MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022110	T	6	6	905443	905448	0 %	100 %	0 %	0 %	532353932
17502	NC_022110	ATT	2	6	905469	905474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353932
17503	NC_022110	AGA	2	6	905488	905493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353933
17504	NC_022110	TGA	2	6	905560	905565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353933
17505	NC_022110	AAG	2	6	905595	905600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353933
17506	NC_022110	A	7	7	905701	905707	100 %	0 %	0 %	0 %	532353933
17507	NC_022110	AGG	2	6	905715	905720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353933
17508	NC_022110	CTTTT	2	10	905748	905757	0 %	80 %	0 %	20 %	532353933
17509	NC_022110	CTT	2	6	905820	905825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353933
17510	NC_022110	T	6	6	905824	905829	0 %	100 %	0 %	0 %	532353933
17511	NC_022110	CAATTT	2	12	905844	905855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532353933
17512	NC_022110	CTT	2	6	906012	906017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353934
17513	NC_022110	T	7	7	906083	906089	0 %	100 %	0 %	0 %	532353934
17514	NC_022110	AC	3	6	906096	906101	50 %	0 %	0 %	50 %	532353934
17515	NC_022110	ATCGCC	2	12	906115	906126	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532353934
17516	NC_022110	TC	3	6	906135	906140	0 %	50 %	0 %	50 %	532353934
17517	NC_022110	TTG	2	6	906148	906153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353934
17518	NC_022110	TA	3	6	906310	906315	50 %	50 %	0 %	0 %	532353934
17519	NC_022110	CAA	2	6	906317	906322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353934
17520	NC_022110	ATC	2	6	906334	906339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353934
17521	NC_022110	CT	3	6	906404	906409	0 %	50 %	0 %	50 %	532353934
17522	NC_022110	TCT	2	6	906471	906476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353934
17523	NC_022110	TTTTA	2	10	906493	906502	20 %	80 %	0 %	0 %	532353934
17524	NC_022110	CTTT	2	8	906511	906518	0 %	75 %	0 %	25 %	532353934
17525	NC_022110	T	6	6	906583	906588	0 %	100 %	0 %	0 %	532353934
17526	NC_022110	ATA	2	6	906620	906625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353934
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17528	NC_022110	AGTT	2	8	906722	906729	25 %	50 %	25 %	0 %	532354102
17529	NC_022110	TCA	2	6	906744	906749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354102
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17533	NC_022110	CAGT	2	8	907067	907074	25 %	25 %	25 %	25 %	532353935
17534	NC_022110	TCT	2	6	907263	907268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353935
17535	NC_022110	AGT	2	6	907275	907280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353935
17536	NC_022110	ATC	2	6	907312	907317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353935
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17538	NC_022110	TTG	2	6	907403	907408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353935
17539	NC_022110	CAAC	2	8	907412	907419	50 %	0 %	0 %	50 %	532353935
17540	NC_022110	AGG	2	6	907500	907505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353935
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17542	NC_022110	TAG	2	6	907681	907686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353935
17543	NC_022110	TCTA	2	8	907805	907812	25 %	50 %	0 %	25 %	532353935
17544	NC_022110	AT	3	6	907852	907857	50 %	50 %	0 %	0 %	532353935
17545	NC_022110	CTT	2	6	907876	907881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353935
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17547	NC_022110	GAA	2	6	907949	907954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353936
17548	NC_022110	TAT	2	6	907963	907968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353936
17549	NC_022110	AGG	2	6	908080	908085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353936
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17551	NC_022110	GAA	2	6	908211	908216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353936
17552	NC_022110	GA	3	6	908232	908237	50 %	0 %	50 %	0 %	532353936
17553	NC_022110	GTT	2	6	908284	908289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353936
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17555	NC_022110	GA	3	6	908356	908361	50 %	0 %	50 %	0 %	532353936
17556	NC_022110	GCT	2	6	908401	908406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353936
17557	NC_022110	TCT	2	6	908463	908468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353936
17558	NC_022110	ATA	2	6	908516	908521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353936
17559	NC_022110	GAG	2	6	908663	908668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353936
17560	NC_022110	TCAC	2	8	908710	908717	25 %	25 %	0 %	50 %	532353936
17561	NC_022110	AG	3	6	908760	908765	50 %	0 %	50 %	0 %	532353936
17562	NC_022110	AGAGC	2	10	908780	908789	40 %	0 %	40 %	20 %	532353936
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17565	NC_022110	CGT	2	6	909266	909271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353937
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17568	NC_022110	GCTT	2	8	909355	909362	0 %	50 %	25 %	25 %	532353937
17569	NC_022110	AGA	2	6	909398	909403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353937
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17572	NC_022110	TTC	2	6	909582	909587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353937
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17578	NC_022110	ATG	2	6	909961	909966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353937
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17600	NC_022110	GAC	2	6	911033	911038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353938
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17605	NC_022110	A	6	6	911226	911231	100 %	0 %	0 %	0 %	532353938
17606	NC_022110	ATT	2	6	911343	911348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353938
17607	NC_022110	GAAG	2	8	911403	911410	50 %	0 %	50 %	0 %	532353938
17608	NC_022110	TC	3	6	911450	911455	0 %	50 %	0 %	50 %	532353938
17609	NC_022110	CG	3	6	911543	911548	0 %	0 %	50 %	50 %	532353938
17610	NC_022110	TTG	2	6	911642	911647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354103
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17612	NC_022110	ATCT	2	8	911732	911739	25 %	50 %	0 %	25 %	532354103
17613	NC_022110	T	7	7	911741	911747	0 %	100 %	0 %	0 %	532354103
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17743	NC_022110	CTT	2	6	918314	918319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353942
17744	NC_022110	GCA	2	6	918353	918358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353942
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17747	NC_022110	TGA	2	6	918463	918468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353942
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17749	NC_022110	CTC	2	6	918557	918562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353942
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17756	NC_022110	GTGG	2	8	918903	918910	0 %	25 %	75 %	0 %	532353942
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17856	NC_022110	AC	4	8	924456	924463	50 %	0 %	0 %	50 %	532353950
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