MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022110	TGT	2	6	737559	737564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353809
14502	NC_022110	CAG	2	6	737737	737742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353809
14503	NC_022110	ACG	2	6	737745	737750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353809
14504	NC_022110	TC	3	6	737780	737785	0 %	50 %	0 %	50 %	532353809
14505	NC_022110	TAG	3	9	737858	737866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353809
14506	NC_022110	GAA	2	6	737982	737987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353809
14507	NC_022110	TGA	2	6	738021	738026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353809
14508	NC_022110	TTG	2	6	738065	738070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353809
14509	NC_022110	A	6	6	738121	738126	100 %	0 %	0 %	0 %	532353809
14510	NC_022110	TCC	2	6	738138	738143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353809
14511	NC_022110	TTA	2	6	738146	738151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353809
14512	NC_022110	GCA	2	6	738162	738167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353809
14513	NC_022110	GTC	2	6	738176	738181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353809
14514	NC_022110	AT	3	6	738333	738338	50 %	50 %	0 %	0 %	532353809
14515	NC_022110	CTT	2	6	738368	738373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353809
14516	NC_022110	A	7	7	738394	738400	100 %	0 %	0 %	0 %	532353809
14517	NC_022110	TTG	2	6	738518	738523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353809
14518	NC_022110	ACG	2	6	738571	738576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353809
14519	NC_022110	GAA	2	6	738658	738663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353809
14520	NC_022110	CTT	2	6	738779	738784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353809
14521	NC_022110	AAG	2	6	738875	738880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353809
14522	NC_022110	AGT	2	6	738912	738917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353809
14523	NC_022110	TAT	2	6	738948	738953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353809
14524	NC_022110	ATA	2	6	739004	739009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353809
14525	NC_022110	A	6	6	739009	739014	100 %	0 %	0 %	0 %	532353809
14526	NC_022110	AGC	2	6	739022	739027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353809
14527	NC_022110	TTC	2	6	739052	739057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353809
14528	NC_022110	AAG	2	6	739079	739084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353809
14529	NC_022110	GGA	2	6	739288	739293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353809
14530	NC_022110	TAA	2	6	739470	739475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353809
14531	NC_022110	GAA	2	6	739578	739583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353809
14532	NC_022110	A	6	6	739594	739599	100 %	0 %	0 %	0 %	532353809
14533	NC_022110	A	7	7	739639	739645	100 %	0 %	0 %	0 %	532353809
14534	NC_022110	CAA	3	9	739652	739660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353809
14535	NC_022110	A	7	7	739659	739665	100 %	0 %	0 %	0 %	532353809
14536	NC_022110	AC	3	6	739682	739687	50 %	0 %	0 %	50 %	532353809
14537	NC_022110	CTG	2	6	739691	739696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353809
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14539	NC_022110	AAG	2	6	739747	739752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353809
14540	NC_022110	A	7	7	739798	739804	100 %	0 %	0 %	0 %	532353809
14541	NC_022110	ATT	2	6	739807	739812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353809
14542	NC_022110	A	6	6	739873	739878	100 %	0 %	0 %	0 %	532353809
14543	NC_022110	GC	3	6	739883	739888	0 %	0 %	50 %	50 %	532353809
14544	NC_022110	ATT	2	6	739937	739942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353809
14545	NC_022110	GA	3	6	739945	739950	50 %	0 %	50 %	0 %	532353809
14546	NC_022110	CTC	2	6	739953	739958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353809
14547	NC_022110	TTC	2	6	739959	739964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353809
14548	NC_022110	TTC	2	6	739971	739976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353809
14549	NC_022110	TGA	2	6	740007	740012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353809
14550	NC_022110	CA	3	6	740075	740080	50 %	0 %	0 %	50 %	532353809
14551	NC_022110	TAG	2	6	740097	740102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353809
14552	NC_022110	ATA	2	6	740118	740123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353809
14553	NC_022110	T	7	7	740160	740166	0 %	100 %	0 %	0 %	532353810
14554	NC_022110	GAG	2	6	740182	740187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353810
14555	NC_022110	TCT	2	6	740209	740214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353810
14556	NC_022110	TTC	2	6	740417	740422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353810
14557	NC_022110	CTTT	2	8	740449	740456	0 %	75 %	0 %	25 %	532353810
14558	NC_022110	ATG	2	6	740458	740463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353810
