MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022110	ATC	2	6	842676	842681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353893
16502	NC_022110	TTG	2	6	842750	842755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353893
16503	NC_022110	GTTT	2	8	842767	842774	0 %	75 %	25 %	0 %	532353893
16504	NC_022110	AGT	2	6	842838	842843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353893
16505	NC_022110	AT	3	6	842940	842945	50 %	50 %	0 %	0 %	532353893
16506	NC_022110	TCT	3	9	842983	842991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353893
16507	NC_022110	AG	4	8	843030	843037	50 %	0 %	50 %	0 %	532353893
16508	NC_022110	TTG	2	6	843053	843058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353893
16509	NC_022110	GC	3	6	843065	843070	0 %	0 %	50 %	50 %	532353893
16510	NC_022110	CAG	2	6	843191	843196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353893
16511	NC_022110	CTT	2	6	843218	843223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353893
16512	NC_022110	AAG	2	6	843280	843285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353893
16513	NC_022110	GCA	2	6	843485	843490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353893
16514	NC_022110	CTT	2	6	843687	843692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353894
16515	NC_022110	GT	3	6	843708	843713	0 %	50 %	50 %	0 %	532353894
16516	NC_022110	GTT	2	6	843742	843747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353894
16517	NC_022110	GCT	2	6	843851	843856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353894
16518	NC_022110	ATG	2	6	843929	843934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353894
16519	NC_022110	CAG	3	9	843938	843946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353894
16520	NC_022110	TTA	2	6	843981	843986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353894
16521	NC_022110	GAT	2	6	843992	843997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353894
16522	NC_022110	ATC	2	6	844100	844105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353894
16523	NC_022110	AAG	2	6	844152	844157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353894
16524	NC_022110	AGA	2	6	844261	844266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353894
16525	NC_022110	ATGGC	2	10	844416	844425	20 %	20 %	40 %	20 %	532353894
16526	NC_022110	T	6	6	844490	844495	0 %	100 %	0 %	0 %	532353894
16527	NC_022110	ATT	2	6	844532	844537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353894
16528	NC_022110	A	6	6	844582	844587	100 %	0 %	0 %	0 %	532353894
16529	NC_022110	GAT	2	6	844625	844630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353894
16530	NC_022110	GGA	3	9	844633	844641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353894
16531	NC_022110	TTG	2	6	844693	844698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353894
16532	NC_022110	TTG	2	6	844732	844737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353894
16533	NC_022110	GGA	2	6	844767	844772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353894
16534	NC_022110	CTT	3	9	844777	844785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353894
16535	NC_022110	TTGC	2	8	844873	844880	0 %	50 %	25 %	25 %	532353894
16536	NC_022110	GC	3	6	845024	845029	0 %	0 %	50 %	50 %	532353895
16537	NC_022110	CAT	2	6	845086	845091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353895
16538	NC_022110	TC	3	6	845095	845100	0 %	50 %	0 %	50 %	532353895
16539	NC_022110	GGAA	2	8	845107	845114	50 %	0 %	50 %	0 %	532353895
16540	NC_022110	AGA	2	6	845132	845137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353895
16541	NC_022110	T	8	8	845158	845165	0 %	100 %	0 %	0 %	532353895
16542	NC_022110	AAG	2	6	845245	845250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353895
16543	NC_022110	AGAA	2	8	845285	845292	75 %	0 %	25 %	0 %	532353895
16544	NC_022110	CTA	2	6	845335	845340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353895
16545	NC_022110	CTT	2	6	845500	845505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353896
16546	NC_022110	TCA	2	6	845563	845568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353896
16547	NC_022110	AGA	2	6	845603	845608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353896
16548	NC_022110	GTAA	2	8	845636	845643	50 %	25 %	25 %	0 %	532353896
16549	NC_022110	TTG	2	6	845678	845683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353896
16550	NC_022110	TG	3	6	845711	845716	0 %	50 %	50 %	0 %	532353896
16551	NC_022110	CAG	2	6	845803	845808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353896
16552	NC_022110	GAA	2	6	845879	845884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353896
16553	NC_022110	GA	3	6	845902	845907	50 %	0 %	50 %	0 %	532353896
16554	NC_022110	ATG	2	6	845917	845922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353896
16555	NC_022110	GT	3	6	845940	845945	0 %	50 %	50 %	0 %	532353896
