MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022110	A	6	6	510309	510314	100 %	0 %	0 %	0 %	532353616
10002	NC_022110	GTC	2	6	510327	510332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353616
10003	NC_022110	ATC	2	6	510380	510385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353616
10004	NC_022110	A	7	7	510462	510468	100 %	0 %	0 %	0 %	532353616
10005	NC_022110	GA	3	6	510495	510500	50 %	0 %	50 %	0 %	532353616
10006	NC_022110	GGA	2	6	510506	510511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353616
10007	NC_022110	GGTTGT	2	12	510559	510570	0 %	50 %	50 %	0 %	532353616
10008	NC_022110	ATG	2	6	510630	510635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353616
10009	NC_022110	GCA	2	6	510674	510679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353616
10010	NC_022110	TTG	2	6	510684	510689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353616
10011	NC_022110	CAA	2	6	510734	510739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353616
10012	NC_022110	AAG	2	6	510792	510797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353616
10013	NC_022110	CA	3	6	510847	510852	50 %	0 %	0 %	50 %	532353616
10014	NC_022110	AGA	2	6	510898	510903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353616
10015	NC_022110	GA	3	6	511054	511059	50 %	0 %	50 %	0 %	532353616
10016	NC_022110	A	7	7	511101	511107	100 %	0 %	0 %	0 %	532353616
10017	NC_022110	A	7	7	511139	511145	100 %	0 %	0 %	0 %	532353616
10018	NC_022110	CAAA	2	8	511146	511153	75 %	0 %	0 %	25 %	532353616
10019	NC_022110	GATC	2	8	511157	511164	25 %	25 %	25 %	25 %	532353616
10020	NC_022110	GAA	2	6	511190	511195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353616
10021	NC_022110	GAG	2	6	511266	511271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353616
10022	NC_022110	TCC	3	9	511279	511287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353616
10023	NC_022110	CAT	2	6	511297	511302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353616
10024	NC_022110	CAG	2	6	511307	511312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353616
10025	NC_022110	ATC	2	6	511313	511318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353616
10026	NC_022110	CTG	2	6	511327	511332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353616
10027	NC_022110	ATC	2	6	511335	511340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353616
10028	NC_022110	CCA	2	6	511379	511384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353616
10029	NC_022110	TCT	2	6	511392	511397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353616
10030	NC_022110	CTA	2	6	511409	511414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353616
10031	NC_022110	TC	3	6	511527	511532	0 %	50 %	0 %	50 %	532353617
10032	NC_022110	TAGA	2	8	511605	511612	50 %	25 %	25 %	0 %	532353617
10033	NC_022110	AGT	2	6	511669	511674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353617
10034	NC_022110	CAC	2	6	511680	511685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353617
10035	NC_022110	AGA	2	6	511714	511719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353617
10036	NC_022110	AAC	2	6	511800	511805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353617
10037	NC_022110	T	6	6	511833	511838	0 %	100 %	0 %	0 %	532353617
10038	NC_022110	T	7	7	511871	511877	0 %	100 %	0 %	0 %	532353617
10039	NC_022110	A	8	8	511942	511949	100 %	0 %	0 %	0 %	532353617
10040	NC_022110	GCC	2	6	511950	511955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353617
10041	NC_022110	TCT	2	6	512252	512257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353618
10042	NC_022110	CTA	2	6	512328	512333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353618
10043	NC_022110	AGC	2	6	512347	512352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353618
10044	NC_022110	AAG	2	6	512385	512390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353618
10045	NC_022110	AGC	2	6	512409	512414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353618
10046	NC_022110	CAA	2	6	512421	512426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353618
10047	NC_022110	ATT	2	6	512428	512433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353618
10048	NC_022110	ACT	2	6	512516	512521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353618
10049	NC_022110	TTA	2	6	512522	512527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353618
10050	NC_022110	ACG	2	6	512588	512593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353618
10051	NC_022110	TACT	2	8	512682	512689	25 %	50 %	0 %	25 %	532353618
10052	NC_022110	GTT	2	6	512714	512719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353618
