MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_022110	AAC	2	6	484244	484249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353589
9502	NC_022110	GAA	2	6	484304	484309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353589
9503	NC_022110	TTA	2	6	484315	484320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353589
9504	NC_022110	CAG	2	6	484321	484326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353589
9505	NC_022110	ATG	2	6	484362	484367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353589
9506	NC_022110	TTG	2	6	484371	484376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353589
9507	NC_022110	GAT	2	6	484393	484398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353589
9508	NC_022110	AG	3	6	484421	484426	50 %	0 %	50 %	0 %	532353589
9509	NC_022110	A	7	7	484508	484514	100 %	0 %	0 %	0 %	532353589
9510	NC_022110	AT	3	6	484561	484566	50 %	50 %	0 %	0 %	532353589
9511	NC_022110	CTC	2	6	484657	484662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353589
9512	NC_022110	CT	3	6	484838	484843	0 %	50 %	0 %	50 %	532353589
9513	NC_022110	ACA	2	6	484863	484868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353589
9514	NC_022110	CT	3	6	484931	484936	0 %	50 %	0 %	50 %	532353589
9515	NC_022110	ATT	2	6	484955	484960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353589
9516	NC_022110	ATG	2	6	485081	485086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353589
9517	NC_022110	TAAA	2	8	485111	485118	75 %	25 %	0 %	0 %	532353589
9518	NC_022110	AAC	2	6	485176	485181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353589
9519	NC_022110	A	6	6	485195	485200	100 %	0 %	0 %	0 %	532353589
9520	NC_022110	CAAAA	2	10	485213	485222	80 %	0 %	0 %	20 %	532353589
9521	NC_022110	A	8	8	485219	485226	100 %	0 %	0 %	0 %	532353589
9522	NC_022110	AC	3	6	485228	485233	50 %	0 %	0 %	50 %	532353589
9523	NC_022110	GA	4	8	485273	485280	50 %	0 %	50 %	0 %	532353589
9524	NC_022110	CAA	2	6	485624	485629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354069
9525	NC_022110	AAT	2	6	485633	485638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354069
9526	NC_022110	GTT	2	6	485644	485649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354069
9527	NC_022110	ATA	2	6	485661	485666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354069
9528	NC_022110	CTC	2	6	485684	485689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354069
9529	NC_022110	AT	3	6	485863	485868	50 %	50 %	0 %	0 %	532353590
9530	NC_022110	A	6	6	485919	485924	100 %	0 %	0 %	0 %	532353590
9531	NC_022110	GA	3	6	485930	485935	50 %	0 %	50 %	0 %	532353590
9532	NC_022110	ATT	2	6	485936	485941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353590
9533	NC_022110	GCAA	2	8	485946	485953	50 %	0 %	25 %	25 %	532353590
9534	NC_022110	AGC	2	6	485962	485967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353590
9535	NC_022110	CTG	2	6	485995	486000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353590
9536	NC_022110	TCT	2	6	486173	486178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353590
9537	NC_022110	ATT	2	6	486179	486184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353590
9538	NC_022110	ACA	2	6	486259	486264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353590
9539	NC_022110	CGAG	2	8	486271	486278	25 %	0 %	50 %	25 %	532353590
9540	NC_022110	TGT	2	6	486307	486312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353590
9541	NC_022110	GTA	2	6	486381	486386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353590
9542	NC_022110	GCC	2	6	486389	486394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353590
9543	NC_022110	CTATT	2	10	486420	486429	20 %	60 %	0 %	20 %	532353590
9544	NC_022110	AAT	2	6	486455	486460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353590
9545	NC_022110	ACAAA	2	10	486496	486505	80 %	0 %	0 %	20 %	532353590
9546	NC_022110	TTG	2	6	486554	486559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353590
9547	NC_022110	ATT	2	6	486601	486606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353590
9548	NC_022110	AAC	2	6	486627	486632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353590
9549	NC_022110	ATT	2	6	486654	486659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353590
9550	NC_022110	GT	3	6	486667	486672	0 %	50 %	50 %	0 %	532353591
9551	NC_022110	ATC	2	6	486701	486706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353591
9552	NC_022110	ATG	2	6	486746	486751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353591
9553	NC_022110	TCTG	2	8	486783	486790	0 %	50 %	25 %	25 %	532353591
9554	NC_022110	AAG	2	6	486830	486835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353591
9555	NC_022110	GCT	2	6	486844	486849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353591
9556	NC_022110	GAA	2	6	486850	486855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353591
9557	NC_022110	CTT	2	6	486859	486864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353591
9558	NC_022110	AGG	2	6	486912	486917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353591
9559	NC_022110	CTAG	2	8	486937	486944	25 %	25 %	25 %	25 %	532353591
9560	NC_022110	TCAA	2	8	487007	487014	50 %	25 %	0 %	25 %	532353591
9561	NC_022110	A	6	6	487016	487021	100 %	0 %	0 %	0 %	532353591
9562	NC_022110	CAC	2	6	487084	487089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353591
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9564	NC_022110	GTT	2	6	487097	487102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353591
