MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022110	GTG	2	6	931940	931945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353955
18002	NC_022110	AGA	2	6	931949	931954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353955
18003	NC_022110	CGT	2	6	931976	931981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353955
18004	NC_022110	GAG	2	6	932000	932005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353955
18005	NC_022110	AG	3	6	932032	932037	50 %	0 %	50 %	0 %	532353955
18006	NC_022110	TCTAT	2	10	932045	932054	20 %	60 %	0 %	20 %	532353955
18007	NC_022110	TAA	2	6	932065	932070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353955
18008	NC_022110	GCT	2	6	932138	932143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353955
18009	NC_022110	GTAA	2	8	932163	932170	50 %	25 %	25 %	0 %	532353955
18010	NC_022110	GAG	2	6	932281	932286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353955
18011	NC_022110	CTGT	2	8	932477	932484	0 %	50 %	25 %	25 %	532353955
18012	NC_022110	CA	3	6	932496	932501	50 %	0 %	0 %	50 %	532353955
18013	NC_022110	TAG	2	6	932581	932586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353955
18014	NC_022110	TAA	2	6	932628	932633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353955
18015	NC_022110	ACAT	2	8	932789	932796	50 %	25 %	0 %	25 %	532353955
18016	NC_022110	AAG	2	6	932847	932852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353955
18017	NC_022110	TGA	2	6	932860	932865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353955
18018	NC_022110	CAAC	2	8	932910	932917	50 %	0 %	0 %	50 %	532353955
18019	NC_022110	CCA	2	6	932945	932950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353955
18020	NC_022110	T	6	6	932964	932969	0 %	100 %	0 %	0 %	532353955
18021	NC_022110	TTC	2	6	933037	933042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353955
18022	NC_022110	GAAC	2	8	933080	933087	50 %	0 %	25 %	25 %	532353955
18023	NC_022110	GA	3	6	933126	933131	50 %	0 %	50 %	0 %	532353955
18024	NC_022110	GAG	2	6	933146	933151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353955
18025	NC_022110	GAG	2	6	933168	933173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353955
18026	NC_022110	ATAA	2	8	933191	933198	75 %	25 %	0 %	0 %	532353955
18027	NC_022110	G	6	6	933209	933214	0 %	0 %	100 %	0 %	532353955
18028	NC_022110	T	6	6	933217	933222	0 %	100 %	0 %	0 %	532353955
18029	NC_022110	TCG	2	6	933277	933282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353955
18030	NC_022110	GCGA	2	8	933344	933351	25 %	0 %	50 %	25 %	532353955
18031	NC_022110	GTT	2	6	933357	933362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353955
18032	NC_022110	CTC	2	6	933394	933399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353955
18033	NC_022110	TCT	2	6	933422	933427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353955
18034	NC_022110	TTG	2	6	933438	933443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353955
18035	NC_022110	AGG	2	6	933475	933480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353955
18036	NC_022110	GCA	2	6	933533	933538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353955
18037	NC_022110	TGA	2	6	933636	933641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353955
18038	NC_022110	GAGG	2	8	933660	933667	25 %	0 %	75 %	0 %	532353955
18039	NC_022110	TCA	2	6	933704	933709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353955
18040	NC_022110	TG	3	6	933779	933784	0 %	50 %	50 %	0 %	532353955
18041	NC_022110	TAAG	2	8	933794	933801	50 %	25 %	25 %	0 %	532353955
18042	NC_022110	CACAT	2	10	933812	933821	40 %	20 %	0 %	40 %	532353955
18043	NC_022110	CGC	2	6	933882	933887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353955
18044	NC_022110	TAG	2	6	933990	933995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353955
18045	NC_022110	CTA	2	6	934035	934040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353955
18046	NC_022110	GA	3	6	934060	934065	50 %	0 %	50 %	0 %	532353955
18047	NC_022110	GAAA	2	8	934079	934086	75 %	0 %	25 %	0 %	532353955
18048	NC_022110	TGG	2	6	934121	934126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353955
18049	NC_022110	TGA	2	6	934280	934285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353955
18050	NC_022110	ATG	2	6	934286	934291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353955
18051	NC_022110	CAT	2	6	934327	934332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353955
18052	NC_022110	AGA	2	6	934388	934393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353955
18053	NC_022110	AG	3	6	934552	934557	50 %	0 %	50 %	0 %	532353955
18054	NC_022110	T	6	6	934571	934576	0 %	100 %	0 %	0 %	532353955
18055	NC_022110	TATT	2	8	934595	934602	25 %	75 %	0 %	0 %	532353955
18056	NC_022110	GGT	2	6	934905	934910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354107
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18058	NC_022110	TTA	2	6	935147	935152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353956
18059	NC_022110	TAG	2	6	935175	935180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353956
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18061	NC_022110	TTC	2	6	935225	935230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353956
18062	NC_022110	CTT	2	6	935241	935246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353956
18063	NC_022110	TCA	2	6	935249	935254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353956
18064	NC_022110	TAG	2	6	935333	935338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353956
18065	NC_022110	TTA	2	6	935392	935397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353956
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18068	NC_022110	TGGT	2	8	935531	935538	0 %	50 %	50 %	0 %	532353956
18069	NC_022110	AAG	2	6	935600	935605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353956
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18072	NC_022110	GCG	2	6	935747	935752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353957
18073	NC_022110	TTC	2	6	935839	935844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353957
18074	NC_022110	TAA	2	6	935874	935879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353957
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18077	NC_022110	T	6	6	936016	936021	0 %	100 %	0 %	0 %	532353957
18078	NC_022110	A	8	8	936040	936047	100 %	0 %	0 %	0 %	532353957
18079	NC_022110	TGTCG	2	10	936118	936127	0 %	40 %	40 %	20 %	532353957
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18082	NC_022110	AC	3	6	936276	936281	50 %	0 %	0 %	50 %	532353957
18083	NC_022110	ATTC	2	8	936324	936331	25 %	50 %	0 %	25 %	532353957
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18089	NC_022110	GCA	3	9	936512	936520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353957
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18092	NC_022110	CTT	2	6	936651	936656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353957
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18096	NC_022110	TG	3	6	936844	936849	0 %	50 %	50 %	0 %	532353957
18097	NC_022110	AAT	2	6	936850	936855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353957
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18099	NC_022110	TAAA	2	8	936886	936893	75 %	25 %	0 %	0 %	532353957
18100	NC_022110	AAT	2	6	936920	936925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353957
18101	NC_022110	TTTA	2	8	936954	936961	25 %	75 %	0 %	0 %	532353957
18102	NC_022110	GTT	2	6	936986	936991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353957
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18119	NC_022110	GAC	2	6	938278	938283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353959
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18121	NC_022110	CAATC	2	10	938371	938380	40 %	20 %	0 %	40 %	532353959
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18240	NC_022110	GA	3	6	943153	943158	50 %	0 %	50 %	0 %	532353965
18241	NC_022110	ATA	2	6	943173	943178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353965
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18486	NC_022110	T	8	8	955246	955253	0 %	100 %	0 %	0 %	532353970
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