MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_022110	GAAA	2	8	874776	874783	75 %	0 %	25 %	0 %	532353912
17003	NC_022110	GGC	2	6	874815	874820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353912
17004	NC_022110	TGT	2	6	874845	874850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353912
17005	NC_022110	AC	3	6	874963	874968	50 %	0 %	0 %	50 %	532353912
17006	NC_022110	TTC	2	6	874969	874974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353912
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17008	NC_022110	TCGA	2	8	875100	875107	25 %	25 %	25 %	25 %	532353912
17009	NC_022110	TCTG	2	8	875187	875194	0 %	50 %	25 %	25 %	532353912
17010	NC_022110	TCA	2	6	875227	875232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353912
17011	NC_022110	ATAA	2	8	875253	875260	75 %	25 %	0 %	0 %	532353912
17012	NC_022110	A	6	6	875361	875366	100 %	0 %	0 %	0 %	532353912
17013	NC_022110	GT	3	6	875383	875388	0 %	50 %	50 %	0 %	532353912
17014	NC_022110	T	6	6	875638	875643	0 %	100 %	0 %	0 %	532353912
17015	NC_022110	CAA	2	6	875650	875655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353912
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17017	NC_022110	GAAGA	2	10	875723	875732	60 %	0 %	40 %	0 %	532353912
17018	NC_022110	AAG	2	6	875746	875751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353912
17019	NC_022110	A	8	8	875814	875821	100 %	0 %	0 %	0 %	532353912
17020	NC_022110	A	7	7	875832	875838	100 %	0 %	0 %	0 %	532353912
17021	NC_022110	AG	3	6	875843	875848	50 %	0 %	50 %	0 %	532353912
17022	NC_022110	A	8	8	875865	875872	100 %	0 %	0 %	0 %	532353912
17023	NC_022110	CTTT	2	8	876017	876024	0 %	75 %	0 %	25 %	532354099
17024	NC_022110	CGAA	2	8	876025	876032	50 %	0 %	25 %	25 %	532354099
17025	NC_022110	GAAG	2	8	876037	876044	50 %	0 %	50 %	0 %	532354099
17026	NC_022110	TAA	2	6	876181	876186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354099
17027	NC_022110	TA	3	6	876194	876199	50 %	50 %	0 %	0 %	532354099
17028	NC_022110	T	6	6	876200	876205	0 %	100 %	0 %	0 %	532354099
17029	NC_022110	GGC	2	6	876239	876244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532354099
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17033	NC_022110	ATT	2	6	882195	882200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353913
17034	NC_022110	TAT	2	6	882209	882214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353913
17035	NC_022110	AAG	2	6	882232	882237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353913
17036	NC_022110	AGA	2	6	882311	882316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353913
17037	NC_022110	TGC	2	6	882353	882358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353913
17038	NC_022110	ACA	2	6	882362	882367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353913
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17040	NC_022110	GATT	2	8	882454	882461	25 %	50 %	25 %	0 %	532353913
17041	NC_022110	GAA	2	6	882486	882491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353913
17042	NC_022110	CGG	2	6	882595	882600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353913
17043	NC_022110	TC	3	6	882602	882607	0 %	50 %	0 %	50 %	532353913
17044	NC_022110	AAG	2	6	882634	882639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353913
17045	NC_022110	T	6	6	882761	882766	0 %	100 %	0 %	0 %	532353913
17046	NC_022110	ATT	2	6	882778	882783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353913
17047	NC_022110	CGATT	2	10	882793	882802	20 %	40 %	20 %	20 %	532353913
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17050	NC_022110	GCT	2	6	882975	882980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353913
17051	NC_022110	CTAC	2	8	883026	883033	25 %	25 %	0 %	50 %	532353913
17052	NC_022110	AGGA	2	8	883099	883106	50 %	0 %	50 %	0 %	532353913
17053	NC_022110	TG	3	6	883126	883131	0 %	50 %	50 %	0 %	532353913
17054	NC_022110	TTG	2	6	883217	883222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353913
17055	NC_022110	GA	3	6	883233	883238	50 %	0 %	50 %	0 %	532353913
17056	NC_022110	AGG	2	6	883268	883273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353913
17057	NC_022110	ATGG	2	8	883359	883366	25 %	25 %	50 %	0 %	532353913
17058	NC_022110	ATA	2	6	883423	883428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353913
17059	NC_022110	ATC	2	6	883493	883498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353913
17060	NC_022110	AG	3	6	883566	883571	50 %	0 %	50 %	0 %	532353913
17061	NC_022110	GCA	2	6	883722	883727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353914
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17064	NC_022110	G	6	6	883920	883925	0 %	0 %	100 %	0 %	532353914
17065	NC_022110	AAT	2	6	883975	883980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353914
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17068	NC_022110	GCT	2	6	884076	884081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353914
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17073	NC_022110	T	7	7	884352	884358	0 %	100 %	0 %	0 %	532353914
17074	NC_022110	GTT	2	6	884387	884392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353914
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17092	NC_022110	T	7	7	885299	885305	0 %	100 %	0 %	0 %	532353915
17093	NC_022110	T	8	8	885338	885345	0 %	100 %	0 %	0 %	532353915
17094	NC_022110	TTC	2	6	885417	885422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353916
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17102	NC_022110	GAA	2	6	885833	885838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353917
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17106	NC_022110	TTA	2	6	885895	885900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353917
17107	NC_022110	GTTT	2	8	885919	885926	0 %	75 %	25 %	0 %	532353917
17108	NC_022110	T	6	6	885924	885929	0 %	100 %	0 %	0 %	532353917
17109	NC_022110	CAT	2	6	885950	885955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353917
17110	NC_022110	TA	3	6	885969	885974	50 %	50 %	0 %	0 %	532353917
17111	NC_022110	GAAA	2	8	886000	886007	75 %	0 %	25 %	0 %	532353917
17112	NC_022110	CA	3	6	886062	886067	50 %	0 %	0 %	50 %	532353917
17113	NC_022110	GCT	2	6	886085	886090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353917
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17118	NC_022110	T	7	7	886357	886363	0 %	100 %	0 %	0 %	532353917
17119	NC_022110	AAG	2	6	886396	886401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353917
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17121	NC_022110	A	6	6	886438	886443	100 %	0 %	0 %	0 %	532353917
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17241	NC_022110	GTA	2	6	892471	892476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353922
17242	NC_022110	AAGG	2	8	892705	892712	50 %	0 %	50 %	0 %	532353922
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17486	NC_022110	GTTTT	2	10	904669	904678	0 %	80 %	20 %	0 %	532353932
17487	NC_022110	GAT	2	6	904806	904811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353932
17488	NC_022110	GAA	2	6	904940	904945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353932
17489	NC_022110	GAAT	2	8	904975	904982	50 %	25 %	25 %	0 %	532353932
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17491	NC_022110	CAA	2	6	905077	905082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353932
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