MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022110	TCA	2	6	634939	634944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353733
12502	NC_022110	CTTT	2	8	634993	635000	0 %	75 %	0 %	25 %	532353733
12503	NC_022110	ATG	3	9	635043	635051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353733
12504	NC_022110	TC	4	8	635068	635075	0 %	50 %	0 %	50 %	532353733
12505	NC_022110	CTA	2	6	635121	635126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353733
12506	NC_022110	TGA	2	6	635134	635139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353733
12507	NC_022110	CAA	2	6	635178	635183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353733
12508	NC_022110	TTTG	2	8	635197	635204	0 %	75 %	25 %	0 %	532353733
12509	NC_022110	TTA	2	6	635225	635230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353733
12510	NC_022110	CTC	2	6	635247	635252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353733
12511	NC_022110	TAT	2	6	635254	635259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353733
12512	NC_022110	TGG	2	6	635283	635288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353733
12513	NC_022110	AGC	2	6	635299	635304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353733
12514	NC_022110	GGCT	2	8	635381	635388	0 %	25 %	50 %	25 %	532353734
12515	NC_022110	TGC	2	6	635410	635415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353734
12516	NC_022110	GGCTC	2	10	635484	635493	0 %	20 %	40 %	40 %	532353734
12517	NC_022110	TA	3	6	635507	635512	50 %	50 %	0 %	0 %	532353734
12518	NC_022110	AGCC	2	8	635520	635527	25 %	0 %	25 %	50 %	532353734
12519	NC_022110	TCTT	2	8	635544	635551	0 %	75 %	0 %	25 %	532353734
12520	NC_022110	ATC	2	6	635585	635590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353734
12521	NC_022110	CT	3	6	635642	635647	0 %	50 %	0 %	50 %	532353734
12522	NC_022110	TGC	2	6	635658	635663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353735
12523	NC_022110	CTT	2	6	635726	635731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353735
12524	NC_022110	ACCA	2	8	635816	635823	50 %	0 %	0 %	50 %	532353735
12525	NC_022110	CT	3	6	635854	635859	0 %	50 %	0 %	50 %	532353735
12526	NC_022110	ATT	2	6	635901	635906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353735
12527	NC_022110	AGG	2	6	635932	635937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353735
12528	NC_022110	ATC	2	6	635978	635983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353735
12529	NC_022110	ATG	2	6	636011	636016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353735
12530	NC_022110	CAG	2	6	636096	636101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353735
12531	NC_022110	ATC	2	6	636137	636142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353735
12532	NC_022110	CTC	2	6	636153	636158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353735
12533	NC_022110	CTAC	2	8	636172	636179	25 %	25 %	0 %	50 %	532353735
12534	NC_022110	TGG	2	6	636227	636232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353735
12535	NC_022110	ATT	2	6	636252	636257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353735
12536	NC_022110	CTA	2	6	636285	636290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353735
12537	NC_022110	TCC	2	6	636307	636312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353735
12538	NC_022110	A	8	8	636329	636336	100 %	0 %	0 %	0 %	532353735
12539	NC_022110	T	6	6	636347	636352	0 %	100 %	0 %	0 %	532353735
12540	NC_022110	GGAG	2	8	636353	636360	25 %	0 %	75 %	0 %	532353735
12541	NC_022110	TTC	2	6	636361	636366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353735
12542	NC_022110	TTG	2	6	636387	636392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353735
12543	NC_022110	TGC	2	6	636431	636436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353735
12544	NC_022110	AAT	2	6	636457	636462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353735
12545	NC_022110	CAA	2	6	636630	636635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353736
12546	NC_022110	CAC	2	6	636690	636695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353736
12547	NC_022110	C	6	6	636736	636741	0 %	0 %	0 %	100 %	532353736
12548	NC_022110	TG	3	6	636754	636759	0 %	50 %	50 %	0 %	532353736
12549	NC_022110	GAG	2	6	636815	636820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353736
12550	NC_022110	CT	3	6	636821	636826	0 %	50 %	0 %	50 %	532353736
12551	NC_022110	T	7	7	636860	636866	0 %	100 %	0 %	0 %	532353736
12552	NC_022110	ATTAA	2	10	636873	636882	60 %	40 %	0 %	0 %	532353736
12553	NC_022110	A	6	6	636927	636932	100 %	0 %	0 %	0 %	532353736
12554	NC_022110	TCT	2	6	636949	636954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353736
12555	NC_022110	CAG	2	6	637017	637022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353736
12556	NC_022110	GCA	2	6	637148	637153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353737
12557	NC_022110	CTG	2	6	637183	637188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353737
12558	NC_022110	CG	3	6	637190	637195	0 %	0 %	50 %	50 %	532353737
12559	NC_022110	GAA	2	6	637263	637268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353737
12560	NC_022110	CAAC	2	8	637381	637388	50 %	0 %	0 %	50 %	532353737
12561	NC_022110	GGA	2	6	637404	637409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353737
12562	NC_022110	AAT	2	6	637453	637458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353737
12563	NC_022110	AGCA	2	8	637471	637478	50 %	0 %	25 %	25 %	532353737
12564	NC_022110	GAA	2	6	637571	637576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353737
12565	NC_022110	ATT	2	6	637633	637638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353737
12566	NC_022110	GGC	2	6	637640	637645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353737
12567	NC_022110	AAC	2	6	637687	637692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353737
12568	NC_022110	GCTCT	2	10	637725	637734	0 %	40 %	20 %	40 %	532353737
12569	NC_022110	TCGTT	2	10	637753	637762	0 %	60 %	20 %	20 %	532353737
12570	NC_022110	TTG	2	6	637795	637800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353737
12571	NC_022110	CTT	2	6	637815	637820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353737