14559	NC_022110	CGGAA	2	10	740526	740535	40 %	0 %	40 %	20 %	532353810
14560	NC_022110	TCT	2	6	740549	740554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353810
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14564	NC_022110	ACG	2	6	740850	740855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353810
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14569	NC_022110	A	6	6	741219	741224	100 %	0 %	0 %	0 %	532353811
14570	NC_022110	TAAT	3	12	741234	741245	50 %	50 %	0 %	0 %	532353811
14571	NC_022110	T	6	6	741271	741276	0 %	100 %	0 %	0 %	532353811
14572	NC_022110	GGT	2	6	741410	741415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353811
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14582	NC_022110	TGA	2	6	741837	741842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353812
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14589	NC_022110	ATC	2	6	742045	742050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353812
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14591	NC_022110	AAG	2	6	742082	742087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353812
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14593	NC_022110	A	7	7	742195	742201	100 %	0 %	0 %	0 %	532353812
14594	NC_022110	GC	3	6	742235	742240	0 %	0 %	50 %	50 %	532353812
14595	NC_022110	G	7	7	742258	742264	0 %	0 %	100 %	0 %	532353812
14596	NC_022110	TCGG	2	8	742344	742351	0 %	25 %	50 %	25 %	532353812
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14602	NC_022110	TTCC	2	8	742514	742521	0 %	50 %	0 %	50 %	532353812
14603	NC_022110	GAG	2	6	742522	742527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353812
14604	NC_022110	TTCT	2	8	742634	742641	0 %	75 %	0 %	25 %	532353812
14605	NC_022110	AGGG	2	8	742686	742693	25 %	0 %	75 %	0 %	532353812
14606	NC_022110	GCT	2	6	742743	742748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353812
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14608	NC_022110	GA	3	6	742823	742828	50 %	0 %	50 %	0 %	532353812
14609	NC_022110	TCT	2	6	742851	742856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353812
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14612	NC_022110	GTG	2	6	742995	743000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353813
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14614	NC_022110	GA	3	6	743074	743079	50 %	0 %	50 %	0 %	532353813
14615	NC_022110	TTTC	2	8	743092	743099	0 %	75 %	0 %	25 %	532353813
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14620	NC_022110	ATT	2	6	743369	743374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353813
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14744	NC_022110	GAG	2	6	749266	749271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353818
14745	NC_022110	TCC	2	6	749333	749338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353818
14746	NC_022110	CTA	2	6	749410	749415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353818
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14763	NC_022110	AGCT	2	8	750090	750097	25 %	25 %	25 %	25 %	532353818
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14775	NC_022110	TAG	2	6	750797	750802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353820
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14843	NC_022110	GTTTT	2	10	754546	754555	0 %	80 %	20 %	0 %	532353825
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14853	NC_022110	CT	3	6	755079	755084	0 %	50 %	0 %	50 %	532353826
14854	NC_022110	GGTA	2	8	755086	755093	25 %	25 %	50 %	0 %	532353826
14855	NC_022110	TCA	2	6	755096	755101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353826
14856	NC_022110	TCA	2	6	755258	755263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353827
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14860	NC_022110	TGA	2	6	755383	755388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353827
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14862	NC_022110	AG	3	6	755407	755412	50 %	0 %	50 %	0 %	532353827
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14988	NC_022110	CGA	2	6	762302	762307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353831
14989	NC_022110	TCT	2	6	762310	762315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353831
14990	NC_022110	GTC	2	6	762335	762340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353831
14991	NC_022110	TGC	2	6	762360	762365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353831
14992	NC_022110	GGAAGA	2	12	762375	762386	50 %	0 %	50 %	0 %	532353831
14993	NC_022110	AGAGA	2	10	762387	762396	60 %	0 %	40 %	0 %	532353831
14994	NC_022110	GCTCT	2	10	762454	762463	0 %	40 %	20 %	40 %	532353831
14995	NC_022110	CTT	2	6	762479	762484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353831
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14997	NC_022110	CAG	2	6	762553	762558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353831
14998	NC_022110	AAC	2	6	762589	762594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353831
14999	NC_022110	GTT	2	6	762600	762605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353831
15000	NC_022110	CT	3	6	762665	762670	0 %	50 %	0 %	50 %	532353831

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