MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022110	GAT	2	6	762688	762693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353831
15002	NC_022110	AGA	2	6	762822	762827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353831
15003	NC_022110	AGC	2	6	762831	762836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353831
15004	NC_022110	ATA	2	6	762887	762892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353831
15005	NC_022110	AT	3	6	763002	763007	50 %	50 %	0 %	0 %	532353831
15006	NC_022110	AAT	2	6	763009	763014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353831
15007	NC_022110	GAA	2	6	763080	763085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353831
15008	NC_022110	TGC	2	6	763097	763102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353831
15009	NC_022110	AGA	2	6	763107	763112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353831
15010	NC_022110	TGT	2	6	763194	763199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353831
15011	NC_022110	AATA	2	8	763315	763322	75 %	25 %	0 %	0 %	532353831
15012	NC_022110	TTTA	2	8	763335	763342	25 %	75 %	0 %	0 %	532353831
15013	NC_022110	TTC	2	6	763344	763349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353831
15014	NC_022110	GCT	2	6	763406	763411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353831
15015	NC_022110	GTT	2	6	763417	763422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353831
15016	NC_022110	TCT	2	6	763505	763510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353831
15017	NC_022110	AG	3	6	763632	763637	50 %	0 %	50 %	0 %	532353832
15018	NC_022110	GTT	2	6	763658	763663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353832
15019	NC_022110	ACA	2	6	763719	763724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353832
15020	NC_022110	AT	3	6	763815	763820	50 %	50 %	0 %	0 %	532353832
15021	NC_022110	TAA	2	6	763894	763899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353833
15022	NC_022110	AGA	2	6	763938	763943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353833
15023	NC_022110	TTG	2	6	763951	763956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353833
15024	NC_022110	AAGC	2	8	763994	764001	50 %	0 %	25 %	25 %	532353833
15025	NC_022110	TTG	2	6	764071	764076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353833
15026	NC_022110	TCAC	2	8	764170	764177	25 %	25 %	0 %	50 %	532353834
15027	NC_022110	ATG	2	6	764182	764187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353834
15028	NC_022110	TTC	2	6	764192	764197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353834
15029	NC_022110	AG	4	8	764224	764231	50 %	0 %	50 %	0 %	532353834
15030	NC_022110	GCT	2	6	764240	764245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353834
15031	NC_022110	ATG	2	6	764324	764329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353834
15032	NC_022110	GTG	2	6	764345	764350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353834
15033	NC_022110	TGC	2	6	764434	764439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353834
15034	NC_022110	ATG	2	6	764565	764570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353834
15035	NC_022110	GGA	2	6	764606	764611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353835
15036	NC_022110	ATGCAA	2	12	764685	764696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532353835
15037	NC_022110	TTG	2	6	764743	764748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353835
15038	NC_022110	ACA	2	6	764789	764794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353835
15039	NC_022110	GAA	2	6	764820	764825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353835
15040	NC_022110	GAA	2	6	764868	764873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353835
15041	NC_022110	TGT	2	6	764890	764895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353835
15042	NC_022110	GAGAAA	2	12	764914	764925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353835
15043	NC_022110	AGT	2	6	765015	765020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353835
15044	NC_022110	TAT	2	6	765132	765137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353835
15045	NC_022110	TGT	2	6	765165	765170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353835
15046	NC_022110	GGT	2	6	765237	765242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353835
15047	NC_022110	GAGT	2	8	765293	765300	25 %	25 %	50 %	0 %	532353836
15048	NC_022110	CTT	2	6	765302	765307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353836
15049	NC_022110	GTC	2	6	765747	765752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353836
15050	NC_022110	TGC	2	6	765768	765773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353836
15051	NC_022110	TGA	2	6	765830	765835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353836
15052	NC_022110	CCT	2	6	765895	765900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353836
15053	NC_022110	GAT	2	6	766015	766020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353836
