492	NC_022118	ATA	2	6	280163	280168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422055
5493	NC_022118	CAT	2	6	280231	280236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422055
5494	NC_022118	TAA	2	6	280238	280243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422055
5495	NC_022118	GTT	2	6	280311	280316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422055
5496	NC_022118	GAT	2	6	280344	280349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422055
5497	NC_022118	TTC	2	6	280408	280413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422055
5498	NC_022118	A	6	6	280419	280424	100 %	0 %	0 %	0 %	532422055
5499	NC_022118	TAAT	2	8	280486	280493	50 %	50 %	0 %	0 %	532422055
5500	NC_022118	TTC	2	6	280496	280501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422055

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