MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022110	A	6	6	659281	659286	100 %	0 %	0 %	0 %	532353756
13002	NC_022110	TTTA	2	8	659354	659361	25 %	75 %	0 %	0 %	532353756
13003	NC_022110	GAA	2	6	659391	659396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353756
13004	NC_022110	AGA	2	6	659399	659404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353756
13005	NC_022110	AGA	2	6	659465	659470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353756
13006	NC_022110	AATC	2	8	659471	659478	50 %	25 %	0 %	25 %	532353756
13007	NC_022110	CAA	2	6	659550	659555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353756
13008	NC_022110	A	6	6	659563	659568	100 %	0 %	0 %	0 %	532353756
13009	NC_022110	TAAA	2	8	659654	659661	75 %	25 %	0 %	0 %	532353756
13010	NC_022110	A	6	6	659659	659664	100 %	0 %	0 %	0 %	532353756
13011	NC_022110	AAC	2	6	659669	659674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353756
13012	NC_022110	TG	3	6	659682	659687	0 %	50 %	50 %	0 %	532353756
13013	NC_022110	GGA	3	9	659688	659696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353756
13014	NC_022110	TCC	2	6	659731	659736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353756
13015	NC_022110	ATA	2	6	659893	659898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353757
13016	NC_022110	CTT	2	6	659936	659941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353757
13017	NC_022110	CTA	2	6	659972	659977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353757
13018	NC_022110	TAC	2	6	659982	659987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353757
13019	NC_022110	A	6	6	660028	660033	100 %	0 %	0 %	0 %	532353757
13020	NC_022110	CTT	2	6	660036	660041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353757
13021	NC_022110	ATG	2	6	660046	660051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353757
13022	NC_022110	ACT	2	6	660157	660162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353757
13023	NC_022110	CT	3	6	660213	660218	0 %	50 %	0 %	50 %	532353757
13024	NC_022110	CCT	2	6	660247	660252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353757
13025	NC_022110	TCT	2	6	660301	660306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353757
13026	NC_022110	ACC	2	6	660405	660410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353757
13027	NC_022110	CT	3	6	660421	660426	0 %	50 %	0 %	50 %	532353757
13028	NC_022110	GAA	2	6	660489	660494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353757
13029	NC_022110	T	8	8	660511	660518	0 %	100 %	0 %	0 %	532353757
13030	NC_022110	GAA	2	6	660519	660524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353757
13031	NC_022110	ATT	2	6	660613	660618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353757
13032	NC_022110	GCC	2	6	660650	660655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353757
13033	NC_022110	CCT	2	6	660662	660667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353757
13034	NC_022110	GAT	2	6	660681	660686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353757
13035	NC_022110	GAG	2	6	660745	660750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353757
13036	NC_022110	TAG	2	6	660772	660777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353757
13037	NC_022110	GAA	2	6	660828	660833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353757
13038	NC_022110	TCG	2	6	660836	660841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353757
13039	NC_022110	ATC	2	6	660912	660917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353757
13040	NC_022110	GAT	2	6	660987	660992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353757
13041	NC_022110	AGA	2	6	660998	661003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353757
13042	NC_022110	A	6	6	661033	661038	100 %	0 %	0 %	0 %	532353757
13043	NC_022110	A	7	7	661058	661064	100 %	0 %	0 %	0 %	532353757
13044	NC_022110	TGC	3	9	661106	661114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353757
13045	NC_022110	CAG	2	6	661138	661143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353757
13046	NC_022110	ATTG	2	8	661190	661197	25 %	50 %	25 %	0 %	532353757
13047	NC_022110	TCT	2	6	661205	661210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353757
13048	NC_022110	AAG	2	6	661267	661272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353757
13049	NC_022110	GTA	2	6	661282	661287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353757
13050	NC_022110	CT	3	6	661292	661297	0 %	50 %	0 %	50 %	532353757
13051	NC_022110	ACG	2	6	661400	661405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353757
13052	NC_022110	CAA	2	6	661431	661436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353757
13053	NC_022110	TAT	2	6	661457	661462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353757
13054	NC_022110	AAG	2	6	661492	661497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353757
13055	NC_022110	AAG	2	6	661504	661509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353757
13056	NC_022110	AGC	2	6	661583	661588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353757
13057	NC_022110	TGA	2	6	661630	661635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353757
13058	NC_022110	GCA	2	6	661638	661643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353757
13059	NC_022110	A	7	7	661643	661649	100 %	0 %	0 %	0 %	532353757
13060	NC_022110	CTC	2	6	661653	661658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353757
13061	NC_022110	GAA	3	9	661671	661679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353757
13062	NC_022110	CTA	2	6	661733	661738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353757
13063	NC_022110	GGA	2	6	661791	661796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353757
13064	NC_022110	GTC	2	6	661862	661867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353757