15054	NC_022110	TTCT	2	8	766073	766080	0 %	75 %	0 %	25 %	532353836
15055	NC_022110	AAC	2	6	766166	766171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353836
15056	NC_022110	TTG	2	6	766178	766183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353836
15057	NC_022110	AG	3	6	766192	766197	50 %	0 %	50 %	0 %	532353836
15058	NC_022110	TCG	2	6	766248	766253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353836
15059	NC_022110	GGATC	2	10	766255	766264	20 %	20 %	40 %	20 %	532353836
15060	NC_022110	TAAAT	2	10	766296	766305	60 %	40 %	0 %	0 %	532353836
15061	NC_022110	A	6	6	766331	766336	100 %	0 %	0 %	0 %	532353836
15062	NC_022110	GCT	2	6	766351	766356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353836
15063	NC_022110	TAG	2	6	766394	766399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353836
15064	NC_022110	TG	3	6	766403	766408	0 %	50 %	50 %	0 %	532353836
15065	NC_022110	AAG	2	6	766442	766447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353836
15066	NC_022110	CAGAG	2	10	766459	766468	40 %	0 %	40 %	20 %	532353836
15067	NC_022110	GTT	2	6	766472	766477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353836
15068	NC_022110	AAC	2	6	766603	766608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353836
15069	NC_022110	AGT	2	6	766645	766650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353837
15070	NC_022110	GAA	4	12	766667	766678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353837
15071	NC_022110	AGAA	2	8	766692	766699	75 %	0 %	25 %	0 %	532353837
15072	NC_022110	GCA	3	9	766709	766717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353837
15073	NC_022110	ACG	2	6	766753	766758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353837
15074	NC_022110	AGA	3	9	766762	766770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353837
15075	NC_022110	A	6	6	766770	766775	100 %	0 %	0 %	0 %	532353837
15076	NC_022110	AGA	2	6	766789	766794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353837
15077	NC_022110	AAG	2	6	766803	766808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353837
15078	NC_022110	AGA	2	6	766816	766821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353837
15079	NC_022110	GAA	2	6	766832	766837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353837
15080	NC_022110	AGATG	2	10	766846	766855	40 %	20 %	40 %	0 %	532353837
15081	NC_022110	TCA	2	6	766867	766872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353837
15082	NC_022110	AAC	2	6	766887	766892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353837
15083	NC_022110	TAAA	2	8	766923	766930	75 %	25 %	0 %	0 %	532353837
15084	NC_022110	ATC	2	6	766968	766973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353837
15085	NC_022110	GAAG	2	8	767030	767037	50 %	0 %	50 %	0 %	532353837
15086	NC_022110	GAA	2	6	767076	767081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353837
15087	NC_022110	CGTCA	2	10	767085	767094	20 %	20 %	20 %	40 %	532353837
15088	NC_022110	TCT	2	6	767099	767104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353837
15089	NC_022110	CAG	2	6	767139	767144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353838
15090	NC_022110	TCT	2	6	767150	767155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353838
15091	NC_022110	AGA	3	9	767160	767168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353838
15092	NC_022110	TTC	2	6	767185	767190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353838
15093	NC_022110	TGG	2	6	767193	767198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353838
15094	NC_022110	ATG	2	6	767257	767262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353838
15095	NC_022110	TAG	2	6	767369	767374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353838
15096	NC_022110	ATA	2	6	767387	767392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353838
15097	NC_022110	GAA	2	6	767449	767454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353838
15098	NC_022110	CAG	2	6	767518	767523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353838
15099	NC_022110	AGC	2	6	767531	767536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353838
15100	NC_022110	TGG	2	6	767546	767551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353838
15101	NC_022110	TCA	2	6	767565	767570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353838
15102	NC_022110	GTTG	2	8	767586	767593	0 %	50 %	50 %	0 %	532353838
15103	NC_022110	A	6	6	767627	767632	100 %	0 %	0 %	0 %	532353838
15104	NC_022110	TGC	2	6	767655	767660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353838
15105	NC_022110	CAT	2	6	767671	767676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353838
15106	NC_022110	AAG	2	6	767681	767686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353838
15107	NC_022110	AAG	2	6	767693	767698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353838