16556	NC_022110	CT	3	6	845975	845980	0 %	50 %	0 %	50 %	532353896
16557	NC_022110	GCA	2	6	846009	846014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353896
16558	NC_022110	ATGCA	2	10	846122	846131	40 %	20 %	20 %	20 %	532353896
16559	NC_022110	TAA	2	6	846212	846217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353896
16560	NC_022110	T	7	7	846264	846270	0 %	100 %	0 %	0 %	532353896
16561	NC_022110	AAT	2	6	846273	846278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353896
16562	NC_022110	CTA	2	6	846337	846342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353896
16563	NC_022110	TTA	2	6	846505	846510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353896
16564	NC_022110	CTT	2	6	846546	846551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353896
16565	NC_022110	TG	3	6	846596	846601	0 %	50 %	50 %	0 %	532353896
16566	NC_022110	AAG	2	6	846659	846664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353896
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16568	NC_022110	T	6	6	846725	846730	0 %	100 %	0 %	0 %	532353896
16569	NC_022110	GAAA	2	8	847181	847188	75 %	0 %	25 %	0 %	532353897
16570	NC_022110	CTTT	2	8	847193	847200	0 %	75 %	0 %	25 %	532353897
16571	NC_022110	GTA	2	6	847202	847207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353897
16572	NC_022110	CTG	4	12	847209	847220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353897
16573	NC_022110	TCT	2	6	847226	847231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353897
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16575	NC_022110	ATCC	2	8	847289	847296	25 %	25 %	0 %	50 %	532353897
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16578	NC_022110	AGC	2	6	847417	847422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353897
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16580	NC_022110	GCTGA	2	10	847523	847532	20 %	20 %	40 %	20 %	532353897
16581	NC_022110	TA	3	6	847558	847563	50 %	50 %	0 %	0 %	532353897
16582	NC_022110	AGT	2	6	847657	847662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353897
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16590	NC_022110	CT	3	6	848239	848244	0 %	50 %	0 %	50 %	532353898
16591	NC_022110	TTC	2	6	848369	848374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353898
16592	NC_022110	TCT	2	6	848395	848400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353898
16593	NC_022110	TAT	2	6	848481	848486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353898
16594	NC_022110	CT	3	6	848570	848575	0 %	50 %	0 %	50 %	532353898
16595	NC_022110	GAT	2	6	848613	848618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353898
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16599	NC_022110	TTGC	2	8	848768	848775	0 %	50 %	25 %	25 %	532353898
16600	NC_022110	A	6	6	848780	848785	100 %	0 %	0 %	0 %	532353898
16601	NC_022110	AT	3	6	848793	848798	50 %	50 %	0 %	0 %	532353898
16602	NC_022110	GC	3	6	848811	848816	0 %	0 %	50 %	50 %	532353898
16603	NC_022110	TTG	2	6	848824	848829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353898
16604	NC_022110	GTG	2	6	848861	848866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353898
16605	NC_022110	AAG	2	6	848999	849004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353898
16606	NC_022110	AGT	2	6	849032	849037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353898
16607	NC_022110	CTCAC	2	10	849100	849109	20 %	20 %	0 %	60 %	532353898
16608	NC_022110	AG	3	6	849199	849204	50 %	0 %	50 %	0 %	532353898
16609	NC_022110	TTG	2	6	849224	849229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353898
16610	NC_022110	TCC	2	6	849243	849248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353898
16611	NC_022110	CTG	2	6	849359	849364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353899
16612	NC_022110	CCT	2	6	849382	849387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353899
16613	NC_022110	TTATGC	2	12	849420	849431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532353899
16614	NC_022110	TGT	2	6	849438	849443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353899
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16616	NC_022110	GGAC	2	8	849492	849499	25 %	0 %	50 %	25 %	532353899
16617	NC_022110	ATT	2	6	849554	849559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353899
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16619	NC_022110	GAA	2	6	849641	849646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353899
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16621	NC_022110	TAA	2	6	849731	849736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353899
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16991	NC_022110	TAG	2	6	874416	874421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353912
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