MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_022110	GGTT	2	8	611551	611558	0 %	50 %	50 %	0 %	532353715
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12004	NC_022110	AG	4	8	611616	611623	50 %	0 %	50 %	0 %	532353715
12005	NC_022110	TGG	2	6	611629	611634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353715
12006	NC_022110	ATA	2	6	611654	611659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353715
12007	NC_022110	GGCGC	2	10	611714	611723	0 %	0 %	60 %	40 %	532353715
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12009	NC_022110	TAT	2	6	611748	611753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353715
12010	NC_022110	ATCG	2	8	611770	611777	25 %	25 %	25 %	25 %	532353715
12011	NC_022110	AGA	2	6	611832	611837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353715
12012	NC_022110	GAA	2	6	611854	611859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353715
12013	NC_022110	AG	3	6	611893	611898	50 %	0 %	50 %	0 %	532353715
12014	NC_022110	CT	3	6	611899	611904	0 %	50 %	0 %	50 %	532353715
12015	NC_022110	TTAC	2	8	611921	611928	25 %	50 %	0 %	25 %	532353715
12016	NC_022110	TAA	2	6	611937	611942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353715
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12018	NC_022110	TTTA	2	8	611974	611981	25 %	75 %	0 %	0 %	532353715
12019	NC_022110	CT	3	6	612014	612019	0 %	50 %	0 %	50 %	532353715
12020	NC_022110	ATT	2	6	612038	612043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353715
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12022	NC_022110	ATT	2	6	612090	612095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353715
12023	NC_022110	GGCT	2	8	612112	612119	0 %	25 %	50 %	25 %	532353715
12024	NC_022110	TCT	2	6	612164	612169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353715
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12030	NC_022110	A	6	6	612319	612324	100 %	0 %	0 %	0 %	532353715
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12041	NC_022110	CTCTC	2	10	612854	612863	0 %	40 %	0 %	60 %	532353716
12042	NC_022110	ATAG	2	8	612899	612906	50 %	25 %	25 %	0 %	532353716
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12107	NC_022110	TAAA	2	8	616038	616045	75 %	25 %	0 %	0 %	532353716
12108	NC_022110	TTAT	2	8	616061	616068	25 %	75 %	0 %	0 %	532353716
12109	NC_022110	CT	4	8	616109	616116	0 %	50 %	0 %	50 %	532353716
12110	NC_022110	TC	3	6	616152	616157	0 %	50 %	0 %	50 %	532353716
12111	NC_022110	T	6	6	616168	616173	0 %	100 %	0 %	0 %	532353716
12112	NC_022110	GAT	2	6	616181	616186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353716
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12117	NC_022110	AG	3	6	616429	616434	50 %	0 %	50 %	0 %	532353716
12118	NC_022110	A	6	6	616442	616447	100 %	0 %	0 %	0 %	532353716
12119	NC_022110	TGAAT	2	10	616729	616738	40 %	40 %	20 %	0 %	532353717
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12124	NC_022110	TC	3	6	617013	617018	0 %	50 %	0 %	50 %	532353717
12125	NC_022110	TCT	2	6	617069	617074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353717
12126	NC_022110	TTC	2	6	617164	617169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353717
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12132	NC_022110	AAAT	2	8	617401	617408	75 %	25 %	0 %	0 %	532353717
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12473	NC_022110	TTA	2	6	633784	633789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353732
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12475	NC_022110	ATC	2	6	633861	633866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353732
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12486	NC_022110	A	6	6	634378	634383	100 %	0 %	0 %	0 %	532353732
12487	NC_022110	CCT	2	6	634443	634448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353733
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12489	NC_022110	TCC	2	6	634461	634466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353733
12490	NC_022110	CCT	2	6	634558	634563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353733
12491	NC_022110	ATT	2	6	634575	634580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353733
12492	NC_022110	ACA	2	6	634613	634618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353733
12493	NC_022110	CCT	2	6	634623	634628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353733
12494	NC_022110	A	6	6	634710	634715	100 %	0 %	0 %	0 %	532353733
12495	NC_022110	TCGAG	2	10	634720	634729	20 %	20 %	40 %	20 %	532353733
12496	NC_022110	T	6	6	634747	634752	0 %	100 %	0 %	0 %	532353733
12497	NC_022110	TTG	2	6	634777	634782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353733
12498	NC_022110	TTA	2	6	634819	634824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353733
12499	NC_022110	CAA	2	6	634896	634901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353733
12500	NC_022110	ATC	2	6	634923	634928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353733

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