MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022118	CTA	2	6	230739	230744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422009
4502	NC_022118	CATC	2	8	230754	230761	25 %	25 %	0 %	50 %	532422009
4503	NC_022118	TTA	2	6	230811	230816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422009
4504	NC_022118	TCT	3	9	230831	230839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422009
4505	NC_022118	A	6	6	230907	230912	100 %	0 %	0 %	0 %	532422009
4506	NC_022118	GCT	2	6	230966	230971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422009
4507	NC_022118	TCT	2	6	231101	231106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422009
4508	NC_022118	T	6	6	231280	231285	0 %	100 %	0 %	0 %	532422009
4509	NC_022118	GC	3	6	231439	231444	0 %	0 %	50 %	50 %	532422009
4510	NC_022118	GAC	2	6	231466	231471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422009
4511	NC_022118	A	8	8	231508	231515	100 %	0 %	0 %	0 %	532422009
4512	NC_022118	TAA	2	6	231544	231549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422009
4513	NC_022118	AGA	2	6	231580	231585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422009
4514	NC_022118	GGA	2	6	231625	231630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422009
4515	NC_022118	TGA	2	6	231640	231645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422009
4516	NC_022118	TCC	2	6	231649	231654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422009
4517	NC_022118	AATG	2	8	231677	231684	50 %	25 %	25 %	0 %	532422009
4518	NC_022118	ATT	2	6	231726	231731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422009
4519	NC_022118	ATG	2	6	231772	231777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422010
4520	NC_022118	CAA	2	6	231778	231783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422010
4521	NC_022118	A	6	6	231804	231809	100 %	0 %	0 %	0 %	532422010
4522	NC_022118	A	6	6	231878	231883	100 %	0 %	0 %	0 %	532422010
4523	NC_022118	AAG	2	6	231974	231979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422010
4524	NC_022118	A	6	6	232073	232078	100 %	0 %	0 %	0 %	532422010
4525	NC_022118	AGG	2	6	232143	232148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422010
4526	NC_022118	TGC	2	6	232194	232199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422010
4527	NC_022118	AGA	2	6	232236	232241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422010
4528	NC_022118	CT	3	6	232263	232268	0 %	50 %	0 %	50 %	532422010
4529	NC_022118	C	6	6	232275	232280	0 %	0 %	0 %	100 %	532422010
4530	NC_022118	A	6	6	232315	232320	100 %	0 %	0 %	0 %	532422010
4531	NC_022118	AAG	2	6	232376	232381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422010
4532	NC_022118	TTAC	2	8	232392	232399	25 %	50 %	0 %	25 %	532422010
4533	NC_022118	TCA	2	6	232431	232436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422010
4534	NC_022118	AT	3	6	232480	232485	50 %	50 %	0 %	0 %	532422010
4535	NC_022118	TCA	2	6	232497	232502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422010
4536	NC_022118	ATT	2	6	232557	232562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422010
4537	NC_022118	CT	3	6	232581	232586	0 %	50 %	0 %	50 %	532422010
4538	NC_022118	CTT	2	6	232684	232689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422011
4539	NC_022118	GCTA	2	8	232709	232716	25 %	25 %	25 %	25 %	532422011
4540	NC_022118	CTT	3	9	232771	232779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422011
4541	NC_022118	AGG	2	6	232811	232816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422011
4542	NC_022118	ATT	2	6	232850	232855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422011
4543	NC_022118	TAA	2	6	232874	232879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422011
4544	NC_022118	TTA	2	6	232900	232905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422011
4545	NC_022118	TA	3	6	232933	232938	50 %	50 %	0 %	0 %	532422011
4546	NC_022118	ATT	2	6	232966	232971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422011
4547	NC_022118	CT	3	6	232995	233000	0 %	50 %	0 %	50 %	532422011
4548	NC_022118	A	6	6	233011	233016	100 %	0 %	0 %	0 %	532422011
4549	NC_022118	CAAAA	2	10	233018	233027	80 %	0 %	0 %	20 %	532422011
4550	NC_022118	AGA	2	6	233032	233037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422011
4551	NC_022118	A	8	8	233057	233064	100 %	0 %	0 %	0 %	532422011
4552	NC_022118	AGG	2	6	233090	233095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422011
4553	NC_022118	CAG	2	6	233158	233163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422011
4554	NC_022118	A	6	6	233198	233203	100 %	0 %	0 %	0 %	532422011
4555	NC_022118	TTCT	2	8	233284	233291	0 %	75 %	0 %	25 %	532422011