9565	NC_022110	AAC	2	6	487134	487139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353591
9566	NC_022110	CTG	2	6	487173	487178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353591
9567	NC_022110	GCT	2	6	487247	487252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353591
9568	NC_022110	GGC	2	6	487253	487258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353591
9569	NC_022110	TGC	2	6	487274	487279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353591
9570	NC_022110	CATTC	2	10	487341	487350	20 %	40 %	0 %	40 %	532353591
9571	NC_022110	AGG	2	6	487352	487357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353591
9572	NC_022110	CAT	2	6	487493	487498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353592
9573	NC_022110	CCTT	2	8	487554	487561	0 %	50 %	0 %	50 %	532353592
9574	NC_022110	CT	3	6	487572	487577	0 %	50 %	0 %	50 %	532353592
9575	NC_022110	CA	3	6	487674	487679	50 %	0 %	0 %	50 %	532353592
9576	NC_022110	TGC	2	6	487753	487758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353592
9577	NC_022110	TGT	2	6	487781	487786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353592
9578	NC_022110	TATG	2	8	487790	487797	25 %	50 %	25 %	0 %	532353592
9579	NC_022110	TCC	2	6	487831	487836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353592
9580	NC_022110	CAT	2	6	487877	487882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353592
9581	NC_022110	ATCT	2	8	487892	487899	25 %	50 %	0 %	25 %	532353592
9582	NC_022110	TGCT	2	8	487930	487937	0 %	50 %	25 %	25 %	532353592
9583	NC_022110	GAG	2	6	487984	487989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353592
9584	NC_022110	AAAT	2	8	488062	488069	75 %	25 %	0 %	0 %	532353592
9585	NC_022110	CTG	2	6	488084	488089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353592
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9587	NC_022110	TCA	2	6	488118	488123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353592
9588	NC_022110	GATC	2	8	488134	488141	25 %	25 %	25 %	25 %	532353592
9589	NC_022110	CTC	2	6	488177	488182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353592
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9592	NC_022110	CTT	2	6	488389	488394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354070
9593	NC_022110	TTG	2	6	488584	488589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354070
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9595	NC_022110	GACA	2	8	488647	488654	50 %	0 %	25 %	25 %	532354070
9596	NC_022110	AG	3	6	488716	488721	50 %	0 %	50 %	0 %	532354070
9597	NC_022110	TTC	2	6	488758	488763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354070
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9601	NC_022110	C	6	6	488882	488887	0 %	0 %	0 %	100 %	532354070
9602	NC_022110	CCG	2	6	488892	488897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532354070
9603	NC_022110	CCT	2	6	488904	488909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354070
9604	NC_022110	ACA	2	6	488940	488945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354070
9605	NC_022110	GC	3	6	488964	488969	0 %	0 %	50 %	50 %	532354070
9606	NC_022110	CAA	2	6	488989	488994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354070
9607	NC_022110	AACA	2	8	489011	489018	75 %	0 %	0 %	25 %	532354070
9608	NC_022110	A	7	7	489018	489024	100 %	0 %	0 %	0 %	532354070
9609	NC_022110	TAAA	2	8	489074	489081	75 %	25 %	0 %	0 %	532354070
9610	NC_022110	T	7	7	489126	489132	0 %	100 %	0 %	0 %	532354070
9611	NC_022110	CT	3	6	489249	489254	0 %	50 %	0 %	50 %	532353593
9612	NC_022110	T	6	6	489445	489450	0 %	100 %	0 %	0 %	532353593
9613	NC_022110	CGAA	2	8	489479	489486	50 %	0 %	25 %	25 %	532353593
9614	NC_022110	ATA	2	6	489564	489569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353594
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9616	NC_022110	TCCA	2	8	489607	489614	25 %	25 %	0 %	50 %	532353594
9617	NC_022110	TTG	2	6	489718	489723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353594
9618	NC_022110	AGA	2	6	489738	489743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353594
9619	NC_022110	AC	3	6	489786	489791	50 %	0 %	0 %	50 %	532353594
9620	NC_022110	AAC	2	6	489804	489809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353594
9621	NC_022110	ACT	2	6	489817	489822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353594
9622	NC_022110	T	8	8	489848	489855	0 %	100 %	0 %	0 %	532353594
9623	NC_022110	TGT	2	6	490549	490554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353595
9624	NC_022110	ATC	2	6	490587	490592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353595
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9994	NC_022110	AGA	2	6	510085	510090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353616
9995	NC_022110	AAG	2	6	510111	510116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353616
9996	NC_022110	CTG	2	6	510132	510137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353616
9997	NC_022110	ATT	2	6	510167	510172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353616
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9999	NC_022110	AAT	2	6	510278	510283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353616
10000	NC_022110	CGT	2	6	510302	510307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353616

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