MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022110	GC	3	6	535661	535666	0 %	0 %	50 %	50 %	532353634
10502	NC_022110	TGACA	2	10	535715	535724	40 %	20 %	20 %	20 %	532353634
10503	NC_022110	GT	3	6	535744	535749	0 %	50 %	50 %	0 %	532353634
10504	NC_022110	TGT	2	6	535781	535786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353634
10505	NC_022110	GAA	2	6	535798	535803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353634
10506	NC_022110	ATC	2	6	535854	535859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353634
10507	NC_022110	CT	3	6	535950	535955	0 %	50 %	0 %	50 %	532353634
10508	NC_022110	CGA	2	6	535984	535989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353634
10509	NC_022110	ATCG	2	8	536032	536039	25 %	25 %	25 %	25 %	532353634
10510	NC_022110	TCC	2	6	536050	536055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353634
10511	NC_022110	ACT	2	6	536063	536068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353634
10512	NC_022110	GCA	3	9	536089	536097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353634
10513	NC_022110	C	6	6	536123	536128	0 %	0 %	0 %	100 %	532353634
10514	NC_022110	AGAA	2	8	536177	536184	75 %	0 %	25 %	0 %	532353634
10515	NC_022110	TTTTC	2	10	536209	536218	0 %	80 %	0 %	20 %	532353634
10516	NC_022110	A	6	6	536221	536226	100 %	0 %	0 %	0 %	532353634
10517	NC_022110	AGA	2	6	536267	536272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353634
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10519	NC_022110	T	6	6	536313	536318	0 %	100 %	0 %	0 %	532353634
10520	NC_022110	TGT	2	6	536340	536345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353634
10521	NC_022110	CTG	2	6	536417	536422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353634
10522	NC_022110	TTTTC	2	10	536442	536451	0 %	80 %	0 %	20 %	532353634
10523	NC_022110	CTT	2	6	536571	536576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353634
10524	NC_022110	CAT	2	6	537099	537104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353635
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10526	NC_022110	AAC	2	6	537201	537206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353635
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10529	NC_022110	TCTCT	2	10	537401	537410	0 %	60 %	0 %	40 %	532353636
10530	NC_022110	TGTC	2	8	537444	537451	0 %	50 %	25 %	25 %	532353636
10531	NC_022110	TTGC	2	8	537521	537528	0 %	50 %	25 %	25 %	532353636
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10534	NC_022110	A	6	6	537826	537831	100 %	0 %	0 %	0 %	532353636
10535	NC_022110	TAT	2	6	537864	537869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353636
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10537	NC_022110	T	6	6	537926	537931	0 %	100 %	0 %	0 %	532353636
10538	NC_022110	TC	3	6	537956	537961	0 %	50 %	0 %	50 %	532353636
10539	NC_022110	AGCT	2	8	538022	538029	25 %	25 %	25 %	25 %	532353636
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10542	NC_022110	TGTA	2	8	538067	538074	25 %	50 %	25 %	0 %	532353636
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10546	NC_022110	CCAA	2	8	538210	538217	50 %	0 %	0 %	50 %	532353636
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10551	NC_022110	T	6	6	538389	538394	0 %	100 %	0 %	0 %	532353637
10552	NC_022110	ACA	2	6	538402	538407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353637
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10557	NC_022110	TC	3	6	538659	538664	0 %	50 %	0 %	50 %	532353637
10558	NC_022110	GAT	2	6	538670	538675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353637
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10561	NC_022110	TC	3	6	538780	538785	0 %	50 %	0 %	50 %	532353637
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10571	NC_022110	CT	3	6	539333	539338	0 %	50 %	0 %	50 %	532353638
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10590	NC_022110	TCCC	2	8	540082	540089	0 %	25 %	0 %	75 %	532354076
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10606	NC_022110	CTTC	2	8	540863	540870	0 %	50 %	0 %	50 %	532353639
10607	NC_022110	CT	3	6	540884	540889	0 %	50 %	0 %	50 %	532353639
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10620	NC_022110	GA	3	6	541720	541725	50 %	0 %	50 %	0 %	532353640
10621	NC_022110	T	6	6	541805	541810	0 %	100 %	0 %	0 %	532353641
10622	NC_022110	T	7	7	541820	541826	0 %	100 %	0 %	0 %	532353641
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10624	NC_022110	AAG	2	6	541855	541860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353641
10625	NC_022110	CCT	2	6	541863	541868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353641
10626	NC_022110	TC	3	6	541939	541944	0 %	50 %	0 %	50 %	532353641
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10731	NC_022110	TTG	2	6	547285	547290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353646
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10740	NC_022110	A	7	7	547858	547864	100 %	0 %	0 %	0 %	532353647
10741	NC_022110	CT	3	6	547886	547891	0 %	50 %	0 %	50 %	532353647
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10744	NC_022110	TC	3	6	548076	548081	0 %	50 %	0 %	50 %	532353647
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10868	NC_022110	GCT	2	6	553508	553513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353651
10869	NC_022110	TTG	2	6	553568	553573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353651
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10982	NC_022110	ACC	2	6	559502	559507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353655
10983	NC_022110	GCATAG	2	12	559528	559539	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532353655
10984	NC_022110	AGC	2	6	559571	559576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353655
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10986	NC_022110	GAAA	2	8	559656	559663	75 %	0 %	25 %	0 %	532353655
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