MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022110	CTTC	2	8	585306	585313	0 %	50 %	0 %	50 %	532353681
11502	NC_022110	CAG	3	9	585321	585329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353681
11503	NC_022110	TTCAAA	2	12	585428	585439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532353681
11504	NC_022110	AT	3	6	585479	585484	50 %	50 %	0 %	0 %	532353681
11505	NC_022110	CAA	2	6	585603	585608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353681
11506	NC_022110	GCC	2	6	585628	585633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353681
11507	NC_022110	TG	3	6	585699	585704	0 %	50 %	50 %	0 %	532353681
11508	NC_022110	TCG	2	6	585747	585752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353681
11509	NC_022110	AGA	2	6	585819	585824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353681
11510	NC_022110	CAG	2	6	585839	585844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353681
11511	NC_022110	TCCC	2	8	585847	585854	0 %	25 %	0 %	75 %	532353681
11512	NC_022110	CTT	2	6	585884	585889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353681
11513	NC_022110	AGC	2	6	585906	585911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353681
11514	NC_022110	GCA	2	6	585940	585945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353682
11515	NC_022110	CAG	2	6	585986	585991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353682
11516	NC_022110	CAG	2	6	586013	586018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353682
11517	NC_022110	TAT	2	6	586040	586045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353682
11518	NC_022110	T	6	6	586084	586089	0 %	100 %	0 %	0 %	532353682
11519	NC_022110	T	8	8	586110	586117	0 %	100 %	0 %	0 %	532353682
11520	NC_022110	CT	3	6	586141	586146	0 %	50 %	0 %	50 %	532353682
11521	NC_022110	ATT	3	9	586154	586162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353682
11522	NC_022110	TCT	2	6	586163	586168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353682
11523	NC_022110	TTTGTT	2	12	586210	586221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	532353682
11524	NC_022110	AAAG	2	8	586240	586247	75 %	0 %	25 %	0 %	532353682
11525	NC_022110	ACG	2	6	586308	586313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353682
11526	NC_022110	AT	3	6	586462	586467	50 %	50 %	0 %	0 %	532353683
11527	NC_022110	ATG	2	6	586513	586518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353683
11528	NC_022110	AGT	2	6	586545	586550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353683
11529	NC_022110	TCTT	2	8	586604	586611	0 %	75 %	0 %	25 %	532353683
11530	NC_022110	ACA	2	6	586772	586777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353684
11531	NC_022110	GGTT	2	8	586837	586844	0 %	50 %	50 %	0 %	532353684
11532	NC_022110	TTC	2	6	586880	586885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353684
11533	NC_022110	ATA	2	6	586946	586951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353684
11534	NC_022110	A	6	6	586961	586966	100 %	0 %	0 %	0 %	532353684
11535	NC_022110	AAG	2	6	587018	587023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353684
11536	NC_022110	GAAA	2	8	587032	587039	75 %	0 %	25 %	0 %	532353684
11537	NC_022110	CCT	2	6	587133	587138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353684
11538	NC_022110	CT	3	6	587144	587149	0 %	50 %	0 %	50 %	532353684
11539	NC_022110	AAT	2	6	587156	587161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353684
11540	NC_022110	AAT	2	6	587201	587206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353684
11541	NC_022110	GGAA	2	8	587327	587334	50 %	0 %	50 %	0 %	532353684
11542	NC_022110	TGT	2	6	587432	587437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353684
11543	NC_022110	AAATA	2	10	587457	587466	80 %	20 %	0 %	0 %	532353684
11544	NC_022110	ACA	2	6	587494	587499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353684
11545	NC_022110	AAC	2	6	587522	587527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353684
11546	NC_022110	ATTC	2	8	587531	587538	25 %	50 %	0 %	25 %	532353684
11547	NC_022110	AAG	2	6	587678	587683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353684
11548	NC_022110	AAC	2	6	587714	587719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353684
11549	NC_022110	A	6	6	587761	587766	100 %	0 %	0 %	0 %	532353684
11550	NC_022110	GCAA	2	8	587880	587887	50 %	0 %	25 %	25 %	532353684
11551	NC_022110	T	6	6	587905	587910	0 %	100 %	0 %	0 %	532353684
11552	NC_022110	GCA	2	6	588021	588026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353684
11553	NC_022110	TC	3	6	588085	588090	0 %	50 %	0 %	50 %	532353684
11554	NC_022110	TCTT	2	8	588104	588111	0 %	75 %	0 %	25 %	532353684
11555	NC_022110	GTTGT	2	10	588163	588172	0 %	60 %	40 %	0 %	532353685
11556	NC_022110	TTC	2	6	588176	588181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353685
11557	NC_022110	AGA	2	6	588332	588337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353685
11558	NC_022110	TTC	2	6	588361	588366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353685
11559	NC_022110	ATA	2	6	588430	588435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353685
11560	NC_022110	AG	3	6	588447	588452	50 %	0 %	50 %	0 %	532353685
11561	NC_022110	ATT	2	6	588495	588500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353685
11562	NC_022110	CAT	2	6	588620	588625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353686
11563	NC_022110	TCC	2	6	588654	588659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353686
11564	NC_022110	T	6	6	588685	588690	0 %	100 %	0 %	0 %	532353686
11565	NC_022110	AGC	2	6	588693	588698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353686
11566	NC_022110	AAACT	2	10	588796	588805	60 %	20 %	0 %	20 %	532353686
11567	NC_022110	CCT	2	6	588811	588816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353686
11568	NC_022110	AAC	2	6	588819	588824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353686
11569	NC_022110	ACA	2	6	588828	588833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353686
11570	NC_022110	GAC	2	6	588840	588845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353686