4556	NC_022118	CAT	2	6	233304	233309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422011
4557	NC_022118	GAA	2	6	233394	233399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422011
4558	NC_022118	CAAA	2	8	233516	233523	75 %	0 %	0 %	25 %	532422011
4559	NC_022118	CAA	2	6	233601	233606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422011
4560	NC_022118	TCTCT	2	10	233632	233641	0 %	60 %	0 %	40 %	532422011
4561	NC_022118	CTT	2	6	233731	233736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422011
4562	NC_022118	TC	3	6	233874	233879	0 %	50 %	0 %	50 %	532422011
4563	NC_022118	ATG	2	6	233976	233981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422011
4564	NC_022118	TCAA	2	8	233998	234005	50 %	25 %	0 %	25 %	532422011
4565	NC_022118	TTA	2	6	234087	234092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422011
4566	NC_022118	GAA	2	6	234132	234137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422011
4567	NC_022118	TTG	2	6	234145	234150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422011
4568	NC_022118	AAC	2	6	234222	234227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422011
4569	NC_022118	TTC	2	6	234524	234529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422012
4570	NC_022118	A	6	6	234537	234542	100 %	0 %	0 %	0 %	532422012
4571	NC_022118	T	7	7	234573	234579	0 %	100 %	0 %	0 %	532422012
4572	NC_022118	GAA	2	6	234586	234591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422012
4573	NC_022118	CTT	2	6	234640	234645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422012
4574	NC_022118	AATA	2	8	234679	234686	75 %	25 %	0 %	0 %	532422012
4575	NC_022118	TAA	2	6	234728	234733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422012
4576	NC_022118	CCT	2	6	234741	234746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422012
4577	NC_022118	TCC	2	6	234764	234769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422012
4578	NC_022118	CTG	2	6	234784	234789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422012
4579	NC_022118	AAG	2	6	234850	234855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422012
4580	NC_022118	TAG	2	6	234896	234901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422012
4581	NC_022118	AGA	2	6	234956	234961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422012
4582	NC_022118	AG	3	6	235092	235097	50 %	0 %	50 %	0 %	532422012
4583	NC_022118	GTT	2	6	235168	235173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422012
4584	NC_022118	GTA	2	6	235189	235194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422012
4585	NC_022118	TTCC	2	8	235221	235228	0 %	50 %	0 %	50 %	532422012
4586	NC_022118	A	6	6	235239	235244	100 %	0 %	0 %	0 %	532422012
4587	NC_022118	A	6	6	235323	235328	100 %	0 %	0 %	0 %	532422012
4588	NC_022118	TAA	2	6	235393	235398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422012
4589	NC_022118	ACG	2	6	235454	235459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422012
4590	NC_022118	AAC	2	6	235493	235498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422012
4591	NC_022118	TC	3	6	235521	235526	0 %	50 %	0 %	50 %	532422012
4592	NC_022118	AAG	2	6	235535	235540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422012
4593	NC_022118	GACT	2	8	235552	235559	25 %	25 %	25 %	25 %	532422012
4594	NC_022118	AT	3	6	235650	235655	50 %	50 %	0 %	0 %	532422012
4595	NC_022118	A	6	6	235678	235683	100 %	0 %	0 %	0 %	532422012
4596	NC_022118	A	7	7	235700	235706	100 %	0 %	0 %	0 %	532422012
4597	NC_022118	CAT	2	6	235723	235728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422012
4598	NC_022118	ACA	2	6	235760	235765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422012
4599	NC_022118	TTCAC	2	10	235802	235811	20 %	40 %	0 %	40 %	532422013
4600	NC_022118	CTT	3	9	235857	235865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422013
4601	NC_022118	ATA	2	6	235880	235885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422013
4602	NC_022118	CTGT	2	8	235932	235939	0 %	50 %	25 %	25 %	532422013
4603	NC_022118	AAC	2	6	236003	236008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422013
4604	NC_022118	AGA	2	6	236236	236241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422013
4605	NC_022118	TCT	2	6	236471	236476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422013
4606	NC_022118	AT	5	10	236491	236500	50 %	50 %	0 %	0 %	532422013
4607	NC_022118	TTGA	2	8	236542	236549	25 %	50 %	25 %	0 %	532422013
4608	NC_022118	CTT	2	6	236554	236559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422013
4609	NC_022118	AAGT	2	8	236623	236630	50 %	25 %	25 %	0 %	532422013
4610	NC_022118	TTCCTT	2	12	236686	236697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422013