12572	NC_022110	GCA	2	6	637865	637870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353737
12573	NC_022110	TAG	2	6	637906	637911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353737
12574	NC_022110	AAAAT	2	10	637916	637925	80 %	20 %	0 %	0 %	532353737
12575	NC_022110	TGG	2	6	637971	637976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353737
12576	NC_022110	CCTT	2	8	637988	637995	0 %	50 %	0 %	50 %	532353737
12577	NC_022110	TCCAT	2	10	638054	638063	20 %	40 %	0 %	40 %	532353737
12578	NC_022110	AGAA	2	8	638064	638071	75 %	0 %	25 %	0 %	532353737
12579	NC_022110	CCT	2	6	638105	638110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353737
12580	NC_022110	CT	3	6	638109	638114	0 %	50 %	0 %	50 %	532353737
12581	NC_022110	CTA	2	6	638123	638128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353737
12582	NC_022110	GAAA	2	8	638217	638224	75 %	0 %	25 %	0 %	532353738
12583	NC_022110	A	6	6	638222	638227	100 %	0 %	0 %	0 %	532353738
12584	NC_022110	CTCTTT	2	12	638325	638336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353738
12585	NC_022110	ATATCC	2	12	638342	638353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353738
12586	NC_022110	AGC	2	6	638380	638385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353738
12587	NC_022110	T	6	6	638440	638445	0 %	100 %	0 %	0 %	532353738
12588	NC_022110	TAAACA	2	12	638453	638464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532353738
12589	NC_022110	AGG	2	6	638562	638567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353738
12590	NC_022110	ACAT	2	8	638619	638626	50 %	25 %	0 %	25 %	532353738
12591	NC_022110	CAA	2	6	638629	638634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353738
12592	NC_022110	GA	3	6	638655	638660	50 %	0 %	50 %	0 %	532353738
12593	NC_022110	TCC	2	6	638691	638696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353739
12594	NC_022110	A	7	7	638702	638708	100 %	0 %	0 %	0 %	532353739
12595	NC_022110	ATGC	2	8	638718	638725	25 %	25 %	25 %	25 %	532353739
12596	NC_022110	ACGA	2	8	638758	638765	50 %	0 %	25 %	25 %	532353739
12597	NC_022110	GA	4	8	638817	638824	50 %	0 %	50 %	0 %	532353739
12598	NC_022110	AAG	2	6	638825	638830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353739
12599	NC_022110	CTA	2	6	638836	638841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353739
12600	NC_022110	A	6	6	638844	638849	100 %	0 %	0 %	0 %	532353739
12601	NC_022110	ACA	2	6	638920	638925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353739
12602	NC_022110	ATC	2	6	638928	638933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353739
12603	NC_022110	TCAT	2	8	638941	638948	25 %	50 %	0 %	25 %	532353739
12604	NC_022110	AAG	2	6	638955	638960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353739
12605	NC_022110	TCT	2	6	638962	638967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353739
12606	NC_022110	AAG	2	6	638982	638987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353739
12607	NC_022110	TTTC	2	8	638988	638995	0 %	75 %	0 %	25 %	532353739
12608	NC_022110	CAC	2	6	639004	639009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353739
12609	NC_022110	TCT	2	6	639016	639021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353739
12610	NC_022110	CAT	2	6	639081	639086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353739
12611	NC_022110	CCA	2	6	639175	639180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353740
12612	NC_022110	ATA	2	6	639181	639186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353740
12613	NC_022110	CAT	2	6	639207	639212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353740
12614	NC_022110	T	8	8	639239	639246	0 %	100 %	0 %	0 %	532353740
12615	NC_022110	TTC	2	6	639250	639255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353740
12616	NC_022110	CCT	2	6	639264	639269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353740
12617	NC_022110	GAA	2	6	639303	639308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353740
12618	NC_022110	AATC	2	8	639322	639329	50 %	25 %	0 %	25 %	532353740
12619	NC_022110	ACC	2	6	639437	639442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353740
12620	NC_022110	TCC	2	6	639532	639537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353741
12621	NC_022110	AAC	2	6	639541	639546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353741
12622	NC_022110	CTT	2	6	639558	639563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353741
12623	NC_022110	CCT	2	6	639635	639640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353741
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12653	NC_022110	TA	3	6	641156	641161	50 %	50 %	0 %	0 %	532353742
12654	NC_022110	GTC	2	6	641167	641172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353742
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12738	NC_022110	A	8	8	645233	645240	100 %	0 %	0 %	0 %	532353744
12739	NC_022110	TTA	2	6	645266	645271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353744
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12750	NC_022110	A	6	6	645558	645563	100 %	0 %	0 %	0 %	532353744
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12984	NC_022110	AAC	2	6	657904	657909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353754
12985	NC_022110	ACA	2	6	658014	658019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353754
12986	NC_022110	T	6	6	658032	658037	0 %	100 %	0 %	0 %	532353754
12987	NC_022110	GTT	2	6	658062	658067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353754
12988	NC_022110	ATG	2	6	658123	658128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353755
12989	NC_022110	TCA	2	6	658169	658174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353755
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12991	NC_022110	A	7	7	658328	658334	100 %	0 %	0 %	0 %	532353755
12992	NC_022110	A	7	7	658346	658352	100 %	0 %	0 %	0 %	532353755
12993	NC_022110	AAG	2	6	658367	658372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353755
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12998	NC_022110	A	9	9	658623	658631	100 %	0 %	0 %	0 %	532353755
12999	NC_022110	T	6	6	658915	658920	0 %	100 %	0 %	0 %	532353756
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