13065	NC_022110	GA	3	6	661885	661890	50 %	0 %	50 %	0 %	532353757
13066	NC_022110	TGAT	2	8	662138	662145	25 %	50 %	25 %	0 %	532353758
13067	NC_022110	GCT	2	6	662218	662223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353758
13068	NC_022110	TGG	2	6	662259	662264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353758
13069	NC_022110	ATG	2	6	662293	662298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353758
13070	NC_022110	ATGC	2	8	662316	662323	25 %	25 %	25 %	25 %	532353758
13071	NC_022110	A	8	8	662423	662430	100 %	0 %	0 %	0 %	532353758
13072	NC_022110	TGA	2	6	662464	662469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353758
13073	NC_022110	AGA	2	6	662557	662562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353758
13074	NC_022110	GCT	2	6	662585	662590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353758
13075	NC_022110	TCT	2	6	662591	662596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353758
13076	NC_022110	ATG	2	6	662622	662627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353758
13077	NC_022110	GAA	2	6	662711	662716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353758
13078	NC_022110	GAC	2	6	662777	662782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353758
13079	NC_022110	ATTG	2	8	662803	662810	25 %	50 %	25 %	0 %	532353758
13080	NC_022110	TCA	2	6	662847	662852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353758
13081	NC_022110	AACCA	2	10	662853	662862	60 %	0 %	0 %	40 %	532353758
13082	NC_022110	GCTAC	2	10	662916	662925	20 %	20 %	20 %	40 %	532353758
13083	NC_022110	AGA	2	6	662953	662958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353758
13084	NC_022110	TAC	2	6	662959	662964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353758
13085	NC_022110	GAA	2	6	663065	663070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353758
13086	NC_022110	A	6	6	663135	663140	100 %	0 %	0 %	0 %	532353758
13087	NC_022110	C	6	6	663173	663178	0 %	0 %	0 %	100 %	532353758
13088	NC_022110	CTC	2	6	663228	663233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353758
13089	NC_022110	A	7	7	663239	663245	100 %	0 %	0 %	0 %	532353758
13090	NC_022110	AATA	2	8	663272	663279	75 %	25 %	0 %	0 %	532353758
13091	NC_022110	CACG	2	8	663297	663304	25 %	0 %	25 %	50 %	532353758
13092	NC_022110	ACA	2	6	663457	663462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353759
13093	NC_022110	CT	3	6	663492	663497	0 %	50 %	0 %	50 %	532353759
13094	NC_022110	CTG	2	6	663531	663536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353759
13095	NC_022110	A	7	7	663607	663613	100 %	0 %	0 %	0 %	532353759
13096	NC_022110	AAC	2	6	663657	663662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353759
13097	NC_022110	AAG	2	6	663792	663797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353759
13098	NC_022110	TATT	2	8	663833	663840	25 %	75 %	0 %	0 %	532353759
13099	NC_022110	CT	3	6	663867	663872	0 %	50 %	0 %	50 %	532353759
13100	NC_022110	TC	3	6	663889	663894	0 %	50 %	0 %	50 %	532353759
13101	NC_022110	CAT	2	6	663904	663909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353759
13102	NC_022110	GAT	2	6	663995	664000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353759
13103	NC_022110	C	6	6	664006	664011	0 %	0 %	0 %	100 %	532353759
13104	NC_022110	TAC	2	6	664020	664025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353759
13105	NC_022110	C	6	6	664027	664032	0 %	0 %	0 %	100 %	532353759
13106	NC_022110	AT	3	6	664105	664110	50 %	50 %	0 %	0 %	532353759
13107	NC_022110	CT	3	6	664114	664119	0 %	50 %	0 %	50 %	532353759
13108	NC_022110	GAA	2	6	664151	664156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353759
13109	NC_022110	CTT	2	6	664173	664178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353759
13110	NC_022110	CGA	2	6	664184	664189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353759
13111	NC_022110	TTG	2	6	664213	664218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353759
13112	NC_022110	T	6	6	664243	664248	0 %	100 %	0 %	0 %	532353759
13113	NC_022110	ATG	2	6	664295	664300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353759
13114	NC_022110	TCG	2	6	664306	664311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353759
13115	NC_022110	CCAT	2	8	664321	664328	25 %	25 %	0 %	50 %	532353759
13116	NC_022110	ATC	2	6	664359	664364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353759
13117	NC_022110	A	7	7	664422	664428	100 %	0 %	0 %	0 %	532353759
13118	NC_022110	GAA	2	6	664472	664477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353759
13119	NC_022110	CAA	2	6	664481	664486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353759
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13121	NC_022110	T	7	7	664570	664576	0 %	100 %	0 %	0 %	532353759
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13276	NC_022110	GAAT	2	8	673555	673562	50 %	25 %	25 %	0 %	532354086
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13353	NC_022110	CTTTT	2	10	677516	677525	0 %	80 %	0 %	20 %	532353765
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13357	NC_022110	A	6	6	677730	677735	100 %	0 %	0 %	0 %	532353765
13358	NC_022110	ACCAT	2	10	677773	677782	40 %	20 %	0 %	40 %	532353765
13359	NC_022110	TC	3	6	677805	677810	0 %	50 %	0 %	50 %	532353766
13360	NC_022110	GCT	2	6	677867	677872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353766
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13362	NC_022110	AACT	2	8	677967	677974	50 %	25 %	0 %	25 %	532353766
13363	NC_022110	ATC	2	6	678017	678022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353766
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13490	NC_022110	AAT	2	6	683304	683309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353773
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