MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022110	TAG	2	6	819257	819262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353873
16002	NC_022110	GGA	3	9	819283	819291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353873
16003	NC_022110	CT	3	6	819337	819342	0 %	50 %	0 %	50 %	532353873
16004	NC_022110	TTA	2	6	819344	819349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353873
16005	NC_022110	GAA	2	6	819417	819422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353873
16006	NC_022110	AG	3	6	819429	819434	50 %	0 %	50 %	0 %	532353873
16007	NC_022110	AGA	2	6	819494	819499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353873
16008	NC_022110	GAC	2	6	819522	819527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353873
16009	NC_022110	CAG	2	6	819573	819578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353873
16010	NC_022110	TGA	2	6	819595	819600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353873
16011	NC_022110	TCGT	2	8	819637	819644	0 %	50 %	25 %	25 %	532353873
16012	NC_022110	TCT	2	6	819645	819650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353873
16013	NC_022110	AAG	3	9	819703	819711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353874
16014	NC_022110	CAA	2	6	819718	819723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353874
16015	NC_022110	GA	3	6	819731	819736	50 %	0 %	50 %	0 %	532353874
16016	NC_022110	TGCA	2	8	819760	819767	25 %	25 %	25 %	25 %	532353874
16017	NC_022110	TGT	2	6	819878	819883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353874
16018	NC_022110	GA	3	6	819994	819999	50 %	0 %	50 %	0 %	532353874
16019	NC_022110	AGT	2	6	820059	820064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353874
16020	NC_022110	AAG	2	6	820110	820115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353874
16021	NC_022110	CTT	2	6	820135	820140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353874
16022	NC_022110	CAA	2	6	820152	820157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353874
16023	NC_022110	GGTT	2	8	820158	820165	0 %	50 %	50 %	0 %	532353874
16024	NC_022110	ATT	2	6	820182	820187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353874
16025	NC_022110	GAAG	3	12	820203	820214	50 %	0 %	50 %	0 %	532353874
16026	NC_022110	TGC	2	6	820223	820228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353874
16027	NC_022110	ATG	2	6	820339	820344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353874
16028	NC_022110	T	6	6	820377	820382	0 %	100 %	0 %	0 %	532353874
16029	NC_022110	CTG	2	6	820471	820476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353874
16030	NC_022110	TGG	2	6	820488	820493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353874
16031	NC_022110	TGAT	2	8	820525	820532	25 %	50 %	25 %	0 %	532353874
16032	NC_022110	GCA	2	6	820569	820574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353874
16033	NC_022110	CTT	2	6	820615	820620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353874
16034	NC_022110	AAT	2	6	820635	820640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353874
16035	NC_022110	TGG	2	6	820673	820678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353874
16036	NC_022110	TGA	2	6	820735	820740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353874
16037	NC_022110	CTA	2	6	820876	820881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353874
16038	NC_022110	CGT	2	6	820995	821000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353874
16039	NC_022110	CAG	2	6	821053	821058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353874
16040	NC_022110	TTG	2	6	821109	821114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353874
16041	NC_022110	GAA	2	6	821205	821210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353874
16042	NC_022110	AAT	2	6	821236	821241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353874
16043	NC_022110	ATT	2	6	821261	821266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353874
16044	NC_022110	A	6	6	821297	821302	100 %	0 %	0 %	0 %	532353874
16045	NC_022110	T	6	6	821305	821310	0 %	100 %	0 %	0 %	532353874
16046	NC_022110	GAT	2	6	821343	821348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353874
16047	NC_022110	TGC	3	9	821423	821431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353874
16048	NC_022110	T	7	7	821452	821458	0 %	100 %	0 %	0 %	532353874
16049	NC_022110	A	6	6	821476	821481	100 %	0 %	0 %	0 %	532353874
16050	NC_022110	TTG	2	6	821614	821619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353875
16051	NC_022110	TTC	2	6	821627	821632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353875
16052	NC_022110	TAA	2	6	821654	821659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353875
16053	NC_022110	TGA	2	6	821702	821707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353875
16054	NC_022110	G	6	6	821730	821735	0 %	0 %	100 %	0 %	532353875
16055	NC_022110	AGA	3	9	821756	821764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353875
16056	NC_022110	CAA	2	6	821817	821822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353875
16057	NC_022110	AAT	2	6	821904	821909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353875
16058	NC_022110	AAAGT	2	10	821926	821935	60 %	20 %	20 %	0 %	532353875
16059	NC_022110	CGATG	2	10	822002	822011	20 %	20 %	40 %	20 %	532353875
16060	NC_022110	CT	3	6	822032	822037	0 %	50 %	0 %	50 %	532353875
16061	NC_022110	GA	3	6	822045	822050	50 %	0 %	50 %	0 %	532353875
16062	NC_022110	AACA	2	8	822130	822137	75 %	0 %	0 %	25 %	532353875
16063	NC_022110	GCTT	2	8	822196	822203	0 %	50 %	25 %	25 %	532353875
16064	NC_022110	TGA	2	6	822251	822256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353875
16065	NC_022110	TCAT	2	8	822298	822305	25 %	50 %	0 %	25 %	532353875
16066	NC_022110	TGA	2	6	822314	822319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353875
16067	NC_022110	TTA	2	6	822395	822400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353875
16068	NC_022110	AAG	2	6	822423	822428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353875
16069	NC_022110	AAT	2	6	822438	822443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353875
16070	NC_022110	CTT	2	6	822451	822456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353875
16071	NC_022110	AG	3	6	822507	822512	50 %	0 %	50 %	0 %	532353875
16072	NC_022110	ATA	2	6	822598	822603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353875
16073	NC_022110	TTC	2	6	822636	822641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353875
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16077	NC_022110	ATT	2	6	822823	822828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353875
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16080	NC_022110	GCT	2	6	822975	822980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353875
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16084	NC_022110	A	6	6	823158	823163	100 %	0 %	0 %	0 %	532353875
16085	NC_022110	TTA	2	6	823239	823244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353875
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16087	NC_022110	AAGC	2	8	823340	823347	50 %	0 %	25 %	25 %	532353875
16088	NC_022110	TGA	2	6	823349	823354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353875
16089	NC_022110	CAG	2	6	823410	823415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353875
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16092	NC_022110	AG	3	6	823499	823504	50 %	0 %	50 %	0 %	532353875
16093	NC_022110	AGC	2	6	823507	823512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353875
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16102	NC_022110	TAAA	2	8	823863	823870	75 %	25 %	0 %	0 %	532353875
16103	NC_022110	AG	3	6	823879	823884	50 %	0 %	50 %	0 %	532353875
16104	NC_022110	AG	3	6	823948	823953	50 %	0 %	50 %	0 %	532353876
16105	NC_022110	AG	5	10	823971	823980	50 %	0 %	50 %	0 %	532353876
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16110	NC_022110	AG	3	6	824162	824167	50 %	0 %	50 %	0 %	532353876
16111	NC_022110	ATT	2	6	824194	824199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353876
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16119	NC_022110	CTT	2	6	824689	824694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353876
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16489	NC_022110	TG	3	6	842284	842289	0 %	50 %	50 %	0 %	532353892
16490	NC_022110	TGT	2	6	842401	842406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353893
16491	NC_022110	TTAA	2	8	842440	842447	50 %	50 %	0 %	0 %	532353893
16492	NC_022110	TGC	2	6	842457	842462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353893
16493	NC_022110	GATCCG	2	12	842482	842493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532353893
16494	NC_022110	A	6	6	842503	842508	100 %	0 %	0 %	0 %	532353893
16495	NC_022110	AGC	2	6	842526	842531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353893
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