MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_022110	TAA	2	6	683692	683697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353773
13503	NC_022110	CG	3	6	683927	683932	0 %	0 %	50 %	50 %	532353773
13504	NC_022110	AAC	2	6	684043	684048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353773
13505	NC_022110	GAAG	2	8	684082	684089	50 %	0 %	50 %	0 %	532353773
13506	NC_022110	CA	3	6	684127	684132	50 %	0 %	0 %	50 %	532353773
13507	NC_022110	GAA	2	6	684319	684324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353774
13508	NC_022110	A	6	6	684386	684391	100 %	0 %	0 %	0 %	532353774
13509	NC_022110	CATA	2	8	684397	684404	50 %	25 %	0 %	25 %	532353774
13510	NC_022110	GAA	2	6	684409	684414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353774
13511	NC_022110	TTTA	2	8	684437	684444	25 %	75 %	0 %	0 %	532353774
13512	NC_022110	CATC	2	8	684466	684473	25 %	25 %	0 %	50 %	532353774
13513	NC_022110	TGT	2	6	684551	684556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353774
13514	NC_022110	AATC	2	8	684611	684618	50 %	25 %	0 %	25 %	532353774
13515	NC_022110	TCCC	2	8	684793	684800	0 %	25 %	0 %	75 %	532353774
13516	NC_022110	AATT	2	8	684824	684831	50 %	50 %	0 %	0 %	532353774
13517	NC_022110	TGC	2	6	684838	684843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353774
13518	NC_022110	CAA	2	6	684866	684871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353774
13519	NC_022110	ATGA	2	8	684879	684886	50 %	25 %	25 %	0 %	532353774
13520	NC_022110	CAT	2	6	684913	684918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353774
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13522	NC_022110	TCT	2	6	684993	684998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353774
13523	NC_022110	TCT	2	6	685177	685182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353774
13524	NC_022110	TCT	2	6	685194	685199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353774
13525	NC_022110	TAG	2	6	685253	685258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353774
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13527	NC_022110	T	7	7	685345	685351	0 %	100 %	0 %	0 %	532353774
13528	NC_022110	TAAAA	2	10	685381	685390	80 %	20 %	0 %	0 %	532353774
13529	NC_022110	A	6	6	685387	685392	100 %	0 %	0 %	0 %	532353774
13530	NC_022110	GAAA	2	8	685400	685407	75 %	0 %	25 %	0 %	532353774
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13534	NC_022110	T	10	10	685462	685471	0 %	100 %	0 %	0 %	532353774
13535	NC_022110	C	6	6	685604	685609	0 %	0 %	0 %	100 %	532353775
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13538	NC_022110	TGA	2	6	685694	685699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353775
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13540	NC_022110	ATC	2	6	685783	685788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353775
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13542	NC_022110	CTT	2	6	685797	685802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353775
13543	NC_022110	TGC	2	6	685854	685859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353775
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13545	NC_022110	AG	3	6	686108	686113	50 %	0 %	50 %	0 %	532353775
13546	NC_022110	CT	3	6	686125	686130	0 %	50 %	0 %	50 %	532353775
13547	NC_022110	ATC	2	6	686337	686342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353776
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13549	NC_022110	TAAT	2	8	686367	686374	50 %	50 %	0 %	0 %	532353776
13550	NC_022110	GCAA	2	8	686435	686442	50 %	0 %	25 %	25 %	532353776
13551	NC_022110	GCA	2	6	686493	686498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353776
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13553	NC_022110	AGA	2	6	686634	686639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353777
13554	NC_022110	TGCC	2	8	686738	686745	0 %	25 %	25 %	50 %	532353777
13555	NC_022110	AGC	2	6	686849	686854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353777
13556	NC_022110	TCTT	2	8	686865	686872	0 %	75 %	0 %	25 %	532353777
13557	NC_022110	A	6	6	686907	686912	100 %	0 %	0 %	0 %	532353777
13558	NC_022110	GCAA	2	8	686913	686920	50 %	0 %	25 %	25 %	532353777
13559	NC_022110	G	6	6	686973	686978	0 %	0 %	100 %	0 %	532353777
13560	NC_022110	TTC	2	6	687055	687060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353777
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13562	NC_022110	TACA	2	8	687079	687086	50 %	25 %	0 %	25 %	532353777
13563	NC_022110	GCA	2	6	687109	687114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353777
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13565	NC_022110	AGCTGG	2	12	687159	687170	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532353777
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13571	NC_022110	TGCAA	3	15	687490	687504	40 %	20 %	20 %	20 %	532353778
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13605	NC_022110	GAACG	2	10	688922	688931	40 %	0 %	40 %	20 %	532353778
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13617	NC_022110	CAG	3	9	689612	689620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353779
13618	NC_022110	C	6	6	689640	689645	0 %	0 %	0 %	100 %	532353779
13619	NC_022110	TAA	2	6	689709	689714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353779
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13851	NC_022110	TCA	2	6	700978	700983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353789
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13856	NC_022110	CTG	2	6	701190	701195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353789
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13863	NC_022110	C	6	6	701396	701401	0 %	0 %	0 %	100 %	532353789
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