MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_022110	AGC	2	6	710113	710118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353792
14003	NC_022110	TAG	2	6	710178	710183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353792
14004	NC_022110	TAA	2	6	710383	710388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353792
14005	NC_022110	GC	3	6	710391	710396	0 %	0 %	50 %	50 %	532353792
14006	NC_022110	T	6	6	710419	710424	0 %	100 %	0 %	0 %	532353792
14007	NC_022110	TAT	2	6	710480	710485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353792
14008	NC_022110	T	7	7	710527	710533	0 %	100 %	0 %	0 %	532353792
14009	NC_022110	CTTA	2	8	710553	710560	25 %	50 %	0 %	25 %	532353792
14010	NC_022110	AGGA	2	8	710599	710606	50 %	0 %	50 %	0 %	532353792
14011	NC_022110	T	6	6	710607	710612	0 %	100 %	0 %	0 %	532353792
14012	NC_022110	GAA	2	6	710636	710641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353792
14013	NC_022110	AAG	2	6	710711	710716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354087
14014	NC_022110	TCT	2	6	710731	710736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354087
14015	NC_022110	A	6	6	710793	710798	100 %	0 %	0 %	0 %	532354087
14016	NC_022110	A	6	6	710815	710820	100 %	0 %	0 %	0 %	532354087
14017	NC_022110	TTG	2	6	710834	710839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354087
14018	NC_022110	TACG	2	8	710865	710872	25 %	25 %	25 %	25 %	532354087
14019	NC_022110	TAA	2	6	710903	710908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353793
14020	NC_022110	GCT	2	6	710911	710916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353793
14021	NC_022110	CT	3	6	710944	710949	0 %	50 %	0 %	50 %	532353793
14022	NC_022110	ACG	2	6	711029	711034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353793
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14027	NC_022110	GAG	2	6	711182	711187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353793
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14029	NC_022110	TGT	2	6	711252	711257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353793
14030	NC_022110	GCAAA	2	10	711296	711305	60 %	0 %	20 %	20 %	532353793
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14032	NC_022110	TTG	2	6	711381	711386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353793
14033	NC_022110	TCTTGA	2	12	711391	711402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532353793
14034	NC_022110	AAAT	2	8	711450	711457	75 %	25 %	0 %	0 %	532353793
14035	NC_022110	CTG	2	6	711468	711473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353793
14036	NC_022110	AT	3	6	711517	711522	50 %	50 %	0 %	0 %	532353793
14037	NC_022110	CG	3	6	711523	711528	0 %	0 %	50 %	50 %	532353793
14038	NC_022110	AAC	2	6	711786	711791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353793
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14041	NC_022110	ACC	2	6	712092	712097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353793
14042	NC_022110	A	8	8	712111	712118	100 %	0 %	0 %	0 %	532353793
14043	NC_022110	AGCC	2	8	712131	712138	25 %	0 %	25 %	50 %	532353793
14044	NC_022110	CTA	2	6	712148	712153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353793
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14052	NC_022110	TAGA	2	8	712436	712443	50 %	25 %	25 %	0 %	532353793
14053	NC_022110	TCC	3	9	712464	712472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353793
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14056	NC_022110	GT	3	6	712735	712740	0 %	50 %	50 %	0 %	532353794
14057	NC_022110	AGC	2	6	712803	712808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353794
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14060	NC_022110	TCC	2	6	712887	712892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353794
14061	NC_022110	TTG	2	6	712895	712900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353794
14062	NC_022110	CTT	2	6	712903	712908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353794
14063	NC_022110	AAC	2	6	712911	712916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353794
14064	NC_022110	T	6	6	713106	713111	0 %	100 %	0 %	0 %	532353794
14065	NC_022110	A	6	6	713151	713156	100 %	0 %	0 %	0 %	532353794
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14073	NC_022110	ACGA	2	8	713640	713647	50 %	0 %	25 %	25 %	532353795
14074	NC_022110	TCTA	2	8	713658	713665	25 %	50 %	0 %	25 %	532353795
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14095	NC_022110	CT	3	6	715161	715166	0 %	50 %	0 %	50 %	532353796
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14103	NC_022110	CAA	2	6	715355	715360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353796
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14105	NC_022110	A	7	7	715406	715412	100 %	0 %	0 %	0 %	532353796
14106	NC_022110	TCT	2	6	715448	715453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353796
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14108	NC_022110	TCCA	2	8	715484	715491	25 %	25 %	0 %	50 %	532353796
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14122	NC_022110	CAT	2	6	717120	717125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353797
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14232	NC_022110	AATC	2	8	725157	725164	50 %	25 %	0 %	25 %	532353802
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14241	NC_022110	A	7	7	725562	725568	100 %	0 %	0 %	0 %	532353802
14242	NC_022110	AGC	2	6	725576	725581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353802
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14244	NC_022110	CCTT	2	8	725627	725634	0 %	50 %	0 %	50 %	532353802
14245	NC_022110	AGA	2	6	725836	725841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353803
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14247	NC_022110	TCA	2	6	726013	726018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353803
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14249	NC_022110	TTG	2	6	726133	726138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353803
14250	NC_022110	ATT	2	6	726197	726202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353803
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14257	NC_022110	CTTA	2	8	726501	726508	25 %	50 %	0 %	25 %	532353803
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14259	NC_022110	TTCG	2	8	726561	726568	0 %	50 %	25 %	25 %	532353803
14260	NC_022110	T	6	6	726635	726640	0 %	100 %	0 %	0 %	532353803
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