10053	NC_022110	TCC	2	6	512740	512745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353618
10054	NC_022110	AGA	2	6	512869	512874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353618
10055	NC_022110	CAA	3	9	512904	512912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353618
10056	NC_022110	ACT	2	6	512960	512965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353618
10057	NC_022110	CTT	2	6	512994	512999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353618
10058	NC_022110	AGC	2	6	513078	513083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353618
10059	NC_022110	CTT	2	6	513087	513092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353618
10060	NC_022110	CAG	2	6	513171	513176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353618
10061	NC_022110	ATAGG	2	10	513281	513290	40 %	20 %	40 %	0 %	532353618
10062	NC_022110	TG	3	6	513323	513328	0 %	50 %	50 %	0 %	532353618
10063	NC_022110	ATC	2	6	513343	513348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353618
10064	NC_022110	T	6	6	513464	513469	0 %	100 %	0 %	0 %	532353618
10065	NC_022110	T	6	6	513475	513480	0 %	100 %	0 %	0 %	532353618
10066	NC_022110	AGCTA	2	10	513517	513526	40 %	20 %	20 %	20 %	532353618
10067	NC_022110	AG	4	8	513538	513545	50 %	0 %	50 %	0 %	532353618
10068	NC_022110	TGA	2	6	513627	513632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353618
10069	NC_022110	ATT	2	6	513663	513668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353618
10070	NC_022110	T	6	6	513667	513672	0 %	100 %	0 %	0 %	532353618
10071	NC_022110	TTA	2	6	513695	513700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353618
10072	NC_022110	TAGT	2	8	513739	513746	25 %	50 %	25 %	0 %	532353618
10073	NC_022110	ACTA	2	8	513765	513772	50 %	25 %	0 %	25 %	532353618
10074	NC_022110	TGT	2	6	513777	513782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353618
10075	NC_022110	ACA	2	6	514014	514019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353619
10076	NC_022110	ACT	2	6	514020	514025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353619
10077	NC_022110	ACA	2	6	514033	514038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353619
10078	NC_022110	AGC	2	6	514047	514052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353619
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10080	NC_022110	TAAAA	2	10	514181	514190	80 %	20 %	0 %	0 %	532353619
10081	NC_022110	T	6	6	514204	514209	0 %	100 %	0 %	0 %	532353619
10082	NC_022110	TAA	2	6	514223	514228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353619
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10084	NC_022110	CAC	2	6	514591	514596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353620
10085	NC_022110	GAA	2	6	514614	514619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353620
10086	NC_022110	TGC	3	9	514689	514697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353620
10087	NC_022110	CTC	2	6	514711	514716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353620
10088	NC_022110	CTT	2	6	514844	514849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353621
10089	NC_022110	ATG	2	6	514850	514855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353621
10090	NC_022110	AGA	2	6	514894	514899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353621
10091	NC_022110	CTT	2	6	514919	514924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353621
10092	NC_022110	ACA	2	6	514948	514953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353621
10093	NC_022110	CTC	2	6	514994	514999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353621
10094	NC_022110	AAG	2	6	515028	515033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353621
10095	NC_022110	GTA	2	6	515061	515066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353621
10096	NC_022110	AG	3	6	515080	515085	50 %	0 %	50 %	0 %	532353621
10097	NC_022110	GAA	2	6	515086	515091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353621
10098	NC_022110	CT	3	6	515145	515150	0 %	50 %	0 %	50 %	532353621
10099	NC_022110	CTT	2	6	515329	515334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353621
10100	NC_022110	T	6	6	515333	515338	0 %	100 %	0 %	0 %	532353621
10101	NC_022110	A	6	6	515359	515364	100 %	0 %	0 %	0 %	532353621
10102	NC_022110	TTCT	2	8	515376	515383	0 %	75 %	0 %	25 %	532353621
10103	NC_022110	AGA	2	6	515412	515417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353621
10104	NC_022110	CCCA	2	8	515446	515453	25 %	0 %	0 %	75 %	532353621
10105	NC_022110	AGA	2	6	515466	515471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353621