15108	NC_022110	GTC	2	6	767705	767710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353838
15109	NC_022110	AGA	2	6	767738	767743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353838
15110	NC_022110	AGA	2	6	767748	767753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353838
15111	NC_022110	AT	3	6	767759	767764	50 %	50 %	0 %	0 %	532353838
15112	NC_022110	GCA	2	6	767785	767790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353838
15113	NC_022110	TAG	2	6	767796	767801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353838
15114	NC_022110	GAAG	2	8	767850	767857	50 %	0 %	50 %	0 %	532353838
15115	NC_022110	TTTTC	2	10	767863	767872	0 %	80 %	0 %	20 %	532353838
15116	NC_022110	GAA	2	6	767926	767931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353838
15117	NC_022110	TCTG	2	8	767961	767968	0 %	50 %	25 %	25 %	532353838
15118	NC_022110	GCT	2	6	767974	767979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353838
15119	NC_022110	GAA	2	6	768064	768069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353839
15120	NC_022110	CTT	2	6	768116	768121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353839
15121	NC_022110	TTA	2	6	768142	768147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353839
15122	NC_022110	ATT	3	9	768155	768163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353839
15123	NC_022110	TTG	2	6	768164	768169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353839
15124	NC_022110	GCT	2	6	768183	768188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353839
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15126	NC_022110	AGA	2	6	768369	768374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353839
15127	NC_022110	AGA	3	9	768459	768467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353839
15128	NC_022110	GTT	2	6	768478	768483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353839
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15130	NC_022110	AGA	2	6	768642	768647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353839
15131	NC_022110	GAA	2	6	768655	768660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353839
15132	NC_022110	AGG	2	6	768669	768674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353839
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15134	NC_022110	ATT	2	6	768814	768819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353839
15135	NC_022110	CAT	2	6	768849	768854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353839
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15137	NC_022110	TCC	2	6	769056	769061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353839
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15140	NC_022110	GAGCA	2	10	769554	769563	40 %	0 %	40 %	20 %	532353840
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15144	NC_022110	TGT	2	6	769811	769816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353840
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15147	NC_022110	ATG	2	6	770019	770024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353840
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15150	NC_022110	TTG	2	6	770138	770143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353840
15151	NC_022110	AGA	2	6	770162	770167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353840
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15153	NC_022110	G	7	7	770220	770226	0 %	0 %	100 %	0 %	532353840
15154	NC_022110	GGA	2	6	770261	770266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353840
15155	NC_022110	AC	3	6	770327	770332	50 %	0 %	0 %	50 %	532353840
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15159	NC_022110	GTT	2	6	770585	770590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353840
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15176	NC_022110	AAG	2	6	771282	771287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353841
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15213	NC_022110	CAG	2	6	773908	773913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353842
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15220	NC_022110	TGT	2	6	774204	774209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353842
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15222	NC_022110	TGCC	2	8	774319	774326	0 %	25 %	25 %	50 %	532353842
15223	NC_022110	AAC	2	6	774355	774360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353842
15224	NC_022110	TAA	2	6	774392	774397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353842
15225	NC_022110	GTTT	2	8	774499	774506	0 %	75 %	25 %	0 %	532353842
15226	NC_022110	AG	3	6	774557	774562	50 %	0 %	50 %	0 %	532353842
15227	NC_022110	GGCGT	2	10	774574	774583	0 %	20 %	60 %	20 %	532353842
15228	NC_022110	GTA	2	6	774646	774651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353842
15229	NC_022110	T	6	6	774658	774663	0 %	100 %	0 %	0 %	532353842
15230	NC_022110	CTG	2	6	774689	774694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353842