11571	NC_022110	CT	3	6	588932	588937	0 %	50 %	0 %	50 %	532353686
11572	NC_022110	CTA	2	6	588958	588963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353686
11573	NC_022110	CTC	2	6	588982	588987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353686
11574	NC_022110	T	6	6	589068	589073	0 %	100 %	0 %	0 %	532353686
11575	NC_022110	CAT	2	6	589141	589146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353687
11576	NC_022110	TA	3	6	589267	589272	50 %	50 %	0 %	0 %	532353687
11577	NC_022110	T	6	6	589310	589315	0 %	100 %	0 %	0 %	532353687
11578	NC_022110	GCT	2	6	589326	589331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353687
11579	NC_022110	ACG	2	6	589343	589348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353687
11580	NC_022110	AACT	2	8	589433	589440	50 %	25 %	0 %	25 %	532353687
11581	NC_022110	TCT	2	6	590122	590127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353688
11582	NC_022110	TGC	2	6	590155	590160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353688
11583	NC_022110	CTT	2	6	590312	590317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353688
11584	NC_022110	ATTC	2	8	590390	590397	25 %	50 %	0 %	25 %	532353688
11585	NC_022110	ATC	2	6	590447	590452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353688
11586	NC_022110	CATA	2	8	590554	590561	50 %	25 %	0 %	25 %	532353689
11587	NC_022110	TTA	2	6	590737	590742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353689
11588	NC_022110	TCT	2	6	590746	590751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353689
11589	NC_022110	TCTT	2	8	590803	590810	0 %	75 %	0 %	25 %	532353689
11590	NC_022110	TA	3	6	590821	590826	50 %	50 %	0 %	0 %	532353689
11591	NC_022110	T	7	7	590828	590834	0 %	100 %	0 %	0 %	532353689
11592	NC_022110	TC	4	8	590856	590863	0 %	50 %	0 %	50 %	532353689
11593	NC_022110	GAA	2	6	590881	590886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353689
11594	NC_022110	ACGT	2	8	590973	590980	25 %	25 %	25 %	25 %	532353689
11595	NC_022110	GAG	2	6	590993	590998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353689
11596	NC_022110	T	6	6	591049	591054	0 %	100 %	0 %	0 %	532353690
11597	NC_022110	AAC	2	6	591095	591100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353690
11598	NC_022110	AGCA	2	8	591135	591142	50 %	0 %	25 %	25 %	532353690
11599	NC_022110	ATC	2	6	591297	591302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353690
11600	NC_022110	GAT	2	6	591303	591308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353690
11601	NC_022110	AAC	2	6	591390	591395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353691
11602	NC_022110	CTT	2	6	591402	591407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353691
11603	NC_022110	ATCAC	2	10	591448	591457	40 %	20 %	0 %	40 %	532353691
11604	NC_022110	CGA	2	6	591475	591480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353691
11605	NC_022110	TAT	2	6	591524	591529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353691
11606	NC_022110	ACT	2	6	591576	591581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353691
11607	NC_022110	CTT	2	6	591657	591662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353691
11608	NC_022110	ATA	2	6	591685	591690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353691
11609	NC_022110	ACC	2	6	591707	591712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353691
11610	NC_022110	AAC	3	9	591751	591759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353691
11611	NC_022110	TGA	2	6	591775	591780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353692
11612	NC_022110	ACT	2	6	591782	591787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353692
11613	NC_022110	T	7	7	591843	591849	0 %	100 %	0 %	0 %	532353692
11614	NC_022110	TGA	2	6	591900	591905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353692
11615	NC_022110	AGC	2	6	591929	591934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353692
11616	NC_022110	CGCA	2	8	591938	591945	25 %	0 %	25 %	50 %	532353692
11617	NC_022110	AG	3	6	591952	591957	50 %	0 %	50 %	0 %	532353692
11618	NC_022110	T	6	6	591959	591964	0 %	100 %	0 %	0 %	532353692
11619	NC_022110	TC	3	6	592003	592008	0 %	50 %	0 %	50 %	532353692
11620	NC_022110	TAA	2	6	592019	592024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353692
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11622	NC_022110	GCA	2	6	592093	592098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354081
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11744	NC_022110	A	6	6	597816	597821	100 %	0 %	0 %	0 %	532353700
11745	NC_022110	T	6	6	597850	597855	0 %	100 %	0 %	0 %	532353700
11746	NC_022110	AACC	2	8	597869	597876	50 %	0 %	0 %	50 %	532353700
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11748	NC_022110	GATA	2	8	598083	598090	50 %	25 %	25 %	0 %	532353701
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11987	NC_022110	ATT	2	6	610865	610870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353714
11988	NC_022110	AC	3	6	610882	610887	50 %	0 %	0 %	50 %	532353714
11989	NC_022110	ATCC	2	8	610902	610909	25 %	25 %	0 %	50 %	532353714
11990	NC_022110	CGC	2	6	610915	610920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353714
11991	NC_022110	TCT	2	6	610963	610968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354083
11992	NC_022110	GAC	2	6	611000	611005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354083
11993	NC_022110	TAC	2	6	611008	611013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354083
11994	NC_022110	ATG	2	6	611025	611030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354083
11995	NC_022110	A	6	6	611060	611065	100 %	0 %	0 %	0 %	532354083
11996	NC_022110	AC	3	6	611133	611138	50 %	0 %	0 %	50 %	532354083
11997	NC_022110	GTA	2	6	611378	611383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353715
11998	NC_022110	CT	3	6	611384	611389	0 %	50 %	0 %	50 %	532353715
11999	NC_022110	GATT	2	8	611468	611475	25 %	50 %	25 %	0 %	532353715
12000	NC_022110	TCT	2	6	611495	611500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353715

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