10106	NC_022110	ATC	2	6	515537	515542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353621
10107	NC_022110	ACGAC	2	10	515622	515631	40 %	0 %	20 %	40 %	532353621
10108	NC_022110	CTCTT	2	10	515705	515714	0 %	60 %	0 %	40 %	532353621
10109	NC_022110	TCC	2	6	515759	515764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353621
10110	NC_022110	GAG	2	6	515812	515817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353621
10111	NC_022110	T	6	6	515867	515872	0 %	100 %	0 %	0 %	532353621
10112	NC_022110	CTC	2	6	515914	515919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353621
10113	NC_022110	CAC	2	6	515952	515957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353621
10114	NC_022110	CTA	2	6	516155	516160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353621
10115	NC_022110	AGGAA	2	10	516165	516174	60 %	0 %	40 %	0 %	532353621
10116	NC_022110	ATGAA	2	10	516189	516198	60 %	20 %	20 %	0 %	532353621
10117	NC_022110	AG	3	6	516277	516282	50 %	0 %	50 %	0 %	532353621
10118	NC_022110	ATTC	2	8	516283	516290	25 %	50 %	0 %	25 %	532353621
10119	NC_022110	TCT	2	6	516634	516639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353622
10120	NC_022110	AGT	2	6	516791	516796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353622
10121	NC_022110	TCT	2	6	516814	516819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353622
10122	NC_022110	ATAG	2	8	516833	516840	50 %	25 %	25 %	0 %	532353622
10123	NC_022110	TCT	2	6	516915	516920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353622
10124	NC_022110	TGC	2	6	516921	516926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353622
10125	NC_022110	TGAACT	2	12	516927	516938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532353622
10126	NC_022110	TTG	2	6	516962	516967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353622
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10129	NC_022110	TC	3	6	517559	517564	0 %	50 %	0 %	50 %	532353623
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10134	NC_022110	ATCC	2	8	517721	517728	25 %	25 %	0 %	50 %	532353623
10135	NC_022110	CAT	2	6	517756	517761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353623
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10144	NC_022110	TAATTC	2	12	518255	518266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532353623
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10154	NC_022110	CTG	2	6	518678	518683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353623
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10158	NC_022110	TGT	2	6	518761	518766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353623
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10161	NC_022110	TAC	2	6	518916	518921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353623
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10203	NC_022110	GTA	2	6	520689	520694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353624
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10227	NC_022110	AACT	2	8	522525	522532	50 %	25 %	0 %	25 %	532353624
10228	NC_022110	AGC	2	6	522543	522548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353624
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10231	NC_022110	CAA	2	6	522632	522637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353624
10232	NC_022110	AAG	2	6	522698	522703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353624
10233	NC_022110	CTC	2	6	522714	522719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353624
10234	NC_022110	TTC	2	6	522727	522732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353624
10235	NC_022110	TGT	2	6	522742	522747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353624
10236	NC_022110	ATAA	2	8	522946	522953	75 %	25 %	0 %	0 %	532353624
10237	NC_022110	TTG	2	6	522956	522961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353624
10238	NC_022110	AAAG	2	8	523015	523022	75 %	0 %	25 %	0 %	532353624
10239	NC_022110	AAG	2	6	523037	523042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353624
10240	NC_022110	AAC	2	6	523065	523070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353624
10241	NC_022110	TC	3	6	523073	523078	0 %	50 %	0 %	50 %	532353624
10242	NC_022110	ACA	2	6	523099	523104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353624
10243	NC_022110	AATA	2	8	523158	523165	75 %	25 %	0 %	0 %	532353624
10244	NC_022110	TCT	2	6	523174	523179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353624
10245	NC_022110	TGC	2	6	523222	523227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353624
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10250	NC_022110	AT	3	6	523556	523561	50 %	50 %	0 %	0 %	532353624