15231	NC_022110	TCT	2	6	774706	774711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353842
15232	NC_022110	TGA	2	6	774767	774772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353842
15233	NC_022110	GTT	2	6	774776	774781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353842
15234	NC_022110	GGATA	2	10	774867	774876	40 %	20 %	40 %	0 %	532353842
15235	NC_022110	TACA	2	8	775046	775053	50 %	25 %	0 %	25 %	532353843
15236	NC_022110	A	7	7	775196	775202	100 %	0 %	0 %	0 %	532353843
15237	NC_022110	AGGA	2	8	775206	775213	50 %	0 %	50 %	0 %	532353843
15238	NC_022110	TGA	2	6	775222	775227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353843
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15339	NC_022110	ACTA	2	8	786319	786326	50 %	25 %	0 %	25 %	532353848
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15357	NC_022110	TTA	2	6	787010	787015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353849
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15359	NC_022110	AAG	2	6	787067	787072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353849
15360	NC_022110	TGCC	2	8	787080	787087	0 %	25 %	25 %	50 %	532353849
15361	NC_022110	GAT	2	6	787114	787119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353849
15362	NC_022110	GCT	2	6	787120	787125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353849
15363	NC_022110	GAA	2	6	787129	787134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353849
15364	NC_022110	T	8	8	787179	787186	0 %	100 %	0 %	0 %	532353849
15365	NC_022110	TGAA	2	8	787199	787206	50 %	25 %	25 %	0 %	532353849
15366	NC_022110	GGA	2	6	787216	787221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353849
15367	NC_022110	GA	3	6	787220	787225	50 %	0 %	50 %	0 %	532353849
15368	NC_022110	TGG	2	6	787271	787276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353849
15369	NC_022110	TAGGT	2	10	787395	787404	20 %	40 %	40 %	0 %	532353849
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15371	NC_022110	ATT	2	6	787509	787514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353849
15372	NC_022110	TCA	2	6	787551	787556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353849
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15376	NC_022110	CTT	2	6	787775	787780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353850
15377	NC_022110	ATC	2	6	787801	787806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353850
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15379	NC_022110	TGT	2	6	787860	787865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353850
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15382	NC_022110	GAA	2	6	787978	787983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353850
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15384	NC_022110	TA	3	6	788008	788013	50 %	50 %	0 %	0 %	532353850
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15388	NC_022110	AGAA	2	8	788163	788170	75 %	0 %	25 %	0 %	532353850
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15391	NC_022110	GCT	2	6	788284	788289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353850
15392	NC_022110	CAT	2	6	788350	788355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353850
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15394	NC_022110	GAGG	2	8	788422	788429	25 %	0 %	75 %	0 %	532353850
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15400	NC_022110	GAT	2	6	789137	789142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353851
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15442	NC_022110	ATAG	2	8	791155	791162	50 %	25 %	25 %	0 %	532353853
15443	NC_022110	TCA	2	6	791182	791187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353853
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15468	NC_022110	CCCTGA	2	12	792540	792551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532353854
15469	NC_022110	AAT	2	6	792558	792563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353854
15470	NC_022110	CA	3	6	792677	792682	50 %	0 %	0 %	50 %	532353854
15471	NC_022110	CTA	2	6	792697	792702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353854
15472	NC_022110	A	7	7	792736	792742	100 %	0 %	0 %	0 %	532353854
15473	NC_022110	A	6	6	792744	792749	100 %	0 %	0 %	0 %	532353854
15474	NC_022110	AT	5	10	792780	792789	50 %	50 %	0 %	0 %	532353854
15475	NC_022110	AGG	2	6	792792	792797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353854
15476	NC_022110	A	6	6	792831	792836	100 %	0 %	0 %	0 %	532353854
15477	NC_022110	TTC	2	6	792912	792917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353854
15478	NC_022110	CG	3	6	793079	793084	0 %	0 %	50 %	50 %	532353855
15479	NC_022110	TTG	2	6	793150	793155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353855
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15482	NC_022110	GA	3	6	793256	793261	50 %	0 %	50 %	0 %	532353855
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