MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022110	CCAATA	2	12	460811	460822	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532353576
9002	NC_022110	CTT	2	6	460856	460861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353576
9003	NC_022110	TTC	2	6	460880	460885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353576
9004	NC_022110	TAC	2	6	460939	460944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353576
9005	NC_022110	AAC	2	6	461020	461025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353576
9006	NC_022110	TTC	2	6	461083	461088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353576
9007	NC_022110	CCA	2	6	461117	461122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353576
9008	NC_022110	TTC	2	6	461184	461189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353576
9009	NC_022110	A	6	6	461267	461272	100 %	0 %	0 %	0 %	532353577
9010	NC_022110	GATT	2	8	461437	461444	25 %	50 %	25 %	0 %	532353577
9011	NC_022110	TCT	2	6	461483	461488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353577
9012	NC_022110	A	6	6	461605	461610	100 %	0 %	0 %	0 %	532353577
9013	NC_022110	CCT	2	6	461614	461619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353577
9014	NC_022110	CGT	2	6	461687	461692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353577
9015	NC_022110	CAA	3	9	461694	461702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353577
9016	NC_022110	AAG	2	6	461813	461818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353577
9017	NC_022110	T	6	6	461853	461858	0 %	100 %	0 %	0 %	532353577
9018	NC_022110	CAA	2	6	461966	461971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353577
9019	NC_022110	CAC	2	6	461988	461993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353577
9020	NC_022110	TGA	2	6	462007	462012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353577
9021	NC_022110	AGCC	2	8	462079	462086	25 %	0 %	25 %	50 %	532353577
9022	NC_022110	AGAAA	2	10	462153	462162	80 %	0 %	20 %	0 %	532353577
9023	NC_022110	TTC	2	6	462190	462195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353577
9024	NC_022110	AAC	2	6	462203	462208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353577
9025	NC_022110	GTT	2	6	462562	462567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353578
9026	NC_022110	TTG	2	6	462585	462590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353578
9027	NC_022110	AAG	2	6	462617	462622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353578
9028	NC_022110	TCCA	2	8	462714	462721	25 %	25 %	0 %	50 %	532353578
9029	NC_022110	TGCT	2	8	462774	462781	0 %	50 %	25 %	25 %	532353578
9030	NC_022110	CAA	2	6	462782	462787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353578
9031	NC_022110	CTTT	2	8	462848	462855	0 %	75 %	0 %	25 %	532353578
9032	NC_022110	AAC	2	6	463010	463015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353578
9033	NC_022110	TC	3	6	463043	463048	0 %	50 %	0 %	50 %	532353578
9034	NC_022110	TAA	2	6	463059	463064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353578
9035	NC_022110	A	6	6	463063	463068	100 %	0 %	0 %	0 %	532353578
9036	NC_022110	ATT	2	6	463125	463130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353578
9037	NC_022110	CAC	2	6	463186	463191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353578
9038	NC_022110	TCT	2	6	463241	463246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353578
9039	NC_022110	AG	3	6	463319	463324	50 %	0 %	50 %	0 %	532353579
9040	NC_022110	TAA	2	6	463343	463348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353579
9041	NC_022110	A	6	6	463353	463358	100 %	0 %	0 %	0 %	532353579
9042	NC_022110	TC	3	6	463378	463383	0 %	50 %	0 %	50 %	532353579
9043	NC_022110	TAGG	2	8	463401	463408	25 %	25 %	50 %	0 %	532353579
9044	NC_022110	CAT	2	6	463426	463431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353579
9045	NC_022110	CGA	2	6	463443	463448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353579
9046	NC_022110	CTT	2	6	463454	463459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353579
9047	NC_022110	AAG	2	6	463461	463466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353579
9048	NC_022110	TCT	2	6	463476	463481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353579
9049	NC_022110	A	6	6	463489	463494	100 %	0 %	0 %	0 %	532353579
9050	NC_022110	T	7	7	463527	463533	0 %	100 %	0 %	0 %	532353579
9051	NC_022110	GCT	2	6	463548	463553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353579
9052	NC_022110	TTG	2	6	463586	463591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353579
9053	NC_022110	AGA	2	6	463604	463609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353579
9054	NC_022110	CCA	2	6	463763	463768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353579
9055	NC_022110	CAG	2	6	463828	463833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353579
9056	NC_022110	AGG	2	6	463849	463854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353579
9057	NC_022110	AGA	2	6	463883	463888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353579
9058	NC_022110	AAC	2	6	463944	463949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353579
9059	NC_022110	CAT	2	6	463958	463963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353579
