MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_022110	A	6	6	955922	955927	100 %	0 %	0 %	0 %	532353971
18503	NC_022110	A	6	6	955945	955950	100 %	0 %	0 %	0 %	532353971
18504	NC_022110	AAC	2	6	955989	955994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353971
18505	NC_022110	GCA	2	6	956011	956016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353971
18506	NC_022110	ACA	2	6	956019	956024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353971
18507	NC_022110	AGA	2	6	956028	956033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353971
18508	NC_022110	GAA	2	6	956074	956079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353971
18509	NC_022110	TGA	2	6	956103	956108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353971
18510	NC_022110	GAAAAA	2	12	956133	956144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532353971
18511	NC_022110	AGA	3	9	956179	956187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353971
18512	NC_022110	GTT	2	6	956202	956207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353971
18513	NC_022110	T	7	7	956206	956212	0 %	100 %	0 %	0 %	532353971
18514	NC_022110	GTA	2	6	956229	956234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353971
18515	NC_022110	T	7	7	956249	956255	0 %	100 %	0 %	0 %	532353971
18516	NC_022110	CGA	2	6	956270	956275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353971
18517	NC_022110	TCA	2	6	956279	956284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353971
18518	NC_022110	CAG	2	6	956332	956337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353971
18519	NC_022110	GT	3	6	956361	956366	0 %	50 %	50 %	0 %	532353971
18520	NC_022110	TTC	2	6	956399	956404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353971
18521	NC_022110	T	6	6	956432	956437	0 %	100 %	0 %	0 %	532353971
18522	NC_022110	ATTT	2	8	956529	956536	25 %	75 %	0 %	0 %	532353972
18523	NC_022110	T	8	8	956534	956541	0 %	100 %	0 %	0 %	532353972
18524	NC_022110	T	7	7	956589	956595	0 %	100 %	0 %	0 %	532353972
18525	NC_022110	GGC	2	6	956651	956656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353972
18526	NC_022110	TGC	2	6	956657	956662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353972
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18529	NC_022110	CAAT	2	8	956765	956772	50 %	25 %	0 %	25 %	532353972
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18532	NC_022110	A	8	8	956952	956959	100 %	0 %	0 %	0 %	532353973
18533	NC_022110	ATT	2	6	956981	956986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353973
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18535	NC_022110	TTTG	2	8	957027	957034	0 %	75 %	25 %	0 %	532353973
18536	NC_022110	AAG	2	6	957087	957092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353973
18537	NC_022110	AGTT	2	8	957151	957158	25 %	50 %	25 %	0 %	532353973
18538	NC_022110	TTA	2	6	957459	957464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353974
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18540	NC_022110	TGA	2	6	957628	957633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353974
18541	NC_022110	AT	3	6	957679	957684	50 %	50 %	0 %	0 %	532353974
18542	NC_022110	GAA	2	6	957791	957796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353974
18543	NC_022110	TGA	2	6	957958	957963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353974
18544	NC_022110	ACG	2	6	958021	958026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353974
18545	NC_022110	TGA	2	6	958062	958067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353974
18546	NC_022110	GCA	2	6	958147	958152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353974
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18548	NC_022110	TACAA	2	10	958214	958223	60 %	20 %	0 %	20 %	532353974
18549	NC_022110	GGGAT	2	10	958227	958236	20 %	20 %	60 %	0 %	532353974
18550	NC_022110	TAT	2	6	958261	958266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353974
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18552	NC_022110	TTG	2	6	958521	958526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353974
18553	NC_022110	TGT	2	6	958528	958533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353974
18554	NC_022110	TG	3	6	958579	958584	0 %	50 %	50 %	0 %	532353974
18555	NC_022110	TTGT	2	8	958701	958708	0 %	75 %	25 %	0 %	532353974
18556	NC_022110	CTG	2	6	958744	958749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353974
18557	NC_022110	TCT	2	6	958752	958757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353974
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18565	NC_022110	TGC	2	6	959093	959098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353975
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18574	NC_022110	GCTA	2	8	959597	959604	25 %	25 %	25 %	25 %	532353975
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18579	NC_022110	GCAA	2	8	959870	959877	50 %	0 %	25 %	25 %	532353975
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18589	NC_022110	TAGA	2	8	960355	960362	50 %	25 %	25 %	0 %	532353975
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18591	NC_022110	CT	3	6	960414	960419	0 %	50 %	0 %	50 %	532353975
18592	NC_022110	TGA	2	6	960420	960425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353975
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18594	NC_022110	A	6	6	960486	960491	100 %	0 %	0 %	0 %	532353975
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