4611	NC_022118	GAC	2	6	236925	236930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422013
4612	NC_022118	C	6	6	236967	236972	0 %	0 %	0 %	100 %	532422013
4613	NC_022118	TGC	2	6	237022	237027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422013
4614	NC_022118	GAT	2	6	237033	237038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422013
4615	NC_022118	TCT	2	6	237041	237046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422013
4616	NC_022118	CTT	2	6	237072	237077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422013
4617	NC_022118	ATCC	2	8	237087	237094	25 %	25 %	0 %	50 %	532422013
4618	NC_022118	CTT	2	6	237132	237137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422013
4619	NC_022118	TCA	2	6	237404	237409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422013
4620	NC_022118	GAG	2	6	237415	237420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422013
4621	NC_022118	A	6	6	237452	237457	100 %	0 %	0 %	0 %	532422013
4622	NC_022118	TTG	2	6	237483	237488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422013
4623	NC_022118	TTC	2	6	237557	237562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422013
4624	NC_022118	GCA	2	6	237639	237644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422013
4625	NC_022118	C	6	6	237679	237684	0 %	0 %	0 %	100 %	532422013
4626	NC_022118	A	7	7	237797	237803	100 %	0 %	0 %	0 %	532422013
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4628	NC_022118	TC	3	6	237921	237926	0 %	50 %	0 %	50 %	532422013
4629	NC_022118	GT	3	6	237931	237936	0 %	50 %	50 %	0 %	532422013
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4632	NC_022118	TGT	2	6	238227	238232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422013
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4739	NC_022118	CAGA	2	8	243591	243598	50 %	0 %	25 %	25 %	532422019
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4742	NC_022118	GCTG	2	8	243773	243780	0 %	25 %	50 %	25 %	532422019
4743	NC_022118	CTT	2	6	243792	243797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422019
4744	NC_022118	T	6	6	243847	243852	0 %	100 %	0 %	0 %	532422019
4745	NC_022118	TAAAC	2	10	243856	243865	60 %	20 %	0 %	20 %	532422019
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4748	NC_022118	TCT	3	9	243983	243991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422019
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4854	NC_022118	T	6	6	248739	248744	0 %	100 %	0 %	0 %	532422023
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4856	NC_022118	GTATT	2	10	248820	248829	20 %	60 %	20 %	0 %	532422024
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4862	NC_022118	TTC	2	6	248976	248981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422024
4863	NC_022118	AT	3	6	248985	248990	50 %	50 %	0 %	0 %	532422024
4864	NC_022118	ATC	2	6	249010	249015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422024
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4866	NC_022118	GCA	2	6	249071	249076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422024
4867	NC_022118	AAG	2	6	249106	249111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422024
4868	NC_022118	GAAA	2	8	249130	249137	75 %	0 %	25 %	0 %	532422024
4869	NC_022118	A	6	6	249135	249140	100 %	0 %	0 %	0 %	532422024
4870	NC_022118	CTC	2	6	249168	249173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422024
4871	NC_022118	CTCC	2	8	249230	249237	0 %	25 %	0 %	75 %	532422024
4872	NC_022118	AGA	2	6	249271	249276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422024
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4989	NC_022118	TCTG	2	8	255644	255651	0 %	50 %	25 %	25 %	532422034
4990	NC_022118	TCC	2	6	255674	255679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422034
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4992	NC_022118	CGA	2	6	255764	255769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422034
4993	NC_022118	TTC	2	6	255811	255816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422034
4994	NC_022118	ACG	2	6	255871	255876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422034
4995	NC_022118	AACC	2	8	255915	255922	50 %	0 %	0 %	50 %	532422034
4996	NC_022118	AAG	2	6	255948	255953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422034
4997	NC_022118	CTG	2	6	255972	255977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422034
4998	NC_022118	GCT	2	6	256100	256105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422034
4999	NC_022118	ATTT	2	8	256157	256164	25 %	75 %	0 %	0 %	532422034
5000	NC_022118	TC	3	6	256409	256414	0 %	50 %	0 %	50 %	532422035

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