9060	NC_022110	TCA	2	6	464019	464024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353579
9061	NC_022110	CACC	2	8	464049	464056	25 %	0 %	0 %	75 %	532353579
9062	NC_022110	GC	3	6	464077	464082	0 %	0 %	50 %	50 %	532353579
9063	NC_022110	AACT	2	8	464100	464107	50 %	25 %	0 %	25 %	532353579
9064	NC_022110	A	6	6	464209	464214	100 %	0 %	0 %	0 %	532353580
9065	NC_022110	AAT	2	6	464236	464241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353580
9066	NC_022110	TCC	2	6	464278	464283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353580
9067	NC_022110	TTC	2	6	464368	464373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353580
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9069	NC_022110	CTT	2	6	464535	464540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353580
9070	NC_022110	AAT	2	6	464542	464547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353580
9071	NC_022110	ACA	2	6	464589	464594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353580
9072	NC_022110	A	6	6	464680	464685	100 %	0 %	0 %	0 %	532353580
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9074	NC_022110	TCT	2	6	465230	465235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353581
9075	NC_022110	A	7	7	465296	465302	100 %	0 %	0 %	0 %	532353581
9076	NC_022110	AGA	2	6	465342	465347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353581
9077	NC_022110	TTA	2	6	465378	465383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353581
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9079	NC_022110	GAA	2	6	465445	465450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353581
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9081	NC_022110	TAC	2	6	465615	465620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353582
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9084	NC_022110	GAA	2	6	465670	465675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353582
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9088	NC_022110	CCTT	2	8	465832	465839	0 %	50 %	0 %	50 %	532353582
9089	NC_022110	ATTG	2	8	465861	465868	25 %	50 %	25 %	0 %	532353582
9090	NC_022110	CTC	2	6	465917	465922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353582
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9093	NC_022110	AGC	2	6	465989	465994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353583
9094	NC_022110	CTT	2	6	466026	466031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353583
9095	NC_022110	AGA	2	6	466098	466103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353583
9096	NC_022110	TCCT	2	8	466216	466223	0 %	50 %	0 %	50 %	532353583
9097	NC_022110	CTT	2	6	466262	466267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353583
9098	NC_022110	AAAG	2	8	466289	466296	75 %	0 %	25 %	0 %	532353583
9099	NC_022110	A	6	6	466298	466303	100 %	0 %	0 %	0 %	532353583
9100	NC_022110	A	6	6	466314	466319	100 %	0 %	0 %	0 %	532353583
9101	NC_022110	TTCT	2	8	466320	466327	0 %	75 %	0 %	25 %	532353583
9102	NC_022110	TC	3	6	466336	466341	0 %	50 %	0 %	50 %	532353583
9103	NC_022110	CAAA	2	8	466345	466352	75 %	0 %	0 %	25 %	532353583
9104	NC_022110	A	6	6	466357	466362	100 %	0 %	0 %	0 %	532353583
9105	NC_022110	ATA	2	6	466366	466371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353583
9106	NC_022110	AT	3	6	466405	466410	50 %	50 %	0 %	0 %	532353583
9107	NC_022110	T	6	6	466431	466436	0 %	100 %	0 %	0 %	532353583
9108	NC_022110	CATA	2	8	466463	466470	50 %	25 %	0 %	25 %	532353583
9109	NC_022110	AAG	2	6	466577	466582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353584
9110	NC_022110	A	7	7	466590	466596	100 %	0 %	0 %	0 %	532353584
9111	NC_022110	AAAG	2	8	466605	466612	75 %	0 %	25 %	0 %	532353584
9112	NC_022110	AGG	2	6	466647	466652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353584
9113	NC_022110	ATCGGC	2	12	466657	466668	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532353584
9114	NC_022110	GTT	2	6	466672	466677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353584
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9118	NC_022110	TCTA	2	8	466772	466779	25 %	50 %	0 %	25 %	532353584
9119	NC_022110	AAT	2	6	466807	466812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353584
9120	NC_022110	GGC	2	6	466821	466826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353584
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9122	NC_022110	ATT	2	6	466926	466931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353584
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9124	NC_022110	TATG	2	8	467000	467007	25 %	50 %	25 %	0 %	532353584
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9389	NC_022110	CT	3	6	479500	479505	0 %	50 %	0 %	50 %	532353588
9390	NC_022110	ACTAT	2	10	479512	479521	40 %	40 %	0 %	20 %	532353588
9391	NC_022110	TCT	2	6	479575	479580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353588
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9393	NC_022110	CAT	2	6	479723	479728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353588
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9402	NC_022110	CT	5	10	480178	480187	0 %	50 %	0 %	50 %	532353589
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