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10252	NC_022110	T	6	6	523617	523622	0 %	100 %	0 %	0 %	532353624
10253	NC_022110	A	7	7	523774	523780	100 %	0 %	0 %	0 %	532354074
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10255	NC_022110	A	7	7	523847	523853	100 %	0 %	0 %	0 %	532354074
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10258	NC_022110	CAA	2	6	523969	523974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354074
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10262	NC_022110	TCA	2	6	524229	524234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353625
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10264	NC_022110	CTAA	2	8	524260	524267	50 %	25 %	0 %	25 %	532353625
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10266	NC_022110	ACTT	2	8	524294	524301	25 %	50 %	0 %	25 %	532353625
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10274	NC_022110	A	7	7	525201	525207	100 %	0 %	0 %	0 %	532353626
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10283	NC_022110	TTCT	2	8	525767	525774	0 %	75 %	0 %	25 %	532353627
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10359	NC_022110	AAC	2	6	529767	529772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353631
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10362	NC_022110	GTT	2	6	529803	529808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353631
10363	NC_022110	TAA	2	6	529818	529823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353631
10364	NC_022110	AGA	2	6	529847	529852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353631
10365	NC_022110	CCT	2	6	529916	529921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353631
10366	NC_022110	A	6	6	529940	529945	100 %	0 %	0 %	0 %	532353631
10367	NC_022110	GC	3	6	529963	529968	0 %	0 %	50 %	50 %	532353631
10368	NC_022110	AGC	2	6	530020	530025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353631
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10370	NC_022110	TGT	2	6	530107	530112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353631
10371	NC_022110	AATCA	2	10	530143	530152	60 %	20 %	0 %	20 %	532353631
10372	NC_022110	AGC	2	6	530170	530175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353631
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10374	NC_022110	TCGT	2	8	530187	530194	0 %	50 %	25 %	25 %	532353631
10375	NC_022110	AGGGT	2	10	530245	530254	20 %	20 %	60 %	0 %	532353631
10376	NC_022110	TG	3	6	530262	530267	0 %	50 %	50 %	0 %	532353631
10377	NC_022110	CAA	2	6	530271	530276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353631
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10388	NC_022110	A	6	6	530860	530865	100 %	0 %	0 %	0 %	532353631
10389	NC_022110	CAAA	2	8	530866	530873	75 %	0 %	0 %	25 %	532353631
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10391	NC_022110	GA	3	6	531133	531138	50 %	0 %	50 %	0 %	532354075
10392	NC_022110	GTA	2	6	531141	531146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354075
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10395	NC_022110	CTT	2	6	531196	531201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354075
10396	NC_022110	CA	3	6	531203	531208	50 %	0 %	0 %	50 %	532354075
10397	NC_022110	AGCCAC	2	12	531209	531220	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532354075
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10400	NC_022110	GTAG	2	8	531378	531385	25 %	25 %	50 %	0 %	532354075
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10426	NC_022110	TAG	2	6	532442	532447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354075
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10444	NC_022110	CGTA	2	8	533222	533229	25 %	25 %	25 %	25 %	532354075
10445	NC_022110	TGG	2	6	533261	533266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354075
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10472	NC_022110	TCG	2	6	534244	534249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353632
10473	NC_022110	TCCTC	2	10	534259	534268	0 %	40 %	0 %	60 %	532353632
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10481	NC_022110	C	7	7	534624	534630	0 %	0 %	0 %	100 %	532353632
10482	NC_022110	A	6	6	534668	534673	100 %	0 %	0 %	0 %	532353632
10483	NC_022110	CTA	2	6	534765	534770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353632
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10486	NC_022110	A	6	6	534842	534847	100 %	0 %	0 %	0 %	532353632
10487	NC_022110	T	6	6	534856	534861	0 %	100 %	0 %	0 %	532353632
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